|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Применение методов молекулярного моделирования для разработки ингибиторов фактора свертываемости крови Xaдипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Сулимов Владимир Борисович
- Автор: Ильин Иван Сергеевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет Фундаментальной Медицины МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2017
- Аннотация: В ходе данной работы для разработки новых низкомолекулярных ингибиторов фактора свертываемости крови Xa была создана модель этого белка, были разработаны критерии отбора потенциальных ингибиторов в результате докинга и постпроцессинга молекул, имеющих экспериментально доказанную ингибирующую активность в отношении фактора Ха. С учетом разработанных критериев был проведен виртуальный скрининг двух баз химических соединений, кафедры органической химии Воронежского государственного университета (ВГУ) и NCI Diversity, в результате которого были отобраны структуры для дальнейшей проверки их ингибирующей активности при тестировании in vitro. Часть лучших структур химической базы ВГУ показали в данных экспериментах ингибирующую активность на уровне нескольких микромоль, а у лучшего из них константа ингибирования оказалась на субмикромолярном уровне: K_i=0.74±0.24 μM. Показано, что именно постпроцессинг на основе квантово-механических расчетов дает адекватное предсказание наличия у конкретной структуры способности ингибировать изучаемую мишень. В дальнейшем планируется использовать данную методологию для оптимизации найденной структуры ингибитораVGY-0224950 для получения более низкой константы диссоциации. Кроме этого, в ближайшее время на основе результатов данной работы будет произведен заказ соединений из химической базы NCI, также с целью измерения in vitro их ингибирующей активности и разработки новых соединений – новых ингибиторов фактора Ха свертывания.
- Добавил в систему: Сулимов Владимир Борисович