![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Сравнение геномов близкородственных бактерий и архей важно для поиска детерминант патогенности, подбора мишеней для разработки новых лекарств и изучения эволюции. Мы разработали новый пакет программ для сравнения геномов, NPG-explorer. Он ориентирован на построения выравниваний высокосходных геномов, что позволяет добиться более точного результата, по сравнению с другими программами полногеномного выравнивания. В пакете реализованы также новые средства сравнительного анализа геномов и визуализации множественного геномного выравнивания. NPG-explorer был применен для построения нуклеотидного пангенома 17-и геномов рода Brucella. Охаракетеризованы крупные геномные перестройки, детектированы все мутации в стабильных (присутствующих во всех геномах в единственном числе) блоках. На основании диагностических мутаций реконструирована филогения видов и штаммов. Обнаружены многочисленные несоответствия в аннотациях генов в разных геномах.