Механизм формирования закрытой конформации протон-связывающего сайта с-кольца АТФ-синтазы бактерии Bacillus pseudofirmus: квантовохимическое изучениекурсовая работа (Специалист)
Аннотация:АТФ-синтаза – мембранный фермент, главная функция которого – синтез аденозинтрифосфата, универсального источника энергии для всех живых систем. Механизм работы этого наиважнейшего белка до конца неизвестен.
АТФ-синтаза состоит из мембранной и цитозольной (или матриксной) частей. Мембранная часть содержит вращающееся с-кольцо и статическую а-субъединицу с полуканалами, ведущими к с-кольцу. На сегодняшний день общепризнан роторный механизм работы АТФ-синтазы, согласно которому по полуканалам проходит ток протонов. Этот ток запускает вращение с-кольца и связанного с ним центрального ротора АТФ-синтазы. Центральный ротор, выходящий в цитозольную (или матриксную) часть белка, приводит в движение каталитические субъединицы, на которых начинается синтез АТФ.
Цель работы – попытаться выяснить механизм и условия реализации первой стадии сложного процесса вращения с-кольца, благодаря которому осуществляется синтез жизненно необходимого АТФ, а именно, определить структурные особенности и энергетические характеристики процесса захвата протона одной из составляющих кольцо субъединиц. Модельные построения основаны на результатах квантовохимических расчётов, и в качестве базовой модели взята структура белка Bacillus pseudofirmus из Protein Data Bank (2X2V)