ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
На сегодняшний день разработан широкий спектр препаратов для борьбы с ВИЧ инфекцией. В основном это ингибиторы вирусных ферментов: обратной транскриптазы, протеазы и интегразы (ИН). Ключевая проблема при их применении - развитие лекарственной устойчивости вируса. В связи с этим актуальна разработка ингибиторов ВИЧ-1, активных против резистентных форм. Один из ключевых вирусных ферментов, ИН, функционирует в составе макромолекулярного прединтеграционного комплекса, в состав которого входят вирусные и клеточные белки-помощники. Этот комплекс представляет интересную мишень для создания ингибиторов ВИЧ-1 нового поколения. Известно, что в состав прединтеграционного комплекса входит белок человека Ku70. Снижение внутриклеточного уровня Ku70 негативно сказывается на репликации вируса. Предполагается, что Ku70 взаимодействует с ИН и защищает ее от протеасомной деградации. Соответственно, нарушение взаимодействия между ИН и Ku70 будет приводить к подавлению репликации вируса. Для создания соединений, способных препятствовать образованию комплекса ИН и Ku70 следует выяснить его структуру. В настоящей работе мы показали, что очищенные рекомбинатные белки ИН и Ku70 действительно формируют стабильный комплекс in vitro (Кд=70 нМ). С помощью широкого спектра делеционных мутантов как ИН, так и Ku70 нам удалось установить, что комплекс формируется за счет двух сайтов связывания. Первый сайт формируется за счет взаимодействия аминокислот 160-220 в составе интегразы и 1-250 в составе Ku70. В формировании второго сайта участвуют остатки 51-160 в составе ИН и 251-439 в составе Ku70. Причем первый сайт вносит преимущественный вклад в стабилизацию комплекса двух белков, поскольку точечные аминокислотные замены E212A и L213A в структуре ИН нарушают взаимодействие между ИН и Ku70. Также мы обнаружили, что конъюгат 11-звенного 2’-О-метилированного олигорибонуклеотида с эозином (11-ОМ-Е) ингибирует образование комплекса ИН с Ku70 (IC50 = 25 нМ). Учитывая, что связывание 11ОМ-Е происходит в С-концевом домене ИН, можно предположить аллостерический механизм ингибирования.