ИСТИНА

Лактатдегидрогеназа А (ЛДГ-А) играет существенную роль в энергетическом обмене раковых клеток и является перспективной мишенью для разработки противоопухолевых химиопрепаратов. В активном центре ЛДГ-А можно выделить участки связывания субстрата и кофермента НАДН. Также при переходе ЛДГ-А в открытую форму за счет движения петли 96-111 образуется дополнительный участок связывания, что позволяет расширить спектр возможных ингибиторов. В данном исследовании определены структурные критерии отбора наиболее перспективных ингибиторов ЛДГ-А и осуществлен компьютерный скрининг обширной библиотеки соединений. В результате анализа связывания субстратов и известных ингибиторов установлены остатки, образующие наиболее важные взаимодействия: Arg168, Arg105 и Thr247. На основе кристаллических структур 1i10 и 4l4s в программе Amber сконструированы модели закрытой и открытой формы ЛДГ-А. В программе Lead Finder проведен докинг 2379 соединений библиотеки ZINC, содержащих сульфогруппу в качестве аналога карбоксильной группы субстрата. Последующее применение выбранных структурных критериев (водородные связи с Arg168, Arg105 и Thr247, а также дополнительные взаимодействия с His192, Asn137, Gln99 и Ile241) позволило отобрать 4% соединений в качестве потенциальных ингибиторов закрытой формы и 5% соединений в качестве ингибиторов открытой формы ЛДГ-А.