ИСТИНА

В данной работе проведен сравнительный метагеномный анализ микробиомов профилей различных почв по генетическим горизонтам. Объектами служили 57 генетических горизонтов 8 различных почв: дерново-подзолистой, темно-серой, черноземов типичных, коричневой, темно-каштановой и солонца. Образцы отбирали из каждого горизонта почвенного профиля, от поверхности до материнской породы. Из образцов почвы выделяли тотальную ДНК, проводили секвенирование гена 16S рРНК, а также сопутствующий анализ химических свойств почвы. Обнаружено, что Почвенные горизонты, контрастно отличающиеся от соседних по экологическим свойствам – натриевый горизонт солонца, элювиальный горизонт дерново-подзолистой почвы, уплотненный подпахотный горизонт агрочернозема – также заметно отличаются от соседних горизонтов по структуре и разнообразию прокариотного сообщества. Бактерии филума Actinobacteria имели большую представленность в верхних горизонтах почвах сухого и теплохо климата, а Acidobacteria – в верхних горизонтах почв прохладных и влажных регионов. Абсолютными доминантами среди обнаруженных архей в исследованных почвах являются представители филума Thaumarchaeota. Они обладали наибольшей представленностью в верхних горизонтах степных почв, вниз по профилю их представленность убывает. Прокариотные сообщества черноземов четко разделяются по типу горизонтов: микробиомы A (органо-минеральных) и B (минеральных) горизонтов образуют непересекающиеся кластеры на диаграммах по методу главных компонент. При этом сообщества A горизонтов значительно сильнее отличаются друг от друга, чем сообщества B горизонтов, которые формируют небольшой узкий кластер. Таким образом, экологические различия почвенных горизонтов являются мощным фактором дифференциации прокариотных сообществ в почвенном профиле, а структура микробных сообществ часто может быть горизонт-специфичной. Работа выполнена при поддержке Российского Научного Фонда, проект № 14-26-00079.