ИСТИНА

Лебедев Юрий Борисович пользователь

МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Кафедра иммунологии, профессор, с 11 января 2016, по совместительству

доктор биологических наук с 2005 года

профессор по специальности № 03.01.03 - молекулярная биология с 24 июня 2013 г.

Институт биоорганической химии имени академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН, заведующий лабораторией

Соавторы: Mamedov I.Z., Звягин И., Komech E.A., Pogorelyy M.V., Chudakov D.M., Minervina A.A., Shugay M., Britanova O.V., Staroverov D.B., Чудаков Д.М., Bolotin D.A., Komkov A.Y., Walczak A. показать полностью..., Мамедов И.З., Maschan M., Лукьянов С.А., Egorov E.S., Fedorenko D.A., Lukyanov S., Mora T., Nugmanov G., Shmidt E.I., Sycheva A., Turchaninova M.A., Бочкова А.А., Комков А.Ю., Назаров В.И., Ребриков Д.В., Салютина М.В., Khodosevich K.V., Kotlobay A.A., Maschan A., Miroshnichenkova A., Shelenkov A.A., Ustyugova S.V., Мерзляк М.Н., Минервина А.А., Мусаткина Е.Н., Новикова А.А., Путинцева Е.В., Шаронов Г.В., Andersen V., Bochkova A.G., Brilliantova V., Cherny D.I., Chkalina A.V., Demin, Elhanati Y., Franzke A., Karnaukhov V.K., Kasatskaya S., Khil P.P., Klinov D.V., Kurnikova M.A., Lagutina I.O., Marcou Q., Mutovina Z.Y., Nasonov E.L., Novik A.A., Olshanskaya Y., Spehlmann M.E., Thierry P., Touzel M.P., Барсова Е.В., Болотин Д.А., Давыдов А.Н., Дородных Т.Ю., Дьяконова Ю.Ю., Карганова Г.Г., Коваленко Е.И., Комков М.А., Коростин Д.О., Кошенкова А.В., Курносов А.А., Макова М.Н., Мишин А.С., Неретина Т.В., Ольшанская Ю.В., Панчин А.Ю., Панчин Ю.В., Погорелый М.В., Прохоров В.В., Свердлов Е.Д., Спирин С.А., Сырко Д.С., Сычева А.А., Устюгова С.В., Ходосевич К.В., Шостак Н.А.

34 статьи, 1 тезисы доклада, 1 членство в диссертационном совете, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 663, Scopus: 668
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 24667622

Деятельность стиль:  обычный | ГОСТ | plain | abbrv | acm | alpha | amsalpha | amsplain | apalike | ieeetr | siam

---

• Статьи в журналах

  • • 2020 Identification of disease-associated traits and clonotypes in the T-cell receptor repertoire of monozygotic twins affected by inflammatory bowel diseases
    • Rosati Elisa, Pogorelyy Mikhail V., Marie Dowds C., Moller Frederik T., Sorensen Signe B., Lebedev Yuri B., Frey Norbert, Schreiber Stefan, Spehlmann Martina E., Andersen Vibeke, Mamedov Ilgar Z., Franke Andre
    • в журнале Journal of Crohn's and Colitis, издательство Elsevier Science (United Kingdom), с. jjz179 DOI
  • 
    • 2020 Primary and secondary anti-viral response captured by the dynamics and phenotype of individual T cell clones
    • Minervina AA, Pogorelyy MV, Komech EA, Karnaukhov VK, Bacher P., Rosati E., Franke A., Chudakov DM, Mamedov IZ, Lebedev YB, Mora T., Walczak AM
    • в журнале eLife, том 9, с. e53704 DOI
  • 
    • 2019 A Pipeline for the Error-free Identification of Somatic Alu Insertions in High-throughput Sequencing Data
    • Nugmanov GA, Komkov AY, Saliutina MV, Minervina AA, Lebedev YB, Mamedov IZ
    • в журнале Молекулярная биология, том 53, № 1, с. 154-165 DOI
  • 
    • 2019 Detecting T cell receptors involved in immune responses from single repertoire snapshots
    • Pogorelyy Mikhail V., Minervina Anastasia A., Shugay Mikhail, Chudakov Dmitriy M., Lebedev Yuri B., Mora Thierry, Walczak Aleksandra M.
    • в журнале PLoS Biology, издательство Public Library of Science (United States), том 17, № 6, с. e3000314 DOI
  • 
    • 2019 БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АЛГОРИТМ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ПРЕЦИЗИОННОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ СОМАТИЧЕСКИХ ИНСЕРЦИЙ РЕТРОЭЛЕМЕНТОВ
    • Нугманов Г.А., Комков А.Ю., Салютина М.В., Минервина А.А., Лебедев Ю.Б., Мамедов И.З.
    • в журнале Молекулярная биология, том 53, № 1, с. 154-165 DOI
  • 
    • 2018 A STUDY OF THE REPERTOIRE OF ACTIVATED T-CELL CLONES OBTAINED FROM A PATIENT WITH ANKYLOSING SPONDYLITIS
    • Komech E.A., Lebedev Y.B., Koshenkova A.V., Syrko D.S., Musatkina E.A., Lukyanov S.A., Chudakov D.M., Zvyagin I.V.
    • в журнале Bulletin of RSMU, издательство Pirogov Russian National Research Medical University (Moscow), № 1, с. 60-67 DOI
  • 
    • 2018 AN ADVANCED ENRICHMENT METHOD FOR RARE SOMATIC RETROELEMENT INSERTIONS SEQUENCING
    • Komkov A.Y., Minervina A.A., Nugmanov G.A., Saliutina M.V., Lebedev Y.B., Mamedov I.Z., Khodosevich K.V.
    • в журнале Mobile DNA, издательство BioMed Central (London), том 9, № 1, с. 31 DOI
  • • 2018 CD8$\mathplus$ T cells with characteristic T cell receptor beta motif are detected in blood and expanded in synovial fluid of ankylosing spondylitis patients
    • Komech Ekaterina A., Pogorelyy Mikhail V., Egorov Evgeniy S., Britanova Olga V., Rebrikov Denis V., Bochkova Anna G., Shmidt Evgeniya I., Shostak Nadejda A., Shugay Mikhail, Lukyanov Sergey, Mamedov Ilgar Z., Lebedev Yuriy B., Chudakov Dmitriy M., Zvyagin Ivan V.
    • в журнале Rheumatology (Oxford, England), издательство Oxford University Press (United Kingdom) DOI
  • 
    • 2018 Characterization of the T-cell Repertoire after Autologous HSCT in Patients with Ankylosing Spondylitis
    • Komech EA, Zvyagin IV, Pogorelyy MV, Mamedov IZ, Fedorenko DA, Lebedev YB
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 10, № 2, с. 48-57
  • 
    • 2018 Method for identification of condition-associated public antigen receptor sequences
    • Pogorelyy MV, Minervina AA, Chudakov DM, Mamedov IZ, Lebedev YB, Mora T., Walczak AM
    • в журнале eLife, том 7, с. pii: e33050 DOI
  • 
    • 2018 Precise tracking of vaccine-responding T cell clones reveals convergent and personalized response in identical twins
    • Pogorelyy Mikhail V., Minervina Anastasia A., Touzel Maximilian Puelma, Sycheva Anastasiia L., Komech Ekaterina A., Kovalenko Elena I., Karganova Galina G., Egorov Evgeniy S., Komkov Alexander Yu, Chudakov Dmitriy M., Mamedov Ilgar Z., Mora Thierry, Walczak Aleksandra M., Lebedev Yuri B.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 115, № 50, с. 12704-12709 DOI
  • 
    • 2018 Quantitative profiling reveals minor changes of T cell receptor repertoire in response to subunit inactivated influenza vaccine
    • Sycheva AL, Pogorelyy MV, Komech EA, Minervina AA, Zvyagin IV, Staroverov DB, Chudakov DM, Lebedev YB, Mamedov IZ
    • в журнале Vaccine, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 36, № 12, с. 1599-1605 DOI
  • • 2018 ИССЛЕДОВАНИЕ КЛОНАЛЬНОГО РЕПЕРТУАРА ФРАКЦИИ АКТИВИРОВАННЫХ Т-ЛИМФОЦИТОВ У ПАЦИЕНТА С АНКИЛОЗИРУЮЩИМ СПОНДИЛИТОМ
    • Комеч Е.А., Лебедев Ю.Б., Кошенкова А.В., Сырко Д.С., Мусаткина Е.А., Лукьянов С.А., Чудаков Д.М., Звягин И.В.
    • в журнале Вестник Российского государственного медицинского университета, издательство РНИМУ им. Н. И. Пирогова (Москва), № 1, с. 65-73 DOI
  • • 2018 ИССЛЕДОВАНИЕ РЕПЕРТУАРА Т-ЛИМФОЦИТОВ ПОСЛЕ АУТОЛОГИЧНОЙ ТГСК У ПАЦИЕНТОВ С АНКИЛОЗИРУЮЩИМ СПОНДИЛИТОМ
    • Комеч Е.А., Звягин И.В., Погорелый М.В., Мамедов И.З., Федоренко Д.А., Лебедев Ю.Б.
    • в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 10, № 2 (37), с. 52-61
  • • 2018 Клональные репертуары Т-лимфоцитов очагов воспаления у пациентов со спондилоартропатиями
    • Комеч Е.А., Мясоутова А.А., Колтакова А.Д., Коротаева Т.В., Логинова Е.Ю., Шмидт Е.И., Сальникова М.А., Минервина А.А., Лебедев Ю.Б., Звягин И.В.
    • в журнале Научно-практическая ревматология, с. 20-20
  • 
    • 2017 Persisting fetal clonotypes influence the structure and overlap of adult human T cell receptor repertoires
    • Pogorelyy MV, Elhanati Y., Marcou Q., Sycheva AL, Komech EA, Nazarov VI, Britanova OV, Chudakov DM, Mamedov IZ, Lebedev YB, Mora T., Walczak AM
    • в журнале PLoS Computational Biology, издательство Public Library of Science (United States), том 13, № 7, с. e1005572 DOI
  • 
    • 2017 Tracking T-cell immune reconstitution after TCR alpha beta/CD19-depleted hematopoietic cells transplantation in children
    • Zvyagin I.V., Mamedov IZ, Tatarinova OV, Komech EA, Kurnikova EE, Boyakova EV, Brilliantova V., Shelikhova LN, Balashov DN, Shugay M., Sycheva AL, Kasatskaya SA, Lebedev YB, Maschan AA, Maschan MA, Chudakov DM
    • в журнале Leukemia, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 31, № 5, с. 1145-1153 DOI
  • 
    • 2016 Detection of immunoglobulin genes rearrangements in patients with acute lymphoblastic leukemia using highthroughput next generation sequencing
    • Komkov AY, Miroshnichenkova AM, Olshanskaya YV, Myakova NV, Diakonova YY, Minervina AA, Mamedov IZ, Lebedev YB, Maschan AA, Maschan MA
    • в журнале Gematologiya i Transfuziologiya, издательство Izdatel'stvo Meditsina Publishers (Russian Federation), том 61, № 4, с. 200-204 DOI
  • 
    • 2016 Reliability of immune receptor rearrangements as genetic markers for minimal residual disease monitoring
    • Nazarov V.I., Minervina A.A., Komkov A.Y., Pogorelyy M.V., Maschan M.A., Olshanskaya Y.V., Zvyagin I.V., Chudakov D.M., Lebedev Y.B., Mamedov I.Z.
    • в журнале Bone Marrow Transplantation, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 51, № 10, с. 1408-1410 DOI
  • 
    • 2016 ДЕТЕКЦИЯ ПЕРЕСТРОЕК ИММУНОГЛОБУЛИНОВЫХ ГЕНОВ ПРИ ОСТРЫХ ЛИМФОБЛАСТНЫХ ЛЕЙКОЗАХ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ
    • Комков М.А., Мирошниченкова А.М., Ольшанская Ю.В., Мякова Н.В., Дьяконова Ю.Ю., Минервина А.А., Мамедов И.З., Лебедев Ю.Б., Масчан А.А.
    • в журнале Гематология и трансфузиология, издательство Медицина (М.), том 61, № 4, с. 200-204 DOI
  • • 2016 УСОВЕРШЕНСТВОВАННАЯ МЕТОДИКА ДЕТЕКЦИИ ОПУХОЛЕВЫХ ЛИМФОБЛАСТОВ ПРИ Т-КЛЕТОЧНЫХ ЛЕЙКОЗАХ
    • Минервина А.А., Комков А.Ю., Мамедов И.З., Лебедев Ю.Б.
    • в журнале Доклады Академии наук, издательство Наука (М.), том 467, № 1, с. 105
  • 
    • 2015 Quantitative Profiling of Immune Repertoires for Minor Lymphocyte Counts Using Unique Molecular Identifiers
    • Egorov E.S., Merzlyak E.M., Shelenkov A.A., Britanova O.V., Sharonov G.V., Staroverov D.B., Bolotin D.A., Davydov A.N., Barsova E., Lebedev Y.B., Shugay M., Chudakov D.M.
    • в журнале Journal of Immunology, издательство American Association of Immunologists (United States), том 194, № 12, с. 6155-6163 DOI
  • 
    • 2015 TCR: AN R PACKAGE FOR T CELL RECEPTOR REPERTOIRE ADVANCED DATA ANALYSIS
    • Nazarov V.I., Pogorelyy M.V., Komech E.A., Zvyagin I.V., Bolotin D.A., Shugay M., Chudakov D.M., Lebedev Y.B., Mamedov I.Z.
    • в журнале BMC Bioinformatics, издательство BioMed Central (London), том 16, № 1, с. 175 DOI
  • 
    • 2015 THE EVIDENCE FOR INCREASED L1 ACTIVITY IN THE SITE OF HUMAN ADULT BRAIN NEUROGENESIS
    • Kurnosov A.A., Ustyugova S.V., Nazarov V.I., Minervina A.A., Komkov A.Yu, Shugay M., Pogorelyy M.V., Mamedov I.Z., Lebedev Y.B., Khodosevich K.V.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 10, № 2, с. e0117854 DOI
  • 
    • 2014 AGE-RELATED DECREASE IN TCR REPERTOIRE DIVERSITY MEASURED WITH DEEP AND NORMALIZED SEQUENCE PROFILING
    • Britanova O.V., Putintseva E.V., Shugay M., Merzlyak E.M., Turchaninova M.A., Staroverov D.B., Bolotin D.A., Lukyanov S., Bogdanova E.A., Mamedov I.Z., Lebedev Y.B., Chudakov D.M.
    • в журнале Journal of Immunology, издательство American Association of Immunologists (United States), том 192, № 6, с. 2689-2698
  • 
    • 2014 DISTINCTIVE PROPERTIES OF IDENTICAL TWINS' TCR REPERTOIRES REVEALED BY HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING
    • Zvyagin I.V., Pogorelyy M.V., Ivanova M.E., Komech E.A., Shugay M., Bolotin D.A., Shelenkov A.A., Kurnosov A.A., Staroverov D.B., Chudakov D.M., Lebedev Y.B., Mamedov I.Z.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 111, № 16, с. 5980-5985
  • 
    • 2013 СТРАТЕГИЯ ПОИСКА СОМАТИЧЕСКИХ ИНСЕРЦИЙ РЕТРОЭЛЕМЕНТОВ В ГЕНОМЕ ЧЕЛОВЕКА
    • Курносов А.А., Устюгова С.В., Погорелый М.В., Комков А.Ю., Болотин Д.А., Ходосевич К.В., Мамедов И.З., Лебедев Ю.Б.
    • в журнале Биоорганическая химия, издательство Наука (М.), том 39, № 4, с. 466
  • 
    • 2012 FIRST AUTOLOGOUS HEMATOPOIETIC SCT FOR ANKYLOSING SPONDYLITIS: A CASE REPORT AND CLUES TO UNDERSTANDING THE THERAPY
    • Britanova O.V., Staroverov D.B., Bolotin D.A., Mamedov I.Z., Turchaninova M.A., Putintseva E.V., Kotlobay A.A., Lukyanov S., Lebedev Y.B., Chudakov D.M., Bochkova A.G., Fedorenko D.A., Novik A.A.
    • в журнале Bone Marrow Transplantation, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 47, № 11, с. 1479-1481 DOI
  • 
    • 2012 NEXT GENERATION SEQUENCING FOR TCR REPERTOIRE PROFILING: PLATFORM-SPECIFIC FEATURES AND CORRECTION ALGORITHMS
    • Bolotin D.A., Mamedov I.Z., Britanova O.V., Zvyagin I.V., Shagin D., Ustyugova S.V., Turchaninova M.A., Lukyanov S., Lebedev Y.B., Chudakov D.M.
    • в журнале European Journal of Immunology, издательство John Wiley & Sons Ltd. (United Kingdom), том 42, № 11, с. 3073-3083 DOI
  • 
    • 2010 Association of ERAP1 Allelic Variants with Risk of Ankylosing Spondylitis
    • Zvyagin I.V., Dorodnykh V.Y., Mamedov I.Z., Staroverov D.B., Bochkova A.G., Rebrikov D.V., Lebedev Y.B.
    • в журнале Acta Naturae (англоязычная версия), издательство Park Media Ltd (Moscow, Russia (Federation)), том 2, № 3, с. 72-77
  • 
    • 2010 Contribution of functional KIR3DL1 to ankylosing spondylitis
    • Zvyagin I.V., Mamedov I.Z., Britanova O.V., Staroverov D.B., Nasonov E.L., Bochkova A.G., Chkalina A.V., Kotlobay A.A., Korostin D.O., Rebrikov D.V., Lukyanov S., Lebedev Y.B., Chudakov D.M.
    • в журнале Cellular & molecular immunology., издательство Chinese Society of Immunology (China), том 7, № 6, с. 471-476
  • 
    • 2009 Individual characterization of stably expanded T cell clones in ankylosing spondylitis patients
    • Mamedov I.Z., Britanova O.V., Chkalina A.V., Staroverov D.B., Amosova A.L., Mishin A.S., Kurnikova M.A., Zvyagin I.V., Mutovina Z.Y., Gordeev A.V., Khaidukov S.V., Sharonov G.V., Shagin D.A., Chudakov D.M., Lebedev Y.B.
    • в журнале Autoimmunity, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 42, № 6, с. 525-536
  • 
    • 2008 HUMAN TRASH ESTs — SEQUENCES FROM cDNA COLLECTION THAT ARE NOT ALIGNED TO GENOME ASSEMBLY
    • PANCHIN ALEXANDER Y., SPIRIN SERGEY A., LUKYANOV SERGEY A., LEBEDEV YURI B., PANCHIN YURI V.
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 6, № 04, с. 759-773 DOI
  • 
    • 1998 High resolution mapping DNAs by R-loop atomic force microscopy.Nucleic Acids Research 11/1998; 26(20):4603-10
    • Klinov D.V., Lagutina I.V., Prokhorov V.V., Neretina T., Khil P.P., Lebedev Y.B., Cherny D.I., Demin V.V., Sverdlov ED
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), № 11, с. 4603-4610

• Тезисы докладов

  • 
    • 2018 TCRbeta CDR3 motif is detected in synovial fluid of patients with different spondyloarthropathies
    • Komech E., Miasoutova A., Koltakova A., Korotaeva T., Loginova E., Shmidt E., Lebedev Y., Zvyagin I.
    • в сборнике FEBS Open Bio, серия Supplement 1, место издания FEBS Open Bio Prague, Czech Republic, том 8, тезисы, с. 489-489

• Членство в диссертационных советах

  • • с 23 апреля 2018 МГУ.03.12, МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
    • 03.03.03 - Иммунология (биол. науки)
    • Действующие члены совета: Виноградов А.Д., Недоспасов С.А., Киселевский Д.Б., Атауллаханов Р.И., Байков А.А., Богачев А.В., Борисов В.Б., Гривенников И.А., Гусев Н.Б., Дризе Н.И., Звягильская Р.А., Зоров Д.Б., Катруха А.Г., Купраш Д.В., Лагарькова М.А., Лебедев Ю.Б., Лядова И.В., Ляпина Л.А., Муронец В.И., Тиллиб С.В., Филиппов П.П.

• Диссертация

  • • 2004 Эндогенные ретровирусы человека: структурно-эволюционный анализ
    • Докторская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
    • Автор: Лебедев Юрий Борисович, д.б.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 002.019.01 при ИБХ РАН

---