ИСТИНА

Ульянов Сергей Владимирович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра молекулярной биологии, ведущий научный сотрудник, с 13 июня 2016

кандидат биологических наук с 2013 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Разин С.В., Khrameeva E., Галицына А.А., Гельфанд М.С., Гаврилов А.А., Кос П.И., Логачёва М.Д., Чертович А.В., Шевелёв Ю.Я., Tyakht A.V., Васецкий Е.С., Flyamer I.M., Golov A.K. показать полностью..., Magnitov M., Яровая О.В., Mikhaleva E., Кантидзе О.Л., Пенин А.А., Половников К.Е., Gavrilov A., Ioudinkova E.S., Luzhin A., Васильев П.А., Гущанская Е.С., Захарова В.В., Doronin S.A., Imakaev M.V., Kalabusheva E.P., Luzhin A., Solovyev M., Starchikov S.S., Величко А.К., Гаврилов А.А., Гараев А.К., Иванова В.И., Ильин А.А., Ковина А.П., Лужин А.О., Ненашева В.В., Нечаев С.К., Флямер И.М., Юдинкова Е.С., Abdennur N.A., Abramov Y.A., Alexeyevsky D., Belyakin S.N., Del Maestro L., Egorova T., Gavrikov A.S., Gebhard A., Germini D., Glentis A., Gorsky A., Gruning B., Joliot V., Kulaeva O.I., Mège R., Nechaev S.K., Nizovtseva E., Olenkina O.M., Onichtchouk D., Petrova N.V., REVEL-MUROZ A., Rosenblatt M., SONETS I., Shafranskaya D., Shevelyov Y., Slimane A., Sobolev A.M., Tachibana-Konwalski K., Tolstoganov I., Tsoy O.L., Vincendon M., Williart A., Zakharova V.S., Zotova E., Акопов С.Б., Артемов А.В., Артемов А.А., Артемов А.В., Белобородова Н.В., Белякин С.Т., Виндюрин А.С., Вьюшков В.С., Герасимов Е.С., Горлова А.В., Дейкин А.В., Жарикова А.А., Карпухина А.А., Киреев И.И., Кононова А.А., Котов А.А., Лактионов П.П., Логачёва М.Д., Ломов Н.А., Максимов Д.А., Миронов А.А., Мишин А.С., Нечаев С.К., Николаев Л.Г., Овсянникова Н.Л., Поликанов Ю.С., Поликарпова А.В., Решетов Д.А., Рубцов М.А., Свердлов Е.Д., Сидорова М.К., Студитский В.М., Черневская Е.А., Шлом В., Штомпель А.С., гаврилов а.а.

51 статья, 1 книга, 33 доклада на конференциях, 7 тезисов докладов, 7 НИР, 5 наград, 1 диссертация, 10 дипломных работ, 3 курсовые работы, 2 учебных курса, 1 выступление в СМИ

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 738, Scopus: 749
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 1616729

ResearcherID: A-4980-2014

Scopus Author ID: 54586135200

ORCID: 0000-0002-6187-310X

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2022 Comparison of genome architecture at two stages of male germline cell differentiation in Drosophila
    • Ilyin Artem A., Kononkova Anna D., Golova Anastasia V., Shloma Viktor V., Olenkina Oxana M., Nenasheva Valentina V., Abramov Yuri A., Kotov Alexei A., Maksimov Daniil A., Laktionov Petr P., Pindyurin Alexey V., Galitsyna Aleksandra A., Ulianov Sergey V., Khrameeva Ekaterina E., Gelfand Mikhail S., Belyakin Stepan N., Razin Sergey V., Shevelyov Yuri Y.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 50, № 6, с. 3203-3225 DOI
  • • 2022 Dosage Compensation in Drosophila: Its Canonical and Non-Canonical Mechanisms
    • Shevelyov Yuri Y., Ulianov Sergey V., Gelfand Mikhail S., Belyakin Stepan N., Razin Sergey V.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 18, с. 10976 DOI
  • 
    • 2022 Genome-Directed Cell Nucleus Assembly
    • Razin Sergey V., Ulianov Sergey V.
    • в журнале Biology, издательство MDPI Publishing (Basel, Switzerland, Switzerland), том 11, № 5, с. 708 DOI
  • 
    • 2022 Hi-C Metagenomics in the ICU: Exploring Clinically Relevant Features of Gut Microbiome in Chronically Critically Ill Patients
    • Ivanova Valeriia, Chernevskaya Ekaterina, Vasiluev Petr, Ivanov Artem, Tolstoganov Ivan, Shafranskaya Daria, Ulyantsev Vladimir, Korobeynikov Anton, Razin Sergey V., Beloborodova Natalia, Ulianov Sergey V., Tyakht Alexander
    • в журнале Frontiers in microbiology, издательство Frontiers Research Foundation (Switzerland), том 12 DOI
  • 
    • 2022 Pentad: a tool for distance-dependent analysis of Hi-C interactions within and between chromatin compartments
    • Magnitov Mikhail D., Garaev Azat K., Tyakht Alexander V., Ulianov Sergey V., Razin Sergey V.
    • в журнале BMC Bioinformatics, издательство BioMed Central (London), том 23, № 1, с. 1-8 DOI
  • 
    • 2022 Pluripotency factors determine gene expression repertoire at zygotic genome activation
    • Gao M., Veil M., Rosenblatt M., Riesle A.J., Gebhard A., Hass H., Buryanova L., Yampolsky L., Gruning B., Ulianov S.V., Timmer J., Onichtchouk D.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 13, с. 1-19 DOI
  • 
    • 2022 Recurrent Translocations in Topoisomerase Inhibitor-Related Leukemia Are Determined by the Features of DNA Breaks Rather Than by the Proximity of the Translocating Genes
    • Lomov N.A., Viushkov V.S., Ulianov S.V., Gavrilov A.A., Alexeyevsky D.A., Artemov A.A., Razin S.V., Rubtsov M.A.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23 DOI
  • 
    • 2022 SETDB1 fuels the lung cancer phenotype by modulating epigenome, 3D genome organization and chromatin mechanical properties
    • Zakharova Vlada V., Magnitov Mikhail D., Del Maestro Laurence, Ulianov Sergey V., Glentis Alexandros, Uyanik Burhan, Williart Alice, Karpukhina Anna, Demidov Oleg, Joliot Veronique, Vassetzky Yegor S., Mège René-Marc, Piel Matthieu, Razin Sergey V., Ait-Si-Ali Slimane
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), с. 1-25 DOI
  • 
    • 2022 Сегрегация кластеров α- и β-глобиновых генов в ходе эволюции позвоночных – случайность или закономерность?
    • Яровая О.В., Ульянов С.В., Юдинкова Е.С., Разин С.В.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 87, № 9, с. 1301-1317 DOI
  • 
    • 2021 LASCA: loop and significant contact annotation pipeline
    • Luzhin Artem V., Golov Arkadiy K., Gavrilov Alexey A., Velichko Artem K., Ulianov Sergey V., Razin Sergey V., Kantidze Omar L.
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), № 11, с. 6361 DOI
  • 
    • 2021 Order and stochasticity in the folding of individual Drosophila genomes
    • Ulianov Sergey V., Zakharova Vlada V., Galitsyna Aleksandra A., Kos Pavel I., Polovnikov Kirill E., Flyamer Ilya M., Mikhaleva Elena A., Khrameeva Ekaterina E., Germini Diego, Logacheva Mariya D., Gavrilov Alexey A., Gorsky Alexander S., Nechaev Sergey K., Gelfand Mikhail S., Vassetzky Yegor S., Chertovich Alexander V., Shevelyov Yuri Y., Razin Sergey V.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 12, № 1 DOI
  • 
    • 2021 Perspectives for the reconstruction of 3D chromatin conformation using single cell Hi-C data
    • Kos PI, Galitsyna AA, Ulianov SV, Gelfand MS, Razin SV, Chertovich AV
    • в журнале PLoS Computational Biology, издательство Public Library of Science (United States), том 17, № 11, с. e1009546 DOI
  • 
    • 2021 Suppression of liquid–liquid phase separation by 1,6-hexanediol partially compromises the 3D genome organization in living cells
    • Ulianov Sergey V., Velichko Artem K., Magnitov Mikhail D., Luzhin Artem V., Golov Arkadiy K., Ovsyannikova Natalia, Kireev Igor I., Gavrikov Alexey S., Mishin Alexander S., Garaev Azat K., Tyakht Alexander V., Gavrilov Alexey A., Kantidze Omar L., Razin Sergey V.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2021 The two waves in single-cell 3D genomics
    • Ulianov Sergey V., Razin Sergey V.
    • в журнале Seminars in Cell and Developmental Biology, издательство Academic Press (United States) DOI
  • 
    • 2020 Benchmark of software tools for prokaryotic chromosomal interaction domain identification
    • Magnitov Mikhail D., Kuznetsova Veronika S., Ulianov Sergey V., Razin Sergey V., Tyakht Alexander V.
    • в журнале Bioinformatics, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2020 Divide and Rule: Phase Separation in Eukaryotic Genome Functioning
    • Razin S.V., Ulianov S.V.
    • в журнале Cells, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 9, № 11 DOI
  • 
    • 2020 Non-backtracking walks reveal compartments in sparse chromatin interaction networks
    • Polovnikov K., Gorsky A., Nechaev S., Razin S.V., Ulianov S.V.
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 10, № 1 DOI
  • 
    • 2020 Studying RNA-DNA interactome by Red-C identifies noncoding RNAs associated with various chromatin types and reveals transcription dynamics
    • Gavrilov AA, Zharikova AA, Galitsyna AA, Luzhin AV, Rubanova NM, Golov AK, Petrova NV, Logacheva MD, Kantidze OL, Ulianov SV, Magnitov MD, Mironov AA, Razin SV
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 48, № 12, с. 6699-6714 DOI
  • 
    • 2019 3D геномика
    • Разин С.В., Ульянов С.В., Гаврилов А.А.
    • в журнале Молекулярная биология, том 53, № 6, с. 911-923 DOI
  • 
    • 2019 C-TALE, a new cost-effective method for targeted enrichment of Hi-C/3C-seq libraries
    • Golov Arkadiy K., Ulianov Sergey V., Luzhin Artem V., Kalabusheva Ekaterina P., Kantidze Omar L., Flyamer Ilya M., Razin Sergey V., Gavrilov Alexey A.
    • в журнале Methods, издательство Academic Press (United States), с. 1-32 DOI
  • 
    • 2019 CRISPR/Cas9-generated mouse model of Duchenne muscular dystrophy recapitulating a newly identified large 430 kb deletion in the human DMD gene
    • Egorova TV, Zotova ED, Reshetov DA, Polikarpova AV, Vassilieva SG, Vlodavets DV, Gavrilov AA, Ulianov SV, Buchman VL, Deykin AV
    • в журнале DMM Disease Models and Mechanisms, издательство The Company of Biologists Ltd. (United Kingdom), том 12, № 4 DOI
  • 
    • 2019 Nuclear lamina integrity is required for proper spatial organization of chromatin in Drosophila
    • Ulianov Sergey V., Doronin Semen A., Khrameeva Ekaterina E., Kos Pavel I., Luzhin Artem V., Starikov Sergei S., Galitsyna Aleksandra A., Nenasheva Valentina V., Ilyin Artem A., Flyamer Ilya M., Mikhaleva Elena A., Logacheva Mariya D., Gelfand Mikhail S., Chertovich Alexander V., Gavrilov Alexey A., Razin Sergey V., Shevelyov Yuri Y.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), № 1176, с. 1-11 DOI
  • 
    • 2019 The Nuclear Lamina as an Organizer of Chromosome Architecture
    • Shevelyov Yuri Y., Ulianov Sergey V.
    • в журнале Cells, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 8, № 136, с. 1-13 DOI
  • 
    • 2018 Genetic and Epigenetic Mechanisms of β-Globin Gene Switching
    • Iarovaia O.V., Kovina A.P., Petrova N.V., Razin S.V., Ioudinkova E.S., Vassetzky Y.S., Ulianov S.V.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 4, с. 381-392 DOI
  • 
    • 2018 Quantitative differences in TAD border strength underly the TAD hierarchy in Drosophila chromosomes
    • Luzhin AV, Flyamer IM, Khrameeva EE, Ulianov SV, Razin SV, Gavrilov AA
    • в журнале Journal of Cellular Biochemistry, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States) DOI
  • 
    • 2018 Single-cell Hi-C discloses general principles of the individual genome folding in Drosophila
    • Zakharova VS, Galitsyna AA, Polovnikov KE, Khrameeva EE, Logacheva MD, Mikhaleva EA, Vassetzky ES, Gavrilov AA, Shevelev YY, Nechaev SK, Ulianov SV, Razin SV
    • в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, № Suppl 1, с. 65-66
  • 
    • 2018 Роль ядерной ламины в репрессии генов и в поддержании хромосомной архитектуры в ядре
    • Шевелев Ю.Я., Ульянов С.В.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 83, № 4
  • • 2017 3D-ГЕНОМИКА ПОМОГАЕТ ПОНЯТЬ, КАК РАБОТАЮТ НАШИ ГЕНЫ
    • Разин С.В., Ульянов С.В.
    • в журнале Коммерсантъ Наука, № 5, с. 25-27
  • 
    • 2017 Activation of the alpha-globin gene expression correlates with dramatic upregulation of nearby non-globin genes and changes in local and large-scale chromatin spatial structure
    • Ulianov Sergey V., Galitsyna Aleksandra A., Flyamer Ilya M., Golov Arkadiy K., Khrameeva Ekaterina E., Imakaev Maxim V., Abdennur Nezar A., Gelfand Mikhail S., Gavrilov Alexey A., Razin Sergey V.
    • в журнале Epigenetics and Chromatin, издательство BioMed Central (London), том 10, № 1, с. 35 DOI
  • 
    • 2017 Cамоорганизация хроматиновой фибриллы в топологически-ассоциированные домены
    • Разин С.В., Гаврилов А.А., Кос П., Ульянов С.В.
    • в журнале Биоорганическая химия, издательство Российская академия наук (Москва), том 43, № 2, с. 115-123 DOI
  • • 2017 Evolution of the genome 3D organization: comparison of fused and segregated globin gene clusters
    • Kovina AP, Petrova NV, Gushchanskaya ES, Dolgushin KV, Gerasimov ES, Galitsyna AA, Penin AA, Flyamer IM, Ioudinkova ES, Gavrilov AA, Vassetzky YS, Ulianov SV, Iarovaia OV, Razin S.V.
    • в журнале Molecular Biology and Evolution, издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2017 Gene functioning and storage within a folded genome
    • Razin S.V., Ulianov S.V.
    • в журнале Cellular and Molecular Biology Letters, издательство University of Wroclaw (Poland), том 22, с. 18 DOI
  • 
    • 2017 Single-cell Hi-C bridges microscopy and genome-wide sequencing approaches to study 3D chromatin organization
    • Ulianov Sergey V., Kikue Tachibana-Konwalski, Razin Sergey V.
    • в журнале BioEssays, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 39, с. 1-8 DOI
  • 
    • 2017 Single-nucleus Hi-C reveals unique chromatin reorganization at oocyte-to-zygote transition
    • Flyamer Ilya M., Gassler Johanna, Imakaev Maxim, Brandão Hugo B., Ulianov Sergey V., Abdennur Nezar, Razin Sergey V., Mirny Leonid A., Tachibana-Konwalski Kikuë
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 544, с. 110-114 DOI
  • 
    • 2016 Active chromatin and transcription play a key role in chromosome partitioning into topologically associating domains
    • Ulianov SV, Khrameeva EE, Gavrilov AA, Flyamer IM, Kos P., Mikhaleva EA, Penin AA, Logacheva MD, Imakaev MV, Chertovich A., Gelfand MS, Shevelyov YY, Razin SV
    • в журнале Genome Research, издательство Cold Spring Harbor Laboratory Press (United States), том 26, с. 70-84 DOI
  • 
    • 2016 Lamina–associated chromatin in the context of the mammalian genome folding
    • Ulianov S.V., Shevelyov Y.Y., Razin S.V.
    • в журнале Biopolymers and Cell, издательство Naukova Dumka (Ukraine), том 32, № 5, с. 327-333
  • • 2016 Topologically associating domains: gene warehouses adapted to serve transcriptional regulation
    • Razin S.V., Gavrilov A.A., VASSETZKY Y.S., Ulianov S.V.
    • в журнале Transcription, издательство Landes Bioscience (United States) DOI
  • 
    • 2016 Unraveling the mechanisms of chromatin fibril packaging
    • Gavrilov AA, Shevelyov YY, Ulianov SV, Khrameeva EE, Kos P., Chertovich A., Razin SV
    • в журнале Nucleus, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 7, № 3, с. 319-324 DOI
  • • 2016 Механизмы укладки хроматиновой фибриллы в топологически-ассоциированные домены
    • Ульянов С.В., Храмеева Е.К., Гаврилов А.А., Флямер И.М., Кос П., Михалева Е.А., Пенин А.А., Логачёва М.Д., Имакаев М.В., Чертович А., Гельфанд М.С., Шевелёв Ю.Я., Разин С.В.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 3-3
  • 
    • 2015 20 Active chromatin regions are sufficient to define borders of topologically associated domains in D. melanogaster interphase chromosomes
    • Khrameeva E.E., Ulyanov S.V., Gavrilov A.A., Shevelyov Y.Y., Gelfand M.S., Razin S.V.
    • в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 33, с. 11-12 DOI
  • 
    • 2015 Nuclear Compartments, Genome Folding, and Enhancer-Promoter Communication
    • Ulianov S.V., Gavrilov A.A., Razin S.V.
    • в журнале International review of cell and molecular biology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 315, с. 183-244 DOI
  • • 2015 Регуляторные элементы эукариотического генома, контролирующие транскрипцию
    • Разин С.В., Гаврилов А.А., Ульянов С.В.
    • в журнале Молекулярная биология, том 49, № 2, с. 212-223 DOI
  • 
    • 2014 The clustering of CpG islands may constitute an important determinant of the 3D organization of interphase chromosomes
    • Gushchanskaya ES, Artemov AV, Ulyanov SV, Logacheva MD, Penin AA, Kotova ES, Akopov SB, Nikolaev LG, Iarovaia OV, Sverdlov ED, Gavrilov AA, Razin SV
    • в журнале Epigenetics : official journal of the DNA Methylation Society, издательство Landes Bioscience (United States), том 9, № 7, с. 951-963 DOI
  • 
    • 2014 Пространственная организация генов домашнего хозяйства в интерфазных ядрах
    • Гущанская Е.С., Артемов А.А., Ульянов С.В., Пенин А.А., Логачева М.Д., Разин С.В., Гаврилов А.А.
    • в журнале Молекулярная биология, том 48, с. 1008-1018
  • • 2012 Distant activation of transcription: mechanism of enhancer action
    • Kulaeva O., Nizovtseva E., Polikanov Y., Ulianov S., Studitsky V.
    • в журнале Molecular and Cellular Biology, издательство American Society for Microbiology (United States)
  • 
    • 2012 Insulators in vertebrates: regulatory mechanisms and chromatin structure
    • Ulianov S.V., Markova E.N., Gavrilov A.A., Razin S.V.
    • в журнале Biopolymers and Cell, издательство Naukova Dumka (Ukraine), том 28, № 4, с. 252-260
  • 
    • 2012 Spatial organization of the chicken beta-globin gene domain in erythroid cells of embryonic and adult lineages
    • Ulyanov SV, Gavrilov AA, Razin SV
    • в журнале Epigenetics and Chromatin, издательство BioMed Central (London), том 5, № 1, с. 16 DOI
  • • 2012 Бета-глобиновые гены кур: модельная система для изучения регуляции транскрипции на уровне геномных доменов
    • Ульянов С.В., Гаврилов А.А.
    • в журнале Молекулярная биология, № 46, с. 683-698
  • • 2012 Домены альфа и бета-глобиновых генов кур в контексте структурно-функциональной организации эукариотического генома
    • Разин С.В., Ульянов С.В., Юдинкова Е.С., Гущанская Е.С., Гаврилов А.А., Яровая О.В.
    • в журнале Успехи биологической химии, том 52, с. 3-36
  • 
    • 2011 The inactivation of the Ï€ gene in chicken erythroblasts of adult lineage is not mediated by packaging of the embryonic part of the α-globin gene domain into a repressive heterochromatin-like structure
    • Ioudinkova E.S., Ulianov S.V., Bunina D., Iarovaia O.V., Gavrilov A.A., Razin S.V.
    • в журнале Epigenetics, том 6, № 12, с. 1481-1488 DOI
  • 
    • 2011 [Patterns of the histone modifications across the chicken alpha-globin genes domain]
    • Iudinkova E.S., Bunina D.A., Ul’ianov S.V., Gavrilov A.A., Razin S.V.
    • в журнале Молекулярная биология, том 45, № 4, с. 662-667 DOI

• Книги

  • • 2020 Human Interphase Chromosomes, chapter "Eukaryotic Genome in Three Dimensions"
    • Razin Sergey V., Gavrilov Alexey A., Ulianov Sergey V.
    • издательство Springer International Publishing (New York) , ISBN 978-3-030-62531-3 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2022 Ингибирование разделения фаз нарушает пространственную организацию хроматина (Устный)
    • Авторы: Ульянов С.В., Величко А.К., Магнитов М.Д., Лужин А.В., Голов А.К., Овсянникова Н., Киреев И.И., Гавриков А.С., Мишин А.С., Гараев А.К., Тяхт А.В., Гаврилов А.А., Кантидзе О.Л., Разин С.В.
    • III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов, Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
  • • 2022 3D-MAGS - SPATIAL CONFORMATIONS OF INDIVIDUAL MICROBIAL GENOMES RECONSTRUCTED FROM HI-C METAGENOMES (Устный)
    • Авторы: REVEL-MUROZ A., SOBOLEV A., SOLOVYEV M., VASILIEV P., ULIANOV S., IVANOVA V., TYAKHT A.
    • «Биоинформатика и системная биология регуляции и структуры геномов» BGRS/SB-2022, Новосибирск, Россия, 4-8 июля 2022
  • • 2021 SETDB1 fuels the lung cancer phenotype by modulating epigenome, 3D genome organization, and chromatin mechanical properties (Устный)
    • Авторы: Magnitov Mikhail D., Zakharova Vlada V., Del-Maestro Laurence, Ulianov Sergey V., Glentis Alexandros, Ulyanik Burhan, Williart Alice, Karpukhina Anna, Demidov Oleg, Joliot Veronique, Vassetzky Yegor S., Mège René-Marc, Piel Matthieu, Razin Sergey V., Ait-Si-Ali Slimane
    • Higher-Order Chromatin Architecture in Time and Space, онлайн, США, 15-17 ноября 2021
  • • 2021 Топология хроматина как фактор регуляции транскрипции: наблюдения в локусе кератиновых генов человека (Приглашенный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Конференция молодых учёных "Актуальные проблемы биологии развития", Москва, Россия, 12-14 октября 2021
  • • 2021 Single-cell анализ геномной архитектуры (Приглашенный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • ШКОЛЫ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ «Получение и анализ транскриптомных данных на уровне единичных клеток» (Single Cell анализ)», Москва, Россия, 7-8 октября 2021
  • • 2021 Трёхмерная геномика индивидуальных клеток (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • III Научно-практическая конференция "Секвенирование единичных клеток", Томск, Россия, 23-27 августа 2021
  • • 2021 Pentads: a novel pile-up analysis tool for assessing the alterations of chromatin compartments using Hi-C data (Приглашенный)
    • Авторы: Garaev Azat, Magnitov M.D., Ulianov S.V., Razin S.V.
    • Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB), Москва, Россия, 30 июля - 2 августа 2021, Skolkovo Insitute of Science and Technology, Moscow, Россия, 30 июля - 2 августа 2021
  • • 2021 Chromosome Conformation of the Hyperthermophilic Archaeon Thermofilum Adornatus (Устный)
    • Авторы: Sobolev A., Solovyev M., Ivanova V., Slepova T., Merkel A., Ulianov S., Tyakht A.
    • World Microbe Forum, online, June 20–24, 2021, Онлайн, США, 20-24 июня 2021
  • • 2020 Топологически ассоциированные домены: структурные и функциональные единицы генома (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ: Генетические технологии в фундаментальных и прикладных исследованиях, онлайн, Россия, 2-4 декабря 2020
  • • 2020 Single-nucleus Hi-C analysis of the Drosophila genome folding (Стендовый)
    • Авторы: Ульянов С.В., Разин С.В.
    • Emerging Technologies in Single Cell Research, https://hopin.com/events/emerging-technologies-in-single-cell-research, Бельгия, 19-21 ноября 2020
  • • 2020 Hi-C-assisted chromosome-scale scaffolding of genomes from beer and cider microbiome (Стендовый)
    • Авторы: Valeria Ivanova, Vasiliev Petr, Solovyev Mikhail, Ulianov Sergey, Tyakht Alexander
    • CSHL Microbiome, США, 20-23 октября 2020
  • • 2019 Исследование пространственной организации хроматина Dictyostelium discoideum (Устный)
    • Авторы: Ульянов С.В., Цой О., Храмеева Е.Е., Лужин А.Н., Галицина А., Стариков С.С., Гельфанд М.С., Разин С.В.
    • II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
  • • 2019 Chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data (Стендовый)
    • Авторы: Кос П.И., Галицына А.А., Ульянов Сергей Владимирович, Гельфанд М.С., Разин С.В., Чертович А.В.
    • EMBO Workshop: Chromatin and epigenetics, Хайдельберг, Германия, 1-4 мая 2019
  • • 2018 Nuclear lamina maintains global spatial organization of chromatin in Drosophila cultured cells (Устный)
    • Авторы: Ulianov SV, Khrameeva EE, Doronin S., Kos P., Luzhin A., Gelfand MS, Shevelyov YY, Razin SV
    • IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Мадрид, Испания, 3-6 декабря 2018
  • • 2018 Reconstruction of the chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data (Устный)
    • Авторы: Кос П.И., Галицына А.А., Чертович А.В., Гельфанд М.С., Разин С.В., Ульянов С.В.
    • IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Мадрид, Испания, 3-6 декабря 2018
  • • 2018 АНАЛИЗ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ОРГАНИЗАЦИИ ГЕНОМА В ИНДИВИДУАЛЬНЫХ КЛЕТКАХ (Пленарный)
    • Авторы: Захарова В.С., Галицина А.А., Половников К.Е., Ульянов С.В., Храмеева Е.Е., Логачева М.Д., Михалева Е.А., Васецкий Е.С., Гаврилов А.А., Нечаев С.К., Шевелев Ю.Я., Разин С.В.
    • V МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ “ПОСТГЕНОМ’2018”, Казань, Россия, 29 октября - 2 ноября 2018
  • • 2018 Nuclear lamina maintains global spatial organization of chromatin in Drosophila (Стендовый)
    • Авторы: Ulianov Sergey V., Doronin Semen A., Khrameeva Ekaterina E., Kos Pavel I., Logacheva Mariya D., Chertovich Alexander V., Razin Sergey V., Shevelyov Yuri Y.
    • EMBL Symposium: Principles of Chromosome Structure and Function, Гейдельберг, Германия, 5-8 сентября 2018
  • • 2018 SELF-ORGANIZATION OF DROSOPHILA CHROMATIN INTO TOPOLOGICALLY- ASSOCIATING DOMAINS (Приглашенный)
    • Авторы: Ulianov S.V., Khrameeva E.E., Zakharova V.S., Galitsyna A.A., Polovnikov K.E., Logacheva M.D., Mikhaleva E.A., Vassetzky E.S., Gavrilov A.A., Kos P., Chertovich A., Gelfand M.S., Shevelev Y.Y., Razin S.V.
    • ХРОМОСОМА 2018, Новосибирский Академгородок, Россия, 20-24 августа 2018
  • • 2018 Single-cell Hi-C discloses general principles of the individual genome folding in Drosophila (Приглашенный)
    • Авторы: Razin S.V., Zakharova V.S., Galitsyna A.A., Polovnikov K.E., Khrameeva E.E., Logacheva M.D., Mikhaleva E.A., Vassetzky E.S., Gavrilov A.A., Shevelev Y.Y., Nechaev S.K., Ulianov S.V.
    • The 43th FEBS Congress, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
  • • 2018 Как упаковка ДНК в ядре клетки управляет работой генов? (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Ломоносовские чтения - 2018, МГУ им .М.В. Ломоносова, Россия, 16-25 апреля 2018
  • • 2017 Adult and larval subloci of the zebrafish major alpha/beta-globin gene cluster possess different epigenetic state and spatial chromatin structure. (Стендовый)
    • Авторы: Gerasimov E.S., Kovina A.P., Petrova N.V., Razin S.V., Ulianov S.V., Iarovaia O.V., Galitsina A.A.
    • 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
  • • 2017 Dictyostelium discoideum chromosomes are partitioned into unstable globular domains (Стендовый)
    • Авторы: Khrameeva E., Razin S., Ulianov S., Bredikhin D., Gelfand M.
    • 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
  • • 2017 Histone acetylation drives the partitioning of the Drosophila chromosomes into topologically-associating domains (Устный)
    • Авторы: Ulianov Sergey V., Khrameeva Ekaterina E., Shevelyov Yuri Y., Razin Sergey V.
    • 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Израиль, 10-14 сентября 2017
  • • 2017 Методы исследования пространственной структуры хроматина (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Летняя школа по биоинформатике, Сколково, Россия, 25 августа - 4 сентября 2017
  • • 2017 Связь эволюции генома и пространственной организации на разных уровнях (от ТАД до точечных локусов) (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Летняя школа по биоинформатике, Сколково, Россия, 25 августа - 4 сентября 2017
  • • 2017 Топология генома в единичных клетках (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Летняя школа по биоинформатике, Сколково, Россия, 25 августа - 4 сентября 2017
  • • 2017 3D genomics - a new step in understanding of chromatin function (Устный)
    • Автор: Ulianov Sergey V.
    • BIOSS Seminar, Фрайбург, Германия, 11 июля 2017
  • • 2017 ORGANIZATION AND EVOLUTION OF VERTEBRATE ALPHA-GLOBIN GENE DOMAINS (Устный)
    • Авторы: Kovina A.P., Petrova N.V., Guschanskaya E.S., Galitsina A.A., Razin S.V., Gerasimov E.S., Vasetzky E.S., Ulianov S.V., Iarovaia O.V., Flyamer I.M.
    • 25th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus, Нижний Новгород, Россия, 19-22 июня 2017
  • • 2017 Трёхмерная структура хроматина - экспериментальные методы (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Школа-семинар по анализу данных, Учебный центр НИУ ВШЭ "Вороново", Россия, 6-9 мая 2017
  • • 2017 Регуляция экспрессии генов в норме и патологии. Роль топологических доменов хроматина (Устный)
    • Автор: Ульянов С.В.
    • Инновационные достижения и разработки в онкологии 2017, Москва, РОНЦ им. Н.Н. Блохина, Россия, 24-26 апреля 2017
  • • 2017 Studying chromosome partitioning into topologically associating domains via saturating interactions. (Устный)
    • Авторы: Кос П.И., Тамм М.В., Ульянов С.В., Гаврилов А.А., Разин С.В., Чертович А.В.
    • Multiscale Modelling and Experimental Approaches to Genome Organization, Les Houches, Франция, 2-7 апреля 2017
  • • 2016 Cell-type specific and transcription-related organization of TADs in and around the chicken alpha-globin gene domain (Стендовый)
    • Авторы: Ulianov Sergey V., Galitsyna Alexandra A., Flyamer Ilya M., Khrameeva Ekaterina E., Imakaev Maxim V., Abdennur Nezar A., Gelfand Mikhail S., Gavrilov Alexey A., Razin Sergey V.
    • Gordon Research Conference "Chromatin Structure and Function 2016", Les Diablerets, Швейцария, 22-27 мая 2016
  • • 2015 Epigenetic landscapes underlying partitioning of eukaryotic chromosomes into topologically associating domains (Устный)
    • Авторы: Khrameeva Ekaterina E., Ulianov Sergey V., Gavrilov Alexey A., Flyamer Ilya M., Pavel Kos, Mikhaleva Elena A., Penin Aleksey A., Logacheva Maria D., Imakaev Maxim V., Alexander Chertovich, Gelfand Mikhail S., Shevelyov Yuri Y., Razin Sergey V.
    • Symposium “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids”, Гиссен, Германия, 14-15 сентября 2015

• Тезисы докладов

  • • 2022 3D-MAGs – spatial conformations of individual microbial genomes reconstructed from Hi-C metagenomes
    • REVEL-MUROZ A., SOBOLEV A., SOLOVYEV M., VASILIEV P., ULIANOV S., IVANOVA V., TYAKHT A.
    • в сборнике The Thirteenth International Multiconference, издательство Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences (China), тезисы DOI
  • • 2022 Investigating bacterial and yeast diversity of spontaneous fermentation beer and cider using Hi-C metagenomics
    • SONETS I., IVANOVA V., VASILIEV P., ULIANOV S., SOLOVYEV M., TYAKHT A.
    • в сборнике The Thirteenth International Multiconference, издательство Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences (China), тезисы DOI
  • • 2022 ИССЛЕДОВАНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ ЛОКУСА КЕРАТИНОВЫХ ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА
    • Штомпель А.С., Сидорова М.К., Калабушева Е.П., Ульянов С.В., Разин С.В.
    • в сборнике Сборник тезисов IX Международной конференции молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков, место издания АНО "Инновационный центр Кольцово" Новосибирск, тезисы, с. 720-720
  • 
    • 2018 Nuclear lamina maintains global spatial organization of chromatin in Drosophila cultured cells
    • Ulianov Sergey V., Doronin Semen A., Khrameeva Ekaterina E., Kos Pavel I., Starikov Sergey S., Galitsyna Aleksandra A., Artem Luzhin, Gelfand Mikhail S., Chertovich Alexander V., Razin Sergey V., Shevelyov Yuri Y.
    • в сборнике 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), тезисы, с. 2493-2493 DOI
  • 
    • 2018 Reconstruction of the chromatin 3D conformation from single cell Hi-C data
    • Kos Pavel I., Galitsyna Aleksandra A., Ulianov Sergey V., Gelfand Mikhail S., Razin Sergey V., Chertovich Alexander V.
    • в сборнике 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), тезисы, с. 2476-2476 DOI
  • 
    • 2018 Single-cell Hi-C demonstrates that TADs are stable units of Drosophila genome folding that persist in individual cells
    • Zakharova Vlada S., Galitsyna Aleksandra A., Polovnikov Kirill E., Khrameeva Ekaterina E., Logacheva Mariya D., Mikhaleva Elena A., Vassetzky Egor S., Gavrilov Aleksey A., Shevelev Yuri Y., Nechaev Sergey K., Ulianov Sergey V., Razin Sergey V.
    • в сборнике 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), тезисы, с. 2494-2494 DOI
  • 
    • 2018 The chromatin structure of Dictyostelium discoideum
    • Olga Tsoy, Aleksandra Galitsyna, Ekaterina Khrameeva, Sergey Ulianov, Mikhail Gelfand, Sergey Razin
    • в сборнике 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), тезисы, с. 2492-2492 DOI

• НИРы

  • • 29 сентября 2021 - 31 декабря 2023 Новые системы и уровни редактирования геномов: от нуклеотидной последовательности к пространственной организации (биологический факультет)
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Студитский В.М. Ответственный исполнитель: Каменский П.А. Участники НИР: Армеев Г.А., Афонин Д.А., Багров Д.В., Балева М.В., Волох О.И., Вьюшков В.С., Галдина Г.В., Герасимов Е.С., Герасимова Н.С., Гилязова А.В., Глухов Г.С., Грибкова А.К., Замалутдинова С.В., Карлова М.Г., Карпова О.И., Кирпичников М.П., Князева А.С., Коровина А.Н., Левицкий С.А., Ломов Н.А., Любителев А.В., Малюченко Н.В., Маслакова А.А., Пиунова У.Е., Разин С.В., Рамонова А.А., Рубцов М.А., Соколова О.С., Станишнева-Коновалова Т.Б., Ульянов С.В., Феофанов А.В., Чичерин И.В., Шайтан А.К., Шайтан К.В.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2025 Хроматин как бионаносистема
    • Кафедра молекулярной биологии
    • Руководитель: Ульянов С.В. Участник НИР: Разин С.В.
  • • 9 августа 2019 - 30 июня 2022 Исследование влияния потенциальных эпигенетических лекарств на компартментализацию хроматина и энхансер-промоторные контакты в нормальных и опухолевых клетках человека
    • Кафедра молекулярной биологии
    • Руководитель: Ульянов С.В. Ответственный исполнитель: Ломов Н.А. Участник НИР: Кантидзе О.Л.
  • • 26 сентября 2018 - 19 декабря 2018 Исследование влияния ростовых факторов и неорганических добавок на пролиферативную активность и продуктивность стабильных клеточных линий млекопитающих, продуцентов терапевтических белков
    • Кафедра биофизики
    • Руководитель: Петрова Е.В. Ответственный исполнитель: Аргентова В.В. Участники НИР: Каменский П.А., Рамонова А.А., Рубцов М.А., Ульянов С.В., Шулепко М.А.
  • • 6 мая 2016 - 31 декабря 2018 Одновременный анализ трехмерной организации хроматина и его связи с ядерной оболочкой в единичных клетках
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Ульянов С.В. Участники НИР: Нефёдочкина А.В., Рубцов М.А.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Хроматин как бионаносистема
    • Кафедра молекулярной биологии
    • Руководитель: Ульянов С.В. Участники НИР: Захарова В.В., Ефимова В.С., Захарова В.В., Разин С.В.
  • • 1 января 2011 - 31 декабря 2015 хроматин как бионаносистема
    • Кафедра молекулярной биологии
    • Руководитель: Разин С.В. Участники НИР: Нефёдочкина А.В., Ульянов С.В.

• Награды и премии

  • • 2022 Премия Правительства Москвы молодым учёным
    • Лауреаты: Ульянов С.В., Гаврилов А.А., Лужин А.В.
    • Правительство Москвы, Россия
  • • 2022 Премия РАН имени А.А. Баева за выдающиеся работы в области геномики и геноинформатики
    • Лауреаты: Разин С.В., Гаврилов А.А., Ульянов С.В.
    • Российская Академия Наук, Россия
  • • 2020 Премия Европейской Академии
    • Лауреат: Ульянов Сергей Владимирович
    • Academia Europaea, Россия
  • • 2019 Академическая премия
    • Лауреат: Ульянов Сергей Владимирович
    • Российская академия наук, Россия
  • • 2017 Премия имени М.В. Ломоносова за научные работы
    • Лауреат: Ульянов Сергей Владимирович
    • МГУ им. М. В. Ломоносова, Россия

• Диссертация

  • • 2013 Роль пространственной организации геномного локуса в феномене переключения экспрессии глобиновых генов
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
    • Автор: Ульянов Сергей Владимирович, к.б.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Научный руководитель: Разин С.В., д.б.н., проф., член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 002.037.01 при ИБГ РАН

• Руководство дипломными работами

  • • 2022 Топология генома вируса Эпштейна- Барр и его взаимодействия с хроматином клетки-хозяина
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Гараев Азат Камилович (Бакалавр)
  • • 2022 Пространственная структура локуса кератиновых генов человека в ходе получения кератиноцитов из ипск
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Штомпель Анастасия Сергеевна (Магистр)
  • • 2022 Изменение архитектуры хроматина при шизофрении
    • Научные руководители: Храмеева Екатерина Евгеньевна, Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Базаревич Мария Валериевна (Магистр)
  • • 2021 РОЛЬ ЖИДКО-ЖИДКОСТНОГО РАЗДЕЛЕНИЯ ФАЗ В АРХИТЕКТУРЕ ИНТЕРФАЗНОГО ЯДРА
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Магнитов Михаил Дмитриевич (Магистр)
  • • 2021 Исследование пространственной организации локуса кератиновых генов человека
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Сидорова Маргарита Кирилловна (Бакалавр)
  • • 2021 Использование архитектурного белка CTCF с искусственным ДНК-связывающим доменом для модифицирования топологии генома
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Тюкачева Евгения Александровна (Магистр)
  • • 2021 ИССЛЕДОВАНИЕ ТОПОЛОГИИ МЕТАГЕНОМА МИКРОБНЫХ СООБЩЕСТВ
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Соловьёв Михаил Андреевич (Бакалавр)
  • • 2017 Поиск не идентифицированных энхансеров гена RUNX1 человека
    • Научный руководитель: Ульянов С.В.
    • Автор: Никитин Д.М. (Бакалавр)
  • • 2017 Анализ трехмерной структуры хроматина
    • Научные руководители: Гаврилов А.А., Храмеева Е.Е., Ульянов С.В., Разин С.В., Гельфанд М.С.
    • Автор: Галицына А.А. (Магистр)
  • • 2015 Анализ пространственной организации хроматина в ооцитах мыши методом Hi-C в отдельных клетках
    • Научные руководители: Ульянов Сергей Владимирович, Kikue Tachibana-Konwalski
    • Автор: Флямер И.М. (Специалист)

• Руководство курсовыми работами

  • • 2015 Картирование топологии хроматина методом Hi-C в семенниках дрозофилы
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Пирогова В.С. (Бакалавр)
  • • 2015 Анализ пространственной организации домена α-глобиновых генов человека на разных стадиях эритроидной дифференцировки методом 5С
    • Научный руководитель: Ульянов Сергей Владимирович
    • Автор: Ефимова В.А. (Бакалавр)
  • • 2014 Анализ пространственной организации интерфазного хроматина эмбриональных гемоцитов Drosophila melanogaster методом Hi-C
    • Научные руководители: Ульянов С.В., Гаврилов А.А.
    • Автор: Флямер Илья Михайлович (Специалист)

• Авторство учебных курсов

  • • 2021 Введение в общую молекулярную биологию
    • Автор: Ульянов Сергей Владимирович
  • • 2020 Геномика
    • Автор: Ульянов Сергей Владимирович

• Преподавание учебных курсов

  • • 6 сентября 2022 - 11 октября 2022 Введение в общую молекулярную биологию
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра молекулярной биологии
    • в ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России (государственная организация, университет, Россия)
    • обязательная, базовой части, лекции, 9 часов
  • • 7 сентября 2021 - 19 октября 2021 Введение в общую молекулярную биологию
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра молекулярной биологии
    • в Институт биологии гена РАН (государственная организация, институт, Россия)
    • обязательная, базовой части, лекции, 11 часов
  • • 13 февраля 2020 - 23 апреля 2020 Геномика
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра молекулярной биологии
    • обязательная, базовой части, лекции, 15 часов

• Выступление в СМИ

  • • 18 сентября 2019 г. Трёхмерная геномика (Научно-просветительский центр "Архэ")
    • Автор (участник): Ульянов Сергей Владимирович

---