ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Большинство работ по изучению структуры и функции белков выполнялось и выполняется in vitro в сильно разбавленных буферных растворах. Эти условия значительно отличаются от клеточных, где миллиарды молекул белков, нуклеиновых кислот и сахаров, содержащихся в цитозоле, занимают значительную часть свободного пространства. Такая густонаселенная (“crowded”) среда оказывает значительное влияние на различные биологические процессы, происходящие с исследуемой молекулой в клетке. Для изучения эффектов молекулярного краудинга in vitro используют ряд концентрированных модельных растворов «краудинг агентов», таких как полиэтиленгликоль (ПЭГ), фиколл, декстраны, инертные белки и др. Сильно концентрованные растворы краудинг агентов обладают высокой вязкостью, что значительно затрудняет процесс приготовления образцов и трактовку полученных результатов. Для того чтобы свести к минимуму ошибку при подготовке проб, нами были получены колибровочные концентрационные зависимости показателя преломления ряда наиболее часто используемых краудинг агентов: декстрана 70, ПЭГ 12000, ПЭГ 8000, ПЭГ 4000, фиколла 70. Полученные зависимости хорошо аппроксимируются полиномом третьей степени и позволяют легко контролировать концентрацию используемого краудинг агента в растворе.