ИСТИНА

OCP — фотоактивный белок, осуществляющий в активированной светом красной форме нефотохимическое тушение флуоресценции фикобилисом — антенных комплексов цианобактерий. В настоящей работе методом полноатомной молекулярной динамики (МД) были смоделированы структурные изменения, которые происходят при внесении точечных мутаций, способствующих (R155L, R155E, W288F) [1] либо препятствующих (Y44S, Y201F) фотоактивации ОСР [2]. Было обнаружено, что при разрушении соляного мостика между доменами в МД расчете длиной 1 мкс не происходит существенного расхождения доменов, что наблюдается в эксперименте. Показано, что при разрушении водородной связи между белком и хромофором ОСР происходит поворот кето-содержащего кольца каротиноида на 60–80o, что в целом соответствует экспериментальным наблюдениям. При удалении С-концевого домена было обнаружено, что каротиноид способен углубляться внутрь N-концевого домена, что наблюдается в эксперименте, но закрепиться внутри гидрофобного кармана не способен. Исследованные точечные мутации не оказали влияния на кривизну каротиноида в МД расчетах.