Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИСТИНА ИНХС РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, возможность загрузки и скачивания файлов временно недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Варижук Анна Михайловна
пользователь
доктор химических наук с 2018 года
ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства», лаборатория искусственного антителогенеза, заведующий лабораторией
Соавторы:
Pozmogova G.E.
,
Tsvetkov V.B.
,
Aralov A.V.
,
Зацепин Т.С.
,
Позмогова Г.Е.
,
Субач О.М.
,
Субач Ф.В.
,
Анохин К.В.
,
Барыкина Н.В.
,
Петкевич К.
,
Manuvera V.A.
,
Turaev A.V.
,
Лагарькова М.А.
показать полностью...
,
Сотсков В.П.
,
Isaakova E.A.
,
Kaluzhny D.N.
,
Malyshev A.
,
Беляев Е.С.
,
Ениколопов Г.Н.
,
Клинов Д.В.
,
Плюснин В.В.
,
Korzhenevskiy D.
,
Nikolaeva A.
,
Tatarinova O.N.
,
Богомазова А.Н.
,
Власкина А.В.
,
Груздева А.М.
,
Ивашкина О.И.
,
Северов В.В.
,
Babenko V.V.
,
Basmanov D.
,
Boiko K.M.
,
Bolden D.S.
,
Fisunov G.Y.
,
Kharlampieva D.D.
,
Rakitina T.V.
,
Shpakovski G.V.
,
Smirnov I.P.
,
Баранов М.С.
,
Баринов Н.
,
Ведешина А.А.
,
Говорун В.М.
,
Дедков В.Г.
,
Ивлева О.А.
,
Козловская Л.И.
,
Костюкевич Ю.И.
,
Лазарев В.Н.
,
Подгорский В.В.
,
Сардушкин М.В.
,
Смирнов И.
,
Смирнов И.В.
,
Тимофеев А.В.
,
Флорентьев В.Л.
,
Ходарович Ю.М.
,
Шипулин Г.А.
,
Agapova Y.K.
,
Aseychev A.V.
,
Bespyatykh J.
,
Bobrovsky P.A.
,
Bogorodsky D.
,
Boldyreva D.I.
,
Borisova O.F.
,
Borshevsky V.I.
,
Bychkova A.V.
,
Cabrero C.
,
Chizhov A.O.
,
Chuvilin A.
,
Chuvilin A.N.
,
Croy R.G.
,
Dukova S.
,
Essigmann J.M.
,
Fedele T.
,
Gaifullina R.
,
Galiamina M.
,
González C.
,
Gospodaryk A.
,
Grafskaia E.
,
Grokhovsky S.L.
,
Gubina N.
,
June 2.
,
Khandazhinskaya A.
,
Khrulev A.A.
,
Klimina K.M.
,
Kovalchuk S.I.
,
Kozhemyako V.B.
,
Lazarenko V.A.
,
Lazarev V.
,
Lioznov D.
,
Markina N.
,
Matyushkina D.
,
Ogarkov O.
,
Pobeguts O.V.
,
Podgornyi O.V.
,
Portugues R.F.
,
Povarova N.
,
Pushkar D.Y.
,
Rakitina D.V.
,
Ryazantsev D.Y.
,
Shchyolkina A.K.
,
Solovieva S.Е.
,
Starikova О.V.
,
Svetlova J.
,
Vanyushkina A.
,
Vasiliev A.L.
,
Vlasenok M.A.
,
Volnukhin A.
,
Vyacheslav S.K.
,
You K.
,
Yusubalieva G.M.
,
Zaitsev S.
,
Zubov A.
,
komissarov
,
Азиева А.М.
,
Андрей Л.
,
Баклаушев В.П.
,
Балеева Н.С.
,
Баринов Н.
,
Баринов Н.В.
,
Бахиев А.Б.
,
Башкиров П.В.
,
Башлыкова Л.А.
,
Беспятых М.А.
,
Благонравова А.С.
,
Бойко К.М.
,
Васильева Л.А.
,
Ведехина Т.С.
,
Веселовский В.А.
,
Вишняков И.Е.
,
Власова О.А.
,
Галеева Ю.Р.
,
Гнучих Е.Ю.
,
Головин А.В.
,
Гущина Е.
,
Доронин Д.А.
,
Доронин Д.С.
,
Дубровин Е.В.
,
Евсютина Д.В.
,
Есипов Д.С.
,
Захаржевская Н.Б.
,
Зиганшин Р.Х.
,
Иванов К.А.
,
Ильина Е.Н.
,
Ишмухаметов А.З.
,
КОЛОНТАРЕВ К.Б.
,
Казеева А.А.
,
Кантидзе О.Л.
,
Кириллова Ю.Г.
,
Колышкина Н.А.
,
Кочетков С.Н.
,
Куницына Т.А.
,
Куропаткин А.Н.
,
Лазуткин А.А.
,
Лисицын Ф.В.
,
Манолов А.И.
,
Матюгина Е.С.
,
Мельник Д.М.
,
Мельник Д.М.
,
Минат В.Н.
,
Миропольская Н.А.
,
Михайлов С.Н.
,
Морозов М.О.
,
Мяснянко И.Н.
,
Новиков Р.А.
,
Новиков Р.А.
,
Орлова Е.Р.
,
Павленко А.В.
,
Патрушев М.В.
,
Петрунина А.А.
,
Попенко Н.Б.
,
Протопопова А.Д.
,
Прусаков К.А.
,
Румянцев А.Н.
,
Румянцев В.Г.
,
Румянцев С.С.
,
Самойлов А.С.
,
Семашко Т.А.
,
Скворцов Д.А.
,
Слепцова Ю.В.
,
Субач М.Ф.
,
Тевяшова А.Н.
,
Тимофеев Э.Н.
,
Трифонова Г.О.
,
Удалов Ю.П.
,
Уличев А.Г.
,
Фарзан В.М.
,
Хромов П.Г.
,
Чернова И.А.
,
Чефанова Е.С.
,
Широков Д.Д.
,
Широкова И.Ю.
,
Шитиков Е.А.
,
Штро А.А.
,
Шустова Е.Ю.
,
Юдин М.А.
,
Якубовская М.Г.
44 статьи
,
2 доклада на конференциях
,
1 тезисы доклада
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 358, Scopus: 369
IstinaResearcherID (IRID): 376484603
ResearcherID:
Y-7558-2019
Scopus Author ID:
26026701500
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Modeling G4s in chromatin context confirms partial nucleosome exclusion and reveals nucleosome-disrupting effects of the least selective G4 ligands
Pavlova Iuliia
,
Barinov Nikolay
,
Novikov Roman
,
Severov Vjacheslav
,
Iudin Mikhail
,
Vedekhina Tatiana
,
Larin Andrey
,
Babenko Vladislav
,
Aralov Andrey
,
Gnuchikh Evgeny
,
Sardushkin Makar
,
Klinov Dmitry
,
Tsvetkov Vladimir
,
Varizhuk Anna
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 204, с. 8-21
DOI
2022
16S rRNA gene sequencing data of the upper respiratory tract microbiome in the SARS-CoV-2 infected patients
Galeeva Julia
,
Babenko Vladislav
,
Bakhtyev Ramiz
,
Baklaushev Vladimir
,
Balykova Larisa
,
Bashkirov Pavel
,
Bespyatykh Julia
,
Blagonravova Anna
,
Boldyreva Daria
, Fedorov Dmitry, Gafurov Ilshat,
Gaifullina Raushaniya
, Galova Elena,
Gospodaryk Alina
,
Ilina Elena
,
Ivanov Konstantin
,
Kharlampieva Daria
,
Khromova Polina
,
Klimina Ksenia
,
Kolontarev Konstantin
,
Kolyshkina Nadezhda
, Koritsky Andrey,
Kuropatkin Vyacheslav
,
Lazarev Vasily
,
Manolov Alexander
,
Manuvera Valentin
,
Matyushkina Daria
,
Morozov Maxim
, Moskaleva Ekaterina, Musarova Varvara,
Ogarkov Oleg
,
Orlova Elizaveta
,
Pavlenko Alexander
, Petrova Alla,
Pozhenko Natalia
,
Pushkar Dmitry
,
Rumyantsev Alexander
,
Rumyantsev Sergey
,
Rumyantsev Vladimir
,
Rychkova Lyubov
,
Samoilov Alexander
,
Shirokova Irina
, Sinkov Vyacheslav,
Solovieva Svetlana
,
Starikova Elizaveta
, Tikhonova Polina,
Trifonova Galina
, Troitsky Alexander,
Tulichev Alexander
,
Udalov Yuri
,
Varizhuk Anna
,
Vasiliev Alexander
,
Veselovsky Vladimir
,
Vereshchagin Rinat
,
Volnukhin Alexey
,
Yusubalieva Gaukhar
,
Govorun Vadim
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 40, с. 107770
DOI
2022
7,8-Dihydro-8-oxo-1,N6-ethenoadenine: an exclusively Hoogsteen-paired thymine mimic in DNA that induces A→T transversions in Escherichia coli
Aralov Andrey V.
,
Gubina Nina
,
Cabrero Cristina
,
Tsvetkov Vladimir B.
,
Turaev Anton V.
,
Fedeles Bogdan I.
,
Croy Robert G.
,
Isaakova Ekaterina A.
,
Melnik Denis
,
Dukova Svetlana
,
Ryazantsev Dmitriy Y.
,
Khrulev Alexei A.
,
Varizhuk Anna M.
,
González Carlos
,
Zatsepin Timofei S.
,
Essigmann John M.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2022
Anticancer activity of G4-targeting phenoxazine derivatives in vitro
Lizunova Sofia A.,
Tsvetkov Vladimir B.
,
Skvortsov Dmitry A.
,
Kamzeeva Polina N.
, Ivanova Olga M.,
Vasilyeva Lilja A.
, Chistov Alexey A.,
Belyaev Evgeny S.
, Khrulev Alexei A., Vedekhina Tatiana S.,
Bogomazova Alexandra N.
,
Lagarkova Maria A.
,
Varizhuk Anna M.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 201, с. 43-54
DOI
2022
Nucleoside Analogs and Perylene Derivatives Modulate Phase Separation of SARS-CoV-2 N Protein and Genomic RNA In Vitro
Svetlova Julia
, Knizhnik Ekaterina,
Manuvera Valentin
,
Severov Vyacheslav
,
Shirokov Dmitriy
,
Grafskaia Ekaterina
,
Bobrovsky Pavel
,
Matyugina Elena
,
Khandazhinskaya Anastasia
,
Kozlovskaya Liubov
,
Miropolskaya Nataliya
,
Aralov Andrey
,
Khodarovich Yuri
,
Tsvetkov Vladimir
,
Kochetkov Sergey
,
Lazarev Vassili
,
Varizhuk Anna
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 23, с. 15281
DOI
2022
cNTnC and fYTnC2, Genetically Encoded Green Calcium Indicators Based on Troponin C from Fast Animals
Subach Oksana M.
,
Vlaskina Anna V.
,
Agapova Yuliya K.
,
Korzhenevskiy Dmitriy A.
,
Nikolaeva Alena Y.
,
Varizhuk Anna M.
,
Subach Maksim F.
,
Patrushev Maxim V.
,
Piatkevich Kiryl D.
,
Boyko Konstantin M.
,
Subach Fedor V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 23, № 23, с. 14614
DOI
2021
DNA G-Quadruplexes Contribute to CTCF Recruitment
Tikhonova Polina, Pavlova Iulia,
Isaakova Ekaterina
,
Tsvetkov Vladimir
,
Bogomazova Alexandra
,
Vedekhina Tatjana
, Luzhin Artem V., Sultanov Rinat, Severov Vjacheslav, Klimina Ksenia,
Kantidze Omar L.
,
Pozmogova Galina
,
Lagarkova Maria
,
Varizhuk Anna
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 22, № 13, с. 7090
DOI
2021
EGCG as an anti-SARS-CoV-2 agent: Preventive versus therapeutic potential against original and mutant virus
Tsvetkov Vladimir
,
Varizhuk Anna
,
Kozlovskaya Liubov
,
Shtro Anna
, Lebedeva Olga,
Komissarov Andrey
,
Vedekhina Tatjana
,
Manuvera Valentin
, Zubkova Olga, Eremeev Artem,
Shustova Elena
,
Pozmogova Galina
,
Lioznov Dmitry
,
Ishmukhametov Aydar
,
Lazarev Vassili
,
Lagarkova Maria
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 191, с. 27-32
DOI
2021
Phenoxazine pseudonucleotides in DNA i-motifs allow precise profiling of small molecule binders by fluorescence monitoring
Tsvetkov Vladimir B.
,
Turaev Anton V.
,
Petrunina Nataliia A.
,
Melnik Denis M.
,
Khodarovich Yuriy M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Varizhuk Anna M.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
The Analyst
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
DOI
2021
The Dynamics of Mycoplasma gallisepticum Nucleoid Structure at the Exponential and Stationary Growth Phases
Fisunov Gleb Y.
,
Zubov Alexander I.
,
Pobeguts Olga V.
,
Varizhuk Anna M.
,
Galyamina Mariya A.
,
Evsyutina Daria V.
,
Semashko Tatiana A.
,
Manuvera Valentin A.
,
Kovalchuk Sergey I.
,
Ziganshin Rustam K.
,
Barinov Nicolay A.
,
Klinov Dmitry V.
,
Govorun Vadim M.
в журнале
Frontiers in microbiology
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 12
DOI
2020
Aureolic Acid Group of Agents as Potential Antituberculosis Drugs
Bespyatykh J.
, Bespiatykh D., Malakhova M., Klimina K., Bespyatykh A.,
Varizhuk A.
,
Tevyashova A.
, Nikolenko T.,
Pozmogova G.
, Ilina E., Shitikov E.
в журнале
Antibiotics
, издательство
MDPI Publishing
(Basel, Switzerland, Switzerland)
, том 9, № 10, с. 715-715
2020
FGCaMP7, an Improved Version of Fungi-Based Ratiometric Calcium Indicator for In Vivo Visualization of Neuronal Activity
Barykina Natalia V.
,
Sotskov Vladimir P.
,
Gruzdeva Anna M.
,
Kure Wu You
,
Portugues Ruben
,
Subach Oksana M.
,
Chefanova Elizaveta S.
,
Plusnin Viktor V.
,
Ivashkina Olga I.
,
Anokhin Konstantin V.
,
Vlaskina Anna V.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Nikolaeva Alena Y.
,
Boyko Konstantin M.
,
Rakitina Tatiana V.
,
Varizhuk Anna M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Subach Fedor V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 8, с. 3012
2020
Genomic DNA i-motifs as fast sensors responsive to near-physiological pH microchanges
Turaev Anton V.
,
Isaakova Ekaterina A.
,
Severov Vjacheslav V.
,
Bogomazova Alexandra N.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Sardushkin Makar V.
,
Aralov Andrey V.
,
Lagarkova Maria A.
,
Pozmogova Galina E.
,
Varizhuk Anna M.
в журнале
Biosensors and Bioelectronics
, издательство
Pergamon Press Ltd.
(United Kingdom)
DOI
2020
Novel Genetically Encoded Bright Positive Calcium Indicator NCaMP7 Based on the mNeonGreen Fluorescent Protein
Subach Oksana M.
,
Sotskov Vladimir P.
,
Plusnin Viktor V.
,
Gruzdeva Anna M.
,
Barykina Natalia V.
,
Ivashkina Olga I.
,
Anokhin Konstantin V.
,
Nikolaeva Alena Y.
,
Korzhenevskiy Dmitry A.
,
Vlaskina Anna V.
,
Lazarenko Vladimir A.
,
Boyko Konstantin M.
,
Rakitina Tatiana V.
,
Varizhuk Anna M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Podgorny Oleg V.
,
Piatkevich Kiryl D.
,
Boyden Edward S.
,
Subach Fedor V.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 21, № 5, с. 1644
DOI
2020
Phenoxazine-based scaffold for designing G4-interacting agents
Tsvetkov Vladimir B.
,
Varizhuk Anna M.
, Lizunova Sofia A., Nikolenko Tatiana A., Ivanov Igor A., Severov Vjacheslav V.,
Belyaev Evgeny S.
,
Shitikov Egor A.
,
Pozmogova Galina E.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Organic and Biomolecular Chemistry
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 18, № 31, с. 6147-6154
DOI
2020
Short Duplex Module Coupled to G-Quadruplexes Increases Fluorescence of Synthetic GFP Chromophore Analogues
Zaitseva Snizhana O.
,
Baleeva Nadezhda S.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Myasnyanko Ivan N.
,
Turaev Anton V.
,
Pozmogova Galina E.
, Khrulev Alexei A.,
Varizhuk Anna M.
,
Baranov Mikhail S.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Sensors
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 20, № 3, с. 915
DOI
2020
Transcription-facilitating histone chaperons interact with genomic and synthetic G4 structures
Pavlova I.I.,
Tsvetkov V.B.
,
Isaakova E.A.
,
Severov V.V.
, Khomyakova E.A., Lacis I.A., Lazarev V.N., Lagarkova M.A.,
Pozmogova G.E.
,
Varizhuk A.M.
в журнале
International Journal of Biological Macromolecules
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 160, с. 1144-1157
2019
Benzothiazole-based cyanines as fluorescent “light-up” probes for duplex and quadruplex DNA
Turaev A.V.,
Tsvetkov V.B.
, Tankevich M.V., Smirnov I.P., Aralov A.V.,
Pozmogova G.E.
,
Varizhuk A.M.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 162, с. 216-228
2019
DNA G‐Quadruplexes (G4s) Modulate Epigenetic (Re)Programming and Chromatin Remodeling
Varizhuk A.
, Isaakova E.,
Pozmogova G.
в журнале
BioEssays
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 41, № 9, с. 1900091-1900091
2019
DNA i-Motifs With Guanidino-i-Clamp Residues: The Counterplay Between Kinetics and Thermodynamics and Implications for the Design of pH Sensors
Tsvetkov Vladimir B.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Turaev Anton V.
,
Farzan Valentina M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Aralov Andrey V.
,
Varizhuk Anna M.
в журнале
Computational and Structural Biotechnology Journal
, том 17, с. 527-536
DOI
2018
Efficient silica synthesis from tetra(glycerol)orthosilicate with cathepsin- and silicatein-like proteins
Povarova Natalia V.
,
Barinov Nikolay A.
,
Baranov Mikhail S.
,
Markina Nadezhda M.
,
Varizhuk Anna M.
, Pozmogova Galina E., Klinov Dmitry V.,
Kozhemyako Valery B.
, Lukyanov Konstantin A.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 8, № 1
2018
Genetically encoded calcium indicator with NTnC-like design and enhanced fluorescence contrast and kinetics
Doronin D.A.
,
Barykina N.V.
,
Subach O.M.
,
Sotskov V.P.
,
Plusnin V.V.
,
Ivleva O.A.
, Isaakova E.A.,
Varizhuk A.M.
,
Pozmogova G.E.
,
Malyshev A.Y.
, Smirnov I.V.,
Piatkevich K.D.
,
Anokhin K.V.
,
Enikolopov G.N.
,
Subach F.V.
в журнале
BMC Biotechnology
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 18, № 1
DOI
2018
NTnC-like genetically encoded calcium indicator with a positive and enhanced response and fast kinetics
Natalia Barykina
,
Doronin Danila A.
,
Subach Oksana M.
,
Sotskov Vladimir P.
,
Plusnin Viktor V.
,
Ivleva Olga A.
,
Gruzdeva Anna M.
,
Kunitsyna Tatiana A.
,
Ivashkina Olga I.
,
Lazutkin Alexander A.
,
Malyshev Aleksey Y.
, Smirnov Ivan V.,
Varizhuk Anna M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Piatkevich Kiryl D.
,
Anokhin Konstantin V.
,
Grigori Enikolopov
,
Subach Fedor V.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 8, № 15233
DOI
2018
Polymorphism of G4 associates: from stacks to wires via interlocks
Varizhuk Anna M.
,
Protopopova Anna D.
,
Tsvetkov Vladimir B.
, Barinov Nikolay A., Podgorsky Victor V., Tankevich Maria V.,
Vlasenok Maria A.
, Severov Vyacheslav V., Smirnov Igor P.,
Dubrovin Evgeniy V.
, Klinov Dmitry V., Pozmogova Galina E.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 46, № 17, с. 8978-8992
DOI
2018
The structural diversity of C-rich DNA aggregates: unusual self-assembly of beetle-like nanostructures
Protopopova A.D.,
Tsvetkov V.B.
,
Varizhuk A.M.
, Barinov N.A., Podgorsky V.V., Klinov D.V.,
Pozmogova G.E.
в журнале
Physical Chemistry Chemical Physics
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 20, № 5, с. 3543-3553
2018
i-Clamp phenoxazine for the fine tuning of DNA i-motif stability
Tsvetkov Vladimir B.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Belyaev Evgeny S.
,
Kostyukevich Yury I.
,
Shpakovski George V.
,
Podgorsky Victor V.
,
Pozmogova Galina E.
,
Varizhuk Anna M.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 46, № 6, с. 2751-2764
DOI
2017
Anti-HIV Activities of Intramolecular G4 and Non-G4 Oligonucleotides
Prokofjeva M.,
Tsvetkov V.
,
Basmanov D.
,
Varizhuk A.
,
Lagarkova M.
, Smirnov I.,
Prusakov K.
,
Klinov D.
, Prassolov V.,
Pozmogova G.
,
Mikhailov S.N.
в журнале
Nucleic acid therapeutics
, издательство
Mary Ann Liebert, Inc.
(New Rochelle, NY, United States)
, том 27, № 1, с. 56-66
2017
Conformational polymorphysm of G-rich fragments of DNA Alu-repeats
Sekridova A.V.,
Varizhuk A.M.
, Tatarinova O.N., Severov V.V., Barinov N.A., Smirnov I.P., Lazarev V.N., Klinov D.V.,
Pozmogova G.E.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 11, № 1, с. 62-71
2017
Conformational polymorphysm of G-rich fragments of DNA Alu-repeats. II. The putative role of G-quadruplex structures in genomic rearrangements
Varizhuk A.M.
, Sekridova A.V., Tankevich M.V., Podgorsky V.S., Smirnov I.P.,
Pozmogova G.E.
в журнале
Biochemistry, Supplemental Series B
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 11, № 2, с. 146-153
2017
Green fluorescent genetically encoded calcium indicator based on calmodulin/M13-peptide from fungi
Barykina Natalia V.
,
Subach Oksana M.
,
Piatkevich Kiryl D.
,
Jung Erica E.
,
Malyshev Aleksey Y.
,
Smirnov Ivan V.
,
Bogorodskiy Andrey O.
,
Borshchevskiy Valentin I.
,
Varizhuk Anna M.
,
Pozmogova Galina E.
,
Boyden Edward S.
,
Anokhin Konstantin V.
,
Enikolopov Grigori N.
,
Subach Fedor V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 12, № 8, с. 0183757
DOI
2017
Interaction of Bacteroides fragilis Toxin with Outer Membrane Vesicles Reveals New Mechanism of Its Secretion and Delivery
Zakharzhevskaya Natalya B.
,
Tsvetkov Vladimir B.
,
Vanyushkina Anna A.
,
Varizhuk Anna M.
,
Rakitina Dania V.
,
Podgorsky Victor V.
,
Vishnyakov Innokentii E.
,
Kharlampieva Dania D.
,
Manuvera Valentin A.
,
Lisitsyn Fedor V.
,
Gushina Elena A.
, Lazarev Vassili N., Govorun Vadim M.
в журнале
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 7, № 2
DOI
2017
Synthesis of Oligonucleotides Containing Novel G-clamp Analog with C8-Tethered Group in Phenoxazine Ring: Implication to qPCR Detection of the Low-Copy Kemerovo Virus dsRNA
Varizhuk Anna M.
,
Zatsepin Timofei S.
,
Golovin Andrey V.
,
Belyaev Evgeny S.
,
Kostyukevich Yury I.
,
Dedkov Vladimir G.
,
Shipulin German A.
,
Shpakovski George V.
,
Aralov Andrey V.
в журнале
Bioorganic and Medicinal Chemistry
, издательство
Pergamon Press Ltd.
(United Kingdom)
, том 25, № 14, с. 3597-3605
DOI
2017
The expanding repertoire of G4 DNA structures
Varizhuk A.
, Ischenko D.,
Tsvetkov V.
, Novikov R., Kulemin N.,
Kaluzhny D.
, Vlasenok M., Naumov V.,
Smirnov I.
,
Pozmogova G.
в журнале
Biochimie
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 135, с. 54-62
2016
A Solution to the Common Problem of the Synthesis and Applications of Hexachlorofluorescein Labeled Oligonucleotides
Chuvilin A.N., Smirnov I.P., Mosina A.G.,
Varizhuk A.M.
,
Pozmogova G.E.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 11, № 11, с. 0166911-0166911
2016
A new design for a green calcium indicator with a smaller size and a reduced number of calcium-binding sites
Barykina NV
,
Subach OM
, Doronin DA,
Sotskov VP
, Roshchina MA, Kunitsyna TA,
Malyshev AY
, Smirnov IV,
Azieva AM
, Sokolov IS,
Piatkevich KD
, Burtsev MS,
Varizhuk AM
,
Pozmogova GE
,
Anokhin KV
,
Subach FV
,
Enikolopov GN
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 6, с. 34447
DOI
2016
Chiral Acyclic PNA Modifications: Synthesis and Properties
Varizhuk A.M.
, Dezhenkov A.V., Kirillova Y.G.
в журнале
Studies in Natural Products Chemistry
, том 47, с. 261-305
2016
G4 Aptamers: Trends in Structural Design
Varizhuk A.
, Ilyinsky N.,
Smirnov I.
,
Pozmogova G.
в журнале
Mini-Reviews in Medicinal Chemistry
, том 16, № 16, с. 1321-1329
2015
A Universal Base in a Specific Role: Tuning up a Thrombin Aptamer with 5-Nitroindole
Tsvetkov Vladimir B.
,
Varizhuk Anna M.
,
Pozmogova Galina E.
, Smirnov Igor P., Kolganova Natalia A.,
Timofeev Edward N.
в журнале
Scientific reports
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 5, с. 16337
DOI
2015
Polyanionic Carboxyethyl Peptide Nucleic Acids (ce-PNAs): Synthesis and DNA Binding
Kirillova J.G.
, Boyarskaya N., Dezhenkov F., Tankevich, Prokhorov I.,
Varizhuk
, Eremin S.,
Esipov D.S.
, Smirnov I.,
Pozmogova G.E.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 10, № 10
DOI
2015
The systematic approach to describing conformational rearrangements in G-quadruplexes
Tsvetkov Vladimir
,
Pozmogova Galina
,
Varizhuk Anna
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, с. 1-11
DOI
2014
Comparison of the 'chemical' and 'structural' approaches to the optimization of the thrombin-binding aptamer
Tatarinova Olga
,
Tsvetkov Vladimir
,
Basmanov Dmitry
,
Barinov Nikolay
,
Smirnov Igor
,
Timofeev Edward
,
Kaluzhny Dmitry
,
Chuvilin Andrey
,
Klinov Dmitry
,
Varizhuk Anna
,
Pozmogova Galina
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 9, № 2, с. e89383
DOI
2013
Synthesis of Triazole-Linked Oligonucleotides with High Affinity to DNA Complements and an Analysis of Their Compatibility with Biosystems
Varizhuk Anna M.
,
Kaluzhny Dmitry N.
,
Novikov Roman A.
,
Chizhov Alexandr O.
,
Smirnov Igor P.
,
Chuvilin Andrey N.
,
Tatarinova Olga N.
,
Fisunov Gleb Y.
,
Pozmogova Galina E.
,
Florentiev Vladimir L.
в журнале
Journal of Organic Chemistry
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 78, № 12, с. 5964-5969
DOI
2013
Synthesis, characterization and in vitro activity of thrombin-binding DNA aptamers with triazole internucleotide linkages
Varizhuk Anna M.
,
Tsvetkov Vladimir B.
,
Tatarinova Olga N.
,
Kaluzhny Dmitry N.
,
Florentiev Vladimir L.
,
Timofeev Edward N.
,
Shchyolkina Anna K.
,
Borisova Olga F.
,
Smirnov Igor P.
,
Grokhovsky Sergei L.
,
Aseychev Anton V.
,
Pozmogova Galina E.
в журнале
European Journal of Medicinal Chemistry
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 67, с. 90-97
DOI
Статьи в сборниках
2019
Oligonucleotide Primers with G8AE-Clamp Modifications for RT-qPCR Detection of the Low-Copy dsRNA
Zatsepin Timofei S.
,
Varizhuk Anna M.
,
Dedkov Vladimir G.
,
Shipulin German A.
,
Aralov Andrey V.
в сборнике
Methods in Molecular Biology
, место издания
Springer Berlin Heidelberg
, том 1973, с. 281-297
DOI
Доклады на конференциях
2022
Visualizing G-quadruplexes DNA with benzothiazole orange in living cells and an evidence for the functioning of the G-quadruplexes as an intracellular Na/K sensor
(Стендовый)
Авторы:
Fedorov D.A.
,
Gorbunov A.M.
,
Maksimov E.G.
,
Aralov A.V.
,
Sidorenko S.V.
,
Bukach O.V.
,
Varizhuk A.M.
,
Lopina O.D.
,
Klimanova E.A.
IUBMB–FEBS–PABMB Congress
, Лиссабон, Португалия, 9-14 июля 2022
2018
Ratiometric Green Fluorescent Genetically Encoded Calcium Indicator Based on Ca2+-binding Domains from Fungi.
(Стендовый)
Авторы:
Boyden E.S.
,
Anokhin K.V.
,
Enikolopov G.N.
,
Subach F.V.
,
Pozmogova G.E.
,
Varizhuk A.M.
,
Borshchevskiy V.I.
,
Bogorodskiy A.O.
,
Smirnov I.V.
,
Malyshev A.Y.
,
Jung E.E.
,
Piatkevich K.D.
,
Barykina N.V.
,
Subach O.M.
11th FENS Forum of Neuroscience
, Берлин, Германия, 7-12 июля 2018
Тезисы докладов
2021
Оценка взаимодействия ряда природных полифенолов с дуплексной ДНК с помощью метода микроскопического термофореза
Чернова И.А.
,
Власова О.А.
,
Варижук А.М.
,
Якубовская М.Г.
в сборнике
Успехи молекулярной онкологии
, серия
МАТЕРИАЛЫ VI Всероссийской конференции по молекулярной онкологии
, место издания
ООО "ИД АБВ-Пресс" Москва
, том 8, тезисы