ИСТИНА

Дюба Артем Владимирович пользователь

кандидат биологических наук с 2016 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Выгодина Т.В., Константинов А.А., Арутюнян А.М., Ацаркина Н.В., Головин А.В., Залевский А.О., Kalinovich A.V., Борисов В.Б., Елкина Д.А., Монахова М.В., Силецкий С.А., Amini E., Arosio D. показать полностью..., Bregestovski P.D., Chia-Chun Y., Claudia M., Ehrke E., Esclapez M., Freitas G.B., Hemming I.A., Howard J.A., Jaggar M., Jakobsen E., Jih-Hwa G., Kaszas A., Mitlöhner J., Paidi R.K., Salamian A., Saleem S., Seidenbecher C.I., Soulimane T., Stefan B., Sulakhiya K., Tefera T.W., Titus H.E., Vafadari B., Vos M.H., Zonfrillo F., Захаров М.П., Зефиров Н.С., Иванцова П.М., Кудрявцев К.В., Соколов М.Н., Чураков А.В., Шаронов М.Ю.

13 статей, 2 доклада на конференциях, 4 тезисов докладов, 8 НИР, 1 научный отчёт, 1 награда, 2 диссертации

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 43, Scopus: 39

IstinaResearcherID (IRID): 3658296

ORCID: 0000-0002-2885-4281

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • • 2022 Individual heme a and heme a3 contributions to the Soret absorption spectrum of the reduced bovine cytochrome c oxidase
    • Diuba* Artem V., Vygodina Tatiana V., Azarkina Natalia V., Arutyunyan Alexander M., Soulimane Tewfik, Vos Marten H., Konstantinov Alexander A.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1863, № 10 DOI
  • • 2019 CLARITY analysis of the Cl/pH sensor expression in the brain of transgenic mice
    • Diuba Artem V., Samigullin Dmitry V., Kaszas Attila, Zonfrillo Francesca, Malkov Anton, Petukhova Elena, Casini Antonio, Arosio Daniele, Esclapez Monique, Gross Cornelius T., Bregestovski Piotr
    • в журнале Neuroscience, издательство Elsevier BV (Netherlands) DOI
  • • 2019 The energetic brain - A review from students to students
    • Bordone M.P., Salman M.M., Titus H.E., Amini E., Andersen J.V., Chakraborti B., Diuba A.V., Dubouskaya T.G., Ehrke E., Freitas A.E., Freitas G.B., Gonçalves R.A., Gupta D., Gupta R., Ha S.R., Hemming I.A., Jaggar M., Jakobsen E., Kumari P., Lakkappa N., Marsh A.P.L, Mitlöhner J., Ogawa Y., Paidi R.K., Ribeiro F.C., Salamian A., Saleem S., Sharma S., Silva J.M., Singh S., Sulakhiya K., Tefera T.W., Vafadari B., Yadav A., Yamazaki R., Seidenbecher C.I.
    • в журнале Journal of Neurochemistry, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2017 Spectral-kinetic analysis of recombination reaction of heme centers of bd-type quinol oxidase from Escherichia coli with carbon monoxide
    • Siletsky S.A., Dyuba A.V., Elkina D.A., Monakhova M.V., Borisov V.B.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 82, № 11, с. 1354-1366 DOI
  • 
    • 2017 Спектрально-кинетический анализ реакции рекомбинации гемовых центров хинолоксидазы типа bd Escherichia coli с окисью углерода
    • Силецкий С.А., Дюба А.В., Елкина Д.А., Монахова М.В., Борисов В.Б.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 82, № 11, с. 1718-1731 DOI
  • 
    • 2015 Calcium ions inhibit reduction of heme a in bovine cytochrome c oxidase
    • Dyuba AV, Vygodina T., Azarkina N., Konstantinov AA
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 589, с. 3853-3858 DOI
  • 
    • 2015 Menthols as Chiral Auxiliaries for Asymmetric Cycloadditive Oligomerization: Syntheses and Studies of β-Proline Hexamers
    • Kudryavtsev Konstantin V., Ivantcova Polina M., Claudia Muhle-Goll, Churakov Andrei V., Sokolov Mikhail N., Dyuba Artem V., Arutyunyan Alexander M., Howard Judith A.K, Chia-Chun Yu, Jih-Hwa Guh, Zefirov Nikolay S., Stefan Bräse
    • в журнале Organic Letters, издательство American Chemical Society (United States), том 17, с. 000-000 DOI
  • • 2014 Revisiting individual absorption spectra of reduced hemes a and a3 in bovine-heart cytochrome c oxidase
    • Dyuba Artem V., Vygodina Tatiana V., Arutyunyan Alexander M., Konstantinov Alexander A.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1837, с. e97-e98 DOI
  • 
    • 2013 Reconstruction of Absolute Absorption Spectrum of Reduced Heme a in Cytochrome c Oxidase from Bovine Heart
    • Dyuba A.V., Vygodina T.V., Konstantinov A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 78, № 12, с. 1358-1365
  • 
    • 2012 Efect of calcium ions on electron transfer between hemes a and a3 in cytochrome-c oxidase
    • Vygodina T.V., Dyuba A.V., Konstantinov A.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 77, № 8, с. 901-909 DOI
  • 
    • 2012 Modeling the circular dichroism and absorption spectra of complexes FI and FII of cytochrome c oxidase
    • Dyuba A.V., Arutyunyan A.M., Vygodina T.V., Konstantinov A.A.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1817, с. S107-S107 DOI
  • 
    • 2011 Circular dichroism spectra of cytochrome c oxidase
    • Dyuba A.V., Arutyunyan A.M., Vygodina T.V., Azarkina N.V., Kalinovich A.V., Sharonov Y.A., Konstantinov A.A.
    • в журнале Metallomics : integrated biometal science, издательство RSC Publishing (Cambridge, England), том 3, с. 417-432
  • 
    • 2010 Circular dichroism of cytochrome c oxidase: Modeling spectra using classical polarizability theory
    • Dyuba Artem V., Vygodina Tatiana V., Azarkina Natalia V., Arutyunyan Alexander M., Sharonov Yury A., Kalinovich Anastasia V., Konstantinov Alexander A.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1797, с. 94-95 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2015 Вычисленный круговой дихроизм спектров гомо- и гетерополярных G-квадруплексов (Стендовый)
    • Авторы: Залевский А.О., Головин А.В., Дюба А.В.
    • 39-я междисциплинарная школа-конференция «Информационные технологии и системы 2015» (7 – 11 сентября, Олимпийская деревня, Сочи, Россия), Олимпийская деревня, Сочи, Россия, 7-11 сентября 2015
  • • 2014 Анализ сложной топологии ДНК-олигомеров с помощью моделирования молекулярной динамики и спектроскопии кругового дихроизма (Стендовый)
    • Авторы: Дюба А.В., Головин А.В., Залевский А.О., Захаров М.П.
    • Междисциплинарный симпозиум по медицинской, органической и биологической химии (МОБИ-Хим2014), Крым, Новый Свет, Россия, 25-28 мая 2014

• Тезисы докладов

  • • 2016 Individual absolute absorption spectra of cytochrome c oxidase hemes a2+ and a32+ resolved by femtosecond pump-probe spectroscopy
    • Dyuba A.V., Vygodina T.V., Azarkina N.V., Soulimane T.K., Vos M.H., Konstantinov A.A.
    • в сборнике Proceedings of the 79th Harden Conference: Oxygen Evolution and Reduction - Common Principles, тезисы, с. 16-16
  • 
    • 2015 Calculated circular dichroism spectra of homo- and heteropolar G-quadruplexes
    • Dyuba A.V., Zalevsky A.O., Golovin A.V.
    • в сборнике Proceedings of IITP RAS Interdisciplinary Conference & School "Information Technology and Systems 2015", место издания ИППИ РАН Москва, тезисы, с. 127-129
  • 
    • 2015 Unraveling CD spectra of G-­quadruplexes
    • Zalevsky A.O., Dyuba A.V., Golovin A.V.
    • в сборнике Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ'15, место издания ИППИ РАН Москва, тезисы, с. 145
  • • 2014 Экспресс-анализ сложных топологий нуклеиновых кислот методом спектроскопии кругового дихроизма. Материалы 38-й конференции молодых ученых и специалистов “Информационные технологии и системы (ИТиС’14)”, г
    • Залевский А.О., Захаров М.П., Дюба А.В., Головин А.В.
    • в сборнике Нижний Новгород, 1-5 сентября 2014 г. ISBN диска, тезисы, с. 29-30

• НИРы

  • • 29 апреля 2019 - 31 декабря 2021 Элементарные стадии в катализе сопряженных химических и транспортных процессов мембранными энергопреобразующими ферментами микроорганизмов
    • Отдел химии белка
    • Руководитель: Байков А.А. Ответственные исполнители: Анашкин В.А., Богачев А.В., Борисов В.Б. Участники НИР: Аксёнова В.А., Берцова Ю.В., Дюба А.В., Замахов И.М., Кириллова Е.А., Мамедов А., Монахова М.В., Олейников И.П., Романов Р.С., Силецкий С.А.
  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Исследование механизмов преобразования энергии в мембранных системах, связанных с циклическим переносом ионов водорода и натрия ферментами электрон-транспортных цепей, механизмов продукции активных форм кислорода и их роли в физиологии клетки
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководители: Северин Ф.Ф., Скулачев В.П. Ответственные исполнители: Богачев А.В., Выгодина Т.В. Участники НИР: Аверина О.А., Аветисян А.В., Адрианов М.А., Алексеевский А.В., Андрианова Н.В., Антоненко Ю.Н., Арутюнян А.М., Ацаркина Н.В., Бабенко В.А., Бакеева Л.Е., Бальзанникова В.В., Беликова М.П., Берцова Ю.В., Борисов В.Б., Бруман С.М., Будаговская Н.В., Вайс В.Б., Вангели И.М., Вахитова И.И., Высоких К.М., Высоких М.Ю., Галкина К.В., Гуськова Л.И., Дедухова В.И., Домнинская М.Л., Дюба А.В., Загрядская Ю.А., Зиновкин Р.А., Злобин А.С., Зоров Д.Б., Зоров С.Д., Зорова Л.Д., Зубарева В.М., Зырина А.Н., Исаев Н.К., Казанцева О.А., Карачевцева Н.М., Каргер Е.М., Кашко Н.Д., Киреева Н.А., Кирсанов Р.С., Кнорре Д.А., Константинов А.А., Королев Д.Е., Коршунова Г.А., Кулебякин А.Н., Лапашина А.С., Лапин И.В., Литвин А.В., Лямзаев К.Г., Манских В.Н., Маркова О.В., Меркулов А.А., Мулкиджанян А.Я., Мунтян М.С., Назаров П.А., Наумова Ю.О., Нестеренко А.М., Носкова Е.О., Носкова Е.О., Олейников И.П., Павлюченкова А.Н., Пантелеева А.А., Певзнер И.Б., Плотников Е.Ю., Попков В.А., Рокицкая Т.И., Северин Ф.Ф., Сергеев О.В., Силачёв Д.Н., Силецкий С.А., Симонян Р.А., Скулачев М.В., Смирнова Е.А., Смирнова Е.Г., Соколов С.С., Токмакова З.А., Третьяков Д.О., Фирсов А.М., Хайлова Л.С., Цвиркун Д.В., Черняк Б.В., Чубаров А.А., Эльдаров Ч.М., Ягужинский Л.С., Яубасарова И.Р.
  • • 9 января 2017 - 31 декабря 2019 Регуляция цитохром с оксидазы митохондрий за счет взаимодействия лигандов с консервативной амфипатической площадкой вблизи протонного канала К в каталитической субъединице I фермента.
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Константинов А.А. Ответственные исполнители: Ацаркина Н.В., Выгодина Т.В. Участники НИР: Арутюнян А.М., Дюба А.В., Олейников И.П.
  • • 6 февраля 2014 - 31 декабря 2015 Исследование пространственной структуры ДНК-аптамеров к тромбину с помощью комплексного метода на основе спектроскопии кругового дихроизма
    • Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов
    • Руководитель: Дюба А.В. Участники НИР: Залевский А.О., Захаров М.П.
  • • 11 января 2014 - 31 декабря 2016 Механизмы регуляции цитохром с оксидазы
    • Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов
    • Руководитель: Константинов А.А. Участники НИР: Арутюнян А.М., Ацаркина Н.В., Выгодина Т.В., Дюба А.В.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Изучение механизмов преобразования энергии, связанных с циклическим переносом ионов водорода и натрия в природных и модельных мембранных системах
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Скулачев В.П. Ответственный исполнитель: Богачев А.В. Участники НИР: Антоненко Ю.Н., Арутюнян А.М., Ацаркина Н.В., Берцова Ю.В., Богачев А.В., Борисов В.Б., Будаговская Н.В., Вайс В.Б., Вангели И.М., Демин О.В., Домнинская М.Л., Дюба А.В., Заспа А.А., Казанцева О.А., Карачевцева Н.М., Кнорре Д.А., Костырко В.А., Мунтян М.С., Назаров П.А., Рокицкая Т.И., Самарский А.Е., Северин Ф.Ф., Смирнова Е.А., Соколов С.С., Хайлова Л.С., Ягужинский Л.С.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Исследование механизмов функционирования электрон-транспортных цепей, продукции активных форм кислорода и их роли в физиологии клетки
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Скулачев В.П. Ответственный исполнитель: Выгодина Т.В. Участники НИР: Аверина О.А., Аветисян А.В., Алексеевский Д.А., Антоненко Ю.Н., Арутюнян А.М., Ацаркина Н.В., Бакеева Л.Е., Бальзанникова В.В., Беликова М.П., Борисов В.Б., Будаговская Н.В., Вайс В.Б., Вангели И.М., Вахитова И.И., Выгодина Т.В., Высоких М.Ю., Гуськова Л.И., Дедухова В.И., Демин О.В., Дюба А.В., Залесова З.Г., Замятнин А.А., Зоров Д.Б., Зорова Л.Д., Исаев Н.К., Казанцева О.А., Карачевцева Н.М., Каргер Е.М., Константинов А.А., Коршунова Г.А., Костырко В.А., Кулебякин А.Н., Лапин И.В., Лямзаев К.Г., Манских В.Н., Маркова О.В., Меркулов А.А., Метлина А.Л., Метлина А.Л., Могилевская Е.А., Мохова Е.Н., Мулкиджанян А.Я., Мунтян М.С., Назаров П.А., Нестеренко А.М., Пантелеева А.А., Певзнер И.Б., Плотников Е.Ю., Пустовидко А.В., Рокицкая Т.И., Саранцева А.В., Силачёв Д.Н., Силецкий С.А., Симонян Р.А., Скулачев М.В., Скулачев М.В., Смирнова Е.А., Смирнова Е.Г., Смирнова И.А., Токмакова З.А., Федоркин О.Н., Федоркин О.Н., Фирсов А.М., Цвиркун Д.В., Черняк Б.В., Эльдаров Ч.М., Ягужинский Л.С.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2013 Механизм регуляции цитохромоксидазы митохондрий ионами кальция
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Константинов А.А. Участники НИР: Ацаркина Н.В., Выгодина Т.В., Дюба А.В.

• Отчеты

  • • 2014 Механизмы регуляции цитохром с оксидазы
    • Авторы: Константинов А.А., Выгодина Т.В., Дюба А.В., Ацаркина Н.В., Арутюнян А.М.
    • #14-04-00425, 41 с.

• Награды и премии

  • • 2016 Приз от журнала BBA - Bioenergetics за лучшее устное сообщение
    • Лауреат: Дюба А.В.
    • Biochemical Society , Великобритания

• Диссертации

  • • СПЕКТРЫ ПОГЛОЩЕНИЯ И КРУГОВОГО ДИХРОИЗМА ЦИТОХРОМ с-ОКСИДАЗЫ: ОПРЕДЕЛЕНИЕ ИНДИВИДУАЛЬНЫХ ВКЛАДОВ ГЕМОВ а И а3
    • Принята к рассмотрению
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (биол. науки)
    • Соискатель: Дюба A.В., к.б.н.
    • Научный руководитель: Константинов А.А., д.б.н.
  • • 2016 Спектры поглощения и кругового дихроизма цитохром с-оксидазы: определение индивидуальных вкладов гемов а и а3
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.02 - Биофизика (биол. науки)
    • Автор: Дюба Артём Владимирович, к.б.н.
    • Научный руководитель: Константинов А.А., д.б.н.
    • Защищена в совете Д 501.001.96 при МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • Ведущая организация: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Воронежский государственный университет»
    • Оппоненты: Андреев И.М., Пищальников Р.Ю.

---