|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Сравнение транксрипционных паттернов, ассоциированных со старением и воздействиями, увеличивающими продолжительность жизникурсовая работа (Специалист)
- Научные руководители: Тышковский А.Э., Дмитриев С.Е., Гладышев В.Н.
- Автор: Тихонов Станислав Алексеевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2020
- Курс: 3
- Аннотация: С развитием технологий высокопроизводительного секвенирования появилось достаточно много данных, посвященных изучению экспрессии генов в ходе различных биологических процессов, в том числе и связанных с долголетием. Это открыло возможность для анализа механизмов регуляции продолжительности жизни на системном уровне. Например, ранее был проведен мета-анализ данных, посвященных изучению воздействий, продлевающих жизнь мышам, в результате чего были получены генетические паттерны увеличения продолжительности жизни. В другой работе была проанализирована связь экспрессии генов с межвидовой разницей продолжительности жизни млекопитающих. Что касается механизмов старения, то ранее другими группами был проведен анализ дифференциальной экспрессии генов с возрастом на системном уровне, в котором были идентифицированы гены, чья активность значимо меняется с возрастом. Однако этот анализ был проведен лишь на качественном уровне, что не позволяет сравнивать между собой паттерны старения в разных моделях, а также с другими механизмами, связанными с долголетием. Таким образом, наиболее стабильные возрастные паттерны млекопитающих на уровне активности генов, а также и их сходство друг с другом и с паттернами, ассоциированными с увеличением продолжительности жизни, остаются неясными. В этой работе мы провели мета-анализ 58 датасетов из 24 независимых источников, в результате чего получили количественный и воспроизводимый профиль изменений экспрессии генов при старении отдельно для 3 видов млекопитающих и 3 тканей, а также единый профиль старения, общий для всех этих моделей. Кроме того, для нормализации датасетов мы разработали алгоритм множественной регрессии Деминга и показали его устойчивость относительно начальных значений. В дальнейшем полученные паттерны старения сравнивались между собой, а также с паттернами воздействий, продлевающих жизнь, как на уровне отдельных генов, так и на уровне функциональных процессов.
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич