Аннотация:CRISPR-Cas (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) системы прокариот являются одним из механизмов защиты прокариотических клеток от чужеродной ДНК. Они состоят из CRISPR-кассет, представляющих собой локус ДНК с идентичными повторами и разделяющими их уникальными спейсерами, и ассоциированных c CRISPR-кассетами сas (CRISPR associated) генов. Большинство CRISPR-Cas системы способны осуществлять разрезание ДНК фагов или плазмид, в которых имеются последовательности, идентичные последовательностям спейсеров CRISPR-кассеты, протоспейсеры. Защитное действие CRISPR-Cas систем называют CRISPR-интерференцией. Процесс встраивания новых спейсеров в CRISPR-кассету называют CRISPR-адаптацией. CRISPR-Cas системы играют большую роль во взаимодействиях между бактериями и бактериофагами, а также в регуляции горизонтального переноса генов и распространении устойчивости к антибиотикам.
CRISPR-Сas системы были открыты более десяти лет назад, и в настоящее время уже известны основные действующие компоненты CRISPR-Cas систем различных типов у разнообразных прокариот. Однако многие тонкие механизмы CRISPR-интерференции и адаптации остаются не до конца изученными. Также мало известно о взаимодействии CRISPR-Cas систем с системами клетки, обеспечивающими стабильность генома. Однако новые данные о роли белков клеточной рекомбинации (RecB, RecC, RecD, RecG, PriA) в CRISPR-адаптации, позволяют предположить возможность таких взаимодействий. Выявление таких взаимодействий является очень актуальной задачей, как с фундаментальной, так и с практической точки зрения. Понимание особенностей механизмов разрушения и возможностей последующей репарации ДНК под воздействием CRISPR-Cas систем имеет значение как для развития технологий редактирования геномов у про- и эукариот, так и для обеспечения CRISPR-опосредованной противофаговой защиты в биотехнологических производствах и разработки технологий, ограничивающих горизонтальный перенос генов в популяциях бактерий (в частности, генов устойчивости к антибиотикам).
В данной работе поставлена задача исследовать роль белков RecC, RecD, RecQ, RecF в процессе интерференции и -адаптации CRISPR-Cas системой типа I-E у Escherichia coli.