ИСТИНА

Способ дифференциальной диагностики глиом на основании анализа экспрессии генов и микро-РНК, включающий выделение тотальной РНК из тканевых проб глиом и перифокальной зоны, обратную транскрипцию, с последующей амплификацией в режиме реального времени RT-PCR, отличающийся тем, что используют высокоспецифичные праймеры для генетических локусов EGFR - F: AGGACGGGGACCAGACAA, R: CTGCGTACTTCCAGACCAGG, MSI1 - F: GGCTGTGGTTCGAGGGAC, R: CTGGGAGTCGAACCTGGAG, PSMC4 - F: CGCTCACGCATTTCGAGC, R: CAGGTGGGCCATACATGAGG, ТВР - F: GTGCCCGAAACGCCGAA, R: GTGGTTCGTGGCTCTCTTATCC, RPLO - F: GAGGAAACTCTGCATTCTCGC, R: CTGCAGACAGACACTGGCA и микро-РНК hsa-miR92-1-5р - F: GAGGTTGGGATCGGTTGGAA, R: AGGTCCAGT(15)AGCA, hsa-miR-126-5p - F: CGCAGCATTATTACTTTTGGTAC, R: GTCCAG15(T)GCGTA, hsa-miR-7-5p - F: CGCAGTGGAAGACTAGTGA, R: GTCCAGT(15)CAAC, анализируют полученные данные и вычисляют коэффициент относительной экспрессии Е с использованием трех высокоспецифичных референсных генов: PSMC4, ТВР, RPLO и двух референсных высокоспецифичных микро-РНК: hsa-miR-126-5р, hsa-miR-7-5p, сравнивают полученные значения Е в опухолевой ткани с контрольными и при значениях EEGFR<0,5 или EEGFR>1,5, EMSI1<0,5 или EMSI1>1,5, Ehsa-miR-92a-1-5p<0,5 или Ehsa-miR-92a-1-5p>1,5 хотя бы по одному локусу у пациента диагностируется глиома высокой степени злокачественности III, IV; отсутствие изменений экспрессии указанных локусов относительно контроля свидетельствует о соответствии опухоли II степени злокачественности; коэффициент Е рассчитывают по формуле: где ΔCt(опухоль) - относительная экспрессия генов и микро-РНК в ткани глиом, где ΔCt(контроль) - относительная экспрессия генов и микро-РНК в ткани перифокальной зоны; при этом относительную экспрессию генетических локусов рассчитывают по формуле ΔCt=2-(Сtцелевого гена-Ctреференсных генов), где Ctцелевого гена - по трем повторам для целевых локусов EGFR или MSI1 и где Сtреференсных генов - среднее геометрическое значение референсных генов PSMC4, ТВР, RPLO; относительную экспрессию микроРНК рассчитывают по формуле ΔCt=2-(Сtцелевой микроРНК-Ctреференсных микроРНК) , где Ctцелевой микроРНК - среднее по трем повторам для микро-РНК hsa-miR-92-1-5р и где Сtреференсных микроРНК - среднее геометрическое значение референсных микро-РНК hsamiR-126-5р, hsa-miR-7-5p