ИСТИНА

Федоров Владимир Андреевич пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра биофизики, Проблемная лаборатория космической биологии, Сектор экзобиологии, научный сотрудник, с 26 ноября 2018

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б., Гудимчук Н.Б., Холина Е.Г., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Орехов Ф.С., Дьяконова А.Н., Жмуров А.А., Древаль В.Д., Антал Т.К. показать полностью..., Атауллаханов Ф.И., Васюченко Е.П., Зленко Д.В., Лопанская Ю.Н., Браже Н.А., Плюснина Т.Ю., Kirillov I.V., Золотарева Н.В., Князева О.С., Мамонов П.А., Орлова М.В.

19 статей, 35 докладов на конференциях, 68 тезисов докладов, 15 НИР, 1 диссертация, 2 учебных курса

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 6, Scopus: 11

IstinaResearcherID (IRID): 7314498

ResearcherID: I-1880-2017

Scopus Author ID: 56677258600

ORCID: 0000-0002-9397-1548

Деятельность стиль:  обычный | ГОСТ | plain | abbrv | acm | alpha | amsalpha | amsplain | apalike | ieeetr | siam

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2020 Microtubule protofilament bending characterization
    • Gudimchuk Nikita B., Kholina Ekateria G., Fedorov Vladimir Andreevich, Dreval Varvara D., Kovalenko I.B.
    • в журнале Computer Research and Modeling, том 12, № 2, с. 435-443
  • • 2019 Comparative analysis of plastocyanin-cytochrome f complex formation in higher plants, green algae and cyanobacteria
    • Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Physiologia Plantarum, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2019 Mechanical properties of tubulin intra- and inter-dimer interfaces and their implications for microtubule dynamic instability
    • Fedorov Vladimir A., Orekhov Philipp S., Kholina Ekaterina G., Zhmurov Artem A., Ataullakhanov Fazoil I., Kovalenko Ilya B., Gudimchuk Nikita B.
    • в журнале PLoS Computational Biology, издательство Public Library of Science (United States), том 15, № 8, с. e1007327 DOI
  • 
    • 2019 Parametrization of the elastic network model using high-throughput parallel molecular dynamics simulations
    • Orekhov P.S., Kirillov I.V., Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Gudimchuk N.B., Zhmurov A.A.
    • в журнале Supercomputing Frontiers and Innovations, том 6, № 1, с. 19-22 DOI
  • • 2018 Performance analysis of different computational architectures: molecular dynamics in application to protein assemblies, illustrated by microtubule and electron transfer proteins
    • Fedorov V.A., Kholina E.G., Kovalenko I.B., Gudimchuk N.B.
    • в журнале Supercomputing Frontiers and Innovations, том 5, № 4 DOI
  • 
    • 2016 The role of electrostatic interactions in the process of diffusional encounter and docking of electron transport proteins
    • Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в журнале Doklady Biochemistry and Biophysics, издательство M A I K Nauka - Interperiodica (Russian Federation), том 468, с. 183-186 DOI
  • • 2016 Роль электростатических взаимодействий в процессе диффузионного сближения и докинга электронтранспортных белков
    • Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в журнале Доклады Академии наук, издательство Наука (М.), том 468, № 2, с. 220-224 DOI
  • 
    • 2015 Brownian-dynamics simulations of protein–protein interactions in the photosynthetic electron transport chain
    • Khruschev S.S., Abaturova A.M., Diakonova A.N., Fedorov V.A., Ustinin D.M., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 60, № 2, с. 212-231 DOI
  • 
    • 2015 The identification of intermediate states of the electron-transfer proteins plastocyanin and cytochrome f diffusional encounters
    • Khruschev S.S., Abaturova A.M., Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в журнале Biophysics, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 60, № 4, с. 513-521 DOI
  • 
    • 2015 Идентификация пpомежуточныx cоcтояний в пpоцеccе диффузионного cближения электpон-тpанcпоpтныx белков плаcтоцианина и цитоxpома f
    • Хрущев Сергей Сергеевич, Абатуpова А.М., Федоpов В.А., Коваленко И.Б., Pизниченко Г.Ю., Pубин А.Б.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 60, № 4, с. 629-638
  • 
    • 2015 Моделиpование взаимодейcтвий белков фотоcинтетичеcкой электpон-тpанcпоpтной цепи фотоcинтеза методом бpоуновcкой динамики
    • Хрущев Сергей Сергеевич, Абатуpова А.М., Дьяконова А.Н., Федоpов В.А., Уcтинин Д.М., Коваленко И.Б., Pизниченко Г.Ю., Pубин А.Б.
    • в журнале Биофизика, издательство Наука (М.), том 60, № 2, с. 270-292
  • 
    • 2013 Моделирование белок-белковых взаимодействий с применением программного комплекса многочастичной броуновской динамики ProKSim
    • Хрущев С.С., Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Устинин Д.М., Зленко Д.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в журнале Компьютерные исследования и моделирование, том 5, № 1, с. 47-64

• Статьи в сборниках

  • • 2019 Photosynthetic Electron Transfer by Dint of Protein Mobile Carriers. Multi-particle Brownian and Molecular Modeling
    • Galina Riznichenko, Ilya Kovalenko, Vladimir Fedorov, Sergei Khruschev, Andrey Rubin
    • в сборнике IV International Conference “Modeling of Nonlinear Processes and Systems” (MNPS-2019), серия EPJ Web of Conferences, издательство EDP Sciences (France), том 224, с. 1-7 DOI
  • • 2018 Анализ конформационной подвижности и оценка изгибной жесткости димеров и тетрамеров белка тубулина
    • Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б., Жмуров А.А.
    • в сборнике Труды 11-ой Международной конференции «Акустооптические и радиолокационные методы измерений и обработки информации», место издания Суздаль, Россия, с. 77-80
  • • 2018 Исследование конформационной подвижности белка тубулина методами молекулярной динамики
    • Древаль В.Д., Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов симпозиума "Методы измерения и математическое моделирование физических процессов: биофотоника, оптика и радиолокация", место издания ООО ПФК "Триада" Астрахань, том 2, с. 106-108
  • • 2018 Компьютерное моделирование образования комплекса электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f высших растений, зеленых водорослей и цианобактерий
    • Федоров В.А., Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов симпозиума "Методы измерения и математическое моделирование физических процессов: биофотоника, оптика и радиолокация", место издания ООО ПФК "Триада" Астрахань, том 2, с. 104-105
  • • 2018 Модели клеточной и молекулярной регуляции фотосинтетической цепи водород-выделяющих микроводорослей
    • Ризниченко Г.Ю., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Федоров В.А.
    • в сборнике Доклады Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика», место издания ИМПБ РАН Пущино, том 7, с. e66 DOI
  • • 2017 Brownian dynamics study of complex formation of proteins plastocyanin and cytochrome f
    • Kovalenko Ilya B., Abaturova Anna M., Knyazeva Olga S., Fedorov Vladimir A., Khruschev Sergei S., Riznichenko Galina Yu, Rubin Andrei B.
    • в сборнике Computer design for new drugs and materials: molucular dynamics of nanoscale phenomena, серия Nanotechnology science and technology computer science, technology and applications, место издания Nova Science Publishers, Inc United States, с. 189-206
  • • 2013 Реконструкция молекулярных процессов в живой клетке
    • Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Федоров В.А., Мамонов П.А., Зленко Д.В., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Альманах «Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности" (2013), место издания Издательство МГУ Москва, с. 85-92

• Доклады на конференциях

  • • 2020 МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ КОМПЛЕКСА NDC80 С МИКРОТРУБОЧКОЙ (Устный)
    • Авторы: Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., ФедоровВ А., КоваленкоИ Б., Гудимчук Н.Б.
    • Математика. Компьютер. Образование. МКО-2020, Дубна, Россия, 27-31 января 2020
  • • 2019 The electron-transport protein-protein complex formation of plastocyanin and cytochrome f of higher plants, green alga and cyanobacteria (Устный)
    • Автор: Fedorov V.A.
    • Mathematical modelling in biomedicine, Москва, Россия, 30 сентября - 4 октября 2019
  • • 2019 Влияние НАДФ+ на стабилизацию комплекса ФД-ФНР. Молекулярно-динамическое исследование (Стендовый)
    • Авторы: Федоров В.А., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 16-21 сентября 2019
  • • 2019 Многочастичное броуновское моделирование взаимодействий между ферредоксином и его белковыми партнерами (Стендовый)
    • Авторы: Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Рубин А.Б., Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 16-21 сентября 2019
  • • 2019 Модель броуновской динамики связывания белков дыхательной электрон-транспортной цепи цитохрома с и водорастворимой части цитохрома с1 в растворе (Стендовый)
    • Авторы: Абатурова А.М., Браже Н.А., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 16-21 сентября 2019
  • • 2019 Особенности формирования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f в высших растениях, зеленой водоросли и цианобактериях (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 16-21 сентября 2019
  • • 2019 Роль структурной организации цитохрома с1 в процессе образования комплекса между цитохромами с и с1 (Стендовый)
    • Авторы: Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б.
    • VI СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ (Сочи, 2019), г. Сочи, Россия, 16-21 сентября 2019
  • • 2019 Modeling of interactions of proteins participating in hydrogen production (Стендовый)
    • Авторы: Diakonova Alexandra N., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю.
    • 10th International Meeting «Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability – 2019», Санкт-Петербург, Россия, 23-25 июня 2019
  • • 2019 Prediction of Relaxed Conformations for Tubulin Dimers: from Cryo- Electron Microscopy to Molecular Dynamics (Устный)
    • Авторы: Fedorov Vladimir A., Orekhov Philipp S., Gudimchuk Nikita B., Kovalenko Ilya B., Kholina Ekaterina G.
    • Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05), Moscow, Россия, 2-5 июня 2019
  • • 2019 Молекулярное моделирование образования комплексов электрон- транспортных белков пластоцианина и цитохрома f. (Устный)
    • Автор: Федоров Владимир Андреевич
    • «Ломоносовские чтения - 2019». Секция «Биология», Москва, МГУ, Россия, 15-25 апреля 2019
  • • 2019 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений, зеленой водоросли и цианобактерий (Устный)
    • Автор: Федоров Владимир Андреевич
    • XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.)., Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
  • • 2018 Модели клеточной и молекулярной регуляции фотосинтетической цепи водород-выделяющих водорослей (Пленарный)
    • Авторы: Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю.
    • VII Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", г.Пущино, Россия, 14-19 октября 2018
  • • 2018 Electron-transfer protein-protein complex formation in higher plants, green alga and cyanobacteria (Стендовый)
    • Авторы: Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • Biomembranes 2018. International conference. October 1-5, 2018, Dolgoprudny, Московский физико-технический институт (гос. университет), Долгопрудный, Россия, 1-5 октября 2018
  • • 2018 Computer simulation of electron-transfer protein-protein complex formation in higer plants, green alga and cyanobacteria (Стендовый)
    • Авторы: Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • First European Congress on Photosynthesis Research, ePS-1 A Marcus Wallenberg Symposium. Uppsala, Sweden. June 25-28, 2018, Uppsala, Швеция, 25-28 июня 2018
  • • 2018 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений и цианобактерий (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 2018, Дубна, Россия, 29 января - 3 февраля 2018
  • • 2018 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса ферредоксина и ферредоксин-НАДФ+ редуктазы из Zеа mays и гидрогеназы из Chlamydomonas reinhardtii (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 2018, Дубна, Россия, 29 января - 3 февраля 2018
  • • 2017 Electron-transfer protein-protein complex formation in higer plants and cyanobacteria (Устный)
    • Авторы: Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences 2017, Петергоф, Россия, Россия, 7-10 сентября 2017
  • • 2017 Density based clustering of Brownian Dynamics trajectories reveals predominant energetically favorable orientations in protein-protein interactions (Устный)
    • Авторы: Khruschev S., Fedorov V., Kovalenko I.
    • International Conference “Mathematical Modeling and Computational Physics, 2017” (MMCP2017), Дубна, ОИЯИ, Россия, 3-7 июля 2017
  • • 2017 Исследование конформации ГТФ-тубулина и ее роли для полимеризации микротрубочки (Устный)
    • Авторы: Гудимчук Н.Б., Орлова М.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 2017, Пущино, Россия, 23-28 января 2017
  • • 2017 Роль электростатических взаимодействий в формировании электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерии P. laminosum (Устный)
    • Авторы: Федоров В.А., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 2017, Пущино, Россия, 23-28 января 2017
  • • 2016 Особенности формирования электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерий (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • Первый Российский кристаллографический конгресс, Москва, Россия, 21-26 ноября 2016
  • • 2016 Evolution of metastable states in the process of plastocyanin and cytochrome f complex formation (Стендовый)
    • Авторы: Федоров В.А., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • 7th International Conference. Photosynthesis Research for Sustainability-2016 , Пущино, Московская область, Россия , Россия, 19-25 июня 2016
  • • 2016 Эволюция метастабильных состояний при образовании комплекса электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f (Устный)
    • Автор: Федоров Владимир Андреевич
    • Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2016», МГУ им. М.В. Ломоносова , Россия, 11-15 апреля 2016
  • • 2016 Идентификация взаимного расположения пары белков пластоцианина и цитохрома f, соответствующего состоянию функционально-активного комплекса (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2016, Дубна, Россия, 25-30 января 2016
  • • 2015 Кинетические параметры образования белок-белковых комплексов пластоцианина и цитохрома f и их связь с электростатическими взаимодействиями между белками (Стендовый)
    • Авторы: Федоров В.А., Коваленко И.Б., Хрущев С.С.
    • V СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ, Ростов-на-Дону , Россия, 4-10 октября 2015
  • • 2015 Промежуточные состояния при образовании электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • V съезд биофизиков России. Ростов на Дону, 4-10 октября 2015 г., Ростов на Дону, Россия, 4-10 октября 2015
  • • 2015 Исследования белок-белковых взаимодействий объединенным методом броуновской и молекулярной динамики (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • XXII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2015», Москва, Россия, 13-17 апреля 2015
  • • 2015 Объединенный метод броуновской и молекулярной динамики для исследования белок-белковых взаимодействий (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • 22 Международная Конференция "МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ", г. Пущино, 26 - 31 января 2015 г., г. Пущино, Россия, 26-31 января 2015
  • • 2015 Роль конформационных изменений в молекулах белков пластоцианина и цитохрома f в кинетике их связывания (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • 22 Международная Конференция "МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ", г. Пущино, 26 - 31 января 2015 г., г. Пущино, Россия, 26-31 января 2015
  • • 2014 Молекулярное моделирование процесса образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • XXI Международная конференция студентов и аспирантов и молодых ученых Ломоносов 2014, Москва, Россия, 7-11 апреля 2014
  • • 2014 Молекулярное моделирование процесса образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • XXI Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование», Дубна, Объединенный институт ядерных исследований, 3-8 февраля 2014
  • • 2013 Молекулярная реконструкция процесса образования белок – белковых комплексов фотосинтетических электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • Молодежная научно-практическа конференция «Биофизика биоэнергетических процессов», посвященная столетию академика А.А. Красновского, Звенигородская биостанция им. С.Н. Скадовского МГУ им. М.В. Ломоносова, 2013
  • • 2013 Computer simulation of intermolecular complex formation of photosynthetic electron transport proteins plastocyanin and cytochrome f (Устный)
    • Автор: Федоров В.А.
    • International Workshop. Computational and Theoretical Modeling of Biomolecular Interactions., Dubna. Russia., Россия, 3-8 июня 2013
  • • 2013 Компьютерное моделирование образования белок-белковых комплексов на примере электрон транспортных белков пластоцианина и цитохрома f (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • XX Международная Конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2013", Москва, Россия, 8-13 апреля 2013
  • • 2013 Расчет кинетики образования комплекса пластоцианина с цитохромом f методом молекулярной динамики (Стендовый)
    • Автор: Федоров В.А.
    • МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2013, Россия, 28 января - 4 февраля 2013

• Тезисы докладов

  • • 2020 Идентификация мутаций ферредоксина, потенциально увеличивающих выход водорода у фотосинтезирующих организмов
    • Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 43-43
  • • 2020 Изменения структурной организации цитохрома с1 в процессе образования и распада комплекса между цитохромами с и с1
    • Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 27: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Москва - Ижевск, том 27, тезисы, с. 41-41
  • • 2020 Изменения структурной организации цитохрома с1 в процессе образования и распада комплекса между цитохромами с и с1
    • Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 41-41
  • • 2020 Молекулярно-динамическая модель взаимодействия комплекса NDC80 с микротрубочкой
    • Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 56-56
  • • 2020 Построение молекулярно-динамической модели взаимодействия комплекса Ndc80 с микротрубочкой
    • Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Жмуров А.А., Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 48-48
  • • 2020 Роль среды обитания организма в кинетике связывания молекул белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерий Synechococcus RCC307 и Synechococcus lacustris
    • Федоров В.А., Орехов Ф.С., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, издательство Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований (Ижевск), том 27, тезисы, с. 70-70
  • • 2020 Создание молекулярно-динамической модели комплекса NDC80 с микротрубочкой
    • Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Жмуров А.А., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике Математика и математическое моделирование. Сборник материалов XIV Всероссийской молодежной научно-инновационной школы, место издания Интерконтакт Саров, тезисы, с. 49-50
  • • 2019 Comparison of the conformational mobility of GTP- and GDP-bound tubulin using the molecular dynamics method
    • Kovalenko I.B., Orekhov P.S., Dreval V.D., Kholina E.G., Fedorov V.A., Gudimchuk N.B.
    • в сборнике Математическое моделирование в биомедицине = Mathematical modelling in biomedicine : сборник тезисов, издательство Российский университет дружбы народов (РУДН) (Москва), тезисы, с. 56-56
  • 
    • 2019 Insights into mechanisms for microtubule dynamic instability from computational analyses of tubulin protofilament mechanics
    • Fedorov V.A., Orekhov P.S., Kholina E.G., Zhmurov A.A., Ataullakhanov F.I., Gudimchuk N.
    • в сборнике EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, издательство SPRINGER/PLENUM PUBLISHERS (233 SPRING ST, NEW YORK, USA, NY,10013), том 48, тезисы, с. 95-95
  • • 2019 Modeling of interactions of proteins participating in hydrogen production
    • Alexandra Diakonova, Sergey Khruschev, Vladimir Fyodorov, Galina Riznichenko
    • в сборнике 10th International Conference “Photosynthesis and Hydrogen Energy Research for Sustainability-2019", June 23 – 28, 2019, Saint Petersburg, Russia, Abstracts, ISBN 978-5-4386-1743-3, место издания Komarov Botanical Institute of the Russian Academy of Sciences St. Petersburg, тезисы, с. 183-183
  • • 2019 Molecular dynamics modeling of tubulin protofilaments
    • Gudimchuk N.B., Fedorov V.A., Orekhov P.S., Kholina E.G., Zhmurov A.A., Ataullakhanov I B Kovalenko F.I.
    • в сборнике Математическое моделирование в биомедицине = Mathematical modelling in biomedicine : сборник тезисов, издательство Российский университет дружбы народов (РУДН) (Москва), тезисы, с. 38-38
  • • 2019 Molecular dynamics modeling of tubulin protofilaments
    • Gudimchuk N.B., Fedorov V.A., Orekhov P.S., Kholina E.G., Zhmurov A.A., Ataullakhanov F.I., Kovalenko I.B.
    • в сборнике Математическое моделирование в биомедицине = Mathematical modelling in biomedicine : сборник тезисов, издательство Российский университет дружбы народов (РУДН) (Москва), тезисы, с. 38-38
  • 
    • 2019 Prediction of Relaxed Conformations for Tubulin Dimers: from Cryo- Electron Microscopy to Molecular Dynamics
    • Fedorov Vladimir A., Orekhov Philipp S., Kholina Ekaterina G., Kovalenko Ilya B., Gudimchuk Nikita B.
    • в сборнике International Journal of Biomedicine, серия Supl.1, место издания International Medical Research and Development Corporation New York, United States, том 9, тезисы, с. s7-s8 DOI
  • • 2019 The electron-transport protein-protein complex formation of plastocyanin and cytochrome f of higher plants, green alga and cyanobacteria
    • Fedorov V.A., Khrushchev S.S., Ustinin D.M., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в сборнике Математическое моделирование в биомедицине = Mathematical modelling in biomedicine : сборник тезисов, издательство Российский университет дружбы народов (РУДН) (Москва), тезисы, с. 33-33
  • • 2019 Анализ взаимодействия кинетохорного комплекса NDC80 и микротрубочки методом молекулярно-динамических расчетов
    • Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 50-50
  • • 2019 Броуновские модели взаимодействия белков и белковых комплексов в фотосинтетических и митохондриальных энергопреобразующих мембранах
    • Ризниченко Г.Ю., Абатурова А.М., Браже Н.А., Коваленко И.Б., Фёдоров В.А., Хрущев С.С., Рубин А.Б.
    • в сборнике Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2019: материалы XIV международной научной конференции, г. Москва, 21-24 ноября 2019 г, место издания Москва-Севастополь, тезисы, с. 69-70
  • • 2019 Влияние НАДФ+ на стабилизацию комплекса ФД-ФНР. Молекулярно-динамическое исследование
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 96-96 DOI
  • • 2019 Исследование взаимодействия кинетохорного комплекса NDC80 и микротрубочки методом молекулярной динамики
    • Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 76-76 DOI
  • • 2019 Кинетические и многочастичные модели нелинейной регуляции процессов в водород выделяющих микроводорослях
    • Ризниченко Г.Ю., Плюсниина Т.Ю., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Рубин А.Б.
    • в сборнике Моделирование нелинейных процессов и систем. Сборник тезисов 4 международной научной конференции, место издания Янус-К Москва, тезисы, с. 164-166
  • • 2019 Многочастичное броуновское моделирование взаимодействий между ферредоксином и его белковыми партнерами
    • Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 64-64 DOI
  • • 2019 Моделирование взаимодействия ферредоксина и ферредоксин-НАДФ-редуктазы из разных фотосинтезирующих организмов
    • Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 35-35
  • • 2019 Моделирование образования комплекса белков цитохрома с и цитохрома с1 из млекопитающих и дрожжей методом броуновской динамики
    • Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Рубин А.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 28-28
  • • 2019 Модель броуновской динамики связывания белков дыхательной электрон-транспортной цепи цитохрома с и водорастворимой части цитохрома с1 в растворе
    • Абатурова А.М., Браже Н.А., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 40-40 DOI
  • • 2019 Молекулярно-динамическое моделирование конформационной подвижности ГТФ- и ГДФ-связанного тубулина
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Орехов Ф.С., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 70-71 DOI
  • • 2019 Молекулярное моделирование цитохромного bc1 комплекса с цитохромом с
    • Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 32-32
  • • 2019 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений, зеленой водоросли и цианобактерий
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 63-63
  • • 2019 Особенности формирования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f в высших растениях, зеленой водоросли и цианобактериях
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар Краснодар, том 2, тезисы, с. 144-145 DOI
  • • 2019 Построение крупнозернистой модели белка тубулина на основе траекторий молекулярной динамики
    • Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Жмуров А.А., Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 38-38
  • • 2019 Роль структурной организации цитохрома с1 в процессе образования комплекса между цитохромами с и с1
    • Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Сборник научных трудов VI Съезда биофизиков России (16.09.2019 - 21.09.2019), место издания ООО Полиграфическое объединение "Плехановец" Краснодар, том 1, тезисы, с. 52-53 DOI
  • • 2019 Сравнение конформационной подвижности ГТФ- и ГДФ-связанного тубулина с использованием метода молекулярной динамики
    • Древаль В.Д., Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 26: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания Регулярная и хаотическая динамика Москва - Ижевск Ижевск, том 26, тезисы, с. 34-34
  • • 2018 Computer simulation of electron-transfer protein-protein complex formation in higer plants, green alga and cyanobacteria
    • Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в сборнике Abstracts of the 1st European Congress on Photosynthesis Research, ePS-1. A Marcus Wallenberg Symposium, место издания Uppsala, Sweden, тезисы
  • • 2018 Electron-transfer protein-protein complex formation in higher plants, green alga and cyanobacteria
    • Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.U., Rubin A.B.
    • в сборнике BIOMEMBRANES 2018. Book of Abstracts, место издания MIPT Dolgoprudny, тезисы, с. 157-157
  • • 2018 Electron-transfer protein-protein complex formation in higher plants, green alga and cyanobacteria
    • Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B.
    • в сборнике Journal of Bioenergetics and Biomembranes. BIOMEMBRANES 2018. Book of Abstracts, место издания Springer US, тезисы, с. 55-55
  • • 2018 Исследование процессов сборки и разборки микротрубочки комбинированным методом броуновской и молекулярной динамики
    • Древаль В.Д., Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ 25: Сборник научных тезисов, серия МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Москва-Ижевск, том 25, тезисы, с. 60-60
  • • 2018 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений и цианобактерий
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ: Сборник научных тезисов, серия 25, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Ижевск, том 1, тезисы, с. 79-79
  • • 2018 Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса ферредоксина и ферредоксин-НАДФ+ редуктазы из Zеа mays и гидрогеназы из Chlamydomonas reinhardtii
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ: Сборник научных тезисов, серия 25, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Ижевск, том 1, тезисы, с. 80-80
  • • 2018 Роль локальных электростатических зарядов на поверхности белков при моделировании образования предварительных комплексов методом броуновской динамики
    • Абатурова А.М., Фёдоров В.А., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. тезисы XXV международной конференции, серия 25, место издания R&G Dynamics Москва Москва, Ижевск, тезисы, с. 52-52
  • • 2017 Density based clustering of Brownian Dynamics trajectories reveals predominant energetically favorable orientations in protein-protein interactions
    • Khruschev S., Fedorov V., Kovalenko I.
    • в сборнике Mathematical Modeling and Computational Physics (MMCP'2017): Book of Abstracts of the International Conference (Dubna, July 3-7, 2017), место издания JINR Dubna, тезисы, с. 119-120
  • 
    • 2017 Electron-transfer protein-protein complex formation in higer plants and cyanobacteria
    • Vladimir Fedorov, Sergei Khruschev, Ilya Kovalenko, Galina Riznichenko, Andrei Rubin
    • в сборнике Book of Abstracts International symposium Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences 2017, тезисы, с. 25-26
  • • 2017 Simulation of binding mechanism of plastocyanin and cytochrome f proteins
    • Ilya Kovalenko, Vladimir Fedorov, Sergey Khruschev
    • в сборнике Programme and Book of abstracts 17th Congress of the European Society for Photobiology, место издания Compano snc Pisa, Italy, тезисы, с. 92-92
  • • 2017 Исследование конформации ГТФ-тубулина и ее роли для полимеризации микротрубочки
    • Гудимчук Н.Б., Орлова М.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ: Сборник научных тезисов, серия 24, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Ижевск, том 1, тезисы, с. 30-30
  • • 2017 Роль электростатических взаимодействий в формировани электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерии P. laminosum
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ: Сборник научных тезисов, серия 24, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Ижевск, том 1, тезисы, с. 57-57
  • • 2016 Computer simulation of complex formation between plastocyanin and cytochrome f
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С.
    • в сборнике Abstracts of Satellite Meeting of the 17th International Congress on Photosynthesis Research, место издания Arnhem, the Netherlands, тезисы, с. 22-22
  • • 2016 Evolution of metastable states in the process of plastocyanin and cytochrome f complex formation
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Book of Abstracts of 7th International Conference “Photosynthesis Research for Sustainability", место издания Pushchino, Russia, тезисы, с. 64-64
  • • 2016 Plastocyanin and cytochrome f protein-protein complex formation: simulation of binding mechanism
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С.
    • в сборнике International symposium KSCMBS-2016. Khudjant symposium on computational materials and biological sciences, серия SCMBS symposiums, место издания Khujand Khujand, том 10, тезисы, с. 52-53
  • • 2016 Анализ механизмов взаимодействия фотосинтетических белков методами молекулярного моделирования
    • Рубин А.Б., Хрущев С.С., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Сборник тезисов Первого российского кристаллографического конгресса, Москва, ВДНХ, 21-26 ноября 2016 г, место издания ООО "НП-Принт" СПб, тезисы, с. 257-258
  • • 2016 Идентификация взаимного расположения пары белков пластоцианина и цитохрома f, соответствующего состоянию функционально-активного комплекса
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование. Сборник научных тезисов. Выпуск 23, место издания НИЦ РХД г.Ижевск, тезисы, с. 36-36
  • • 2016 Изучение белок-белковых взаимодействий методами компьютерного моделирования
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Сборник тезисов Первого российского кристаллографического конгресса, Москва, ВДНХ, 21-26 ноября 2016 г, место издания ООО "НП-Принт" СПб, тезисы, с. 206-206
  • • 2016 Особенности формирования электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерий
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Сборник тезисов Первого российского кристаллографического конгресса, Москва, ВДНХ, 21-26 ноября 2016 г, место издания ООО "НП-Принт" СПб, тезисы, с. 263-263
  • • 2016 Эволюция метастабильных состояний при образовании комплекса электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А.
    • в сборнике Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2016» [Электронный ресурс], серия Биология, место издания МАКС Пресс Москва, тезисы
  • • 2016 Электростатические взаимодействия электронтранспортных белков в процессе диффузионного сближения
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания АНО НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика" Ижевск, том 23, тезисы, с. 23-23
  • • 2015 Intermediate states in the process of complex formation of proteins plastocyanin and cytochrome f
    • Kovalenko I.B., Fedorov V.A., Khrushchev S.S.
    • в сборнике The 4th IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems. Program and Abstracts. August 31-September 2, 2015, место издания Nagoya University, Japan Nagoya, Japan, тезисы, с. 10-10
  • • 2015 Исследования белок-белковых взаимодействий объединенным методом броуновской и молекулярной динамики
    • Федоров В.А.
    • в сборнике XXII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2015", серия Секция «Биология», место издания МАКС Пресс Москва, том 13, тезисы
  • • 2015 Кинетические параметры образования белок-белковых комплексов пластоцианина и цитохрома f и их связь с электростатическими взаимодействиями между белками
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Материалы докладов V съезда биофизиков России, серия Биофизика сложных систем, место издания Ростов на Дону, Южный федеральный университет, том 2, тезисы, с. 331-331
  • • 2015 Объединенный метод броуновской и молекулярной динамики для исследования белок-белковых взаимодействий
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование. Тезисы 22 международной конференции, г. Пущино, 26-31 января 2015 г, место издания Регулярная и хаотическая динамика М.-Ижевск, том 22, тезисы, с. 53-53
  • • 2015 Промежуточные состояния при образовании электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Материалы докладов V съезда биофизиков России, серия Структура и динамика белков и их комплексов, место издания Ростов на Дону, Южный федеральный университет Ростов на Дону Ростов на Дону, том 1, тезисы, с. 123-123
  • • 2015 Роль конформационных изменений в молекулах белков пластоцианина и цитохрома f в кинетике их связывания / Математика
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование. Тезисы 22 международной конференции, г. Пущино, 26-31 января 2015 г, место издания Регулярная и хаотическая динамика М.-Ижевск, том 22, тезисы, с. 54-54
  • • 2014 Алгоритмы разрешения столкновений в методе многочастичной броуновской динамики
    • Хрущев С.С., Устинин Д.М., Федоров В.А., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М.-Ижевск, том 21, тезисы, с. 168-168
  • • 2014 Молекулярное моделирование процесса образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М.-Ижевск, том 21, тезисы, с. 29-29
  • • 2014 Молекулярное моделирование процесса образования комплекса белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике XXI Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов-2014". 7-11 апреля, серия Биология, место издания МАКС ПРЕСС Москва, том 1, тезисы, с. 44-45
    • редактор Стриж Ирина Георгиевна
  • 
    • 2013 Computer simulation of intermolecular complex formation of electron transport proteins
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С.
    • в сборнике 1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences, место издания Waseda University Токио, Япония, тезисы, с. 8-8
  • • 2013 Computer simulation of intermolecular complex formation of photosynthetic electron transport proteins plastocyanin and cytochrome f
    • Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khrushchev S.S.
    • в сборнике International Workshop "Computational and Theoretical Modeling of Biomolecular Interactions", место издания Institute of Computer Science Moscow-Izhevsk, тезисы, с. 22-24
  • • 2013 Компьютерное моделирование образования белок-белковых комплексов на примере электрон транспортных белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А.
    • в сборнике Тезисы докладов XX Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых ЛОМОНОСОВ-2013, серия секция "БИОЛОГИЯ", место издания МАКС Пресс, Москва, тезисы, с. 42-43
    • редакторы Брюханов Андрей Леонидович, Стриж Ирина Георгиевна, Темерева Елена Николаевна
  • • 2013 Молекулярная реконструкция процесса образования белок – белковых комплексов фотосинтетических электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
    • в сборнике Тезисы докладов Молодежной научно-практической конференции «Биофизика биоэнергетических процессов», посвященная столетию академика А.А. Красновского, г. Звенигород, 24–27 октября 2013 г, тезисы, с. 19-19
  • • 2013 Оценка роли электростатических взаимодействий в образовании диффузионно-столкновительных комплексов белков методом многочастичной броуновской динамики
    • Хрущев С.С., Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Устинин Д.М., Зленко Д.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Современные проблемы биофизики сложных систем.информационно-образовательные процессы. Материалы докладов Международной научно-методической конференции, место издания г.Воронеж, тезисы, с. 84-87
  • • 2013 Расчет кинетики образования комплекса пластоцианина с цитохромом f методом молекулярной динамики
    • Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б.
    • в сборнике Математика. Компьютер. Образование, место издания Регулярная и хаотическая динамика М. - Ижевск, тезисы, с. 38-38
  • • 2012 Computer simulation of protein-protein complex formation by Brownian and molecular dynamics
    • Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С., Золотарева Н.В.
    • в сборнике Тезисы 15-й Международной научной конференции MOGRAN 15 «Современный Групповой Анализ», тезисы
  • • 2012 Изучение механизмов межмолекулярного взаимодействия при образовании белок - белковых комплексов методами молекулярной и броуновской динамики
    • Федоров В.А., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Хрущев С.С., Ризниченко Г.Ю.
    • в сборнике Сборник тезисов IV Съезда биофизиков России, место издания Нижний Новгород, тезисы, с. 297-297

• НИРы

  • • 27 февраля 2020 - 31 декабря 2022 Системный анализ динамики воздействия тяжелых металлов на фотосинтетический электронный транспорт у высших растений
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Рубин А.Б. Ответственные исполнители: Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маторин Д.Н., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Тодоренко Д.А., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2020 - 31 декабря 2022 Системный анализ динамики воздействия тяжелых металлов на фотосинтетический электронный транспорт у высших растений
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маторин Д.Н., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Тодоренко Д.А., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 14 января 2019 - 31 декабря 2021 Взаимодействие подвижных белков-переносчиков электрона: от структуры к функции
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Антал Т.К., Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Холина Е.Г., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2018 - 31 декабря 2018 Проект организации симпозиума "Биофизика сложных систем: вычислительная и системная биология, молекулярное моделирование, медицинская биофизика" в рамках XXV Международной конференции "Математика. Компьютер. Образование"
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Нестеренко А.М., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Федоров В.А., Фурсова П.В., Хрущев С.С.
  • • 1 июля 2017 - 30 июня 2020 Рациональная разработка анти-митотиков для подавления пролиферации клеток опухолей
    • Физический факультет
    • Руководитель: Гудимчук Н.Б. Участники НИР: Аржаник В.К., Коваленко И.Б., Коршунова А.В., Костарев А.В., Лопанская Ю.Н., Макаров Г.И., Мустяца В.В., Орлова М.В., Романов А.Н., Федоров В.А.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2019 Анализ разнонаправленных электронных потоков в микроводорослях при производстве водорода
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Волгушева А.А., Дегтерева Н.С., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 1 января 2017 - 31 декабря 2017 Проект организации Симпозиума с международным участием «Биофизика сложных систем. Молекулярное моделирование. Системная биология. Процессы самоорганизации» в рамках XXIV Международной конференции «Математика. Компьютер. Образование» г.Пущино, 23 -28 января 2017 г
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Ответственные исполнители: Плюснина Т.Ю., Ризниченко Г.Ю., Хрущев С.С. Участники НИР: Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Устинин Д.М., Федоров В.А., Фурсова П.В.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Физико-химические механизмы и математическое моделирование биологических процессов
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Ризниченко Г.Ю. Участники НИР: Абатурова А.М., Беляева Н.Е., Гусева В.В., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Плюснина Т.Ю., Соколов Д.В., Устинин Д.М., Федоров В.А., Фролов А.Е., Фурсова П.В., Холина Е.Г., Хрущев С.С.
  • • 9 февраля 2015 - 31 декабря 2017 Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях.
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Воронова Е.Н., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Конюхов И.В., Лукашев Е.П., Сьянова Д.П., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 20 января 2015 - 31 декабря 2017 Программная система параллельного моделирования процессов в биомембранах на гибридных архитектурах
    • Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук"
    • Руководитель: Устинин Д.М. Ответственные исполнители: Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 6 марта 2014 - 31 декабря 2015 Изучение влияния ионного состава среды и водного окружения на скорость взаимодействия белков фотосинтетического аппарата методами броуновской и молекулярной динамики
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Дьяконова А.Н. Участники НИР: Зленко Д.В., Сьянова Д.П., Федоров В.А.
  • • 27 июня 2013 - 15 ноября 2013 Разработка научно-технических основ фотобиологических процессов в биоэнергетике» по теме: «Разработка научно-технических основ получения биоэнергоносителей из фототрофных микроорганизмов в фотобиореакторе
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Рубин А.Б. Участники НИР: Антал Т.К., Воронова Е.Н., Горячев С.Н., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Конюхов И.В., Кренделева Т.Е., Кукарских Г.П., Маторин Д.Н., Плюснина Т.Ю., Погосян С.И., Ризниченко Г.Ю., Устинин Д.М., Федоров В.А., Яковлева О.В.
  • • 1 ноября 2012 - 31 декабря 2013 Программный комплекс для параллельного моделирования белок-белковых взаимодействий.
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Устинин Д.М. Участники НИР: Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Князева О.С., Коваленко И.Б., Мамонов П.А., Маслаков А.С., Федоров В.А., Хрущев С.С.
  • • 8 октября 2012 - 31 декабря 2013 Изучение кинетических характеристик белок-белкового взаимодействия методами компьютерного моделирования
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Коваленко И.Б. Участники НИР: Абатурова А.М., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Федоров В.А.
  • • 1 января 2001 - 31 декабря 2015 УСТОЙЧИВОСТЬ БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ И СИСТЕМ К ПОВРЕЖДАЮЩИМ ВОЗДЕЙСТВИЯМ ЛУЧЕВОЙ И НЕЛУЧЕВОЙ ПРИРОДЫ
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Кудряшов Ю.Б. Участники НИР: Ахалая М.Я., Байжуманов А.А., Гиоргиевская А.М., Деев Л.И., Клементьев К.Е., Мазитова Н.З., Пархоменко И.М., Пирутин С.К., Платонов А.Г., Трофимова Л.К., Федоров В.А., Ярошевич И.А.

• Диссертация

  • • 2019 Молекулярное моделирование образования комплексов электрон-транспортных белков пластоцианина и цитохрома f
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (физ.-мат. науки)
    • Автор: Федоров Владимир Андреевич, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научные руководители: Рубин Андрей Борисович, д.б.н., проф., член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова, Коваленко Илья Борисович, д.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете МГУ.03.02 МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • Организация, в которой выполнялась работа: МГУ имени М.В.Ломоносова
    • Оппоненты: Полежаев Андрей Александрович, Хренова Мария Григорьевна, Шайтан Алексей Константинович
    • Объявление о защите

• Преподавание учебных курсов

  • • с 1 сентября 2015 Биоинформатика и математическое моделирование в биологии
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • обязательная, базовой части, семинары, 48 часов
  • • с 1 октября 2014 Биофизика (практикум по биофизическим методам)
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • обязательная, базовой части, лабораторные занятия, 54 часов

---