Характеристика модельной системы для изучения транспозиций гетерологичных копий ретротранспозонов в трансгенных линиях дрозофилы.дипломная работа (Бакалавр)
Аннотация:Мобильные элементы – важные компоненты регулирования реализации генетической информации в организмах. Новые копии МЭ могут вызывать геномные и генетические изменения при встраивании в новые сайты. Встройки могут изменять экспрессию генов, формируя регуляторные цис-элементы(энхансеры, промоторы, сайленсеры, места связывания транскрипционных факторов (ТФ)), вызывать делеции, опосредованные инсерциями, влиять на репликацию, рекомбинацию хромосом и образование хромосомных пар.
Не так давно было высказано предположение о новой модели интеграции ретротранспозонов из группы R2, главным процессом в которой является формирование и разрешение структур Холлидея. (Mukha et al., 2013) Для проверки верности предположения о новой модели ретротранспозиции необходима модельная система.
Цель данной работы – создание и проверка модельной системы для изучения перемещений ретротранспозонов.
Для выполнение этой цели были решены следующие задачи:
1) проверка трансгенных линий, содержащихся в лабораторных условиях в течение 5 лет и имеющих чужеродный генетический материал в своём геноме (сайт встройки МЭ R2, ОРС этого элемента и его полноразмерная копия),
2) получение линии D. melanogaster, в которой будут совмещены хромосомы с этими чужеродными генетическими элементами,
3) анализ закономерностей флуоресценции маркерного белка с помощью постановки скрещиваний с разными драйверными линиями и поиск маркеров для детекции перемещений МЭ из группы R2