Аннотация:Поиск новых антибиотиков не перестаёт быть актуальной проблемой сегодня. Один из перспективных способов их обнаружения – высокопроизводительный скрининг библиотек органических соединений. Однако при таком способе поиска новых антибактериальных веществ зачастую не получают никакой информации о механизме их действия. В этом году нашей целью было разработать систему, которая позволила бы не только обнаружить потенциальный антибиотик, но и сразу сделать предположение о механизме его работы.
Один из методов исследования механизма действия антибактериальных веществ – использование плазмид с репортёрными генами, экспрессирующимися только в случае, если антибиотик действует на определённый процесс в клетке (репликация, трансляция и т.д.). Для достижения такого эффекта репортёрные гены, как правило, помещают под специальные промоторы, которые будут репрессируют экспрессию гена при неспецифичном действии антибиотика. Ранее были созданы плазмиды, в который ген флуоресцентного белка CER находился под контролем sulA промотора или лидерного пептида, взятого из Trp оперона, в котором 2 триптофановых кодона были заменены на 2 Ala. В таких системах CER экспрессировался в случае, когда потенциальный антибиотик повреждал ДНК или вызывал торможение рибосомы соответственно.
После объединения этих репортёров в единую конструкцию мы получили плазмиду, использование которой даст возможность определять сразу два возможных механизма действия новых антибактериальных веществ. Она и была использована при скрининге библиотеки 20000 органических веществ на их антибактериальную активность, что позволило нам предположить механизм действия некоторых из них и отобрать вещества с интересующими нас механизмами для дальнейшего анализа.