Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИСТИНА ИНХС РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Капуста Дмитрий Павлович
пользователь
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра физической химии
,
НИЛ квантовой химии и молекулярного моделирования
, техник, 1 октября 2021 - 10 октября 2022
Соавторы:
Хренова М.Г.
,
Бабчук И.В.
,
Метелешко Ю.И.
,
Брехов А.Т.
,
Володина М.О.
,
Григорьева А.В.
,
Гудилин Е.А.
,
Еремина Е.А.
,
Кулакова А.М.
,
Сидоров А.В.
,
Фирсов Д.А.
,
Григоренко Б.Л.
,
Мулашкин Ф.Д.
показать полностью...
,
Немухин А.В.
8 статей
,
12 докладов на конференциях
,
5 тезисов докладов
,
8 НИР
,
1 диссертация
,
4 курсовые работы
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 5, Scopus: 8
IstinaResearcherID (IRID): 88963026
Деятельность
Статьи в журналах
2021
Keto‐enol tautomerism of the 4,5‐dimethyl‐2‐(2′‐hydroxyphenyl)imidazole in water solution: Modeling equilibrium between neutral forms and accurate assignment of the absorption bands
Kapusta Dmitry P.
, Mulashkin Fedor D.,
Khrenova Maria G.
в журнале
International Journal of Quantum Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 121, № 8
DOI
2020
Keto-enol tautomerism of the 4,5-dimethyl-2-(2′- hydroxyphenyl)imidazole in water solution: modeling equilibrium between neutral forms and accurate assignment of the absorption bands
Khrenova Maria G.,
Kapusta Dmitry P.
,
Mulashkin Fedor D.
в журнале
International Journal of Quantum Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
DOI
2020
Modeling the Tautomeric Equilibrium and Absorption Spectrum of 4,5-Dimethyl-2-(2'-hydroxyphenyl)imidazole
Kapusta D.P.
,
Kulakova A.M.
,
Khrenova M.G.
в журнале
Russian Journal of Physical Chemistry A
, издательство
Pleiades Publishing, Ltd
(Road Town, United Kingdom)
, том 94, № 5, с. 945-950
DOI
2020
Моделирование таутомерного равновесия и спектра поглощения 4,5-диметил-2-(2'-гидроксифенил)имидазола
Капуста Д.П.
,
Кулакова А.М.
,
Хренова М.Г.
в журнале
Журнал физической химии
, издательство
Наука
(М.)
, том 94, № 5, с. 719-725
DOI
2019
Effect of solvation water shells on enzyme active sites in zinc-dependent hydrolases
Kapusta Dmitry P.
,
Firsov Denis A.
,
Khrenova Maria G.
,
Grigorenko Bella L.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Structural Chemistry
, издательство
Springer-Verlag
(Heidelberg, Germany)
, том 30, № 2, с. 481-488
DOI
2018
Applications of High Performance Computing: Born–Oppenheimer Molecular Dynamics of Complex Formation in Aqueous Solutions
Kapusta Dmitry P.
,
Meteleshko Yulia I.
,
Babchuk Ilya V.
,
Khrenova Maria G.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 5, № 3, с. 70-73
DOI
2015
Investigation of Kinetics of the Process of Formation of Gold and Silver Nanoparticles and Composites Based on Them
Eremina E.A.
,
Kapusta D.P.
,
Volodina M.O.
,
Sidorov A.V.
,
Grigorieva A.V.
,
Goodilin E.A.
в журнале
Nanotechnologies in Russia
, том 10, № 9-10, с. 713-726
DOI
2015
Исследование кинетики процесса образования наночастиц золота и серебра и композитов на их основе
Еремина Е.А.
,
Капуста Д.П.
,
Володина М.О.
,
Сидоров А.В.
,
Григорьева А.В.
,
Гудилин Е.А.
в журнале
Российские нанотехнологии
, издательство
Парк-медиа
(М.)
, том 10, № 9 - 10, с. 42-49
Доклады на конференциях
2021
РАЗРАБОТКА И ТЕСТИРОВАНИЕ КМ/ММ ИНТЕРФЕЙСА NAMD/TERACHEM ДЛЯ РАСЧЕТОВ ПРОФИЛЕЙ СВОБОДНОЙ ЭНЕРГИИ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ
(Устный)
Авторы:
Поляков Игорь
,
Книга А.
,
Капуста Д.
,
Немухин А.В.
XXVII Симпозиум "Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств"
, Онлайн на базе платформы zoom, Россия, 5-8 апреля 2021
2020
КМ/ММ исследования комплексов каликс-[4]-арена и щелочных металлов
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
XX ЕЖЕГОДНАЯ МОЛОДЕЖНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ C МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ ИБХФ РАН-ВУЗЫ “БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА”
, Москва, Россия, 16-17 ноября 2020
2020
Расчет профилей свободной энергии методом КМ/ММ МД
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
ЛОМОНОСОВ
, МГУ, Россия, 7-27 ноября 2020
2019
Разработка интерфейса для КМ/ММ моделирования
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
XIX Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы “БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА”
, Россия, 28-30 октября 2019
2019
Структурообразующие мотивы катионов магния и цинка в белках: расчёты констант комплексообразования
(Устный)
Авторы:
Капуста Д.П.
,
Метелешко Ю.И.
,
Брехов А.Т.
,
Бабчук И.В.
,
Хренова М.Г.
XXXI Симпозиум Современная химическая физика
, Туапсе, Россия, 16-30 сентября 2019
2019
BORN-OPPENHEIMER AND QM/MM MOLECULAR DYNAMICS OF CATIONS BINDING IN SOLUTIONS
(Стендовый)
Авторы:
Khrenova M.G.
,
Babchuk I.V.
,
Brekhov A.T.
,
Kapusta D.P.
XXI Менделеевский съезд по общей и прикладной химии
, г. Санкт-Петербург, Россия, 8-13 сентября 2019
2019
Разработка и применение методов КМ/ММ
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
IV Международная конференция «Суперкомпьютерные технологии математического моделирования» (СКТеММ’19)
, г. Москва, Россия, 19-21 июня 2019
2019
Молекулярное моделирование фоторецепторных белков на основе флавина и его аналогов для оптогенетических конструкций
(Устный)
Авторы:
Метелешко Ю.И.
,
Московский А.А.
,
Капуста Д.П.
,
Немухин А.В.
,
Хренова М.Г.
«Взаимосвязь ионных и ковалентных взаимодействий в дизайне молекулярных и наноразмерных химических систем» (ChemSci-2019)
, Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского Российской академии наук (ИОХ РАН), Россия, 13-17 мая 2019
2018
Разработка и применение методов КМ/ММ.
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
XVIII Ежегодная молодежная конференция c международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы "Биохимическая физика"
, Москва, Россия, 13-15 ноября 2018
2018
Сольватационные эффекты в реакциях ферментативного катализа.
(Устный)
Автор:
Капуста Д.П.
ЛОМОНОСОВ
, Москва, Россия, 9-13 апреля 2018
2017
Сольватационные эффекты в реакциях ферментативного катализа.
(Устный)
Авторы:
Хренова М.Г.
,
Фирсов Д.А.
,
Капуста Д.П.
XVII ежегод. междун. молод. конф. ИБХФ РАН-ВУЗы "БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА"
, Москва, ул. Косыгина 4, 414, Россия, 13-15 ноября 2017
2016
Моделирование влияния растворителя на каталитические способности матричной металлопротеиназы ММР-2
(Устный)
Авторы:
Капуста Д.П.
,
Хренова М.Г.
,
Фирсов Д.А.
XVI Ежегодная международная молодежная конференция Биохимическая физика ИБХФ РАН-ВУЗы
, г. Москва, ИБХФ им. Н.М. Эмануэля РАН, ул. Косыгина д.4, Россия, 24-26 октября 2016
Тезисы докладов
2019
BORN-OPPENHEIMER AND QM/MM MOLECULAR DYNAMICS OF CATIONS BINDING IN SOLUTIONS
Khrenova M.G.
,
Babchuk I.V.
,
Brekhov A.T.
,
Kapusta D.P.
в сборнике
ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry. Book of abstracts in 6 volumes
, серия
Book 6. Satellite symposia
, место издания
Saint Petersburg
, том 6, тезисы, с. 84-84
2019
Разработка интерфейса для расчетов методом молекулярной динамики с потенциалами КМ/ММ
Капуста Д.П.
,
Брехов А.Т.
,
Метелешко Ю.И.
,
Бабчук И.В.
,
Хренова М.Г.
в сборнике
Книга тезисов "1ая Конференция с международным участием "Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента""
, место издания
ISBN 978-5-4465-2339-9
, тезисы, с. 22-23
2019
Структурообразующие мотивы катионов магния и цинка в белках: расчёты констант комплексообразования
Капуста Д.П.
,
Метелешко Ю.И.
,
Брехов А.Т.
,
Бабчук И.В.
,
Хренова М.Г.
в сборнике
Тезисы докладов XXXI Симпозиума Современная химическая физика
, место издания
Москва
, тезисы, с. 109-109
2018
Born-Oppenheimer molecular dynamics reveals the origin of calixarene selectivity to cesium cations
Khrenova M.G.
,
Kapusta D.P.
, Brekhov A.T.,
Babchuk I.V.
,
Meteleshko Yu I.
в сборнике
Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2018
, тезисы, с. 23-23
2016
Моделирование влияния растворителя на каталитические способности матричной металлопротеиназы ММР-2
Хренова М.Г.
,
Капуста Д.П.
,
Фирсов Д.А.
в сборнике
XVI Ежегодная международная молодежная конференция ИБХФ РАН ВУЗЫ «Биохимическая физика»
, тезисы, с. 1-4
НИРы
1 января 2022 - 31 декабря 2024
Многомасштабное моделирование сложных химических реакций в фотоактивных белках
НИЛ квантовой химии и молекулярного моделирования
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственные исполнители:
Домрачева Т.М.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Блинова А.Р.
,
Захарова Т.М.
,
Капуста Д.П.
,
Кулакова А.М.
,
Одинцов К.В.
1 января 2021 - 31 декабря 2024
Строение и динамика атомно-молекулярных систем
Кафедра физической химии
Руководитель:
Немухин А.В.
Ответственные исполнители:
Безруков Д.С.
,
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Абраменков А.В.
,
Андронова Т.А.
,
Батаев В.А.
,
Бедняков А.С.
,
Белега Е.Д.
,
Белов А.С.
,
Богдашин В.А.
,
Бохан Д.А.
,
Боченкова А.В.
,
Волынкина И.А.
,
Глебов И.О.
,
Годунов И.А.
,
Головкин А.В.
,
Голосная М.Н.
,
Григоренко Б.Л.
,
Давыдова И.Б.
,
Домрачева Т.М.
,
Духовских Е.А.
,
Емельянова М.А.
,
Еремин В.В.
,
Ермилов А.Ю.
,
Занина А.А.
,
Зареченская А.С.
,
Исаева Е.В.
,
Кабылда А.М.
,
Капуста Д.П.
,
Клещина Н.Н.
,
Князева М.А.
,
Козлов М.И.
,
Козлов С.В.
,
Корнейчук А.Я.
,
Королева Л.А.
,
Кочергина И.Ю.
,
Краснощеков С.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Кулакова А.М.
,
Курамшина Г.М.
,
Лазарев А.В.
,
Ларин А.В.
,
Максимов С.В.
,
Марина В.И.
,
Маслов Д.В.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Московский А.А.
,
Мулашкина Т.И.
,
Никитина Н.А.
,
Осин С.Б.
,
Пазюк Е.А.
,
Петров С.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Поддубный В.В.
,
Поляков И.В.
,
Родин В.А.
,
Руденко А.Ю.
,
Рыбаков А.А.
,
Рыжова О.Н.
,
Сенявин В.М.
,
Степанов Н.Ф.
,
Сызганцева О.А.
,
Татаренко К.А.
,
Терашкевич В.А.
,
Трубников Д.Н.
,
Уркунова Т.А.
,
Устынюк Л.Ю.
,
Финенко А.А.
,
Хохлов Д.В.
,
Хрустов В.Ф.
,
Чистиков Д.Н.
,
Шепелев Н.М.
,
Шляпина В.Л.
,
Щербинин А.В.
,
Яковлев Н.Н.
1 января 2020 - 31 декабря 2021
Моделирование строения и свойств биомолекул для многоцветной флуоресцентной визуализации в живых системах
НИЛ квантовой химии и молекулярного моделирования
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственный исполнитель:
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Домрачева Т.М.
,
Захарова Т.М.
,
Капуста Д.П.
,
Кулакова А.М.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Мулашкин Ф.Д.
,
Поляков И.В.
1 января 2019 - 31 декабря 2021
Молекулярное моделирование механизмов ферментативных реакций фосфорилирования-дефосфорилирования
Кафедра физической химии
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственный исполнитель:
Поляков И.В.
Участники НИР:
Капуста Д.П.
,
Книга А.Е.
,
Кулакова А.М.
6 февраля 2018 - 31 декабря 2020
Моделирование комплексообразования катионов металлов с органическими лигандами методом молекулярной динамики с квантовыми потенциалами
Кафедра физической химии
Руководитель:
Хренова М.Г.
Ответственный исполнитель:
Метелешко Ю.И.
Участники НИР:
Бабчук И.В.
,
Брехов А.Т.
,
Захарова Т.М.
,
Капуста Д.П.
,
Фирсов Д.А.
1 января 2017 - 31 декабря 2019
Моделирование строения и свойств биомолекул для многоцветной флуоресцентной визуализации в живых системах
Кафедра физической химии
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственный исполнитель:
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Капуста Д.П.
,
Коц Е.Д.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Строение и динамика атомно-молекулярных систем
Кафедра физической химии
Руководители:
Немухин А.В.
,
Степанов Н.Ф.
Ответственный исполнитель:
Безруков Д.С.
Участники НИР:
Абраменков А.В.
,
Абрамович А.И.
,
Агеев Г.Г.
,
Адамсон С.О.
,
Алексеев Е.С.
,
Альтова Е.П.
,
Банару А.М.
,
Батаев В.А.
,
Баум Е.А.
,
Бедняков А.С.
,
Безруков Д.С.
,
Белега Е.Д.
,
Белов А.С.
,
Белова М.В.
,
Богатова Т.В.
,
Богдан Т.В.
,
Бохан Д.А.
,
Боченкова А.В.
,
Бучаченко А.А.
,
Вилкова А.Л.
,
Глебов И.О.
,
Годунов И.А.
,
Головкин А.В.
,
Григоренко Б.Л.
,
Грикина О.Е.
,
Гринева О.В.
,
Давыдова И.Б.
,
Дмитриенко А.О.
,
Дорофеева О.В.
,
Еремин В.В.
,
Ермилов А.Ю.
,
Засурская Л.А.
,
Захарова Т.М.
,
Иванов А.А.
,
Исаева Е.В.
,
Капуста Д.П.
,
Клещина Н.Н.
,
Князева М.А.
,
Ковтун Д.М.
,
Колесникова И.Н.
,
Королева Л.А.
,
Коц Е.Д.
,
Крамаренко С.С.
,
Краснощеков С.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Кулакова А.М.
,
Курамшина Г.М.
,
Лазарев А.В.
,
Ланшина Л.В.
,
Ларин А.В.
,
Лысенко К.А.
,
Львова Е.Ю.
,
Майорова А.Ф.
,
Макухин Н.Н.
,
Марочкин И.И.
,
Миронов В.А.
,
Митин А.В.
,
Моисеева Н.Ф.
,
Московский А.А.
,
Немухин А.В.
,
Новаковская Ю.В.
,
Осин С.Б.
,
Пазюк Е.А.
,
Панченко Ю.Н.
,
Петров С.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Поддубный В.В.
,
Поляков И.В.
,
Прибытков А.В.
,
Пупышев В.И.
,
Рыбаков А.А.
,
Рыжова О.Н.
,
Рыков А.Н.
,
Сенявин В.М.
,
Словохотов Ю.Л.
,
Степанов Н.Ф.
,
Степанова А.В.
,
Татаренко К.А.
,
Терентьев Р.В.
,
Тихонов Д.С.
,
Трубников Д.Н.
,
Тукачев Н.В.
,
Устынюк Л.Ю.
,
Филимонова М.А.
,
Хайкин Л.С.
,
Хренова М.Г.
,
Христенко Л.В.
,
Хрустов В.Ф.
,
Чемлева Т.А.
,
Шергольд И.А.
,
Шишков И.Ф.
,
Щербинин А.В.
,
Яковлев Н.Н.
1 января 2016 - 31 декабря 2018
Молекулярное моделирование механизмов химических реакций в цинк-зависимых ферментах
Кафедра физической химии
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Участники НИР:
Капуста Д.П.
,
Князева М.А.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Хренова М.Г.
Диссертация
2022
Молекулярно-динамическое моделирование реакций в гидратированных системах
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.04 - Физическая химия (физ.-мат. науки)
Автор:
Капуста Дмитрий Павлович
Научный руководитель:
Хренова Мария Григорьевна
, д.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
МГУ.014.3(02.04)
МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
Оппоненты:
Полынская Ю.Г.
,
Крупянский Ю.Ф.
,
Шайтан А.К.
Объявление о защите
Руководство курсовыми работами
2022
Расчёт профиля энергии Гиббса таутомеризации 2-(2'-гидроксифенил)бензимидазола методами молекулярного моделирования
Научный руководитель:
Капуста Д.П.
Автор: Усанова Екатерина Дмитриевна (Специалист)
2022
Расчет профиля энергии Гиббса таутомерного перехода в 4,5-диметил-2-(2'-метоксифенил)имидазоле методом молекулярной динамики с комбинированными квантово-механическими / молекулярно-механическими потенциалами
Научный руководитель:
Капуста Д.П.
Автор: Панченко Ольга Антоновна (Специалист)
2022
Расчет профиля энергии Гиббса таутомеризации 2-(2'-гидроксифенил)бензимидазола методом молекулярной динамики с КМ/ММ потенциалами
Научный руководитель:
Капуста Д.П.
Автор: Рыбкин Михаил Сергеевич (Специалист)
2021
Расчет энергии связывания ГТФ с ферментом p21RAS методами молекулярного моделирования
Научный руководитель:
Капуста Д.П.
Автор: Барай Дарья Николаевна (Специалист)