Изучение домена, несущего ковалентно связанный фосфоэфирной связью остаток FMN, на примере водорастворимых белков бактерий рода Shewanella.дипломная работа (Специалист)
Аннотация:В качестве предварительного этапа по планируемой работе по структурному исследованию FMN-связывающего домена (FMN_bind, PF04205) проведен биоинформатический анализ белков, гомологичных субъединице NqrC Na+-транслоцирующей NADH:хинон оксидоредуктазы. Среди них для дальнейшей работы выбран гипотетический периплазматический белок SO_4620 из Shewanella oneidensis MR1. Ген этого белка клонирован и гетерологически экспрессирован в клетках Vibrio. Получен препарат очищенного белка, содержащего две простетические группы: ковалентно связанный остаток FMN и нековалентно связанный FAD. Проведено сравнение первичных и пространственных структур ферментов, гомологичных белку SO_4620. На основе этого анализа выдвинуто предположение о структурных особенностях природного субстрата SO_4620.