ИСТИНА

Никитин Дмитрий Валериевич пользователь

Соавторы: Студитский В.М., Кирпичников М.П., Солонин А.С., Кулаева О.И., Чертков О.В., Герасимова Н.С., Mokrishcheva M., Кудряшова К.С., Малюченко Н.В., Феофанов А.В., Pestov N.A., Tosato V., Любителев А.В. показать полностью..., Сузина Н.Е., Bruschi C., Budarina Z., Dmitriev V., Kalyuzhnaya M.G., Khmelenina V., Rodikova E., Shlyapnikov I.M., Sims J., Zakharova M.Y., Валиева М.Е., Демиденко А.В., Троценко Ю.А., Чупыркина А., Шайтан А.К., Baida G., Bedina A., Breitenbach M., Breitenbach and M.B., Chuvilskaya N., Del S.G., Denjmukhametov M.M., Eshinimaev B., Hippe H., J-L L., Kertesz-Farkas A., Kovalevskiy O., Kulaeva O.I., Kuzmin N., Leech M.A., Lysenko A., Makutina V., Marano R., McDonald I., Mendrock U., Murrell C., Ogarkov O., Osipov G., Pertsev A., Pikuta E., Rinnerthaler M., Rusakova T., Severinov K., Siunov A., West N., Zenkin N., Zrimec J., and Bruschi C.V., Дуда В.И., Ефременко А.В., Котова Е.Ю., Лауринавичус К.С., Марченков Ю.В., Масюкова С.А., Мельник Б.С., Пестов Н.А.

29 статей, 3 книги, 3 доклада на конференциях, 1 тезисы доклада, 9 НИР, 1 патент, 4 научного отчёта

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 346, Scopus: 389
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 8902386

ResearcherID: A-8289-2014

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2017 Bridge-Induced Translocation between NUP145 and TOP2 yeast genes models the genetic fusion between the human orthologs associated with Acute Myeloid Leukemia
    • Tosato V., West N., Zrimec J., Nikitin D., Del Sal G., Marano R., Breitenbach and M.Bruschi C
    • в журнале Frontiers in oncology, издательство Frontiers Research Foundation (Switzerland), том 7, с. 231 DOI
  • 
    • 2016 Linker histones structure and functions
    • Lyubitelev A.V., Nikitin D.V., Shaytan A.K., Studitsky V.M., Kirpichnikov M.P.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 3, с. 213-223 DOI
  • 
    • 2016 Структура и функции линкерных гистонов
    • Любителев А.В., Никитин Д.В., Шайтан А.К., Кирпичников М.П.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 3, с. 329-338
  • 
    • 2015 Development of fluorescently labeled mononucleosomes to study transcription mechanisms by method of microscopy of single complexes
    • Kudryashova K.S., Nikitin D.V., Chertkov O.V., Gerasimova N.S., Valieva M.E., Studitsky V.M., Feofanov A.V.
    • в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin, издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States), том 70, № 4, с. 189-193
  • 
    • 2015 Molecular mechanisms of DNA transcription regulation by a factor PARP1
    • Maluchenko N., Kulaeva O.I., Kotova E., Chupyrkina A., Nikitin D., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.M.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 49, № 1, с. 99-113
  • 
    • 2015 Preparation of mononucleosomal templates for analysis of transcription with RNA polymerase using spFRET. Methods in Molecular Biology. Chromatin protocols
    • Kudryashova K.S., Chertkov O., Nikitin D., Pestov N., Kulaeva O.I., Efremenko A., Solonin A.S., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.М., Feofanov A.V.
    • в журнале Methods in molecular and cellular biology, издательство Wiley (Singapore), том 1288, с. 395-412 DOI
  • 
    • 2015 Repair of chromatinized DNA
    • Gerasimova N.S., Pestov N.A., Kulaeva O.I., Nikitin D.V., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.M.
    • в журнале Moscow University Biological Sciences Bulletin, издательство Allerton Press (New York, N.Y., United States), том 70, № 3, с. 122-126 DOI
  • • 2015 МЕХАНИЗМЫ РЕГУЛЯЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ ПОЛИ(ADPРИБОЗО)ПОЛИМЕРАЗОЙ 1 (PARP1)
    • Малюченко Н.В., Кулаева О.И., Котова Е., Чупыркина А.А., Никитин Д.В., Кирпичников М.П., Студитский В.М.
    • в журнале Молекулярная биология, том 49, № 1, с. 99-113 DOI
  • • 2015 Разработка флуоресцентно-меченых мононуклеосом для изучения механизмов транскрипции методом микроскопии одиночных комплексов
    • Кудряшова К.С., Никитин Д.В., Чертков О.В., Герасимова Н.С., Валиева М.Е., Студитский В.М., Феофанов А.В.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), № 4, с. 41-45
  • 
    • 2015 Репарация ДНК в составе хроматина
    • Герасимова Н.С., Пестов Н.А., Кулаева О.И., Никитин Д.В., Кирпичников М.П., Студитский В.М.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), № 3, с. 21-25
  • • 2015 Создание макета функциональной системы скрининга противоопухолевых препаратов на основе анализа PARP1
    • Малюченко Н.В., Кулаева О.И., Никитин Д.В., Студитский В.М.
    • в журнале Сеченовский вестник, том 2, № 20, с. 101-103
  • 
    • 2014 Chromosome translocation may lead to PRK1-dependent anticancer drug resistance in yeast via actin network deregulation
    • Nikitin D., Bruschi C., Breitenbach M., Rinnerthaler M., Sims J., Tosato V.
    • в журнале European Journal of Cell Biology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 93, № 4, с. 145-156
  • 
    • 2013 Molecular Mechanisms of Transcription Through a Nucleosome by RNA polymerase II
    • Kulaeva O.I., Maluchenko N., Nikitin D., Demidenko A., Chertkov O., Efimova N., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.M.
    • в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 47, № 5, с. 655-666 DOI
  • • 2013 Молекулярные механизмы транскрипции хроматина РНК-полимеразой 2
    • Кулаева О.И., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Демиденко А.В., Чертков О.В., Ефимова Н.С., Кирпичников М.П., Студитский В.М.
    • в журнале Молекулярная биология, том 5, с. 754-766
  • • 2012 Binding to operator decreases Ecl18kI DNA methylating activity
    • Nikitin D., Mokrishcheva M., Solonin A.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 77, № 3, с. 392-397
  • 
    • 2011 Fused eco29kIR- and M genes coding for a fully functional hybrid polypeptide as a model of molecular evolution of restriction-modification systems
    • Mokrishcheva M., Solonin A., Nikitin D.
    • в журнале BMC Evolutionary Biology, издательство BioMed Central (London), том 11, № 1, с. 35 DOI
  • 
    • 2008 Molecular and cellular effects of nonreciprocal chromosome translocations in S.cerevisiae
    • Nikitin D., Tosato V., Bedina A., Bruschi C.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 105, № 28, с. 9703-9708 DOI
  • 
    • 2007 6His-Eco29kI DNA methyltransferase methylation site and kinetic mechanism characterization
    • Nikitin D., Mokrishcheva M., Solonin A.
    • в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1774, № 8, с. 1014-1019 DOI
  • 
    • 2007 Two HlyIIR dimers bind to a long perfect inverted repeat in the operator of the hemolysin II gene from Bacillus cereus
    • Rodikova E., Kovalevskiy O., Mayorov S., Budarina Z., Marchenkov V., Melnik B., Leech A., Nikitin D., Shlyapnikov M., Solonin A.
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 581, № 6, с. 1190-1196 DOI
  • 
    • 2004 A new B. cereus DNA-binding protein, HlyIIR, negatively regulates expression of B. cereus hemolysin II in E. coli
    • Budarina Zh, Nikitin D., Zenkin N., Zakharova M., Semenova E., Shlyapnikov M., Rodikova E., Ogarkov O., Baida G., Masyukova S., Severinov K., Solonin A.
    • в журнале Microbiology, издательство Microbiology Society (London), том 150, № 11, с. 3691-3701 DOI
  • 
    • 2003 The construction of an overproducing strain, purification and biochemical characterization of the 6His-Eco29kI restriction endonuclease
    • Nikitin D., Mokrishcheva M., Denjmukhametov M., Pertzev A., Zakharova M., Solonin A.
    • в журнале Protein Expression and Purification, издательство Academic Press (United States), том 30, № 1, с. 26-31 DOI
  • • 2002 Methanotrophic communities in the soils of Russian Northern Taiga and Subarctic Tundra
    • Kalyuzhnaya M., Makutina V., Rusakova T., Nikitin D., Khmelenina V., Dmitriev V., Trotsenko Yu
    • в журнале Microbiology, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 71, № 2, с. 227-233
  • 
    • 2001 Taxonomic characterization of new alkalitolerant methanotrophs from soda lakes of the southeastern transbaikal region
    • Kaluzhnaya M., Khmelenina V., Eshinimaev B., Suzina N., Nikitin D., Solonin A., J-L Lin, McDonald I., Murrell C., Trotsenko Y.
    • в журнале Systematic and Applied Microbiology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 24, № 2, с. 166-176 DOI
  • 
    • 2000 Anoxybacillus pushchinoensis gen. nov., sp. nov., a new anaerobic alkaliphilic moderately thermophilic bacterium
    • Pikuta E., Lysenko A., Chuvilskaya N., Mendrock U., Hippe H., Suzina N., Nikitin D., Osipov G., Laurinavichius K.
    • в журнале International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, издательство Society for General Microbiology (United Kingdom), том 50, № 6, с. 2109-2117 DOI
  • 
    • 1999 Phylogenetic status of Anaerobacter polyendosporus, an anaerobic, polysporogenic bacterium
    • Siunov A., Nikitin D., Suzina N., Dmitriev V., Kuzmin N., Duda V.
    • в журнале International journal of systematic bacteriology, издательство Society for General Microbiology (United Kingdom), том 49, № 3, с. 1119-1124 DOI

• Статьи в сборниках

  • 
    • 2015 Analysis of nucleosome transcription using single-particle FRET
    • Feofanov A.V., Kudryashova K.S., Chertkov O.V., Nikitin D.V., Pestov N.A., Kulaeva O.I., Studitsky V.M., Kirpichnikov M.P.
    • в сборнике "2nd International Multidisciplinary Microscopy and Microanalysis Congress"; E.K. Polychroniadis, A.Y. Oral, M. Ozer, Eds.,, серия Springer Proceedings in Physics, место издания Springer, том 164, с.  255-260 DOI
  • 
    • 2014 Influence of chromosome translocation on yeast life span: implications for long-term industrial biofermentation
    • Sims J., Nikitin D., and Bruschi C.V.
    • в сборнике Nanobiotechnology in energy, environment and electronics: methods and applications, место издания Pan Stanford Publishing Pte, с. 9-40
  • • 2012 Bifunctional prokaryotic DNA-methyltransferases
    • Nikitin D., Kertesz-Farkas A., Solonin A., Mokrishcheva M.
    • в сборнике Methylation: from DNA, RNA and histones to diseases and treatment, место издания InTech Rijeka, Croatia, с. 71-89
  • 
    • 2012 Role of gene fusion in evolution of restriction endonucleases
    • Mokrishcheva M., Solonin A., Nikitin D.
    • в сборнике Protein purification and analysis I – methods and applications, место издания Australia-Hong Kong, с. 163-181

• Книги

  • • 2017 Molecular and cellular effects of translocations on eukaryotic cells
    • Nikitin D.
    • место издания Lambert Academic Publishing Saarbrücken, Germany, ISBN 978-620-2-02857-8, 65 с.
  • • 2013 Kinetics peculiarities of bifunctional DNA-methyltransferase M.Ecl18kI
    • Nikitin D.V.
    • место издания Lambert Academic Publishing Germany, ISBN 978-3-659-41314-8, 65 с.
  • • 2013 Role of gene fusion in evolution of restriction-modification enzymes
    • Nikitin DV
    • место издания Lambert Academic Publishing Saarbrücken, Germany, ISBN 978-3-659-37337-4, 65 с.

• Доклады на конференциях

  • • 2016 Chromatin Transcription: Epigenetics, Cancer & Aging (Устный)
    • Авторы: Valieva Maria E., Gerasimova Nadezhda S., Armeev Grigori A., Kudryashova Kseniya S., Nikitin Dmitry V., Chertkov Oleg V., Kulaeva Olga I., Feofanov Alexey V., Kirpichnikov Mikhail P., Studitsky Vasily M., Shaytan Alexey K.
    • II Международная научная конференция «Наука будущего», Казань, Россия, 20-23 сентября 2016
  • • 2015 Analysis of nucleosome transcription with RNA polymerase using single particle FRET microscopy (Устный)
    • Авторы: Kudryashova Ksenia, Chertkov Oleg, Nikitin Dmitry, Kulaeva Olga, Studitsky Vasiliy, Feofanov Alexey
    • 12th Multinational Congress on Microscopy , Венгрия, 23-28 августа 2015
  • • 2015 Interactions of nucleosomes with proteins: single-particle FRET analysis (Приглашенный)
    • Авторы: Feofanov A.V., Kudryashova K.S., Lyubitelev A.V., Chertkov O.V., Nikitin D.V., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.М.
    • V International Symposium “Topical Problems of Biophotonics” (TPB-2015), 20 – 24 July, 2015 Nizhny Novgorod, Russia , Nizhny Novgorod, Россия, 20-24 июля 2015

• Тезисы докладов

  • • 2015 Interactions of nucleosomes with proteins: single-particle FRET analysis
    • Feofanov A.V., Kudryashova K.S., Lyubitelev A.V., Chertkov O.V., Nikitin D.V., Kirpichnikov M.P., Studitsky V.М.
    • в сборнике Proceedings of V International Symposium “Topical Problems of Biophotonics", тезисы, с. 120-121

• НИРы

  • • 26 октября 2017 - 28 февраля 2021 Механизмы узнавания повреждений ДНК в хроматине белками семейства PARP
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Герасимова Н.С. Участники НИР: Гущина И.В., Кудряшова К.С., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Нилов Д.К., Султанов Д.Ч., Чертков О.В.
  • • 11 августа 2017 - 27 ноября 2020 Механизм взаимодействия PARP-1 с хроматином
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Феофанов А.В. Ответственный исполнитель: Малюченко Н.В. Участники НИР: Армеев Г.А., Валиева М.Е., Герасимова Н.С., Гераськина О.В., Иванова М.А., Коровина А.Н., Кошкина Д.О., Любителев А.В., Никитин Д.В., Саулина А.А., Чертков О.В., Шайтан А.К.
  • • 2 мая 2017 - 31 декабря 2018 Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции: структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Ответственный исполнитель: Шайтан К.В. Участники НИР: Алескерова Л.Э., Армеев Г.А., Багров Д.В., Волох О.И., Герасимова Н.С., Ефременко А.В., Иванова М.А., Иванова М.А., Карлова М.Г., Киташов А.В., Любителев А.В., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Сивкина А.Л., Соколова О.С., Студитский В.М., Феофанов А.В., Чертков О.В., Шайтан А.К.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Участники НИР: Айдналиева Н.В., Алескерова Л.Э., Аргентова В.В., Армеев Г.А., Архипова А.Ю., Асланян Р.Р., Ахаев Д.Н., Багров Д.В., Барский Е.Л., Баулина О.И., Боздаганян М.Е., Бонарцев А.П., Бондаренко Е.А., Буракова О.В., Валиева М.Е., Васильева С.Г., Вахрушева А.В., Волох О.И., Волынцева А.Д., Герасимова Н.С., Гераськина О.В., Глухов А.И., Глухов Г.С., Гончаренко А.В., Гончарук М.В., Гончарук С.А., Гордеев С.А., Горелова О.А., Долгих Д.А., Дольникова Г.А., Жаркова И.И., Зайцева А.А., Иванова М.А., Карлова М.Г., Коровина А.Н., Кошкина Д.О., Кузьменков А.И., Лобакова Е.С., Лукьянов А.А., Любителев А.В., Малюченко Н.В., Мариловцева Е.В., Мойсенович А.М., Мойсенович М.М., Налобин Д.С., Никитин Д.В., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Орлова А.А., Панченко Л.А., Петушкова Ю.А., Петушкова Ю.П., Попова С.С., Пугачева Т.Т., Рамонова А.А., Саванина Я.В., Савилова З.Д., Селях И.О., Семенова Л.Р., Сивкина А.Л., Соколова О.С., Соловченко А.Е., Соловченко О.В., Станишнева-Коновалова Т.Б., Студитский В.М., Суханова Ю.А., Тамбиев А.Х., Трифонова Е.С., Утешинская Л.В., Федоренко Т.А., Феофанов А.В., Чеканов К.А., Чемерис А.С., Чертков О.В., Чивкунова О.Б., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шебанова А.С., Шибзухова К.А., Щербаков П.Н., Яголович А.В., герасимова н.с.
  • • 6 августа 2014 - 31 декабря 2016 Эпигенетические механизмы и регуляция транскрипции:структурно-функциональный анализ и разработка новых методов исследования
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Ответственные исполнители: Феофанов А.В., Шайтан К.В. Участники НИР: Волох О.И., Киташов А.В., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Соколова О.С., Студитский В.М., Феофанов А.В., Шайтан А.К.
  • • 27 июня 2014 - 31 декабря 2016 Создание макета функциональной системы скрининга противоопухолевых препаратов на основе анализа PARP1
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Студитский В.М. Участники НИР: Берсенева У.В., Валиева М.Е., Герасимова Н.С., Иванова М.А., Кулаева О.И., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Станишнева-Коновалова Т.Б., Чертков О.В.
  • • 7 марта 2013 - 3 сентября 2013 Создание научных основ повышения эффективности молекулярно-генетической диагностики и лечения онкологических заболеваний на основе анализа про-опухолевого фактора FACT
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Студитский В.М. Участники НИР: Герасимова Н.С., Иванова М.А., Киташов А.В., Кулаева О.И., Малюченко Н.В., Никитин Д.В., Чертков О.В., Чупыркина А.
  • • 1 декабря 2010 - 31 декабря 2012 Эукариотическое транскрибирование: механизмы генетических и эпигенетических процессов и разработка регуляторов для биоинженерии
    • Биологический факультет
    • Руководитель: Студитский В.М. Участники НИР: Аргентова В.В., Армеев Г.А., Багров Д.В., Волох О.И., Герасимова Н.С., Глухов Г.С., Демиденко А.В., Ефременко А.В., Ефремов Ю.М., Иванова М.А., Киташов А.В., Кудряшова К.С., Кулаева О.И., Малюченко Н.В., Маслакова А.А., Никитин Д.В., Орловский И.В., Печникова Е.В., Роскошная А.С., Рубцов М.А., Соколова О.С., Феофанов А.В., Чертков О.В., Шайтан А.К.
  • • 1 января 2006 - 31 декабря 2015 Физико-химические основы молекулярной биоинженерии
    • Кафедра биоинженерии
    • Руководитель: Кирпичников М.П. Участники НИР: Аргентова В.В., Архипова А.Ю., Асланян Р.Р., Багров Д.В., Барский Е.Л., Баулина О.И., Бонарцев А.П., Буракова О.В., Васильева С.Г., Гончаренко А.В., Гончарук М.В., Гончарук С.А., Горелова О.А., Дольникова Г.А., Лобакова Е.С., Лукьянов А.А., Малюченко Н.В., Мойсенович М.М., Несов А.В., Никитин Д.В., Новоселецкий В.Н., Панченко Л.А., Петушкова Ю.А., Петушкова Ю.П., Попова С.С., Саванина Я.В., Селях И.О., Семенова Л.Р., Соколова О.С., Соловченко А.Е., Соловченко О.В., Станишнева-Коновалова Т.Б., Студитский В.М., Тамбиев А.Х., Трифонова Е.С., Федоренко Т.А., Чеканов К.А., Чемерис А.С., Чертков О.В., Чивкунова О.Б., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шебанова А.С., Яголович А.В.

• Патенты

  • • 2016 Метод сайт-направленных транслокаций в клетках Saccharomyces cerevisiae
    • Автор: Никитин Д.В.
    • #2016126349, 30 июня

• Отчеты

  • • 2014 Создание макета функциональной системы скрининга противоопухолевых препаратов на основе анализа PARP1
    • Авторы: Малюченко Н.В., Студитский В.М., Кулаева О.И., Никитин Д.В.
    • #1, 132 с.
  • • 2013 Создание научных основ повышения эффективности молекулярно-генетической диагностики и лечения онкологических заболеваний на основе анализа про-опухолевого фактора FACT (2 этап)
    • Авторы: Малюченко Н.В., Студитский В.М., Киташов А.В., Никитин Дмитрий Валерьевич, Чертков О.В., Кулаева О.И.
    • #2, 117 с.
  • • 2013 Создание научных основ повышения эффективности молекулярно-генетической диагностики и лечения онкологических заболеваний на основе анализа про-опухолевого фактора FACT
    • Авторы: Малюченко Н.В., Студитский В.М., Киташов А.В., Никитин Дмитрий Валерьевич, Чертков О.В., Кулаева О.И.
    • #1, 139 с.
  • • 2012 Итоговый, этап №3
    • Авторы: Малюченко Н.В., Студитский В.М., Демиденко А.В., Киташов А.В., Кулаева О.И., Аргентова Виктория Витальевна, Багров Д.В., Ефимова Н.С., Никитин Дмитрий Валерьевич, Соколова О.С., Феофанов А.В., Шайтан А.К.
    • #5, 227 с.