ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Многодоменный бактериальный белок S1 является самым большим и функционально важным белком 30S субъединицы рибосомы, взаимодействующим как с мРНК, так и с белками. Отличительной особенностью этого семейства является наличие множества структурных повторов S1 доменов у бактерий, количество которых изменяется в строго ограниченном диапазоне: от одного до шести [3]. Исследование 1453 последовательностей S1 белков (UniProt) показало, что число таких доменов можно рассматривать как отличительную особенность для филогенетической классификации бактерий по основным таксономическим отделам [5], а также позволило выявить структурные особенности отдельных S1 доменов необходимых для функциональной активности белков семейства [2, 4, 5]. Так, более стабильная и компактная центральная часть в мультидоменных белках важна для взаимодействия РНК, терминальные домены - для других функций. В то же время, равное соотношение областей, соединяющих вторичную структуру в отдельных доменах и между структурными доменами, указывает на одинаковую организацию мультидоменных S1 белков, а также положение и соотношение вторичной структуры в отдельных доменах [4]. Кроме того, исследование склонности к формированию ассоциатов полноразмерного рибосомного белка S1 из Thermus thermophilus, показало, что разупорядоченные области на N- и С-концах белка могут играть ключевую роль в его агрегации [1]. При этом, полученные результаты могут стать основой для актуальной задачи поиска и подбора условий кристаллизации полноразмерных многодоменных S1 белков, структур которых на сегодняшний день не существует. Работа поддержана грантом РНФ № 18-14-00321. Примечание: Мы благодарны нашему руководителю д.ф.-м.н. Галзитской О.В.