Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИСТИНА ИНХС РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Шайтан Алексей Константинович
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, доцент, с 17 июня 2021
доктор физико-математических наук с 2021 года
кандидат физико-математических наук
профессор РАН с 17 мая 2022 г.
член-корреспондент РАН с 2 июня 2022 г.
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
, ведущий научный сотрудник, 1 марта 2007 - 16 июня 2021
Соавторы:
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Кирпичников М.П.
,
Студитский В.М.
,
Panchenko A.R.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
,
Хохлов А.Р.
,
Landsman D.
,
Соколова О.С.
,
Феофанов А.В.
,
Новиков Р.В.
,
Глухов Г.С.
показать полностью...
,
Левцова О.В.
,
Халатур П.Г.
,
Чертков О.В.
,
Комарова Г.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Малюченко Н.В.
,
Терешкина К.Б.
,
Турлей Е.В.
,
Zhurkin V.B.
,
Антонов М.Ю.
,
Боздаганян М.Е.
,
Горковец Т.К.
,
Зайцев П.А.
,
Касимова М.А.
,
Качер Ю.Г.
,
Любителев А.В.
,
Поспелова Ю.
,
Hua X.
,
Басс М.В.
,
Блинов В.Н.
,
Волох О.И.
,
Голик Д.Н.
,
Кобельков Г.М.
,
Кулаева О.И.
,
Ложников М.А.
,
Орехов Ф.С.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Федик И.В.
,
Carl W.
,
Chang C.F.
,
Delemotte L.
,
Formosa T.
,
Gaykalova D.A.
,
Legotsky S.A.
,
McCullough L.L.
,
Mounir T.
,
Talbert P.B.
,
Tarek M.
,
Бондаренко Е.А.
,
Касимова М.А.
,
Клячко Н.Л.
,
Котова Е.Ю.
,
Крылов В.Н.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Ли А.
,
Мирошников К.А.
,
Никитин Д.В.
,
Николаев И.Н.
,
Султанов Д.Ч.
,
Упоров И.В.
,
Andraz P.
,
Arnold F.
,
Bertoncini C.
,
Biswas R.
,
Bohne J.
,
Borner H.G.
,
Bruford E.A.
,
Burkal'tseva M.
,
Bäuerle P.
,
Chang H.
,
Clark D.J.
,
Cultraro C.
,
Damijan M.
,
David L.
,
Denny P.
,
Draizen E.J.
,
E-K S.
,
Elena M.
,
Eva-Kathrin S.
,
Feofanov V.
,
FitzGerald P.
,
Forssmann W.G.
,
Francesca A.
,
Fu-Kai H.
,
Geiger H.
,
Ghirlando R.
,
Giaccone G.
,
Goffinet C.
,
Goncearenco A.
,
Gupta S.
,
Hsieh F.
,
Hsieh F.
,
Huang Y.
,
Jens H.
,
Kennani S.E.
,
Kirchhoff F.
,
Kiselev N.A.
,
Knowles T.
,
Krylov S.V.
,
Kuznedelov K.
,
Li S.
,
Lin Y.
,
Lucie D.
,
Luis M.
,
Lunov O.
,
Luse D.S.
,
Marie B.
,
Mariño-Ramírez L.
,
Marzluff W.F.
,
Maura C.
,
McAndrews M.
,
Meier C.
,
Meltzer P.
,
Mena-Osteritz E.
,
Muller J.
,
Munch J.
,
Nizovtseva E.
,
Nordenskiöld L.
,
Palesch D.
,
Persinger J.
,
Pestov N.A.
,
Peter B.
,
Pitts S.
,
Roan N.
,
Saadi K.
,
Salvatella X.
,
Sauter D.
,
Schmid S.
,
Schrezenmeier H.
,
Schrump D.
,
Schwarz K.
,
Seal R.L.
,
Shi X.
,
Simmet T.
,
Standker L.
,
Sykilinda N.
,
Usmani S.
,
Vas V.
,
Venugopalan A.
,
Walther P.
,
Wei D.
,
Weil T.
,
Wisniewski J.
,
Wu C.
,
Yolamanova M.
,
Zirafi O.
,
Андреева Е.А.
,
Багров Д.В.
,
Винников Р.С.
,
Георгиев П.Г.
,
Грешнова А.А.
,
Ефимова Д.А.
,
Ефремов Р.Г.
,
Зиганшин Р.Х.
,
Иванов В.А.
,
Калебина Т.С.
,
Карлова М.Г.
,
Косарим Н.А.
,
Котова Е.Ю.
,
Котова Е.Ю.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Легоцкий С.А.
,
Моисеенко А.В.
,
Моторин Н.А.
,
Николаев И.Н.
,
Оршанский И.А.
,
Печникова Е.В.
,
Рекстина В.В.
,
Сивкина А.Л.
,
Суханова Ю.А.
,
Сыкилинда Н.Н.
,
Трифонова Т.С.
,
Турченков Д.А.
,
УПОРОВ И.В.
,
Шабурова О.В.
,
Шабурова О.В.
,
Шуров Д.Л.
101 статья
,
1 книга
,
79 докладов на конференциях
,
31 тезисы докладов
,
34 НИР
,
1 патент
,
2 научного отчёта
,
1 членство в программном комитете
,
1 членство в диссертационном совете
,
2 диссертации
,
18 дипломных работ
,
1 курсовая работа
,
9 учебных курсов
,
5 выступления в СМИ
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 715, Scopus: 792
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 405377
ResearcherID:
D-7306-2012
Scopus Author ID:
26635808600
ORCID:
0000-0003-0312-938X
Деятельность
Статьи в журналах
2023
Editorial: Recent advances in molecular properties of DNA-protein interactions, chromatin and their biological roles
Shi Xiangyan
,
Nordenskiöld Lars
,
Sokolova Olga S.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Frontiers in Molecular Biosciences
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 10
DOI
2023
Structure and Dynamics of Compact Dinucleosomes: Analysis by Electron Microscopy and spFRET
Stefanova Maria E.,
Volokh Olesya I.
,
Chertkov Oleg V.
,
Armeev Grigory A.
,
Shaytan Alexey K.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
International Journal of Molecular Sciences
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 24, № 15, с. 12127-12127
DOI
2022
A standardized nomenclature for mammalian histone genes
Seal Ruth L.
,
Denny Paul
,
Bruford Elspeth A.
,
Gribkova Anna K.
,
Landsman David
,
Marzluff William F.
,
McAndrews Monica
,
Panchenko Anna R.
,
Shaytan Alexey K.
,
Talbert Paul B.
в журнале
Epigenetics and Chromatin
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 15, № 34
DOI
2022
Analysis of Ion Atmosphere Around Nucleosomes Using Supercomputer MD Simulations
Косарим Н.А.
,
Армеев Г.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 9, № 2, с. 56-67
DOI
2022
Bulk automated analysis of variability of nucleosome structures and their complexes
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 121, № 3, с. 361a-362a
DOI
2022
Development of algorithms for mining and classification of histone proteins
Singh-Palchevskaia Lovepreet
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 121, № 3, с. 361a
DOI
2022
Electron microscopy analysis of ATP-independent nucleosome unfolding by FACT
Sivkina Anastasiia L.
,
Karlova Maria G.
,
Valieva Maria E.
,
McCullough Laura L.
,
Formosa Timothy
,
Shaytan Alexey K.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Communications Biology
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 5, № 1
DOI
2022
From DNA-protein interactions to the genetic circuit design using CRISPR-dCas systems
Shaytan A.K.
,
Novikov R.V.
,
Vinnikov R.S.
,
Gribkova A.K.
,
Glukhov G.S.
в журнале
Frontiers in Molecular Biosciences
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 9, с. 1-10
DOI
2022
H2A-H2B Histone Dimer Plasticity and Its Functional Implications
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 18, с. 1-20
DOI
2022
N-Terminal Tails of Histones H2A and H2B Differentially Affect Transcription by RNA Polymerase II In Vitro
Chang Han-Wen
,
Feofanov Alexey V.
,
Lyubitelev Alexander V.
,
Armeev Grigory A.
,
Kotova Elena Y.
,
Hsieh Fu-Kai
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 16
DOI
2022
Nucleosomes and their complexes in the cryoEM era: Trends and limitations
Armeev Grigoriy A.
,
Gribkova Anna K.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Frontiers in Molecular Biosciences
, издательство
Frontiers Media S.A.
(Lausanne, Switzerland)
, том 9
DOI
2022
Structure of an Intranucleosomal DNA Loop That Senses DNA Damage during Transcription
Gerasimova Nadezhda S.
,
Volokh Olesya I.
,
Pestov Nikolay A.
,
Armeev Grigory A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Cells
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 17, с. 2678
DOI
2022
Применение нейронных сетей для распознавания конформационных изменений в структуре белка по рентгеновским дифрактограммам его одиночных молекул на примере фотоцикла бактериородопсина
Армеев Г.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в журнале
Интеллектуальные системы. Теория и приложения (ранее: Интеллектуальные системы по 2014, № 2, ISSN 2075-9460)
, издательство
[б.и.]
(М.)
, том 26, № 1, с. 24-34
2021
Design of Nucleic Acid Biosensors Based on CRISPR/Cas Systems and Reporter Split Proteins
Novikov R.V.
,
Gribkova A.K.
,
Kacher J.G.
,
Zaytsev P.A.
,
Armeev G.A.
,
Gluhov G.S.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 76, № 2, с. 52-58
DOI
2021
Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomes
Armeev Grigoriy A.
,
Kniazeva Anastasiia S.
,
Komarova Galina A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 12, № 1, с. 1-15
DOI
2021
Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomes: insights from multi-microsecond molecular dynamics simulations
Armeev Grigoriy A.
,
Kniazeva Anastasia S.
,
Komarova Galina A.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
bioRxiv (The preprint server for biology)
, с. 1-29
DOI
2021
Modeling of tandem dCas9 complexes bound to DNA for nucleic acids detection
Novikov Roman
,
Kacher Julia
,
Gribkova Anna
,
Zaytsev Petr
,
Armeev Grigoriy
,
Gluhov Grigoriy
,
Shaytan Alexey
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, том 27, № S1, с. 1696-1698
DOI
2021
Molecular Mechanisms of Oncogenesis through the Lens of Nucleosomes and Histones
Espiritu Daniel,
Gribkova Anna K.
,
Gupta Shubhangi
,
Shaytan Alexey K.
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
DOI
2021
Дизайн биосенсоров нуклеиновых кислот на основе систем CRISPR/Cas и репортерных сплит-белков
Новиков Роман вячеславович
,
Грибкова А.К.
,
Качер Ю.Г.
,
Зайцев П.А.
,
Армеев Г.А.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 76, № 2, с. 67-75
2021
Картирование ДНК в капсиде гигантского бактериофага phiEL (Caudovirales: Myoviridae: Elvirus) с помощью аналитической электронной микроскопии
Трифонова Т.С.
,
Моисеенко А.В.
,
Буркальцева М.В.
,
Шабурова О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Крылов В.Н.
,
Соколова О.С.
в журнале
Вопросы вирусологии
, издательство
Медицина
(М.)
, том 66, № 6
DOI
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
Anastasiia Kniazeva
,
Grigorii Armeev
,
Iunona Pospelova
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 118, № 3
DOI
2020
Detecting Cas9-sgRNA Complex Interactions with DNA via Fluorescent Microscopy: Computer Simulations of Experimental Designs
Novikov Roman
,
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Kacher Julia
,
Gluhov Grigory
,
Shaytan Alexey
в журнале
Microscopy and Microanalysis
, издательство
Cambridge University Press
(United Kingdom)
, с. 1-3
DOI
2020
Determining the Binding Constant of LANA Protein Fragment with Nucleosome
Novikov R.V.
,
Bondarenko E.A.
,
Malyuchenko N.V.
,
Feofanov A.V.
,
Studitsky V.M.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 75, № 4, с. 252-256
DOI
2020
Integrative Modeling of Nucleosomes and Supranucleosomal Structures
Grigoriy Armeev
,
Anna Panchenko
,
Alexey Feofanov
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 118, № 3
DOI
2020
Определение константы связывания фрагмента белка LANA с нуклеосомой
Новиков Р.В.
,
Бондаренко Е.А.
,
Малюченко Н.В.
,
Феофанов А.В.
,
Студитский В.М.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 75, № 4, с. 296-301
2019
Abstract OR-19: Integrative Approach on Nucleosome Complexes Modeling
Armeev Grigoriy A.
,
Panchenko Anna
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
International Journal of Biomedicine
, том 9, № S1, с. 13-14
2019
Abstract P-20: Linker Histone H1: The Interplay between Chromatosome Stability, Oncomutations and Post-Translational Modifications
Bass Mikhail V.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
International Journal of Biomedicine
, том 9, № S1, с. 25-25
2019
Analyzing nucleosome plasticity using molecular dynamics simulations
Армеев Г.А.
,
Поспелова Юнона
,
Князева А.
,
Комарова г.а.
,
Шайтан А.К.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № sup1, с. 19-19
DOI
2019
Construction and analysis of an interactome between nucleosomes and chromatin proteins
Gribkova A.K.
,
Shaytan A.K.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № sup1, с. 393-393
DOI
2019
Histone Octamer Structure Is Altered Early in ISW2 ATP-Dependent Nucleosome Remodeling
Hada Arjan, Hota Swetansu K., Luo Jie,
Lin Yuan-chi
, Kale Seyit,
Shaytan Alexey K.
, Bhardwaj Saurabh K.,
Persinger Jim
, Ranish Jeff,
Panchenko Anna R.
, Bartholomew Blaine
в журнале
Cell reports
, издательство
Cell Press
(United States)
, том 28, № 1, с. 282-294.e6
DOI
2019
Linking chromatin composition and structural dynamics at the nucleosome level
Armeev Grigoriy A.
,
Gribkova Anna K.
,
Pospelova Iunona
,
Komarova Galina A.
,
Shaytan Alexey K.
в журнале
Current Opinion in Structural Biology
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 56, с. 46-55
DOI
2019
Python toolkit for DNA geometry analysis and modeling
Armeev G.A.
,
Sukhanova I.A.
,
Shaytan A.K.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 9, № sup1, с. 150
DOI
2019
The Effect of Oncomutations and Posttranslational Modifications of Histone H1 on Chromatosome Structure and Stability
Bass M.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 74, № 3, с. 121-126
DOI
2019
ВЛИЯНИЕ ОНКОМУТАЦИЙ И ПОСТТРАНСЛЯЦИОННЫХ МОДИФИКАЦИЙ ГИСТОНА Н1 НА СТРУКТУРУ И СТАБИЛЬНОСТЬ ХРОМАТОСОМЫ
Басс М.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 74, № 3, с. 154-160
2019
Синтетическая биология: конструирование живого
Грешнова А.А.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Химия и жизнь - XXI век (до 1997 г. "Химия и жизнь")
, издательство
Химия и жизнь
(М.)
, № 9, с. 32-38
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
Феофанов А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Любителев А.В.
,
Армеев Г.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Котова Е.Ю.
,
Студитский В.М.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 2, с. 56-56
2018
Joint Effect of Histone H1 Amino Acid Sequence and DNA Nucleotide Sequence on the Structure of Chromatosomes: Analysis by Molecular Modeling Methods
Gorkovets T.K.
,
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 73, № 2, с. 82-87
DOI
2018
Mutual influence of linker histone H1 amino acid sequence and DNA nucleotide sequence on the linker histone H1 position in chromatosome
Горковец Т.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
FEBS open bio
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 8, № Supplement S1, с. 346-346
DOI
2018
Structural interpretation of DNA-protein hydroxyl-radical footprinting experiments with high resolution using HYDROID
Шайтан А.К.
,
Xiao H.
,
Армеев Г.А.
,
Gaykalova D.A.
,
Комарова Г.А.
,
Carl Wu
,
Студитский В.М.
,
Landsman D.
,
Panchenko A.R.
в журнале
Nature Protocols
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 13, № 1, с. 2535-2556
DOI
2018
Совместное влияние аминокислотной последовательности гистона H1 и нуклеотидной последовательности днк на структуру хроматосомы: анализ методами молекулярного моделирования
Горковец Т.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 73, № 2, с. 99-105
2017
Dual Active Site in the Endolytic Transglycosylase gp144 of Bacteriophage phiKZ
Chertkov O.V.
, Armeev G.A.,
Uporov I.V.
,
Legotsky S.A.
, Sykilinda N.N.,
Shaytan A.K.
,
Klyachko N.L.
, Miroshnikov and K.A
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 9, № 1, с. 81-87
2017
Dual active site in the Endolytic Transglycosylase gp144 of Bacteriophage phiKZ
Chertkov O.V.
, Armeev G.A., Uporov I.V.,
Legotsky S.A.
,
Sykilinda N.N.
,
Shaytan A.K.
, Klyachko N.L.,
Miroshnikov K.A.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 9, № 32, с. 81-87
2017
Hydroxyl-radical footprinting combined with molecular modeling identifies unique features of DNA conformation and nucleosome positioning
Shaytan Alexey K.
,
Xiao Hua
,
Armeev Grigoriy A.
,
Carl Wu
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2017
MS_HistoneDB, a manually curated resource for proteomic analysis of human and mouse histones
Kennani Sara El
, Annie Adrait,
Shaytan Alexey K.
,
Saadi Khochbin
, Christophe Bruley, Panchenko Anna R.,
David Landsman
, Delphine Pflieger, Jérôme Govin
в журнале
Epigenetics and Chromatin
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 10, № 1
DOI
2017
Microsecond molecular dynamics simulations of nucleosomes:implications for nucleosome function
Shaytan AK
,
Armeev GA
,
Goncearenco A.
,
Zhurkin VB
,
Landsman D.
,
Panchenko AR
в журнале
Biochemistry and Cell Biology
, издательство
NRC Research Press
(Canada)
, том 95, № 2, с. 183
DOI
2017
Molecular basis of CENP-C association with the CENP-A nucleosome at yeast centromeres
Xiao H.
, Wang F.,
Wisniewski J.
,
Shaytan AK
,
Ghirlando R.
,
FitzGerald PC
,
Huang Y.
,
Wei D.
,
Li S.
,
Landsman D.
,
Panchenko AR
,
Wu C.
в журнале
Genes and Development
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 31, № 19, с. 1958-1972
DOI
2017
Второй активный центр в эндолитической трансгликозилазе gp144 бактериофага phiKZ
Чертков О.В.
,
Армеев Г.А.
,
Упоров И.В.
, Легоцкий С.А., Сыкилинда Н.Н.,
Шайтан А.К.
,
Клячко Н.Л.
, Мирошников К.А.
в журнале
Acta Naturae (русскоязычная версия)
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 9, № 1, с. 87-94
2017
Дублирующий активный центр в структуре эндолитической трансгликозилазы gp144 бактериофага phiKZ
Чертков О.В.
,
Легоцкий С.А.
,
Сыкилинда Н.Н.
,
Упоров И.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
, Клячко Н.Л.,
Мирошников К.А.
в журнале
Acta Naturae (англоязычная версия)
, издательство
Park Media Ltd
(Moscow, Russia (Federation))
, том 9, № 1, с. 87-94
2017
ИССЛЕДОВАНИЕ ЭНЕРГЕТИЧЕСКОГО ПРОФИЛЯ ПРОЦЕССА ОТВОРАЧИВАНИЯ ДНК ОТ ГИСТОНОВОГО ЯДРА НУКЛЕОСОМЫ МЕТОДАМИ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ
Грибкова А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, том 72, № 3, с. 164-168
2016
Coupling between Histone Conformations and DNA Geometry in Nucleosomes on a Microsecond Timescale: Atomistic Insights into Nucleosome Functions
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Journal of Molecular Biology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 428, № 1, с. 221-237
DOI
2016
Genomic profiling of multiple sequentially acquired tumor metastatic sites from an “exceptional responder” lung adenocarcinoma patient reveals extensive genomic heterogeneity and novel somatic variants driving treatment response
Biswas R.
, Gao S.,
Cultraro CM
, Maity TK,
Venugopalan A.
, Abdullaev Z.,
Shaytan AK
, Carter CA, Thomas A., Rajan A., Song Y.,
Pitts S.
, Chen K., Bass S., Boland J., Hanada KI, Chen J.,
Meltzer PS
,
Panchenko AR
, Yang JC, Pack S.,
Giaccone G.
,
Schrump DS
, Khan J., Guha U.
в журнале
Molecular Case Studies
, издательство
Cold Spring Harbor Laboratory Press
(United States)
, том 2, № 6
DOI
2016
HistoneDB 2.0: a histone database with variants—an integrated resource to explore histones and their variants
Draizen Eli J.
,
Shaytan Alexey K.
,
Mariño-Ramírez Leonardo
,
Talbert Paul B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Database : the journal of biological databases and curation
, издательство
Oxford Journals
(Oxford, England)
, том 2016
DOI
2016
Large-Scale ATP-Independent Nucleosome Unfolding by a Histone Chaperone
Valieva M.E.
,
Armeev G.A.
,
Kudryashova K.S.
,
Gerasimova N.S.
,
Shaytan A.K.
,
Kulaeva O.I.
,
McCullough L.L.
,
Formosa T.
,
Georgiev P.G.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Studitsky V.M.
,
Feofanov A.V.
в журнале
Nature Structural and Molecular Biology
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 23, № 12, с. 1111-1116
DOI
2016
Linker histones structure and functions
Lyubitelev A.V.
,
Nikitin D.V.
,
Shaytan A.K.
,
Studitsky V.M.
,
Kirpichnikov M.P.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 81, № 3, с. 213-223
DOI
2016
Nucleosomal Barrier to Transcription: Structural Determinants and Changes in Chromatin Structure
Studitsky Vasily M.
,
Nizovtseva Ekaterina V.
,
Shaytan Alexey K.
,
Luse Donal S.
в журнале
Biochemistry & Molecular Biology Journal
, издательство
iMedPub LTD
(London, UK)
, том 2, № 2, с. 8
DOI
2016
The Dynamics of Irreversible Evaporation of a Water–Protein Droplet and the Problem of Structural and Dynamic Experiments with Single Molecules
Shaitan K.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в журнале
Biophysics
, издательство
Maik Nauka/Interperiodica Publishing
(Russian Federation)
, том 61, № 2, с. 177-184
DOI
2016
Trajectories of microsecond molecular dynamics simulations of nucleosomes and nucleosome core particles
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Data in Brief
, издательство
Elsevier Inc.
(США)
, том 7, с. 1678-1681
DOI
2016
Динамика необратимого испарения водно-белковой капли и проблема структурно-динамических экспериментов с единичными молекулами
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 61, № 2, с. 213-221
2016
МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ ДНК-БЕЛКОВЫХ КОМПЛЕКСОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ДАННЫХ ПО РЕЗОНАНСНОМУ ПЕРЕНОСУ ЭНЕРГИИ И ПЕРЕКИСНОМУ ОКИСЛЕНИЮ
Армеев Г.А.
,
Горковец Т.К.
,
Ефимова Д.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 1, с. 35-40
2016
Релаксация структуры нуклеосомы при отворачивании ДНК: исследование методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 3, с. 34-37
2016
Структура и функции линкерных гистонов
Любителев А.В.
,
Никитин Д.В.
,
Шайтан А.К.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Biochemistry (Moscow)
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 81, № 3, с. 329-338
2015
6 Combined influence of linker DNA and histone tails on nucleosome dynamics as revealed by microsecond molecular dynamics simulations
Shaytan Alexey K.
,
Armeev Grigoriy A.
, Goncearenco Alexander,
Zhurkin Victor B.
,
Landsman David
,
Panchenko Anna R.
в журнале
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
, издательство
Adenine Press
(United States)
, том 33, № sup1, с. 3-3
DOI
2015
Conformational Flexibility of Nucleosomes: A Molecular Dynamics Study
Armeev G.A.
,
Shaitan K.V.
,
Shaytan and A.K
в журнале
Moscow University Biological Sciences Bulletin
, издательство
Allerton Press
(New York, N.Y., United States)
, том 70, № 3, с. 147-151
DOI
2015
Direct prediction of residual dipolar couplings of small molecules in a stretched gel by stochastic molecular dynamics simulations
Frank AO, Freudenberger JC,
Shaytan AK
, Kessler H., Luy B.
в журнале
Magnetic Resonance in Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 53, № 3, с. 213-217
2015
Nucleosome adaptability conferred by sequence and structural variations in histone H2A-H2B dimers
Шайтан А.К.
, Landsman D.,
Panchenko A.R.
в журнале
Current Opinion in Structural Biology
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 32, с. 48-57
DOI
2015
Structural analysis of nucleosomal barrier to transcription
Gaykalova Daria A.
,
Kulaeva Olga I.
,
Olesya Volokh
,
Shaytan Alexey K.
,
Fu-Kai Hsieh
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 112, № 43, с. E5787-E5795
DOI
2015
Исследование ионного окружения и электрических характеристик нуклеосом методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 4, с. 24-28
2015
Конформационная подвижность нуклеосомы: исследование методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 3, с. 49-54
2014
Analysis of the mechanism of nucleosome survival during transcription
Chang HW
, Kulaeva OI,
Shaytan AK
, Kibanov M.,
Kuznedelov K.
, Severinov KV,
Kirpichnikov MP
,
Clark DJ
,
Studitsky VM
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
, том 42, № 3, с. 1619-1627
2014
Comparative Computational Study of Interaction of C60- Fullerene and Tris-Malonyl-C60-Fullerene Isomers with Lipid Bilayer: Relation to Their Antioxidant Effect
Bozdaganyan M.E.
,
Orekhov Ph S.
,
Shaytan A.K.
,
Shaitan K.V.
в журнале
PLoS ONE
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, № e102487
DOI
2014
Genome packaging in EL and Lin68, two giant phiKZ-like bacteriophages of P. aeruginosa
Sokolova O.S.
,
Shaburova O.V.
,
Pechnikova E.V.
,
Shaytan A.K.
,
Krylov S.V.
,
Kiselev N.A.
,
Krylov V.N.
в журнале
Virology
, издательство
Academic Press
(United States)
, том 470, с. 472-478
DOI
2014
Physicochemical mechanisms of protein regulation by phosphorylation
Nishi H.,
Shaytan A.
,
Panchenko AR
в журнале
Frontiers in genetics
, издательство
Frontiers Research Foundation.
(Lausanne, Switzerland)
, том 5, с. 270
DOI
2014
Voltage-gated ion channel modulation by lipids: insights from molecular dynamics simulations
Kasimova MA
,
Tarek M.
,
Shaytan AK
,
Shaitan KV
,
Delemotte L.
в журнале
Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 1838, № 5, с. 1322-1331
DOI
2013
Peptide nanofibrils boost retroviral gene transfer and provide a rapid means for concentrating viruses
Yolamanova M.
,
Meier C.
,
Шайтан А.К.
,
Vas V.
,
Bertoncini C.
,
Arnold F.
,
Zirafi O.
,
Usmani S.
,
Muller J.
,
Sauter D.
,
Goffinet C.
,
Palesch D.
,
Walther P.
,
Roan N.
,
Geiger H.
,
Lunov O.
,
Simmet T.
,
Bohne J.
,
Schrezenmeier H.
,
Schwarz K.
,
Standker L.
,
Forssmann W.G.
,
Salvatella X.
,
Халатур П.Г.
,
Хохлов А.Р.
,
Knowles T.
,
Weil T.
,
Kirchhoff F.
,
Munch J.
в журнале
Nature Nanotechnology
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 8, с. 130-136
DOI
2013
Structural Analysis of the Key Intermediate Formed during Transcription through a Nucleosome
Chang H.W.
,
Shaytan A.K.
,
Hsieh F.K.
,
Kulaeva O.I.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Studitsky V.M.
в журнале
Trends in cell & molecular biology
, издательство
Research Trends
(India)
, том 8, с. 13-23
2013
Алгоритмы и методы исследования трехмерных атомистических моделей молекул белков на основе анализа картины рассеяния мощного рентгеновского лазерного излучения
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
,
Багров Д.В.
,
Блинов В.Н.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Соколова О.С.
,
Шуров Д.Л.
,
Турченков Д.А.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Наноструктуры. Математическая физика и моделирование
, том 9, № 2, с. 33-74
2013
Моделирование нуклеосом методами атомистического суперкомпьютерного моделирования
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
, Севенюк А.А.,
Студитский В.М.
,
Шайтан А.К.
в журнале
International Journal of Qafqaz University (PHYSICA)
, том 1, № 2, с. 91-99
2012
Расчет спектральных сдвигов мутантов бактериородопсина гибридными методами квантовой механики/молекулярной механики
Орехов Ф.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 57, № 2, с. 221-231
2012
ЭФФЕКТЫ МЕЖИОННЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ ПРИ ФУНКЦИОНИРОВАНИИ И ИНГИБИРОВАНИИ ПОТЕНЦИАЛ-ЗАВИСИМЫХ КАЛИЕВЫХ КАНАЛОВ
Шайтан К.В.
,
Соколова О.С.
,
Шайтан А.К.
, Касимова М.А.,
Новоселецкий В.Н.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
, издательство
Изд-во Моск. ун-та
(М.)
, № 4, с. 17-23
2011
Self-Assembling Nanofibers from Thiophene–Peptide Diblock Oligomers: A Combined Experimental and Computer Simulations Study
Shaytan Alexey K.
,
Eva-Kathrin Schillinger
,
Khalatur Pavel G.
,
Elena Mena-Osteritz
,
Jens Hentschel
,
Borner Hans G.
,
Peter Bauerle
,
Khokhlov Alexei R.
в журнале
ACS Nano
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 5, № 9, с. 6894-6909
2011
Self-organizing bioinspired oligothiophene-oligopeptide hybrids
Shaytan A.K.
,
E-K Schillinger
,
Mena-Osteritz E.
,
Schmid S.
,
Khalatur P.G.
,
Bäuerle P.
,
Khokhlov A.R.
в журнале
Beilstein journal of nanotechnology
, издательство
Beilstein-Institut zur Förderung der Chemischen Wissenschaften
(Frankfurt am Main, Germany)
, том 2, с. 525-544
2011
Метод молекулярной динамики в исследовании свойств биологических объектов
Шайтан К.В.
,
Антонов М.Ю.
,
Шайтан А.К.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Боздаганян М.Е.
,
Касимова М.А.
в журнале
Наноструктуры. Математическая физика и моделирование
, том 6, № 1/2, с. 61-75
2010
Free energy profiles of amino acid side chain analogs near water-vapor interface obtained via MD simulations
Shaytan A.K.
,
Ivanov V.A.
,
Shaitan K.V.
,
Khokhlov A.R.
в журнале
Journal of Computational Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 31, № 1, с. 204-216
2010
Large-scale atomistic simulation of a nanosized fibril formed by thiophene-peptide “molecular chimeras
Shaytan A.K.
,
Khokhlov A.R.
,
Khalatur P.G.
в журнале
Soft Matter
, издательство
Royal Society of Chemistry
(United Kingdom)
, том 6, с. 1453-1461
2010
Взаимодействие зевамицина IIB с липидными бислоями
Николаев И.Н.
,
Левцова О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в журнале
Вестник Якутского государственного университета
, издательство
Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова
(Якутск)
, том 7, с. 52-64
2009
Solvent Accessible Surface Area of Amino Acid Residues in Globular Proteins: Correlation of Apparent Transfer Free Energies with Experimental Hydrophobicity Scales
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Khokhlov Alexei R.
в журнале
Biomacromolecules
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 10, № 5, с. 1224-1237
DOI
2009
Молекулярная динамика зервамицина II и его аналогов в воде и метаноле
Левцова О.В.
,
Антонов М.Ю.
,
Шайтан А.К.
,
Оршанский И.А.
,
Николаев И.Н.
,
Шайтан К.В.
в журнале
Биофизика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 54, № 4, с. 616-621
2006
Динамический молекулярный дизайн био- и наноструктур
Шайтан К.В.
,
Турлей Е.В.
,
Голик Д.Н.
,
Терешкина К.Б.
,
Левцова О.В.
,
Федик И.В.
,
Шайтан А.К.
,
Ли А.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Российский химический журнал
, издательство
Химия
(М.)
, том 50, № 2, с. 53-65
2006
Неравновесная молекулярная динамика наноструктур, включая биологические
Шайтан К.В.
,
Турлей Е.В.
,
Голик Д.Н.
,
Терешкина К.Б.
,
Левцова О.В.
,
Федик И.В.
,
Шайтан А.К.
,
Ли А.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Химическая физика
, издательство
ФГБУ "Издательство "Наука"
(Москва)
, том 25, № 9, с. 31-48
2005
Молекулярная динамика и дизайн био- и наноструктур
Шайтан К.В.
,
Турлей Е.В.
,
Голик Д.Н.
,
Терешкина К.Б.
,
Левцова О.В.
,
Федик И.В.
,
Шайтан А.К.
,
Кирпичников М.П.
в журнале
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова
, том 1, № 1, с. 66-78
Статьи в сборниках
2023
Филогенетический анализ и классификация коротких H2A-гистонов
Сингх-Пальчевская Л.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
VII СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ СБОРНИК ТРУДОВ
, место издания
Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» г. Краснодар
, том 1, с. 355-356
2021
Дизайн множественной экспрессионной кассеты для наработки направляющей рнк системы CRISPR-Cas
Зайцев П.А.
,
Новиков Р.В.
,
Грибкова А.К.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXVIII Международная конференция Математика. Компьютер. Образование-2021
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
2019
Распознавание дифракционных изображений единичных частиц в экспериментах на рентгеновских лазерах
Армеев Г.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
Современные проблемы математики и механики. Материалы международной конференции, посвященной 80-летию академика В. А. Садовничего
, издательство
ООО "МАКС Пресс"
(Москва)
, том 2, с. 441-443
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
Sultanov D.C.
,
Valieva M.E.
,
Maluchenko N.V.
,
Kotova E.
,
Gerasimova N.S.
,
Armeev G.A.
, Hsieh F.K.,
Kudryashova Ksenia S.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaytan A.K.
,
Feofanov A.V.
,
Studitsky V.M.
в сборнике
Abstracts of Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION” 2018
, место издания
США
, с. 76
2014
Investigation of Ion Permeation through the Cx26 Hemichannel
Marina Kasimova
,
Alexey Shaytan
,
Konstantin Shaitan
,
Mounir Tarek
в сборнике
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 106, с. 556a-556a
DOI
2014
Molecular Insights into Electroporation and Electrotransfer through Model Cell Membranes
Marina Kasimova
,
Lucie Delemotte
,
Andraz Polak
,
Damijan Miklavcic
,
Maura Casciola
,
Francesca Apollonio
,
Marie Breton
,
Luis Mir
,
Alexey Shaytan
,
Konstantin Shaitan
,
Mounir Tarek
в сборнике
Biophysical Journal
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 106, с. 291a-291a
2012
Использование параллельных вычислений для решения задач молекулярного моделирования. Глава 2
Антонов М.Ю.
,
Шайтан А.К.
,
Боздаганян М.Е.
,
Орехов Ф.С.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
ТРУДЫ МЕЖДУНАРОДНЫХ КОНФЕРЕНЦИЙ ПО МАТЕМАТИЧЕСКОМУ МОДЕЛИРОВАНИЮ
, место издания
ООО «ИЗДАТЕЛЬСТВО СФЕРА» Якутск
, с. 263-278
2009
Суперкомпьютерное конструирование биоорганических нанопроводов
Шайтан А.К.
,
Халатур П.Г.
,
Хохлов А.Р.
в сборнике
Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности
, место издания
Издательство Московского университета Москва МГУ
, том 1, с. 51-56
редактор
Садовничий Виктор Антонович
2006
Application of molecular dynamics simulations to study of membrane related structures
Shaitan K.V.
,
Tourleigh Ye V.
,
Shaytan A.K.
,
Tereshkina K.B.
,
Levtsova O.V.
,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике
Proceedings of the 2nd Russian-Bavarian Conference on Bio-Medical Engineering
, с. CD-ROM
2006
Molecular dynamics and design of ion channels and nanostructures
Shaitan K.V.
,
Tereshkina K.B.
,
Tourleigh Ye V.
,
Levtsova O.V.
,
Shaytan A.K.
,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике
Proceedings of the 2nd Russian-Bavarian Conference on Bio-Medical Engineering
, с. CD-ROM
2006
Peptide dynamics at water-membrane interface
Shaytan AK
,
Khokhlov AR
, Ivanov VA
в сборнике
Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
, место издания
Novosibirsk, RUSSIA
, том 1, с. 320-323
Книги
2012
Молекулярное моделирование
Шайтан А.К.
,
Николаев И.Н.
,
Антонов М.Ю.
,
Ефремов Р.Г.
,
Шайтан К.В.
место издания
Издательский дом СВФУ Якутск
, ISBN 978-5-7513-1738-6, 64 с.
Доклады на конференциях
2023
Comparative analysis of human nuclear proteome and chromatome composition from different experiments, databases and prediction algorithms
(Стендовый)
Авторы:
Gribkova Anna K.
,
Shaytan Alexey K.
EMBL Conference: Chromatin and epigenetics
, Heidelberg, Германия, 15-18 мая 2023
2023
Understanding functional modes of histone octamer plasticity with MD simulations and en masse analysis of PDB structures
(Приглашенный)
Автор:
Шайтан А.К.
Multisacle Simulations of DNA from Electrons to Nucleosomes: 22 years of the Ascona B-DNA Consortium
, Аскона, Швейцария, 17-21 апреля 2023
2023
От ДНК-белковых взаимодействий к пониманию функционирования геномов эукариот
(Пленарный)
Автор:
Шайтан А.К.
VII Съезд биофизиков России
, Краснодар, Россия, 17-23 апреля 2023
2023
Разработка подходов к моделированию скольжения ДНК в нуклеосоме методом полноатомной МД
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
VII Съезд биофизиков России
, Краснодар, Россия, 17-23 апреля 2023
2023
Сравнительный анализ состава ядерного протеома и хроматома человека из экспериментов, баз данных и предсказательных алгоритмов
(Устный)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Шайтан Алексей Константинович
Ломоносовские чтения - 2023, Секция биология
, Россия, 4-14 апреля 2023
2023
ВЛИЯНИЕ ПРИРОДНЫХ ПЕПТИДОВ С ВЫСОКОЙ АФФИННОСТЬЮ К «КИСЛОТНОМУ ЛОСКУТУ» ГИСТОНОВОГО ДИМЕРА Н2А/Н2В НА РАЗВОРАЧИВАНИЕ НУКЛЕОСОМ КОМПЛЕКСОМ FACT
(Стендовый)
Авторы:
Олейников П.Д.
,
Сивкина А.Л.
,
Студитский В.М.
,
Феофанов А.В.
,
Шайтан А.К.
III Студенческий биохимический форум
, Москва, Россия, 12-13 марта 2023
2023
ВЛИЯНИЕ ПРИРОДНЫХ ПЕПТИДОВ С ВЫСОКОЙ АФФИННОСТЬЮ К «КИСЛОТНОМУ ЛОСКУТУ» ГИСТОНОВОГО ДИМЕРА РАЗВОРАЧИВАНИЕ НУКЛЕОСОМ КОМПЛЕКСОМ FACT
(Стендовый)
Авторы:
Олейников П.Д.
,
Сивкина А.Л.
,
Студитский В.М.
,
Феофанов А.В.
,
Шайтан А.К.
XXXV ЗИМНЯЯ МОЛОДЁЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ
, г. москва, Россия, 7-10 февраля 2023
2023
Collection of Nucleosome Structures: Current State and Perspective
(Стендовый)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Шайтан А.К.
International Symposium on Chromatin Architecture: Structure and Function 2023
, Онлайн, Япония, 24-25 января 2023
2023
Intranucleosomal DNA Loops Senses DNA Damage during Transcription
(Стендовый)
Авторы:
Gerasimova Nadezhda S.
,
Pestov Nikolay A.
,
Volokh Olesya I.
,
Armeev Grigory A.
,
Shaytan Alexey K.
,
Sokolova Olga S.
,
Studitsky Vasily M.
International Symposium on Chromatin Architecture: Structure and Function 2023
, Онлайн, Япония, 24-25 января 2023
2023
Исследование пластичности димера гистонов Н2А-Н2В методом молекулярной динамики
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, on-line, Россия, 23-27 января 2023
2022
Structure and dynamics of chromatin at nucleosome level: integrating experiments and simulations
(Приглашенный)
Автор:
Шайтан А.К.
«Биоинформатика и системная биология регуляции и структуры геномов» BGRS/SB-2022
, Новосибирск, Россия, 4-8 июля 2022
2022
Компьютерное моделирование структуры и динамики ДНК в хроматине
(Пленарный)
Автор:
Шайтан А.К.
IX Всероссийская научная молодежная школа-конференция "Химия, физика, биология: пути интеграции"
, ФИЦ ХФ РАН, Россия, 20-22 апреля 2022
2022
BULK AUTOMATED ANALYSIS OF VARIABILITY OF NUCLEOSOME STRUCTURES AND THEIR COMPLEXES
(Стендовый)
Авторы:
Armeev Grigoriy
,
Gribkova Anna
,
Shaytan Alexey K.
66th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан Франциско, США, 19-23 февраля 2022
2022
Development of algorithms for mining and classification of histone proteins
(Стендовый)
Авторы:
Singh-Palchevskaia Lovepreet
,
Shaytan Alexey K.
66th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан Франциско, США, 19-23 февраля 2022
2022
Histone tails conformation switching analyzed by all-atom MD simulations of nucleosomes
(Стендовый)
Авторы:
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
Biophysical Society 66th Annual Meeting
, San Francisco, California, США, 19-23 февраля 2022
2022
Комплексный биоинформатический анализ последовательностей белков хроматина человека
(Устный)
Авторы:
Грибкова А.К.
,
Шайтан А.К.
ИТИС(б) — Информационные технологии и системы. Биоинформатика.
, Огниково, Моск. обл., Россия, 18 февраля - 21 марта 2022
2022
Разработка методов анализа данных секвенирования нового поколения в экспериментах по лентивирусной трансдукции мезенхимальных стволовых клеток
(Устный)
Авторы:
Кожевникова Д.Д.
,
Бигильдеев А.Е.
,
Шайтан А.К.
ИТИС(б) — Информационные технологии и системы. Биоинформатика.
, Огниково, Моск. обл., Россия, 18 февраля - 21 марта 2022
2022
Исследование скольжения ДНК в нуклеосоме методом молекулярного моделирования.
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXIX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2022
, on-line, Россия, 24-28 января 2022
2022
Построение классификатора для выявления белков, разделяющих жидкие фазы, методами машинного обучения
(Устный)
Авторы:
Грибкова А.К.
,
Шайтан А.К.
XXIX Международная конференция Математика. Компьтер. Образование МКО-2022
, on-line, Россия, 24-30 января 2022
2021
Использование нейронных сетей для решения задач распознавания диффракционных картин рассеяния в экспериментах с использованием рентгеновских лазеров на свободных электронах
(Пленарный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Кирпичников М.П.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
XII Международная научная конференция «Интеллектуальные системы и компьютерные науки»
, Москва, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 29 ноября - 3 декабря 2021
2021
Влияние фосфорилирования на структуру глюканозилтрансгликозилазы Bgl2 клеточной стенки дрожжей Saccharomyces cerevisiae
(Стендовый)
Авторы:
Моторин Н.А.
,
Рекстина В.В.
,
Зиганшин Р.Х.
,
Шайтан А.К.
, Калебина Т.С.
III ОБЪЕДИНЕННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ ФИЗИОЛОГОВ, БИОХИМИКОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ; VII СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ; X РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ»; VII СЪЕЗД ФИЗИОЛОГОВ СНГ
, Сочи, Дагомыс, Россия, 3-8 октября 2021
2021
Using supercomputers to study molecular dynamics of DNA-protein complexes at multi-microsecond time scale
(Пленарный)
Автор:
Шайтан А.К.
Суперкомпьютерные дни в России 2021
, Москва, Россия, 27-28 сентября 2021
2021
Modeling of tandem dCas9 complexes bound to DNA for nucleic acids detection
(Стендовый)
Авторы:
Новиков Роман Вячеславович
,
Качер Юлия Германовна
,
Грибкова Анна Кирилловна
,
Зайцев Пётр Андреевич
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Глухов Григорий Сергеевич
,
Шайтан Алексей Константинович
Microscopy and Microanalysis 2021
, Online, США, 1 августа - 5 октября 2021
2021
Atomic-level mechanisms of nucleosome dynamics from MD simulations and comparative structure analysis
(Приглашенный)
Автор:
Шайтан А.К.
The Biophysical Society’s (BPS) Multiscale Genome Organization Subgroup Webinars
, онлайн, США, 23 июня 2021
2021
Neural Network Approaches to Classify 3D Protein Structures from the Data of X-ray Laser Radiation Diffraction from Single Particles
(Стендовый)
Авторы:
Novoseletsky Valery
,
Lozhnikov Mikhail
,
Armeev Grigoriy
,
Kudriavtsev Aleksandr
,
Shaytan Alexey
,
Kobelkov Georgiy
,
Shaitan Konstantin
Криоэлектронная микроскопия 2021: достижения и перспективы (RUSSIAN INTERNATIONAL СONFERENCE ON CRYOELECTRON MICROSCOPY 2021; RICCEM2021)
, Москва, Россия, 30 мая - 2 июня 2021
2021
Молекулярная динамика нуклеосом на временах до 15 микросекунд
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
Ломоносовские чтения 2021
, МГУ им.М.В. Ломоносова, Россия, 21 апреля 2021
2021
Numerical experiments using neural network algorithms to determine 3D protein structures from the data of X-ray laser radiation diffraction from single particles
(Стендовый)
Авторы:
Shaitan K.V.
,
Lozhnikov M.A.
,
Novoseletsky V.N.
,
Armeev G.A.
,
Kudryavtsev A.V.
,
Kobelkov G.M.
,
Shaitan A.K.
,
Kirpichnikov M.P.
European XFEL Users' Meeting 2021
, Гамбург, Германия, 25-29 января 2021
2020
Design of molecular systems for pathogens nucleic acids detection
(Устный)
Авторы:
Качер Ю.Г.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
CRISPRussia 2020
, Институт биологии гена Российской академии наук, Россия, 2-4 декабря 2020
2020
Биоинформатический подход для дизайна гидовых РНК для набора детектирующих CRISPR/Cas-систем
(Устный)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
ШКОЛА-КОНФЕРЕНЦИЯ: Генетические технологии в фундаментальных и прикладных исследованиях
, онлайн, Россия, 2-4 декабря 2020
2020
Detecting Cas9-sgRNA Complex Interactions with DNA via Fluorescent Microscopy: Computer Simulations of Experimental Designs
(Стендовый)
Авторы:
Novikov R.
,
Armeev G.
,
Gribkova A.
,
Kacher J.
,
Gluhov G.
,
Shaytan A.
Microscopy and Microanalysis 2020
, virtual, США, 1-6 августа 2020
2021
ДИЗАЙН МНОЖЕСТВЕННОЙ ЭКСПРЕССИОННОЙ КАССЕТЫ ДЛЯ НАРАБОТКИ НАПРАВЛЯЮЩЕЙ РНК СИСТЕМЫ CRISPR-CAS
(Устный)
Авторы:
Зайцев П.А.
,
Новиков Р.В.
,
Грибкова А.К.
,
Глухов Г.С.
,
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2021
Использование пары флуоресцентно-меченных CRISPR/Cas для детекции целевого участка ДНК, исследование методами молекулярного моделирования
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Новиков Р.В.
,
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2021
Компьютерное моделирование эксперимента по изучению взаимодействия между комплексом Cas9-sgRNA с ДНК с использованием флуоресцентной микроскопии
(Устный)
Авторы:
Новиков Р.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2021
Моделирование и молекулярный дизайн комплексов белков и нуклеиновых кислот
(Устный)
Автор:
Шайтан А.К.
XXVIII-ая Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (25 - 30 января 2021)
, Россия, 25 февраля 2020 - 30 января 2021
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
(Приглашенный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Шайтан А.К.
64th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан-Диего, США, 15-19 февраля 2020
2020
Analyzing nucleosome plasticity via atomistic MD simulations
(Приглашенный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Шайтан А.К.
64th Biophysical Society Annual Meeting
, Сан-Диего, США, 15-19 февраля 2020
2020
Сравнительная динамика канонических нуклеосом и нуклеосом с вариантной формой гистона Н2А
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
II межвузовская студенческая конференция «Студенческий биохимический форум — 2020»
, Кафедра биохимии Биологического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Россия, 9-10 февраля 2020
2020
Динамические особенности нуклеосом с каноническим гистоном Н2А и его вариантной формой Н2А.Z
(Устный)
Авторы:
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVII Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование».
, г. Дубна, Россия, 28 января - 1 февраля 2020
2020
Физические основы эпигенетических процессов - на пути к пониманию функционирования генома
(Приглашенный)
Автор:
Шайтан А.К.
XXVII Международная конференция «Математика. Компьютер. Образование».
, г. Дубна, Россия, 28 января - 1 февраля 2020
2019
Структура, динамика и функционирование нуклеосом в хроматине
(Пленарный)
Автор:
Шайтан А.К.
школа молодых ученых «Генетика и эпигенетика: механизмы, структура, функция»
, Москва, Россия, 10-11 октября 2019
2019
Флуоресцентная микроскопия одиночных нуклеосом в структурных исследованиях ДНК-белковых комплексов
(Устный)
Авторы:
Феофанов А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Любителев А.В.
,
Армеев Г.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
,
Котова Е.Ю.
,
Студитский В.М.
,
Кирпичников М.П.
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды»
, Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
2019
Analyzing nucleosome plasticity using molecular dynamics simulations
(Устный)
Авторы:
Князева А.
,
Поспелова Юнона
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
,
Комарова г.а.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Analyzing nucleosome plasticity using molecular dynamics simulations
(Устный)
Автор:
Шайтан А.К.
FEBS 2019
, г. Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Construction and analysis of an interactome between nucleosomes and chromatin proteins
(Стендовый)
Авторы:
Gribkova A.K.
,
Shaytan A.K.
The 44th FEBS Congress, Krakow, Poland, July 6-11.
, Краков, Польша, 6-11 июля 2019
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
(Устный)
Авторы:
Lozhnikov Mikhail A.
,
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Shaitan Konstantin V.
Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05)
, Moscow, Россия, 2-5 июня 2019
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
(Устный)
Авторы:
Lozhnikov Mikhail A.
,
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
,
Shaitan Konstantin V.
Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05)
, Moscow, Россия, 2-5 июня 2019
2019
Распознавание дифракционных изображений единичных частиц в экспериментах на рентгеновских лазерах
(Устный)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
Международная научная конференция «Современные проблемы математики и механики», посвященная 80-летию академика В. А. Садовничего
, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 13-15 мая 2019
2019
Моделирование дифракционных экспериментов с единичными частицами с использованием рентгеновских лазеров на свободных электронах
(Устный)
Авторы:
Ложников М.А.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кобельков Г.М.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
«Ломоносовские чтения - 2019». Секция «Биология»
, Москва, МГУ, Россия, 15-25 апреля 2019
2019
NUCLEOSOME MODELING AT ATOMISTIC DETAIL HELPS TO INTERPRET BIOPHYSICAL EXPERIMENTS
(Стендовый)
Авторы:
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
,
Panchenko A.R.
Multiscale Modeling of Chromatin: Bridging Experiment with Theory
, Les Houches, Франция, 31 марта - 5 апреля 2019
2019
GROMACS force field parameters and molecule topology editing
(Стендовый)
Авторы:
Андреева Е.А.
,
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВ ГИСТОНОВ H3-H4
(Стендовый)
Авторы:
Поспелова Ю.
,
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВ ГИСТОНОВ H3-H4
(Устный)
Авторы:
Поспелова Ю.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
Оценка изменения свободной энергии депротонирования аминокислот, участвующих в переносе протона, в ходе фотоцикла бактериородопсина
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
РЕДАКТИРОВАНИЕ ПАРАМЕТРОВ СИЛОВЫХ ПОЛЕЙ И ТОПОЛОГИЙ МОЛЕКУЛ ДЛЯ ПРОГРАММЫ GROMACS
(Устный)
Авторы:
Андреева Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2019
Создание молекулярных моделей нуклеосом и их комплексов по разнородным экспериментальным данным
(Устный)
Авторы:
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
XXVI международная конференция «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 28 января — 2 февраля 2019 г.).
, Пущино, Россия, 28 января - 2 февраля 2019
2018
Исследование процесса переноса протона в ходе фотоцикла бактериородопсина
(Стендовый)
Авторы:
Князева А.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
Студенческий биохимический форум
, Биологический факультет МГУ, Москва, Россия, 10-17 декабря 2018
2018
Mutual influence of linker histone H1 amino acid sequence and DNA nucleotide sequence on the linker histone H1 position in chromatosome
(Стендовый)
Авторы:
Горковец Т.К.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Армеев Г.А.
The 43th FEBS Congress
, Прага, Чехия, 7-12 июля 2018
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
(Приглашенный)
Авторы:
Kudryashova K.S.
,
Kotova E.Y.
,
Studitsky V.М.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Maluchenko N.V.
,
Valieva M.E.
,
Sultanov D.C.
,
Gerasimova N.S.
,
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Feofanov A.V.
,
Shaytan A.K.
5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy ( INTERM 2018)
, Oludeniz, Турция, 24-30 апреля 2018
2018
Effects of Histone Chaperones FACT and PARP1 on Nucleosome Structure and Transcription
(Приглашенный)
Авторы:
Sultanov D.C.
,
Valieva M.E.
,
Maluchenko N.V.
,
Kotova E.
,
Gerasimova N.S.
,
Shaytan A.K.
,
Hsieh F.K.
,
Kudryashova K.S.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Feofanov A.V.
,
Studitsky
,
Armeev G.A.
Cold Spring Harbor Laboratory international meeting on “THE PARP FAMILY & ADP-RIBOSYLATION”
, Cold Spring Harbor Laboratory, США, 3-6 апреля 2018
2017
nucleosome’s stability in volatile buffer
(Стендовый)
Авторы:
Valieva Maria E.
,
Gerasimova Nadezhda S.
,
Armeev Grigori A.
,
Maluchenko Natalia V.
,
Kudryashova Kseniya S.
,
Feofanov Alexey V.
,
Studitsky Vasily M.
,
Shaytan Alexey K.
"Biology at Advanced Laser Light Sources" workshop at European XFEL
, Гамбург, European XFEL, Германия, 30 ноября - 1 декабря 2017
2017
Integrative modeling methods for understanding nucleosome dynamics
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Gribkova A.K.
,
Armeev G.A.
Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'17)
, Москва, Россия, 27-30 июля 2017
2017
Integrative modeling of protein-DNA complexes
(Стендовый)
Авторы:
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
Российская международная конференция по криоэлектронной микроскопии RICCEM-2017
, Москва, МГУ имени М. В. Ломоносова, Россия, 5-8 июня 2017
2017
Large-Scale ATP-independent nucleosome unfolding by a histone chaperone FACT
(Стендовый)
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Valieva M.E.
,
Armeev G.A.
,
Kudryashova K.S.
,
Gerasimova N.S.
,
Kulaeva O.I.
,
McCullough L.L.
,
Formosa T.
,
Studitsky V.M.
,
Feofanov A.V.
Chromatin and Epigenetics
, Гейдельберг, Германия, 3-6 мая 2017
2017
Nucleosome dynamics, histone variants and DNA breaking by hydroxyl-radicals
(Стендовый)
Авторы:
Hua Xiao
,
Grigoriy Armeev
,
Shaytan Alexey K.
,
David Landsman
,
Panchenko Anna R.
,
Carl Wu
Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology "Genomic instability and DNA repair"
, Санта Фе, США, 2-7 апреля 2017
2019
Профиль процесса отворачивания ДНК от гистонового ядра нуклеосомы, рассчитанный методами молекулярного моделирования
(Устный)
Авторы:
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
V International Scientific Conference of Young Researchers Devoted to the 94-th Anniversary of Azerbaijani National Leader Heydar Aliyev
, Баку, Азербайджан, 2 апреля 2017 - 19 апреля 2019
2017
Chromatin structure and function investigation using integrative modeling approach
(Устный)
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Сотрудничество факультетов Московского университета и Рочестерского технологического института: направления и перспективы
, ЗБС МГУ имени С.Н. Скадовского, Россия, 10-16 января 2017
2016
Интеграция экспериментальных данных и вычислительных методов в исследовании хроматина.
(Устный)
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Первый Российский кристаллографический конгресс
, Москва, Россия, 21-26 ноября 2016
2016
Dual active site in the endolytic transglycosilase gp144 of bacteriophage phiKZ
(Стендовый)
Авторы:
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Legotsky S.A.
,
Klyachko N.L.
,
Miroshnikov K.A.
,
Shaytan A.K.
BACTERIOPHAGES: Theoretical and practical aspects of Their application in Medicine, Veterinary and Food. To the 100th Anniversary of the Discovery of Bacteriophages
, Москва, Россия, 13-15 октября 2016
2016
Chromatin Transcription: Epigenetics, Cancer & Aging
(Устный)
Авторы:
Valieva Maria E.
,
Gerasimova Nadezhda S.
,
Armeev Grigori A.
,
Kudryashova Kseniya S.
,
Nikitin Dmitry V.
,
Chertkov Oleg V.
,
Kulaeva Olga I.
,
Feofanov Alexey V.
,
Kirpichnikov Mikhail P.
,
Studitsky Vasily M.
,
Shaytan Alexey K.
II Международная научная конференция «Наука будущего»
, Казань, Россия, 20-23 сентября 2016
2016
Nucleosome Dynamics at Microsecond Timescale: DNA-Protein Interac- tions, Water-Mediated Interactions and Nucleosome Formation
(Стендовый)
Авторы:
Armeev Grigory A.
,
Alexander Goncearenco
,
Shaytan Alexey K.
,
David Landsman
,
Panchenko Anna R.
,
Zhurkin Victor B.
Biophysical Society 60th Annual Meeting
, Los Angeles, США, 27 февраля - 2 марта 2016
2016
Liquid sample delivery for XFEL: simulations of a protein solution nanodroplet evaporation
(Стендовый)
Авторы:
Armeev G.
,
Shaytan A.
,
Shaitan K.
European European x-ray free electron laser/XFEL Users’ Meeting 2016
, Hamburg, Германия, 27 января - 29 апреля 2016
2014
Structural Analysis of the Strong Nucleosomal Barrier to Transcription by Pol II
(Стендовый)
Авторы:
Gaykalova D.A.
,
Volokh O.I.
,
Kulaeva O.I.
,
Hsieh F.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Sokolova O.S.
,
Studitsky V.M.
,
Shaytan A.K.
Gordon Research Conference
, Bentley University Waltham, MA, США, 8-13 июня 2014
2014
Investigation of Ion Permeation through the Cx26 Hemichannel
(Стендовый)
Авторы:
Marina Kasimova
,
Alexey Shaytan
,
Mounir Tarek
,
Konstantin Shaitan
Biophysical society meeting 2014
, Сан-Франциско, Калифорния, США, 14-19 февраля 2014
2014
Molecular Insights into Electroporation and Electrotransfer through Model Cell Membranes
(Стендовый)
Авторы:
Marina Kasimova
,
Lucie Delemotte
,
Andraz Polak
,
Damijan Miklavcic
,
Maura Casciola
,
Alexey Shaytan
,
Marie Breton
,
Luis Mir
,
Konstantin Shaitan
,
Mounir Tarek
,
Francesca Apollonio
Biophysical society meeting 2014
, Сан-Франциско, Калифорния, США, 14-19 февраля 2014
2013
Atomistic computer simulations of nucleosomes and elongation complexes
(Устный)
Авторы:
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
19. International Symposium “Frontiers In Electronic Structure Theory and Multi Scale Modeling”, 21 – 22 October, 2013
, Moscow, Russia, Россия, 2013
2013
Исследование нуклеосом и элонгационных комплексов методами атомистического компьютерного моделирования
(Устный)
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
,
Севенюк А.А.
,
Студитский В.М.
VII Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития", 19-22 марта 2013
, Москва, Россия, 19-22 марта 2013
2013
Методы молекулярного моделирования и биоинформатики для регуляризации обратной задачи рассеяния лазерного рентгеновского излучения на белковых структурах
(Устный)
Авторы:
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
,
Кирпичников М.П.
VII Московский международный конгресс, "Биотехнология: состояние и перспективы развития"
, г.Москва, Россия, 19-22 марта 2013
2006
Application of molecular dynamics simulations to study of membrane related structures
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Shaitan K.V.
,
Tourleigh Ye V.
,
Tereshkina K.B.
,
Levtsova O.V.
,
Kirpichnikov M.P.
Proceedings of the 2nd Russian-Bavarian Conference on Bio-Medical Engineering
, Russia, Россия, 2006
2006
Molecular dynamics and design of ion channels and nanostructures
Авторы:
Shaytan A.K.
,
Tereshkina K.B.
,
Tourleigh Ye V.
,
Levtsova O.V.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaitan K.V.
Proceedings of the 2nd Russian-Bavarian Conference on Bio-Medical Engineering
, Russia, Россия, 2006
Тезисы докладов
2023
Исследование пластичности димера гистонов Н2А-Н2В методом молекулярной динамики
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2023
, тезисы
2023
От ДНК-белковых взаимодействий к пониманию функционирования геномов эукариот
Шайтан А.К.
в сборнике
VII СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ СБОРНИК ТРУДОВ
, место издания
Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» г. Краснодар г. Краснодар
, том 1, тезисы, с. 7-8
2023
Разработка подходов к моделированию скольжения ДНК в нуклеосоме методом полноатомной МД
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
VII СЪЕЗД БИОФИЗИКОВ РОССИИ СБОРНИК ТРУДОВ
, место издания
Типография ФГБОУ ВО «КубГТУ» г. Краснодар г. Краснодар
, том 1, тезисы, с. 341-342
2022
Histone tails conformation switching analyzed by all-atom MD simulations of nucleosomes
Kniazeva Anastasiia S.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Shaytan Alexey K.
в сборнике
Biophysical Society 66th Annual Meeting
, издательство
Biophysical Society
(United States)
, том 121, тезисы, с. 361a
DOI
2022
Structure and dynamics of chromatin at nucleosome level: integrating experiments and simulations
Шайтан А.К.
в сборнике
Abstracts the Thirteenth International Multiconference. Novosibirsk, 2022
, место издания
Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук Новосибирск
, тезисы, с. 315
2022
Исследование скольжения ДНК в нуклеосоме методом молекулярного моделирования
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXIX Международная конференция Математика. Компьютер. Образование МКО-2022
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 29, тезисы
2022
Кластеризация и анализ последовательностей гистоновых белков H2A
Сингх-Пальчевская Л.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Сборник тезисов IX Международной конференции молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков
, место издания
АНО "Инновационный центр Кольцово" Новосибирск
, тезисы, с. 46-47
2021
15-microsecond molecular dynamics simulations of nucleosome show structural heterogeneity and plasticity
Armeev G.A.
,
Kniazeva A.S.
,
Komarova G.A.
,
Kirpichnikov M.P.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
International Journal of Biomedicine
, серия
Issue Suppl_1
, место издания
International Medical Research and Development Corporation
, том 11, тезисы, с. 19-20
DOI
2021
Влияние фосфорилирования на структуру глюканозилтрансгликозилазы Bgl2 клеточной стенки дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Моторин Н.А.
,
Рекстина В.В.
,
Зиганшин Р.Х.
,
Шайтан А.К.
,
Калебина Т.С.
в сборнике
III ОБЪЕДИНЕННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ ФИЗИОЛОГОВ, БИОХИМИКОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ; VII СЪЕЗД БИОХИМИКОВ РОССИИ; X РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ»; VII СЪЕЗД ФИЗИОЛОГОВ СНГ. НАУЧНЫЕ ТРУДЫ
, место издания
Перо Москва
, том 2, тезисы, с. 118
2020
Динамические особенности нуклеосом с каноническим гистоном Н2А и его вариантной формой Н2А.Z. 27 международная конференция Математика, компьютер
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XXVII Международная конференция "Математика. Компьютер. Образование" (МКО-2020)
, серия
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, том 27, тезисы, с. 47-47
2020
Сравнительная динамика канонических нуклеосом и нуклеосом с вариантной формой гистона Н2А. II межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
II межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум - 2020
, тезисы
2019
Abstract P-47: Recognition of single particle’s diffraction images generated in x-ray free electron laser experiments
Lozhnikov Mikhail A.
,
Kobelkov Georgiy M.
,
Armeev Grigoriy A.
,
Kudriavtsev Aleksandr V.
,
Novoseletsky Valery N.
,
Shaytan Alexey K.
,
Shaitan Konstantin V.
в сборнике
International Journal of Biomedicine
, серия
S1
, место издания
International Medical Research and Development Corporation Нью Йорк
, том 9, тезисы, с. 38-38
DOI
2019
Оценка изменения свободной энергии депротонирования аминокислот , участвующих в переносе протона , в ходе фотоцикла бактериородопсина
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Математика, компьютер образование
, место издания
АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск
, тезисы, с. 37-37
2019
Создание молекулярных моделей нуклеосом и их комплексов по разнородным экспериментальным данным
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Математика, компьютер образование
, место издания
АНО "Ижевский институт компьютерных исследований" Ижевск
, тезисы, с. 30-30
2018
Single-particle FRET Microscopy of Structural Rearrangements in Nucleosomes Induced by Some Nuclear Proteins
Feofanov V.
,
Maluchenko N.V.
,
Valieva M.E.
,
Sultanov D.C.
,
Gerasimova N.S.
,
Chertkov O.V.
,
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
,
Kudryashova K.S.
,
Kotova E.Y.
,
Studitsky V.М.
,
Kirpichnikov M.P.
в сборнике
Book of abstracts of 5th International Congress on Microscopy & Spectroscopy (INTERM 2018)
, место издания
Turkey
, тезисы, с. 55
2018
Исследование процесса переноса протона в ходе фотоцикла бактериородопсина
Князева А.С.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
"I межвузовская студенческая конференция Студенческий биохимический форум - 2018"
, тезисы, с. 12-13
2018
МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ ДИМЕРОВГИСТОНОВ H3-H4
Поспелова Ю.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 56
2018
РЕДАКТИРОВАНИЕ ПАРАМЕТРОВ СИЛОВЫХ ПОЛЕЙ И ТОПОЛОГИЙМОЛЕКУЛ ДЛЯ ПРОГРАММЫ GROMACS
Андреева Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 29
2018
СОЗДАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МОДЕЛЕЙ НУКЛЕОСОМ И ИХ КОМПЛЕКСОВПО РАЗНОРОДНЫМ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫМ ДАННЫМ
Армеев Г.А.
,
Шайтан К.В.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
26 международная конференция " Математика, компьютер, образование"
, серия
26
, издательство
Автономная некоммерческая организация Ижевский институт компьютерных исследований
(Ижевск)
, тезисы, с. 30
2017
INTEGRATIVE MODELING METHODS FOR UNDERSTANDING NUCLEOSOME DYNAMICS. 2017. С. 178
Armeev G.
,
Gribkova A.
,
Shaytan A.
в сборнике
Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB-2017
, место издания
Moscow
, тезисы, с. 178
2017
INTEGRATIVE MODELING OF PROTEIN-DNA COMPLEXES
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
Сборник трудов международной конференции по криоэлектронной микроскопии
, тезисы, с. 11-11
2017
Профиль процесса отворачивания ДНК от гистонового ядра нуклеосомы, рассчитанный методами молекулярного моделирования
Грибкова Анна Кирилловна
,
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
V International Scientific Conference of Young Researchers Devoted to the 94-th Anniversary of Azerbaijani National Leader Heydar Aliyev
, место издания
Baku
, тезисы
2013
Atomistic computer simulations of nucleosomes and elongation complexes
Armeev G.A.
,
Shaytan A.K.
в сборнике
Frontiers In Electronic Structure Theory And Multi Scale Modeling
, место издания
Moscow, MS&S
, тезисы, с. 49-978
2013
Исследование нуклеосом и элонгационных комплексов методами атомистического компьютерного моделирования», VII Московский международный конгресс, Биотехнология: состояние и перспективы развития, 19-22 марта 2013, материалы конгресса
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
, Севенюк А.А.,
Студитский В.М.«
в сборнике
VII Московский международный конгресс, "Биотехнология: состояние и перспективы развития Москва, 19-22 марта 2013 г. Материалы Конгресса
, место издания
ЗАО «Экспо-биохим-технологии», РХТУ им. Д.И.Менделеева г.Москва
, том 1, тезисы, с. 251-251
2013
Исследование структуры и конформационной подвижности нуклеосом методом молекулярной динамики
Армеев Г.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2013»
, издательство
ООО "МАКС Пресс"
(Москва)
, тезисы, с. 23-23
редакторы
Андреев А.И.
,
Андриянов Андрей Владимирович
,
Антипов Евгений Александрович
,
Чистякова М.В.
2012
Design of Block Copolymer Nanostructures in the Bulk and in Thin Films
Шайтан А.К.
,
Хохлов А.Р.
в сборнике
Book of abstracts 11th European symposium on polymer blends, 25-28 March, 2012 San Sebastian-Donostia, Spain
, тезисы, с. 21
2012
Modulation of voltage-gated potassium channel Kv1.2 by lipid composition
Касимова М.А.
,
Delemotte L.
,
Tarek M.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
Book of abstracts IAS Winter School of “Hierarchical Methods for Dynamics in Complex Molecular Systems”, Forschungszentrum, Jülich. 2012
, тезисы, с. 31
2012
Молекулярное моделирования амилоидоподобных фибрилл
Шайтан А.К.
,
Халатур П.Г.
,
Хохлов А.Р.
в сборнике
Материалы докладов IV Съезда биофизиков России (20-26 августа 2012 г., Нижний Новгород)
, место издания
© Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского, 2012 Нижний Новгород
, том 1, тезисы, с. 319
2011
Изучение молекулярных механизмов ионной проводимости бактериального калиевого канала KcsA методами молекулярного моделирования
Касимова М.А.
,
Шайтан А.К.
в сборнике
XVIII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных Ломоносов-2011, Москва
, тезисы, с. 23-23
2011
Исследование взаимодействия фуллерена и его производного с биомембранами методом молекулярной динамики
Боздаганян М.Е.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
в сборнике
II Международная научная школа «Наноматериалы и нанотехнологии в живых системах. Безопасность и наномедицина.», Москва, 19 – 24 сентября 2011 г
, место издания
Москва
, тезисы, с. 16-16
2010
Computer Simulations of Self-Assembling Nanowires from Thiophene-Peptide Diblock Oligomers
Шайтан А.К.
,
Халатур П.Г.
,
Хохлов А.Р.
в сборнике
Book of abstracts 9th International Symposium on Functional Pi-Electron Systems. May 23-28, 2010, Georgia Institute of Technology – Atlanta, USA
, тезисы
НИРы
Модуляция функций потенциал-зависимых ионных каналов: исследования методами молекулярной динамики
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан А.К.
Участник НИР:
Касимова М.А.
6 мая 2022 - 31 декабря 2023
Анализ разнообразия и поиск новых функционально значимых семейств гистоновых белков в животных, растениях, грибах, археях и вирусах
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственный исполнитель:
Сингх-Пальчевская Л.Р.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
10 января 2022 - 30 ноября 2023
Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач промышленных и пищевых биотехнологий
Кафедра синтетической биологии
Руководитель:
Страховская М.Г.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Глухов Г.С.
,
Кочиева Е.З.
,
Машко С.В.
,
Попов В.О.
,
Шайтан А.К.
29 октября 2021 - 31 декабря 2023
Разработка научно-методической базы для проведения исследований и подготовки кадров при решении структурных и динамических задач фундаментальной и прикладной биологии с использованием современных источников рентгеновского излучения и нейтронов
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственные исполнители:
Гераськина О.В.
,
Максимов Е.Г.
,
Рамонова А.А.
,
Феофанов А.В.
,
Шайтан А.К.
29 октября 2021 - 15 декабря 2021
Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач промышленных и пищевых биотехнологий
Биологический факультет
Руководитель:
Страховская М.Г.
Ответственные исполнители:
Кочиева Е.З.
,
Машко С.В.
,
Попов В.О.
,
Шайтан А.К.
29 сентября 2021 - 31 декабря 2023
Новые системы и уровни редактирования геномов: от нуклеотидной последовательности к пространственной организации (биологический факультет)
Биологический факультет
Руководители:
Разин С.В.
,
Студитский В.М.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Афонин Д.А.
,
Багров Д.В.
,
Балева М.В.
,
Волох О.И.
,
Вьюшков В.С.
,
Галдина Г.В.
,
Герасимов Е.С.
,
Герасимова Н.С.
,
Гилязова А.В.
,
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
,
Жаркова И.И.
,
Замалутдинова С.В.
,
Карлова М.Г.
,
Карпова О.И.
,
Кирпичников М.П.
,
Князева А.С.
,
Кожевникова Д.Д.
,
Коровина А.Н.
,
Кравчук Е.В.
,
Левицкий С.А.
,
Ломов Н.А.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Мамаева Н.Ю.
,
Маслакова А.А.
,
Петрова Е.В.
,
Пиунова У.Е.
,
Разин С.В.
,
Рамонова А.А.
,
Рубцов М.А.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Ульянов С.В.
,
Феофанов А.В.
,
Чичерин И.В.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Штомпель А.С.
2 августа 2021 - 30 июня 2023
Структурная динамика нуклеосом и их взаимодействий: поиск подходов для диагностики и лечения онкологических заболеваний
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
Участники НИР:
Багров Д.В.
,
Косарим Н.А.
,
Моторин Н.А.
,
Новиков Р.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
1 января 2021 - 31 декабря 2026
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Лобакова Е.С.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В.
,
Алескерова Л.Э.
,
Алипкина С.И.
,
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Ахаев Д.Н.
,
Багров Д.В.
,
Барский Е.Л.
,
Баулина О.И.
,
Боздаганян М.Е.
,
Бонарцев А.П.
,
Бондаренко Е.А.
,
Буракова О.В.
,
Васильева С.Г.
,
Вахрушева А.В.
,
Волох О.И.
,
Гапизов С.Ш.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Глухов Г.С.
,
Горелова О.А.
,
Грибкова А.К.
,
Дольникова Г.А.
,
Жаркова И.И.
,
Зайцев П.А.
,
Зайцева А.А.
,
Карлова М.Г.
,
Качер Ю.Г.
,
Князева А.С.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Кудрявцев А.В.
,
Кудряцев А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Лукьянов А.А.
,
Любителев А.В.
,
Люкманова Е.Н.
,
Малинина Д.К.
,
Малюченко Н.В.
,
Мариловцева Е.В.
,
Налобин Д.С.
,
Никишин И.И.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Орлов Н.А.
,
Панченко Л.А.
,
Петушкова Ю.А.
,
Петушкова Ю.П.
,
Рамонова А.А.
,
Саванина Я.В.
,
Саулина А.А.
,
Селях И.О.
,
Семенова Л.Р.
,
Сивкина А.Л.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Соколова А.И.
,
Соколова О.С.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловченко О.В.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Суханова Ю.А.
,
Трифонова Е.С.
,
Утешинская Л.В.
,
Федоренко Т.А.
,
Феофанов А.В.
,
Чеканов К.А.
,
Чивкунова О.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Шапиро Т.Н.
,
Шибзухова К.А.
,
Шиловский Г.А.
,
Щербаков П.Н.
,
Яголович А.В.
12 декабря 2019 - 25 октября 2021
Универсальный биосенсор целевых последовательностей нуклиновых кислот на основе dCas9 белков
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Зайцев П.А.
,
Качер Ю.Г.
,
Новиков Р.В.
2 декабря 2019 - 1 декабря 2021
Интегративное моделирование укладки нуклеосом в хроматине на основе данных Micro-C
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственный исполнитель:
Армеев Г.А.
Участники НИР:
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
,
Комарова Г.А.
,
Поспелова Ю.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Тимохин Г.С.
1 марта 2019 - 31 декабря 2022
Эпигенетические механизмы биологических процессов и их роль в патогенезе онкологических заболеваний
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Феофанов А.В.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Соколова О.С.
,
Студитский В.М.
,
Шайтан А.К.
10 октября 2018 - 10 октября 2021
Моделирование структуры и динамики хроматина в соответствии с данными Hi-C для одиночных клеток.
Кафедра физики полимеров и кристаллов
Руководитель:
Чертович А.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Гаврилов А.А.
,
Кос П.И.
,
Петров А.И.
,
Тамм М.В.
,
Шайтан А.К.
5 сентября 2018 - 31 августа 2020
Разработка биоинженерной исследовательской модели для ранней диагностики рака головы и шеи
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Бонарцев А.П.
Участники НИР:
Багров Д.В.
,
Воинова В.В.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
8 августа 2018 - 30 июня 2021
Структурная динамика нуклеосом и их взаимодействий: поиск подходов для диагностики и лечения онкологических заболеваний.
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан А.К.
Ответственные исполнители:
Армеев Г.А.
,
Новоселецкий В.Н.
Участники НИР:
Андреева Е.А.
,
Басс М.В.
,
Глухов Г.С.
,
Грибкова А.К.
,
Князева А.С.
,
Комарова Г.А.
,
Новиков Р.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Поспелова Ю.
,
Сингх-Пальчевская Л.Р.
,
Суханова Ю.А.
,
Тарасов К.А.
31 июля 2018 - 8 февраля 2022
Моделирование структурных и динамических экспериментов с биомакромолекулярными объектами с использованием рентгеновских лазеров
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственный исполнитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Вылегжанин Ф.Е.
,
Кобельков Г.М.
,
Кудрявцев А.В.
,
Ложников М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
15 февраля 2018 - 15 июля 2021
Механизмы формирования и функциональные свойства липопротеиновых дисков, стабилизированных амфифильными альтернирующими сополимерами, содержащими звенья малеиновой кислоты
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственный исполнитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Боздаганян М.Е.
,
Глухов Г.С.
,
Карлова М.Г.
,
Орехов Ф.С.
,
Соколова О.С.
,
Тарасов К.А.
15 ноября 2017 - 4 декабря 2019
Разработка научных и технологических основ получения и исследования физико-химических свойств биополимерного материала для создания внутрикостных имплантов с биополимерным покрытием на основе сверхупругих титановых сплавов.
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Шайтан К.В.
Ответственные исполнители:
Багров Д.В.
,
Бонарцев А.П.
,
Мойсенович М.М.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Воинова В.В.
,
Рамонова А.А.
,
Шайтан А.К.
26 октября 2017 - 28 февраля 2021
Структурная динамика ретиналь-содержащих белков
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственный исполнитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Кудрявцев А.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Островский М.А.
,
Фельдман Т.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Эрендженова А.А.
11 августа 2017 - 27 ноября 2020
Механизм взаимодействия PARP-1 с хроматином
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Феофанов А.В.
Ответственный исполнитель:
Малюченко Н.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Валиева М.Е.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Иванова М.А.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Любителев А.В.
,
Никитин Д.В.
,
Саулина А.А.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
2 мая 2017 - 31 декабря 2018
Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции: структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
Биологический факультет
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственный исполнитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Алескерова Л.Э.
,
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Волох О.И.
,
Герасимова Н.С.
,
Ефременко А.В.
,
Иванова М.А.
,
Иванова М.А.
,
Карлова М.Г.
,
Киташов А.В.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Никитин Д.В.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Студитский В.М.
,
Феофанов А.В.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Айдналиева Н.В.
,
Алескерова Л.Э.
,
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Архипова А.Ю.
,
Асланян Р.Р.
,
Ахаев Д.Н.
,
Багров Д.В.
,
Барский Е.Л.
,
Баулина О.И.
,
Боздаганян М.Е.
,
Бонарцев А.П.
,
Бондаренко Е.А.
,
Буракова О.В.
,
Валиева М.Е.
,
Васильева С.Г.
,
Вахрушева А.В.
,
Волох О.И.
,
Волынцева А.Д.
,
Герасимова Н.С.
,
Гераськина О.В.
,
Глухов А.И.
,
Глухов Г.С.
,
Гончаренко А.В.
,
Гончарук М.В.
,
Гончарук С.А.
,
Гордеев С.А.
,
Горелова О.А.
,
Долгих Д.А.
,
Дольникова Г.А.
,
Жаркова И.И.
,
Зайцева А.А.
,
Иванова М.А.
,
Карлова М.Г.
,
Коровина А.Н.
,
Кошкина Д.О.
,
Кузьменков А.И.
,
Лобакова Е.С.
,
Лукьянов А.А.
,
Любителев А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Мариловцева Е.В.
,
Мойсенович А.М.
,
Мойсенович М.М.
,
Налобин Д.С.
,
Никитин Д.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Орлова А.А.
,
Панченко Л.А.
,
Петушкова Ю.А.
,
Петушкова Ю.П.
,
Попова С.С.
,
Пугачева Т.Т.
,
Рамонова А.А.
,
Саванина Я.В.
,
Савилова З.Д.
,
Селях И.О.
,
Семенова Л.Р.
,
Сивкина А.Л.
,
Соколова О.С.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловченко О.В.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Суханова Ю.А.
,
Тамбиев А.Х.
,
Трифонова Е.С.
,
Утешинская Л.В.
,
Федоренко Т.А.
,
Феофанов А.В.
,
Чеканов К.А.
,
Чемерис А.С.
,
Чертков О.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шебанова А.С.
,
Шибзухова К.А.
,
Щербаков П.Н.
,
Яголович А.В.
,
герасимова н.с.
1 января 2015 - 31 декабря 2018
Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
Ректорат
Руководитель:
Садовничий В.А.
Ответственный исполнитель:
Каменский П.А.
Участники НИР:
Cоина В.С.
,
Абрамов С.М.
,
Аверина О.А.
,
Агеева Л.В.
,
Адельянов А.М.
,
Азовский А.И.
,
Акопян Ж.А.
,
Аксенова А.А.
,
Аксенова В.А.
,
Аксянов Е.А.
,
Аласания К.Ю.
,
Александров В.В.
,
Александрова А.В.
,
Александрушкина Н.И.
,
Александрушкина Н.А.
,
Алексеевский А.В.
,
Аляутдинов А.Р.
,
Алёшин В.В.
,
Андреева Т.В.
,
Антал Т.К.
,
Антонова И.И.
,
Антоновская А.А.
,
Антохина О.Г.
,
Арифулин Е.А.
,
Армеев Г.А.
,
Артюшин И.В.
,
Арушанян И.О.
,
Ахметжанова А.А.
,
Ашапкин В.В.
,
Бабенко В.А.
,
Бакеева Л.Е.
,
Балацкий А.В.
,
Банникова А.А.
,
Баринова Н.Н.
,
Баулина О.И.
,
Бацевич В.А.
,
Бедарева И.В.
,
Белевич Т.А.
,
Беме И.Р.
,
Бенедиктов А.А.
,
Березина Н.Я.
,
Биланенко Е.Н.
,
Бисерова Н.М.
,
Благовещенская Е.Ю.
,
Боброва В.К.
,
Бондарева Э.А.
,
Бондаренко Г.Н.
,
Борисанова А.О.
,
Брагина Е.Е.
,
Брызгалина Е.В.
,
Бубнова Е.Н.
,
Бугров Д.И.
,
Бушуев А.В.
,
Бызов Б.А.
,
Бычков А.Ю.
,
Бычкова Е.Ю.
,
Вайпан Д.В.
,
Вайс В.Б.
,
Вальехо-Роман К.М.
,
Вангели И.М.
,
Ванюшин Б.Ф.
,
Варлыгина Т.И.
,
Вархотов Т.А.
,
Васильев А.Н.
,
Васильева Е.Д.
,
Васильева С.Г.
,
Вилкул Е.А.
,
Виноградова Е.Н.
,
Виноградская М.И.
,
Владыченская И.П.
,
Водопьянов С.С.
,
Волкова О.А.
,
Волкова О.С.
,
Волцит О.В.
,
Воробьева Е.А.
,
Воронина Е.Ю.
,
Воронко О.В.
,
Ворцепнева Е.В.
,
Высоких М.Ю.
,
Гавриленко С.М.
,
Галинская Т.В.
,
Галкин И.И.
,
Галоян Э.А.
,
Ганчарова О.С.
,
Гаранина А.С.
,
Георгиев А.А.
,
Герасимов Е.С.
,
Глаголева Е.С.
,
Глушакова А.М.
,
Гмошинский В.И.
,
Гоголева С.С.
,
Година Е.З.
,
Головин А.В.
,
Гололобова М.А.
,
Гомыранов И.А.
,
Горелова О.А.
,
Горшкова Е.А.
,
Горюнов Д.В.
,
Гофман Д.К.
,
Григорьев Ф.В.
,
Григорьева А.А.
,
Григорьева О.А.
,
Грицышин В.А.
,
Груздева М.А.
,
Грум-Гржимайло О.А.
,
Гусев Ф.Е.
,
Данилович И.Л.
,
Дегтярева Г.В.
,
Диброва Д.В.
,
Добров Б.В.
,
Добровольская Т.Г.
,
Дроздова О.Ю.
,
Дуброва М.С.
,
Дудов С.В.
,
Дудова К.В.
,
Дыйканов Д.Т.
,
Дьяков М.Ю.
,
Евтеев А.А.
,
Ежова О.В.
,
Екимова И.А.
,
Еланский С.Н.
,
Елумеева Т.Г.
,
Емельянова Л.Г.
,
Еремичев Р.Ю.
,
Ерохина М.В.
,
Ефименко А.Ю.
,
Ефимов С.В.
,
Жадан А.Э.
,
Жирков И.А.
,
Зайцева А.А.
,
Захаров К.В.
,
Землемерова Е.Д.
,
Зернов А.С.
,
Зубкова Е.Н.
,
Иваненко В.Н.
,
Иваницкая О.Н.
,
Иваницкий В.В.
,
Иванов А.О.
,
Иванова А.Е.
,
Игнатов М.С.
,
Игнатова Е.А.
,
Ильина И.Ю.
,
Ильинская О.П.
,
Калякин М.В.
,
Камалов А.А.
,
Карапетян М.К.
,
Касумян А.О.
,
Каткова Е.В.
,
Качалкин А.В.
,
Квятковский А.Л.
,
Квятковский А.Я.
,
Керимов А.Б.
,
Климович П.С.
,
Климчук О.И.
,
Клёнова А.В.
,
Кнорре Д.А.
,
Князева А.А.
,
Кобельков Г.М.
,
Кобельков С.Г.
,
Кокаева Л.Ю.
,
Колбасов Г.А.
,
Колбасова Г.Д.
,
Колесниченко К.А.
,
Кондакова О.А.
,
Коновалова О.П.
,
Конюхов И.В.
,
Копылов-Гуськов Ю.О.
,
Королев Д.Е.
,
Королева А.Т.
,
Корсуновская О.С.
,
Коршунова Г.А.
,
Коршунова Т.А.
,
Кочкин Д.В.
,
Кошелева Н.В.
,
Крайнов В.Н.
,
Крамина Т.Е.
,
Кремнёв С.В.
,
Криницына А.А.
,
Крупицкий А.В.
,
Крускоп С.В.
,
Кручинин П.А.
,
Кручинина А.П.
,
Кузищин К.В.
,
Кузнецов А.Г.
,
Кулебякин К.Ю.
,
Кулебякина М.А.
,
Куприянова Е.В.
,
Кураков А.В.
,
Кутов Д.К.
,
Кутуева Л.И.
,
Кутузова И.А.
,
Кушунина М.А.
,
Лазарев Е.Н.
,
Лапашина А.С.
,
Лапыгина Е.В.
,
Лебедев В.С.
,
Левик Л.Ю.
,
Лемак С.С.
,
Леонтьева О.А.
,
Лисенкова А.А.
,
Лисовский А.А.
,
Лобакова Е.С.
,
Логачёва М.Д.
,
Лопатина Ю.В.
,
Лубнина Н.В.
,
Лукашевич Н.В.
,
Лукьянов А.А.
,
Лысак Л.В.
,
Лысков Д.Ф.
,
Мазей Ю.А.
,
Макарова Н.Е.
,
Максимова И.А.
,
Малахов В.В.
,
Малютина А.М.
,
Манахов А.Д.
,
Манских В.Н.
,
Манучарова Н.А.
,
Маркина М.М.
,
Маркова О.В.
,
Марова-Кляйнбуб И.М.
,
Мартынов А.В.
,
Марфенина О.Е.
,
Маслакова А.А.
,
Мелихова Е.В.
,
Мельникова М.Н.
,
Милютина И.А.
,
Михайлов К.В.
,
Михайлов К.Г.
,
Морковин А.А.
,
Москаленко В.Н.
,
Мохова Е.Н.
,
Мулкиджанян А.Я.
,
Мунтян М.С.
,
Мурашев В.В.
,
Мурашев И.А.
,
Нагаев Б.Э.
,
Назаров П.А.
,
Назаров Р.А.
,
Нанова О.Г.
,
Недоспасов С.А.
,
Неретин Н.Ю.
,
Неретина Т.В.
,
Нестеренко А.М.
,
Нетрусов А.И.
,
Никитин М.А.
,
Николаева О.В.
,
Нилова М.В.
,
Нимирицкий П.П.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новаковский Г.Э.
,
Новоселецкая Е.С.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Носов А.М.
,
Оболенская Е.В.
,
Овченков Е.А.
,
Огурцов С.В.
,
Озеров А.Л.
,
Озрина Р.Д.
,
Олейникова О.В.
,
Олейникова О.В.
,
Онипченко В.Г.
,
Онищенко Г.Е.
,
Орлов Д.С.
,
Орловский И.В.
,
Павлинов И.Я.
,
Павлов Д.С.
,
Павлов С.Д.
,
Павлова Н.С.
,
Панина О.Б.
,
Панютина А.А.
,
Парфёнова Е.В.
,
Пенин А.А.
,
Перехватов В.В.
,
Петракова О.С.
,
Петров Н.Б.
,
Петров П.Н.
,
Петушкова Ю.А.
,
Пивоваров Е.А.
,
Плетюшкина О.Ю.
,
Плеханова О.С.
,
Погосян С.И.
,
Поздняков Л.А.
,
Полевова С.В.
,
Полилов А.А.
,
Поляков М.П.
,
Полянская Л.М.
,
Попеленский Ф.Ю.
,
Попкова Е.Г.
,
Попов В.С.
,
Попова Е.Н.
,
Попова С.С.
,
Поярков Н.А.
,
Просвиров А.С.
,
Птушенко В.В.
,
Пугачева Т.Т.
,
Рамонова А.А.
,
Распопова А.А.
,
Ревина Д.Б.
,
Редькин Я.А.
,
Решетников Р.В.
,
Римская-Корсакова Н.Н.
,
Рогаев Е.И.
,
Романов А.А.
,
Романова Е.С.
,
Романова Е.С.
,
Рубина К.А.
,
Румянцев В.Ю.
,
Русин Л.Ю.
,
Русинов И.С.
,
Рыжов А.Л.
,
Рысенкова К.Д.
,
Савилова З.Д.
,
Савицкая М.А.
,
Савицкий В.Ю.
,
Савкин И.А.
,
Савченко А.С.
,
Самигуллин Т.Х.
,
Самойлов К.Ю.
,
Самоходская Л.М.
,
Самсонов Т.Е.
,
Северова Е.Э.
,
Селях И.О.
,
Семенова А.В.
,
Семенова Л.Р.
,
Семенова М.Л.
,
Семин В.Н.
,
Семина Е.В.
,
Сенченков Е.П.
,
Сенчукова А.Л.
,
Серегин А.П.
,
Сидоренко Г.Ю.
,
Симоненко Е.Ю.
,
Симонян Р.А.
,
Синев А.Ю.
,
Скулачев В.П.
,
Скулачев К.В.
,
Слободкина Е.А.
,
Смирнова Е.А.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловьева Е.Н.
,
Сорокин М.И.
,
Сото Э.
,
Спасская Н.Н.
,
Сперанская А.С.
,
Спирин С.А.
,
Стамбольский Д.В.
,
Старостина Е.Е.
,
Степанов А.Л.
,
Сулимов А.В.
,
Сулимов В.Б.
,
Сумбатян Н.В.
,
Суханова Е.С.
,
Сухоруков А.П.
,
Сысоева В.Ю.
,
Тарнопольская М.Е.
,
Тащилова А.С.
,
Твердислов В.А.
,
Темерева Е.Н.
,
Терентьева Е.И.
,
Терехова В.А.
,
Тимошенко В.Ю.
,
Титова М.В.
,
Тихонов В.В.
,
Тишечкин Д.Ю.
,
Токарчук А.В.
,
Томкович П.С.
,
Троицкий А.В.
,
Тужилин А.А.
,
Тузов К.А.
,
Федоров А.В.
,
Федоров В.В.
,
Федорова А.В.
,
Федосеева (Бандолина) Е.В.
,
Федосов В.Э.
,
Фенюк Б.А.
,
Фетисова Е.К.
,
Флегонтов П.Н.
,
Фырнин Д.М.
,
Хайлова Л.С.
,
Храмова Ю.В.
,
Цетлин А.Б.
,
Чеканов К.А.
,
Челомбитько М.А.
,
Черепанов Д.А.
,
Чернов И.Ю.
,
Черняк Б.В.
,
Чертополохов В.А.
,
Чертопруд Е.С.
,
Чесунов А.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Чотчаева Ф.Р.
,
Чубатова Н.В.
,
Чудаев Д.А.
,
Чурикова О.А.
,
Шагиева Г.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шалаева Д.Н.
,
Шаранова Н.Э.
,
Шаталкин А.И.
,
Шаталова Н.Н.
,
Шафеи Р.А.
,
Шахпаронов В.В.
,
Шведчикова Н.К.
,
Шестаков А.И.
,
Шилов Е.С.
,
Шиловский Г.А.
,
Шнырева А.В.
,
Штратникова В.Ю.
,
Шубина Е.А.
,
Шуленина Н.Э.
,
Щелкунов М.И.
,
Щербаков П.Н.
,
Эльдаров Ч.М.
,
Юрцева О.В.
,
Яворская М.И.
,
Яковенко С.А.
,
Якушев А.В.
,
Якушев А.Г.
,
Яровая Е.Б.
6 августа 2014 - 31 декабря 2016
Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции:структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Ответственные исполнители:
Феофанов А.В.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Волох О.И.
,
Киташов А.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Никитин Д.В.
,
Соколова О.С.
,
Студитский В.М.
,
Феофанов А.В.
,
Шайтан А.К.
6 июня 2012 - 11 июля 2013
Исследование и разработка алгоритмов и методов построения трехмерных атомистических моделей молекул белков и их комплексов на основе анализа карт электронной плотности низкого разрешения, молекулярного моделирования и баз данных по пространственной структуре гомологов
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Балабаев Н.К.
,
Боздаганян М.Е.
,
Давлетов И.Д.
,
Кирпичников М.П.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Сивожелезов В.С.
,
Соколова О.С.
,
Турченков Д.А.
,
Шайтан А.К.
,
Шуров Д.Л.
1 января 2012 - 31 декабря 2013
Суперкомпьютерное моделирование структуры и динамики нуклеосом
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан А.К.
Участники НИР:
Армеев Г.А.
,
Блинов В.Н.
1 декабря 2010 - 31 декабря 2012
Эукариотическое транскрибирование: механизмы генетических и эпигенетических процессов и разработка регуляторов для биоинженерии
Биологический факультет
Руководитель:
Студитский В.М.
Участники НИР:
Аргентова В.В.
,
Армеев Г.А.
,
Багров Д.В.
,
Волох О.И.
,
Герасимова Н.С.
,
Глухов Г.С.
,
Демиденко А.В.
,
Ефременко А.В.
,
Ефремов Ю.М.
,
Иванова М.А.
,
Киташов А.В.
,
Кудряшова К.С.
,
Кулаева О.И.
,
Малюченко Н.В.
,
Маслакова А.А.
,
Никитин Д.В.
,
Орловский И.В.
,
Печникова Е.В.
,
Роскошная А.С.
,
Рубцов М.А.
,
Соколова О.С.
,
Феофанов А.В.
,
Чертков О.В.
,
Шайтан А.К.
1 ноября 2010 - 15 ноября 2012
Разработка методов исследования структуры и функций потенциал-зависимых ионных каналов, включая кодируемые 18 хромосомой человека
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Антонов М.Ю.
,
Багров Д.В.
,
Боздаганян М.Е.
,
Браже А.Р.
,
Волох О.И.
,
Глухов Г.С.
,
Ефремов Ю.М.
,
Карлова М.Г.
,
Касимова М.А.
,
Левцова О.В.
,
Малюченко Н.В.
,
Маслакова А.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Оршанский И.А.
,
Печникова Е.В.
,
Пищальникова А.В.
,
Полевова С.В.
,
Попинако А.В.
,
Соколова О.С.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Трифонова Е.С.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
1 июня 2010 - 31 декабря 2011
Разработка методов исследования взаимодействия кардиолипина с цитохромным bc1 комплексом митохондрий млекопитающих
Руководитель:
Мулкиджанян А.Я.
Участники НИР:
Боздаганян М.Е.
,
Диброва Д.В.
,
Замятнин А.А.
,
Лохматиков А.В.
,
Лямзаев К.Г.
,
Пустовидко А.В.
,
Симонян Р.А.
,
Ташлицкий В.Н.
,
Терещенков А.Г.
,
Федоркин О.Н.
,
Черепанов Д.А.
,
Шайтан А.К.
1 января 2010 - 31 декабря 2012
Мультимасштабное молекулярное моделирование функционирования мембранных белков и их мутантных форм, включая замены на неприродные аминокислотные остатки
Биологический факультет
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Балабаев Н.К.
,
Боздаганян М.Е.
,
Левцова О.В.
,
Орехов Ф.С.
,
Оршанский И.А.
,
Попинако А.В.
,
Шайтан А.К.
18 ноября 2009 - 15 сентября 2011
Распределенные вычислительные системы для решения задач молекулярной биоинженерии
Биологический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова
Руководитель:
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Антонов М.Ю.
,
Балабаев Н.К.
,
Боздаганян М.Е.
,
Волох О.И.
,
Касимова М.А.
,
Левцова О.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Орехов Ф.С.
,
Оршанский И.А.
,
Попинако А.В.
,
Соколова О.С.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Турлей Е.В.
,
Шайтан А.К.
3 сентября 2009 - 31 августа 2011
Исследование сложных доменных структур в мезогенных наноматериалах для дисплеев нового поколения
Кафедра физики полимеров и кристаллов
Руководитель:
Емельяненко А.В.
Участники НИР:
Калинин Н.В.
,
Молькин В.Е.
,
Ромашин М.С.
,
Рудяк В.Ю.
,
Шайтан А.К.
,
Штыков Н.М.
4 августа 2009 - 25 июня 2011
Создание и изучение новых амфифильных и гидрофобно-модифицированных гребнеобразных полимеров: теория, синтез, структура и свойства
Кафедра физики полимеров и кристаллов
Руководитель:
Хохлов А.Р.
Участники НИР:
Галлямов М.О.
,
Насимова И.Р.
,
Стародубцев С.Г.
,
Шайтан А.К.
2 февраля 2009 - 15 декабря 2010
Структурные и энергетические аспекты взаимодействия белков потенциал-зависимых ионных каналов человека с лигандами/блокаторами, перспективными для создания фармакологических препаратов направленного действия
Биологический факультет
Руководители:
Соколова О.С.
,
Шайтан К.В.
Участники НИР:
Касимова М.А.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Попинако А.В.
,
Уласова Н.Ю.
,
Шайтан А.К.
1 января 2006 - 31 декабря 2015
Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
Кафедра биоинженерии
Руководитель:
Кирпичников М.П.
Участники НИР:
Аргентова В.В.
,
Архипова А.Ю.
,
Асланян Р.Р.
,
Багров Д.В.
,
Барский Е.Л.
,
Баулина О.И.
,
Бонарцев А.П.
,
Буракова О.В.
,
Васильева С.Г.
,
Гончаренко А.В.
,
Гончарук М.В.
,
Гончарук С.А.
,
Горелова О.А.
,
Дольникова Г.А.
,
Лобакова Е.С.
,
Лукьянов А.А.
,
Малюченко Н.В.
,
Мойсенович М.М.
,
Несов А.В.
,
Никитин Д.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Панченко Л.А.
,
Петушкова Ю.А.
,
Петушкова Ю.П.
,
Попова С.С.
,
Саванина Я.В.
,
Селях И.О.
,
Семенова Л.Р.
,
Соколова О.С.
,
Соловченко А.Е.
,
Соловченко О.В.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Студитский В.М.
,
Тамбиев А.Х.
,
Трифонова Е.С.
,
Федоренко Т.А.
,
Чеканов К.А.
,
Чемерис А.С.
,
Чертков О.В.
,
Чивкунова О.Б.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Шебанова А.С.
,
Яголович А.В.
Патенты
2016
Способ скрининга потенциальных противоопухолевых препаратов - ингибиторов FACT
Авторы:
Студитский В.М.
,
Кулаева О.И.
,
Шайтан А.К.
#RU2580006C2, 14 октября
Отчеты
2012
Итоговый, этап №3
Авторы:
Малюченко Н.В.
,
Студитский В.М.
,
Демиденко А.В.
,
Киташов А.В.
,
Кулаева О.И.
,
Аргентова Виктория Витальевна
,
Багров Д.В.
,
Ефимова Н.С.
,
Никитин Дмитрий Валерьевич
,
Соколова О.С.
,
Феофанов А.В.
,
Шайтан А.К.
#5, 227 с.
2011
Отчет за 1 полугодие 2011 года по договору № 11.G34.31.0009 от «01» декабря 2010 г. (грант Правительства Российской Федерации для государственной поддержки научных исследований, проводимых под руководством ведущих ученых в российских образовательных учреждениях высшего профессионального образования)
Авторы:
Студитский В.М.
,
Малюченко Н.В.
,
Киташов А.В.
,
Феофанов А.В.
,
Соколова О.С.
,
Багров Д.В.
,
Шайтан А.К.
#3, 121 с.
Участие в программных комитетах конференций
12-23 апреля 2021
XXVIII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов 2021"
Член программного комитета
МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия
Членство в диссертационных советах
с 2 мая 2023
МГУ.015.5(03.02), МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
1.5.8 - Математическая биология, биоинформатика (физ.-мат. науки)
Действующие члены совета:
Рубин А.Б.
,
Булычев А.А.
,
Лобышев В.И.
,
Максимов Г.В.
,
Фурсова П.В.
,
Ефремов Р.Г.
,
Коваленко И.Б.
,
Максимов Е.Г.
,
Немухин А.В.
,
Нокс П.П.
,
Пащенко В.З.
,
Погосян С.И.
,
Ризниченко Г.Ю.
,
Сахаров И.Ю.
,
Соболев А.С.
,
Соколова О.С.
,
Страховская М.Г.
,
Тихонов А.Н.
,
Трофимов А.В.
,
Феофанов А.В.
,
Чеботарева Н.А.
,
Шайтан А.К.
,
Шайтан К.В.
,
Яковенко Л.В.
Руководство диссертациями
2018
Определение структуры нуклеосом и их комплексов с белками хроматина методами молекулярного моделирования
Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (физ.-мат. науки)
Автор:
Армеев Григорий Алексеевич
, к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научные руководители:
Шайтан Константин Вольдемарович
, д.ф.-м.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова,
Шайтан Алексей Константинович
, д.ф.-м.н., проф. РАН, член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
МГУ.015.5(03.02)
МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
Организация, в которой выполнялась работа:
МГУ имени М.В. Ломоносова
Оппоненты:
Ефремов Роман Гербертович
,
Головин Андрей Викторович
,
Балабаев Николай Кириллович
Диссертация
2021
Интегративное моделирование структуры и динамики биомакромолекулярных комплексов
Докторская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (физ.-мат. науки)
Автор:
Шайтан Алексей Константинович
, д.ф.-м.н., проф. РАН, член-корр. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
Научный консультант:
Кирпичников Михаил Петрович
, д.б.н., акад. РАН, МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
МГУ.015.5(03.02)
МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
Организация, в которой выполнялась работа:
МГУ имени М.В. Ломоносова
Оппоненты:
Бриллиантов Николай Васильевич
,
Разин Сергей Владимирович
,
Ефремов Роман Гербертович
Руководство дипломными работами
2022
Структура и динамика амилоидного белка дрожжей Bgl2p, поиск остатков аминокислот, модификации которых влияют на его закрепление в клеточной стенке
Научные руководители:
Калебина Т.С.
,
Шайтан А.К.
,
Рекстина В.В.
Автор: Моторин Н.А. (Бакалавр)
2022
Разработка методов анализа данных секвенирования нового поколения в экспериментах по лентивирусной трансдукции мезенхимальных стволовых клеток
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Кожевникова Д.Д. (Бакалавр)
2022
Анализ влияния типа моновалентных катионов на структуру и динамику линкерной области нуклеосомы
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Косарим Н.А., (Магистр)
2021
Разработка подходов интегративного моделирования структуры и динамики нуклеосомных фибрилл на основе анализа экспериментальных данных 3D-геномики субнуклеосомного разрешения
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Тимохин Г.С. (Бакалавр)
2021
Молекулярные механизмы динамики канонических и H2A.Z-нуклеосом
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Князева А.С. (Магистр)
2021
Дизайн генетических регуляторных сетей для оценки эволюционного потенциала транскрипционных факторов
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Грешнова А.А. (Бакалавр)
2021
Дизайн биосенсора нуклеиновых кислот на основе двух dCas9 белков
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Новиков Р.В. (Бакалавр)
2020
Анализ филетического распределения гистоновых вариантов в эукариотических организмах
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Неугодов А.М. (Бакалавр)
2019
Построение и анализ интерактома нуклеосом и белков хроматина
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Грибкова Анна Кирилловна (Магистр)
2019
Компьютерный дизайн трехмерной полноатомной структуры аспартат N-ацетилтрансферазы человека
Научные руководители:
Поляков Игорь Вадимович
,
Шайтан А.К.
Автор: Книга Артем Евгеньевич (Магистр)
2019
Исследование функционально-значимых конформационных изменений в белковых молекулах методами термодинамического интегрирования и метадинамики
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Князева А.С. (Бакалавр)
2017
Исследование энергетического профиля процесса отворачивания ДНК от гистонового кора нуклеосомы
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Грибкова Анна Кирилловна (Бакалавр)
2016
Анализ и предсказание профилей гидроксильного расщепления днк для изучения нуклеосом и их комплексов
Научные руководители:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
Автор: Ефимова Дарья Андреевна (Бакалавр)
2014
Изучение принципов формирования нуклеосом методами молекулярного моделирования
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Армеев Г.А., (Специалист)
2014
Взаимодействие потенциал-зависимых калиевых каналов с модулирующими пептидами
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Горковец Т.К. (Специалист)
2011
Изучение молекулярных механизмов ионной проводимости бактериального калиевого канала KcsA методами молекулярного моделирования
Научный руководитель:
Шайтан А.К.
Автор: Касимова М.А. (Специалист)
2010
Расчет спектральных свойств бактериородопсина гибридными методами квантовой химии и молекулярной механики
Научные руководители:
Соколова О.С.
,
Шайтан А.К.
Автор: Орехов Ф.С. (Специалист)
2010
Исследование взаимодействия фуллерена (C60) и его производного трималонатфуллерена (C3) с биологическими мембранами методом молекулярной динамики
Научные руководители:
Соколова О.С.
,
Шайтан А.К.
Автор: Боздаганян М.Е. (Специалист)
Руководство курсовыми работами
2023
Анализ взаимодействий пионерных транскрипционных факторов с негистоновыми белками хроматина
Научные руководители:
Грибкова А.К.
,
Шайтан А.К.
Автор: Хасанова У.Н. (Специалист)
Авторство учебных курсов
2023
От организации хроматина к пониманию функционирования геномов эукариот
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Грибкова А.К.
2022
Современные проблемы биологии
Автор:
Шайтан А.К.
2021
Программирование для биологов
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
,
Князева А.С.
,
Грибкова А.К.
,
Сингх-Пальчевская Л.
2021
Молекулярное моделирование
Автор:
Шайтан А.К.
2021
Python для биологов
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
2020
Прикладное программирование на языке Python
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Армеев Г.А.
2020
Введение в структурную биологию
Авторы:
Попов В.О.
,
Люкманова Е.Н.
,
Шенкарев З.О.
,
Бойко К.М.
,
Коневега А.Л.
,
Багрянская Е.Г.
,
Шайтан А.К.
,
Соколова О.С.
,
Станишнева-Коновалова Т.Б.
,
Гераськина О.В.
2018
Практикум по синтетической биологии
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Глухов Г.С.
2018
Введение в биоинформатику
Авторы:
Шайтан А.К.
,
Коротков Е.В.
,
Новоселецкий В.Н.
,
Герасимов Е.С.
,
Армеев Г.А.
Преподавание учебных курсов
10 апреля 2023 - 15 апреля 2023
От организации хроматина к пониманию функционирования геномов эукариот
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
в НТУ "Сириус" (государственная организация, университет, Россия)
обязательная, базовой части, лекции, 52 часов
1 сентября 2022 - 30 июня 2024
Современные проблемы биологии
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, вариативной части, лекции, 28 часов
1 сентября 2021 - 30 июня 2024
Введение в структурную биологию
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, вариативной части, лекции, 2 часов
8 февраля 2021 - 24 мая 2021
Молекулярное моделирование
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, базовой части, лекции, 72 часов
1 февраля 2021 - 30 июня 2024
Молекулярное моделирование
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, вариативной части, лекции, 56 часов
3 сентября 2018 - 15 сентября 2018
Практикум по синтетической биологии
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
,
Кафедра биоинженерии
обязательная, базовой части, лабораторные занятия, 48 часов
1 сентября 2018 - 30 сентября 2024
Введение в биоинформатику
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Биологический факультет
обязательная, базовой части, лекции, 28 часов
Выступление в СМИ
22 апреля 2021 г.
Суперкомпьютер помог учёным МГУ разобраться с дыханием и скольжением ДНК
(Научная Россия)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Суперкомпьютер помог учёным разобраться с дыханием и скольжением ДНК
(Русская Планета)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Ученые МГУ разбираются в логике “чтения” молекулярными механизмами “текста” из нуклеотидов
(Научно-информационный портал ПОИСК)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович
22 апреля 2021 г.
Ученые проследили за движением нитей ДНК внутри ядра клеток
(ТАСС, Наука)
Автор (участник):
Шайтан Алексей Константинович
22 апреля 2021 г.
Ученые проследили за движением нитей ДНК внутри ядра клеток
(ТАСС, Наука)
Авторы (участники):
Князева Анастасия Сергеевна
,
Шайтан Алексей Константинович
,
Армеев Григорий Алексеевич
,
Кирпичников Михаил Петрович
,
Воеводин Владимир Валентинович