ИСТИНА

Длительные эволюционные эксперименты, проводимые в строго контролируемых лабораторных условиях на различных микроорганизмах, представляют большой интерес. Они призваны описывать эволюционную динамику экспериментальных популяций, а также выяснять молекулярные механизмы наблюдаемых изменений. Наша научная группа проводит непрерывный эволюционный эксперимент с 2012 года, используя для этого модельный аскомицетный гриб Podospora anserina. Рост восьми независимых линий поддерживают в жидкой питательной среде методом единовременных серийных пассажей. В данном сообщении мы приводим результаты полногеномного анализа всех экспериментальных линий спустя 8 лет от старта проекта, что соответствует 532 пассажам. Принятые в настоящей работе достаточно строгие критерии в сумме позволили выявить 312 достоверных однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs) и 39 коротких инсерционно-делеционных полиморфизмов (инделей). Причем, 153 SNPs были обнаружены в кодирующих участках геномов. Зная, что кодирующие последовательности составляют около 47% генома P. anserina, можно говорить о практически равной вероятности фиксации точечных замен в кодирующих и некодирующих областях. Синонимических, или «молчащих» мутаций было выявлено всего 38. Существенное преобладание значимых замен дает основание полагать, что, по крайней мере, часть из них носит адаптивный характер. Среди них 42 были классифицированы как нонсенс- и 73 как несинонимические мутации. Чуть более половины инделей (21 из 39) также локализованы в кодирующих областях, причем большая часть из них (17 из 21) – это фреймшифт-мутации. Практически для всех мутаций в нашей модельной системе выполняется эмпирическое правило: единожды закрепившись, данная мутация сохраняется во времени. Работа выполнена при финансовой поддержке РНФ, грант № 23-24-00318.