|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Систематический анализ транслируемых участков в транскриптах мобильных элементов генома человекадипломная работа (Магистр)
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Кулаковский И.В., Макеев В.Ю.
- Автор: Егоров Артём Арменович
- Тип: Магистр
- Организация, в которой проходила защита: Московский физико-технический институт (МФТИ)
- Год защиты: 2022
- Аннотация: Мобильные элементы (МЭ) – широкий класс генетических элементов, способных изменять свое положение в геноме хозяина. МЭ оказывают огромное влияние на эволюцию видов, а также на здоровье и развитие их представителей. В последние годы с развитием технологий секвенирования и биоинформатических методов интерес к изучению активности МЭ и её последствий неуклонно возрастает. Фундаментальные проблемы анализа МЭ - их высокая копийность, сложная иерархия семейств и вырожденность представителей. Это вносит существенные ограничения в использование стандартных биоинформатических методов, в частности выравнивания, эта проблема особенно актуальна для коротких прочтений. Несмотря на развитие подходов, предлагающих решения этих проблем, до настоящего времени систематический анализ трансляционной активности МЭ не проводился. Целью данной работы являлась разработка подхода для идентификации транслируемых открытых рамок считывания (ORF, англ. Open Reading Frame) МЭ в геноме человека на основе данных рибосомного профайлинга и масс-спектрометрии различных тканей и клеток человека. Для решения этой проблемы мы разработали подход, основанный на использовании консенсусных последовательностей МЭ. В результате анализа мы выявили более 800 ORF с белок-кодирующим потенциалом в 37 подсемействах МЭ человека.
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич