Аннотация:Наследственная информация в живых организмах о структурах белков и их свойствах хранится в виде генов. “Содержаниe” генов, согласно центральной догме молекулярной биологии, пределяется первичной структурой ДНК (у большинства организмов). Однако способ реализации этой информации очень сильно зависит от взаимодействия молекулы ДНК с белками и от динамических свойств этих взаимодействий. Механизмы контроля реализации наследственной
информации изучает эпигенетика. Наследственный материал клетки хранится в ядре, в виде компактной, сложно организованной и тонко регулируемой структуры - хроматина. Базовой
единицей хроматина является нулкеосома - белковый диск c участком ДНК, совершающим два неполных витка вокруг диска. Эти структуры представляют собой динамические комплексы, которые определяют будет ли прочитан этот участок генома и с какой эффективностью. Существует несколько способов модуляции хроматина на этом, базовом уровне, такие как метилирование
ДНК, пост-трансляционные модификации белков нуклеосомного диска, изменение состава белков диска. Интригующим вопросом является связь между структурными особенностями белков нуклеосомного диска и особенностями функционирования таких систем с точки зрения динамики ДНК. Работа нашей научной группы по изучению динамики нуклеосом канонического состава и поиску механизма управления динамикой ДНК белковым диском была опубликована в апреле в журнале Nature Communications.
Данная выпускная квалификационная работа посвящена изучению одного из описанных выше путей модуляции хроматина - замене канонического гистонового белка Н2А в составе нуклеосомного диска на его вариантную форму H2A.Z с помощью ремоделирующего комплекса SWR1. Это явление
будет рассмотрено с точки зрения возможных механизмов узнавания канонических (H2A) и вариантных (H2A.Z) нуклеосом и димеров гистоновых белков H2A(.Z)/H2B соответствующими молекулярными машинами и особенностей динамики таких нуклеосом.