ИСТИНА

Домрачева Татьяна Михайловна пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет, Кафедра физической химии, НИЛ квантовой химии и молекулярного моделирования, старший научный сотрудник, с 15 июня 2020

кандидат химических наук с 2000 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Schlichting I., Немухин А.В., Udvarhelyi A., Хренова М.Г., Григоренко Б.Л., Olivucci M., Новаковская Ю.В., Blumenstein L., Fedorov R., Hartmann E., Krylov A., Schulten K., Кубасов А.А. показать полностью..., Adhikari S., Amoyal G.S., Baranov E., Barends Thomas R.M., Barends Thomas R.M., Barends Thomas R.M., Barends Thomas R.M., Bernd E., Bondar A., Boutet S., Bruce D.R., Carbajo S., Carell T., Chang C.A., Church J., Colletier J., De Vico L., Dunn M.F., Ehrenberg D., Ferre N., Finelli A., Foucar L., Gardner K.H., Gasper R., Getzoff E.D., Giebeler L., Gomelsky M., González R., González‐Espinoza C.E., Gorel A., Groot M., Grünbein M.L., Haacke S., Hegemann P., Hellingwerf K.J., Hilpert M., Iwata T., Kandori H., Kemmer L., Kennis J.T., Kloos M., Koglin J.E., Kongsted J., Kottke T., Kovacs G.N., Lahav Y., Liu D., Loic J., Mahaputra W.I., Maximowitsch E., Michalik Š., Mroginski M., NasserEddin Q., Navizet I., Olsen Jógvan M.H., Olsen O., Pedraza-González L., Piers A., Pérez de Alba O.A., Rao A., Rehaman Moughal S.A., Rehaman Moughal S.A., Reinstein J., Ricardi N., Roome C.M., SO, Schlesinger R., Seaberg M., Sen S., Stensitzki T., Stricker M., Wang S., Wang Y., Wesolowski T.A., Xuechun H., igor 2.1., van Grondelle R., van Wilderen Luuk J.G., Зорин В.А., Соловьёв И.А., Сулиман А., Филина О.В.

39 статей, 5 докладов на конференциях, 1 НИР, 2 дипломные работы

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1405, Scopus: 1442

IstinaResearcherID (IRID): 240039534

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2021 Frontiers in Multiscale Modeling of Photoreceptor Proteins
    • Mroginski Maria‐Andrea, Adam Suliman, Amoyal Gil S., Barnoy Avishai, Bondar Ana‐Nicoleta, Borin Veniamin A., Church Jonathan R., Domratcheva Tatiana, Ensing Bernd, Fanelli Francesca, Ferré Nicolas, Filiba Ofer, Pedraza‐González Laura, González Ronald, González‐Espinoza Cristina E., Kar Rajiv K., Kemmler Lukas, Kim Seung Soo, Kongsted Jacob, Krylov Anna I., Lahav Yigal, Lazaratos Michalis, NasserEddin Qays, Navizet Isabelle, Nemukhin Alexander, Olivucci Massimo, Olsen Jógvan Magnus Haugaard, Pérez de Alba Ortíz Alberto, Pieri Elisa, Rao Aditya G., Rhee Young Min, Ricardi Niccolò, Sen Saumik, Solov'yov Ilia A., De Vico Luca, Wesolowski Tomasz A., Wiebeler Christian, Yang Xuchun, Schapiro Igor
    • в журнале Photochemistry and Photobiology, издательство American Society for Photobiology (United States) DOI
  • 
    • 2020 Four resonance structures elucidate double-bond isomerisation of a biological chromophore
    • Gromov Evgeniy V., Domratcheva Tatiana
    • в журнале Physical Chemistry Chemical Physics, издательство Royal Society of Chemistry (United Kingdom), том 22, № 16, с. 8535-8544 DOI
  • • 2019 Three-dimensional view of ultrafast dynamics in photoexcited bacteriorhodopsin
    • Kovacs Gabriela Nass, Colletier Jacques-Philippe, Grünbein Marie Luise, Yang Yang, Stensitzki Till, Batyuk Alexander, Carbajo Sergio, Bruce Doak R., Ehrenberg David, Foucar Lutz, Gasper Raphael, Gorel Alexander, Hilpert Mario, Kloos Marco, Koglin Jason E., Reinstein Jochen, Roome Christopher M., Schlesinger Ramona, Seaberg Matthew, Shoeman Robert L., Stricker Miriam, Boutet Sébastien, Haacke Stefan, Heberle Joachim, Heyne Karsten, Domratcheva Tatiana, Barends Thomas R.M., Schlichting Ilme
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 10, № 1
  • 
    • 2018 Spiers Memorial Lecture : Introductory lecture: the impact of structure on photoinduced processes in nucleic acids and proteins
    • Domratcheva Tatiana, Schlichting Ilme
    • в журнале Faraday Discussions, издательство Royal Society of Chemistry (United Kingdom), том 207, с. 9-26 DOI
  • 
    • 2017 Indications of 5´ to 3´ Interbase Electron Transfer as the First Step of Pyrimidine Dimer Formation Probed by a Dinucleotide Analog
    • Jian Yajun, Maximowitsch Egle, Liu Degang, Adhikari Surya, Lei Li, Domratcheva Tatiana
    • в журнале Chemistry - A European Journal, издательство John Wiley & Sons Ltd. (United Kingdom), том 23, № 31, с. 7526-7537 DOI
  • 
    • 2017 Molecular mechanism of the dark-state recovery in BLUF photoreceptors
    • Khrenova Maria G., Tatiana Domratcheva, Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Chemical Physics Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 676, с. 25-31 DOI
  • • 2016 Evidence for Tautomerisation of Glutamine in BLUF Blue Light Receptors by Vibrational Spectroscopy and Computational Chemistry
    • Domratcheva Tatiana, Hartmann Elisabeth, Schlichting Ilme, Kottke Tilman
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 6, № 1 DOI
  • • 2016 Nuclear dynamics investigation of the initial electron transfer in the cyclobutane pyrimidine dimer lesion repair process by photolyases
    • Loic Joubert-Doriol, Tatiana Domratcheva, Massimo Olivucci, Izmaylov Artur F.
    • в журнале arXiv Physics Chemical Physics
  • 
    • 2016 Onset of the Electronic Absorption Spectra of Isolated and π-Stacked Oligomers of 5,6-Dihydroxyindole: An Ab Initio Study of the Building Blocks of Eumelanin
    • Tuna D., Udvarhelyi A., Sobolewski A., Domcke W., Domratcheva T.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 120, № 14, с. 3493-3502 DOI
  • 
    • 2016 Single Hydrogen Bond Donation from Flavin N5 to Proximal Asparagine Ensures FAD Reduction in DNA Photolyase
    • Mahaputra Wijaya I.M, Domratcheva Tatiana, Iwata Tatsuya, Getzoff Elizabeth D., Kandori Hideki
    • в журнале Journal of the American Chemical Society, издательство American Chemical Society (United States), том 138, № 13, с. 4368-4376 DOI
  • 
    • 2015 Role of the Molecular Environment in Flavoprotein Color and Redox Tuning: QM Cluster versus QM/MM Modeling
    • Udvarhelyi Anikó, Olivucci Massimo, Domratcheva Tatiana
    • в журнале Journal of Chemical Theory and Computation, издательство American Chemical Society (United States), том 11, № 8, с. 3878-3894 DOI
  • 
    • 2015 Theoretical Characterization of the Flavin-Based Fluorescent Protein iLOV and Its Q489K Mutant
    • Khrenova Maria G., Nemukhin Alexander V., Tatiana Domratcheva
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 119, с. 5176-5183 DOI
  • • 2014 Separation of photo-induced radical pair in cryptochrome to a functionally critical distance
    • Solov´yov Ilia A., Domratcheva Tatiana, Schulten Klaus
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 4, № 1 DOI
  • 
    • 2013 Challenges in Computing Electron-Transfer Energies of DNA Repair Using Hybrid QM/MM Models
    • Rehaman Moughal Shahi Abdul, Domratcheva Tatiana
    • в журнале Journal of Chemical Theory and Computation, издательство American Chemical Society (United States), том 9, № 10, с. 4644-4652 DOI
  • 
    • 2013 Glutamine Rotamers in BLUF Photoreceptors: A Mechanistic Reappraisal
    • Anikó Udvarhelyi, Tatiana Domratcheva
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 117, № 10, с. 2888-2897 DOI
  • 
    • 2013 Photoinduced Electron Transfer Facilitates Tautomerization of the Conserved Signaling Glutamine Side Chain in BLUF Protein Light Sensors
    • Khrenova M.G., Nemukhin A.V., Domratcheva T.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 117, № 8, с. 2369-2377 DOI
  • 
    • 2012 Decrypting Cryptochrome: Revealing the Molecular Identity of the Photoactivation Reaction
    • Solov’yov Ilia A., Domratcheva Tatiana, Rehaman Moughal Shahi Abdul, Schulten Klaus
    • в журнале Journal of the American Chemical Society, издательство American Chemical Society (United States), том 134, № 43, с. 18046-18052 DOI
  • 
    • 2011 Computational Characterization of Reaction Intermediates in the Photocycle of the Sensory Domain of the AppA Blue Light Photoreceptor
    • Khrenova Maria G., Tatiana Domratcheva, Ilme Schlichting, Grigorenko Bella L., Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Photochemistry and Photobiology, издательство American Society for Photobiology (United States), том 87, с. 564-573 DOI
  • 
    • 2011 Coupling between the BLUF and EAL domains in the blue light-regulated phosphodiesterase BlrP1
    • Khrenova Maria, Domratcheva Tatiana, Grigorenko Bella, Nemukhin Alexander
    • в журнале Journal of Molecular Modeling, издательство Springer Verlag (Germany), том 17, № 7, с. 1579-1586 DOI
  • 
    • 2011 Neutral Histidine and Photoinduced Electron Transfer in DNA Photolyases
    • Domratcheva Tatiana
    • в журнале Journal of the American Chemical Society, издательство American Chemical Society (United States), том 133, № 45, с. 18172-18182 DOI
  • 
    • 2011 Photoreaction in BLUF Receptors: Proton‐coupled Electron Transfer in the Flavin‐Gln‐Tyr System
    • Anikó Udvarhelyi, Tatiana Domratcheva
    • в журнале Photochemistry and Photobiology, издательство American Society for Photobiology (United States), том 87, с. 554-563 DOI
  • 
    • 2011 Vibrational Mode Analysis of Isotope-Labeled Electronically Excited Riboflavin
    • Wolf Matthias M.N, Herbert Zimmermann, Rolf Diller, Tatiana Domratcheva
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 115, № 23, с. 7621-7628 DOI
  • 
    • 2011 X-ray and NMR Crystallography in an Enzyme Active Site: The Indoline Quinonoid Intermediate in Tryptophan Synthase
    • Lai Jinfeng, Niks Dimitri, Wang Yachong, Domratcheva Tatiana, Barends Thomas R.M., Schwarz Friedrich, Olsen Ryan A., Elliott Douglas W., Qaiser Fatmi M., Chang Chia-en A., Schlichting Ilme, Dunn Michael F., Mueller Leonard J.
    • в журнале Journal of the American Chemical Society, издательство American Chemical Society (United States), том 133, № 1, с. 4-7 DOI
  • 
    • 2010 Quantum Chemistry Calculations Provide Support to the Mechanism of the Light-Induced Structural Changes in the Flavin-Binding Photoreceptor Proteins
    • Khrenova M.G., Nemukhin A.V., Grigorenko B.L., Krylov A.I., Domratcheva T.M.
    • в журнале Journal of Chemical Theory and Computation, издательство American Chemical Society (United States), том 6, № 8, с. 2293-2302 DOI
  • 
    • 2009 Electronic Structure of (6-4) DNA Photoproduct Repair Involving a Non-Oxetane Pathway
    • Domratcheva Tatiana, Schlichting Ilme
    • в журнале Journal of the American Chemical Society, издательство American Chemical Society (United States), том 131, № 49, с. 17793-17799 DOI
  • 
    • 2009 Primary Reactions of the LOV2 Domain of Phototropin Studied with Ultrafast Mid-Infrared Spectroscopy and Quantum Chemistry
    • Alexandre Maxime T.A., Domratcheva Tatiana, Bonetti Cosimo, van Wilderen Luuk J.G.W, van Grondelle Rienk, Groot Marie-Louise, Hellingwerf Klaas J., Kennis John T.M.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 97, № 1, с. 227-237 DOI
  • 
    • 2008 Crystal Structure and Mechanism of a DNA (6-4) Photolyase
    • Maul Melanie, Barends Thomas R.M., Glas Andreas, Cryle Max, Domratcheva Tatiana, Schneider Sabine, Schlichting Ilme, Carell Thomas
    • в журнале Angewandte Chemie - International Edition, издательство John Wiley & Sons Ltd. (United Kingdom), том 47, № 52, с. 10076-10080
  • 
    • 2008 Molecular Models Predict Light-Induced Glutamine Tautomerization in BLUF Photoreceptors
    • Domratcheva Tatiana, Grigorenko Bella L., Schlichting Ilme, Nemukhin Alexander V.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 94, № 10, с. 3872-3879 DOI
  • 
    • 2008 Structure and Mechanistic Implications of a Tryptophan Synthase Quinonoid Intermediate
    • Barends Thomas R.M., Domratcheva Tatiana, Kulik Victor, Blumenstein Lars, Niks Dimitri, Dunn Michael F., Schlichting Ilme
    • в журнале ChemBiochem, том 9, № 7, с. 1024-1028 DOI
  • 
    • 2008 Ultrafast Infrared Spectroscopy of Riboflavin: Dynamics, Electronic Structure, and Vibrational Mode Analysis
    • Wolf Matthias M.N, Christian Schumann, Ruth Gross, Tatiana Domratcheva, Rolf Diller
    • в журнале Journal of Physical Chemistry B, издательство American Chemical Society (United States), том 112, № 42, с. 13424-13432 DOI
  • 
    • 2007 $\upbeta$Q114N and $\upbeta$T110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate $\upalpha$-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase†
    • Blumenstein Lars, Domratcheva Tatiana, Niks Dimitri, Ngo Huu, Seidel Ralf, Dunn Michael F., Schlichting Ilme
    • в журнале Biochemistry, издательство American Chemical Society (United States), том 46, № 49, с. 14100-14116 DOI
  • 
    • 2006 Analysis of the Primary Photocycle Reactions Occurring in the Light, Oxygen, and Voltage Blue-Light Receptor by Multiconfigurational Quantum-Chemical Methods
    • Domratcheva Tatiana, Fedorov Roman, Schlichting Ilme
    • в журнале Journal of Chemical Theory and Computation, издательство American Chemical Society (United States), том 2, № 6, с. 1565-1574 DOI
  • 
    • 2006 Crystal Structures of the AppA BLUF Domain Photoreceptor Provide Insights into Blue Light-mediated Signal Transduction
    • Jung Astrid, Reinstein Jochen, Domratcheva Tatiana, Shoeman Robert L., Schlichting Ilme
    • в журнале Journal of Molecular Biology, издательство Academic Press (United States), том 362, № 4, с. 717-732 DOI
  • 
    • 2005 Structure of a bacterial BLUF photoreceptor: Insights into blue light-mediated signal transduction
    • Jung A., Domratcheva T., Tarutina M., Wu Q., Ko W.h., Shoeman R.L., Gomelsky M., Gardner K.H., Schlichting I.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 102, № 35, с. 12350-12355 DOI
  • 
    • 2003 Crystal Structures and Molecular Mechanism of a Light-Induced Signaling Switch: The Phot-LOV1 Domain from Chlamydomonas reinhardtii
    • Fedorov Roman, Schlichting Ilme, Hartmann Elisabeth, Domratcheva Tatjana, Fuhrmann Markus, Hegemann Peter
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 84, № 4, с. 2474-2482 DOI
  • 
    • 2000 Неэмпирическое моделирование взаимодействия воды с дефектами кристаллической решетки цеолита
    • Домрачева Т.М., Новаковская Ю.В., Степанов Н.Ф.
    • в журнале Журнал физической химии, издательство Наука (М.), том 74, № 1, с. 132-137
  • • 1999 Неэмпирическая модель простейших адсорбционных комплексов вода–цеолит: образование подвижного протона
    • Домрачева Т.М., Новаковская Ю.В., Кубасов А.А., Степанов Н.Ф.
    • в журнале Журнал физической химии, издательство Наука (М.), том 73, № 7, с. 1249-1255
  • 
    • 1998 Кислотные свойства мономера и димера воды, координированных модельным фрагментом цеолита
    • Степанов Н.Ф., Новаковская Ю.В., Кубасов А.А., Домрачева Т.М.
    • в журнале Доклады Академии наук, издательство Наука (М.), том 359, № 4, с. 507-509

• Статьи в сборниках

  • 
    • 2014 Computational Spectroscopy, Dynamics, and Photochemistry of Photosensory Flavoproteins
    • Domratcheva T., Udvarhelyi A., Shahi A.R.M
    • в сборнике Flavins and Flavoproteins, серия Methods in Molecular Biology (Methods and Protocols), место издания Humana Press, New York, NY New York, том 1146, с. 191-228 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Resonance interactions of ionic chromophores play key role in biological photoreception (Приглашенный)
    • Автор: Tatiana Domratcheva
    • Frontiers in Multiscale Modelling of Photoreceptor Proteins, Тель Авив, Израиль, 3-5 сентября 2019
  • • 2019 Anisotropic Response of Cryptochrome Radicals to a Weak Magnetic field (Устный)
    • Авторы: Victor Bezchastnov, Angela Gehrckens, Tatiana Domratcheva
    • 16th International Symposium on Spin and Magnetic Field Effects in Chemistry and Related Phenomena, Saint Petersburg, Россия, 18-22 августа 2019
  • • 2019 Formation and decay of magnetosensory radical pairs in animal cryptochrome (Устный)
    • Автор: Tatiana Domratcheva
    • 16th International Symposium on Spin and Magnetic Field Effects in Chemistry and Related Phenomena, Saint Petersburg, Россия, 18-22 августа 2019
  • • 2018 Central role of electronic effects in photoactivation of PYP (Устный)
    • Автор: Tatiana Domratcheva
    • Gordon Reserach Conference Photosensory Receptors and Signal Transduction, Lucca (Barga), Италия, 4-9 марта 2018
  • • 2014 Complex Alternative Electron Transfer Pathways in Cryptochromes and Photolyases Revealed by Molecular Simulations (Пленарный)
    • Автор: Tatiana Domratcheva
    • 16th International Congress on Photobiology Córdoba, Argentina, Cordoba, Аргентина, 8-12 сентября 2014

• НИРы

  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2023 Строение и динамика атомно-молекулярных систем
    • Кафедра физической химии
    • Руководитель: Немухин А.В. Ответственный исполнитель: Безруков Д.С. Участники НИР: Абраменков А.В., Батаев В.А., Бедняков А.С., Белега Е.Д., Белов А.С., Бохан Д.А., Боченкова А.В., Глебов И.О., Годунов И.А., Голосная М.Н., Григоренко Б.Л., Давыдова И.Б., Домрачева Т.М., Еремин В.В., Ермилов А.Ю., Исаева Е.В., Капуста Д.П., Клещина Н.Н., Князева М.А., Козлов М.И., Козлов С.В., Корнейчук А.Я., Королева Л.А., Краснощеков С.В., Кузьменко Н.Е., Кулакова А.М., Курамшина Г.М., Лазарев А.В., Ларин А.В., Метелешко Ю.И., Миронов В.А., Московский А.А., Новаковская Ю.В., Осин С.Б., Пазюк Е.А., Петров С.В., Пичугина Д.А., Поддубный В.В., Поляков И.В., Сенявин В.М., Степанов Н.Ф., Сызганцева О.А., Татаренко К.А., Терашкевич В.А., Трубников Д.Н., Устынюк Л.Ю., Хренова М.Г., Хрустов В.Ф., Шергольд И.А., Щербинин А.В., Яковлев Н.Н.

• Руководство дипломными работами

  • • 2019 Computational characterization of electron-tarnsfer and radical pair dynamics in Drosophila melanogaster cryptochrome
    • Научный руководитель: Tatiana Domratcheva
    • Автор: Angela Gehrckens (Магистр)
  • • 2015 Unravelling the mechanisms of fluoreccence quenching in phytochrome photoreceptors
    • Научные руководители: Tatiana Domratcheva, Ilme Schlichting
    • Автор: Egle Maksimovitsch (Магистр)

---