|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
8-Оксогуанин в составе G-богатых мотивов: влияние на структуру ДНК и функционирование гликозилазы OGG1 человекакурсовая работа (Бакалавр)
- Научные руководители: Кубарева Е.А., Сныга В.Г.
- Автор: Грек Дарья Александровна
- Тип: Бакалавр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2024
- Курс: 2
- Аннотация: Окислительный стресс повышает уровень клеточного редокс-потенциала, что приводит к окислению dG до 8-оксо-7,8-дигидро-2′-дезоксигуанозина (8-oxoG), вызывающего онкологические заболевания [1]. G-богатые последовательности ДНК, способные образовывать G-квадруплексы, особенно подвержены такому окислению. Сниженная активность ферментов эксцизионной системы репарации (BER), а именно бифункциональной 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы (OGG1), может способствовать возникновению и закреплению мутаций [2]. Объект исследования – последовательность, формирующая параллельный квадруплекс мотива (GGGT)4 и встречающаяся в теломерных областях и промоторах различных генов. Цель данной работы заключалась в установлении влияния 8-oxoG в составе 41-звенных G-богатых последовательностей на структуру квадруплекса и на функционирование OGG1. Были сконструированы 41-звенные системы, представляющие собой параллельный квадруплекс мотива (GGGT)4 и содержащие модификацию 8-oxoG в первом, втором G-трактах (положения - 14, 15, 16 и 18, 19, 20 соответственно) и в третьем, четвертом трактах (положения - 22, 23, 24 и 26, 27, 28 соответственно). Методом спектроскопии кругового дихроизма показано образование G4 параллельного типа для всех одноцепочечных 41-звенных олигонуклеотидов, за исключением позиций модификаций 15, 19, 23 и 27, которые дестабилизируют формирование G4. Удаление 8-oxoG ферментом OGG1 происходило по одинаковому принципу для всех тетрад G-квадруплекса, средние положения G репарировались хуже, чем боковые. Степень удаления 8-oxoG ферментом OGG1 из двухцепочечных систем оказалась выше, чем из одноцепочечных ДНК-фрагментов, что свидетельствует о влиянии G4 на функционирование OGG1. На примере сконструированных олигонуклеотидов было показано, что положение 8-oxoG влияет на образование G-квадруплекса в G-богатых мотивах, а также на эффективность узнавания и удаления этой мутации из G-квадруплекса ферментом OGG1.
- Добавил в систему: Кубарева Елена Александровна