ИСТИНА

Микробные родопсины - интегральные мембранные белки, которые выполняют светозависимый транспорт протонов и других ионов или сенсорные функции. Они обнаруживаются у архей, бактерий и эукариотических водорослей и включают в себя семь трансмембранных сегментов и хромофор ретиналь. Гены, кодирующие потенциальные ретинальные белки, были выявлены в геномах Грамположительных бактерий Exiguobacterium sibiricum, выделенной из вечномерзлого грунта возрастом 3 млн лет (ESR), термофильной Exiguobacterium AT1b из горячих источников Йеллоустонского Национального парка (ATER) и Exiguobacterium 7-3, также выделенной из многолетнемерзлого грунта (E7_3R). Ранее мы клонировали ген ESR и провели его структурно-функциональную характеристику. Аминокислотная последовательность E7_3R отличается от ESR в семи положениях, а АТЕR – в 39 положениях. Для сравнения свойств ретинальных белков, принадлежащих к близкородственным видам из разных мест обитания, мы экспрессировали ATER и E7_3R в клетках E. coli и исследовали их методом флеш-фотолиза при различных рН. Показано, что фотоцикл ATER и E7_3R отличается от ESR сдвигом рКа образования интермедиата M (депротонированного основания Шиффа) в щелочную область, а также пониженной скоростью его образования. Наблюдаемые различия обсуждаются во взаимосвязи с данными о трехмерной структуре ESR.