|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Поиск структурных и эволюционных корреляций между функциональными сайтами в структурах ферментовкурсовая работа (Специалист)
- Научные руководители: Суплатов Д.А., Швядас В.К.
- Автор: Злобин Александр Сергеевич
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2016
- Курс: 3
- Аннотация: Аллостерию принято определять как процесс регуляции функции белка путем связывания эффектора – лиганда или другого белка – в сайте на поверхности структуры, который называют аллостерическим центром. Известно, что аллостерическая регуляция метаболизма важна для функционирования живых клеток, а аллостерические эффекторы могут быть как ингибиторами, так и активаторами функции белков. С момент открытия первых аллостерических белков были предложены различные механизмы этого явления, в том числе классические модели Монода и Кошланда, однако последующие исследования показали, что молекулярные механизмы аллостерической регуляции сложны и разнообразны, и ни одна из предложенных моделей не описывает исчерпывающе явление аллостерии. Не вызывает сомнений тот факт, что конформационные изменения в структуре белка, обусловленные связыванием лиганда в аллостерическом центре, в конечном итоге приводят к изменению функциональных свойств. Однако не много известно о конкретных молекулярных механизмах этого явления. Как объяснить кооперативность, наблюдаемую при связывании различных лигандов и как предсказать взаимодействие между сайтами в белках, в которых аллостерия еще не описана? В последние годы предпринято несколько попыток понять взаимосвязь функции и регуляции. Одни из подходов заключаются в компьютерных методах поиска корреляций – структурных или эволюционных – между остатками топологически независимых центров на поверхносиях белков, происходящих при связывании лигандов.
- Добавил в систему: Суплатов Дмитрий Андреевич