Аннотация:Курсовая работа студентки 3го курса факультета биоинженерии и биоинформатики.
Системы рестрикции-модификации (Р-М) защищают бактерии и археи от чужеродной ДНК. Типичные системы Р-М имеют две активности: метилтрансфеазную, которая метилирует определенный нуклеотид ДНК и эндонуклеазную, которая расщепляет неметилированную ДНК.
Известно, что системы Р-М могут эволюционировать независимо от хозяина благодаря горизонтальному переносу систем или отдельных генов. Многими авторами они рассматриваются как мобильные генетические элементы, несмотря на то, что у них нет собственного механизма распространения в геноме.
Интерес представляет изучение ко-эволюции бактерий, бактериофагов и систем рестрикции-модификации.
Целью данной работы служит описание эволюции систем Р-М на всем доступном материале полных геномах бактерий и аннотаций систем Р-М в них.
Решались следующие задачи.
• Описание разнообразия состава генов в системах Р-М разных типов
• Кластеризация основных генов систем Р-М – ЭР и Мтаз – по сходству последовательностей каталитических доменов
• Классификация систем Р-М в соответствии с семействами РЕ и Мтазе
• Анализ распространенности разных классов систем Р-М в таксонах бактерий и архей. Идентификация случает горизонтального переноса.
Полученные результаты являются необходимым шагом в описании эволюции систем Р-М.