ШИРОКОМАСШТАБНЫЙ ПОИСК ИНГИБИТОРОВ БИОСИНТЕЗА БЕЛКА В ОРГАНИЧЕСКОЙ БИБЛИОТЕКЕ ВЕЩЕСТВ (HIGH-THROUGHPUT SCREENING FOR TRANSLATION INHIBITORS IN THE ORGANIC COMPOUND LIBRARY)курсовая работа (Специалист)
Аннотация:Поиск новых потенциальных антибиотиков является по-прежнему важной и актуальной задачей, поскольку представляет интерес как с фундаментальной точки зрения, позволяя по-новому взглянуть на механизм действия различных антибиотиков, на центральные процессы в жизни бактериальной клетки, так и с практической – разработка новых антимикробных агентов, обладающих большей специфичностью или большим спектром действия.
Около половины применяемых в настоящее время антибиотиков действуют на рибосому. При этом механизмы их действия могут быть различными: некоторые вызывают ошибки в ходе синтеза белка, другие замедляют скорость трансляции или блокируют рибосому на разных стадиях ее функционального цикла. Определение механизма действия является необходимым шагом на пути создания лекарственного препарата. Разработанный уникальный метод, позволяющий проводить широкомасштабный анализ тысяч новых потенциальных антибактериальных агентов in vivo, одновременно дает возможность определять и эффективность ингибирования клеточного роста, и механизм действия тестируемых соединений, не требуя много времени и затрат на дополнительные субстраты. В основе данного метода лежит использование созданной ранее репортёрной конструкции pDualrep2, трансформированной в штамм ΔtolC E. coli и позволяющей детектировать потенциальные ингибиторы биосинтеза белка наряду с индукторами SOS-ответа.
Целью данной работы является поиск ингибиторов биосинтеза белка среди органической библиотеки веществ.
Для достижения поставленной цели был проведён широкомасштабный скрининг около шести тысяч органических веществ на действие по одному из двух механизмов благодаря использованию вышеописанного подхода. В результате него были отобраны несколько активных соединений, действующих по механизму ингибирования трансляции, и проверены на активность в in vitro системе, а также для них были определены минимальные ингибирующие концентрации на штамме ΔtolC E. coli.
В дальнейшем возможно для отобранных соединений, активных как в in vitro, так и in vivo системах, проводить поиск и анализ их аналогов, тест на токсичность.