Влияние системы эксцизионной репарации оснований на закрепление мутаций в промоторе гена TERT человека - курсовая работа | ИСТИНА – Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных

Научные руководители: Савицкая В.Ю., Кубарева Е.А.
Автор: Песковацкова Е.С.
Тип: Бакалавр
Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
Год защиты: 2023
Курс: 2
Аннотация: Наиболее распространенным повреждением dG, которое образуется под действием активных форм кислорода, является 8-оксогуанин (8-oxoG). В процессе репликации ДНК эукариотические ДНК-полимеразы с высокой вероятностью встраивают напротив поврежденного dG различные dA, что приводит к мутациям. Объектом нашего исследования является промотор гена обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT). Мутации dG>dA в промоторе hTERT в матричной цепи в позициях -124, -146 относительно стартового кодона ассоциированы с такими видами рака как уротелиальная карцинома, меланома, глиобластома, а в позициях -138 и -139 встречаются в раковых клетках кожи. Мы предположили, что закрепление указанных мутаций в промоторе hTERT может быть связано с: 1) мутациями в гене фермента 8-оксо-ДНК-гликозилазы (OGG1) из системы эксцизионной репарации оснований, ответственного за узнавание и удаление 8-oxoG, которые могут влиять на его активность; 2) низкой эффективностью функционирования нативной OGG1 в определенных позициях промотора hTERT. Согласно базе данных IGCC, замена dG>dA в позиции -124 hTERT встречается практически во всех рассмотренных видах рака, а в положении -146 преобладает над -124 в геномах больных меланомой и аденокарциномой кожи. Замены в положениях -138 и -139 присутствовали только в геномах больных меланомой. Исходя из файлов с простыми соматические мутациями пациентов с онкологическими заболеваниями, наибольший процент пациентов, имеющих одновременно мутации в указанных позициях hTERT и в гене OGG1, мы обнаружили среди больных меланомой и аденокарциномой кожи (21% и 8% соответственно). Анализ найденных нуклеотидных замен в OGG1 программой VEP показал, что они не приводят к изменению аминокислотной последовательности фермента OGG1, но влияют на аминокислотную последовательность белков CAMK1, TADA3 и BRPF1. Мы проанализировали эффективность удаления остатка 8-oxoG из позиций -124, -146, -138, -139 (относительно старт-кодона) матричной цепи hTERT-промотора ферментом OGG1 in vitro. Способность OGG1 удалять 8-oxoG из позиций -124 и -146, но не -138, -139, была резко снижена. Такой результат может быть связан с возможностью образования G-квадруплексной структуры в этом районе hTERT-промотора. Таким образом, закрепление мутаций dG>dA в позициях -124 и -146 hTERT-промотора может быть результатом возникновения 8-oxoG и низкой эффективностью его удаления белком OGG1. Тем не менее, корреляция между наличием мутаций в гене OGG1 и наличием мутаций в указанных позициях hTERT-промотора отсутствует.
Добавил в систему: Кубарева Елена Александровна

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ИНХС РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ИНХС РАН

Влияние системы эксцизионной репарации оснований на закрепление мутаций в промоторе гена TERT человекакурсовая работа (Бакалавр)

Прикрепленные файлы