Первушин Дмитрий Давидович
пользователь
кандидат физико-математических наук с 2002 года
Прежние места работы (Нажмите для отображения)
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 2375,
Scopus: 2523
IstinaResearcherID (IRID): 4473614
Деятельность
-
Статьи в журналах
-
-
-
-
-
-
2019
Re-annotation of 191 developmental andepileptic encephalopathy-associated genes unmasks de novo variants in SCN1A
-
Steward CA,
Roovers J.,
Suner MM,
Gonzalez JM,
Uszczynska-Ratajczak B.,
Pervouchine D.,
Fitzgerald S.,
Viola M.,
Stamberger H.,
Hamdan FF,
Ceulemans B.,
LeroyP,
Nava C.,
Lepine A.,
Tapanari E.,
Keiller D.,
Abbs S.,
Sanchis-Juan A.,
Grozeva D.,
Rogers AS,
Diekhans M.,
Guigó R.,
Petryszak R.,
Minassian BA,
Cavalleri G.,
VitsiosD,
Petrovski S.,
Harrow J.,
Flicek P.,
Lucy Raymond F.,
Lench NJ,
Jonghe P.,
Mudge JM,
Weckhuysen S.,
Sisodiya SM,
Frankish A.
-
в журнале Genome Medicine, издательство BioMed Central (London), том 4, № 31
DOI
-
-
2019
Urinary biomarkers of latent inflammation and fibrosis in children with vesicoureteral reflux
-
Morozova O.,
Morozov D.,
Pervouchine D.,
Einav Y.,
Lakomova D.,
Zakharova N.,
Severgina L.,
Maltseva L.,
Budnik I.
-
в журнале International Urology and Nephrology, издательство Springer Nature (Switzerland), том 52, с. 603-610
DOI
-
-
-
2018
Hypoxic renal injury in newborns withabdominal compartment syndrome (clinical and experimental study)
-
Morozov D.,
Morozova O.,
Pervouchine D.,
Severgina L.,
Tsyplakov A.,
Zakharova N.,
Sushentsev N.,
Maltseva L.,
Budnik I.
-
в журнале Pediatric Research, издательство Lippincott Williams & Wilkins Ltd. (United States), том 83, № 2, с. 520-526
DOI
-
-
2018
The effects of death and post-mortem cold ischemia on human tissue transcriptomes
-
Ferreira PG,
Muñoz-Aguirre M.,
Reverter F.,
Sá Godinho CP,
Sousa A.,
Amadoz A.,
Sodaei R.,
Hidalgo MR,
Pervouchine D.,
Carbonell-Caballero J.,
Nurtdinov R.,
Breschi A.,
Amador R.,
Oliveira P.,
Çubuk C.,
Curado J.,
Aguet F.,
Oliveira C.,
Dopazo J.,
Sammeth M.,
Ardlie KG,
Guigó R.
-
в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 13, № 9, с. 490
-
-
-
2016
A benchmark for RNA-seq quantification pipelines
-
Teng M.,
Love MI,
Davis CA,
Djebali S.,
Dobin A.,
Graveley BR,
Li S.,
Mason CE,
Olson S.,
Pervouchine D.,
Sloan CA,
Wei X.,
Zhan L.,
Irizarry RA
-
в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 17, № 1, с. 74
DOI
-
-
2016
Gene-specific patterns of expression variation across organs and species
-
Breschi A.,
Djebali S.,
Gillis J.,
Pervouchine DD,
Dobin A.,
Davis CA,
Gingeras TR,
Guigo R.
-
в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 17, № 1, с. 151
DOI
-
-
-
2015
Comparison of GENCODE and RefSeq gene annotation and the impact of reference geneset on variant effect prediction
-
Frankish A.,
Uszczynska B.,
Ritchie GR,
Gonzalez JM,
Pervouchine D.,
Petryszak R.,
Mudge JM,
Fonseca N.,
Brazma A.,
Guigo R.,
Harrow J.
-
в журнале BMC Genomics, издательство BioMed Central (London), том 16, № Suppl 8, с. S2
DOI
-
-
2015
Enhanced transcriptome maps from multiple mouse tissues reveal evolutionary constraint in gene expression
-
Pervouchine Dmitri D.,
Sarah Djebali,
Alessandra Breschi,
Davis Carrie A.,
Pablo Prieto Barja,
Alex Dobin,
Andrea Tanzer,
Julien Lagarde,
Chris Zaleski,
Lei-Hoon See,
Meagan Fastuca,
Jorg Drenkow,
Huaien Wang,
Giovanni Bussotti,
Baikang Pei,
Suganthi Balasubramanian,
Jean Monlong,
Arif Harmanci,
Mark Gerstein,
Beer Michael A.,
Cedric Notredame,
Roderic Guigo,
Gingeras Thomas R.
-
в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 6, № 5903, с. 1-11
DOI
-
-
2015
Human genomics. The human transcriptome across tissues and individuals
-
Melé M.,
Ferreira PG,
Reverter F.,
DeLuca DS,
Monlong J.,
Sammeth M.,
Young TR,
Goldmann JM,
Pervouchine DD,
Sullivan TJ,
Johnson R.,
Segrè AV,
Djebali S.,
Niarchou A.,
GTEx Consortium,
Wright FA,
Lappalainen T.,
Calvo M.,
Getz G.,
Dermitzakis ET,
Ardlie KG,
Guigó R.
-
в журнале Science, издательство American Association for the Advancement of Science (United States), том 348, № 6235, с. 660-5
DOI
-
-
2014
A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome" Nature
-
Yue F.,
Cheng Y.,
Breschi A.,
Vierstra J.,
Wu W.,
Ryba T.,
Sandstrom R.,
Ma Z.,
Davis C.,
Pope BD,
Shen Y.,
Pervouchine DD,
Djebali S.,
Thurman RE,
Kaul R.,
Rynes E.,
Kirilusha A.,
Marinov GK,
Williams BA,
Trout D.,
Amrhein H.,
Fisher-Aylor K.,
Antoshechkin I.,
DeSalvo G.,
See LH,
Fastuca M.,
Drenkow J.,
Zaleski C.,
Dobin A.,
Prieto P.,
Lagarde J.,
Bussotti G.,
Tanzer A.,
Denas O.,
Li K.,
Bender MA,
Zhang M.,
Byron R.,
Groudine MT,
McCleary D.,
Pham L.,
Ye Z.,
Kuan S.,
Edsall L.,
Wu YC,
Rasmussen MD,
Bansal MS,
Kellis M.,
Keller CA,
Morrissey CS,
Mishra T.,
Jain D.,
Dogan N.,
Harris RS,
Cayting P.,
Kawli T.,
Boyle AP,
Euskirchen G.,
Kundaje A.,
Lin S.,
Lin Y.,
Jansen C.,
Malladi VS,
Cline MS,
Erickson DT,
Kirkup VM,
Learned K.,
Sloan CA,
Rosenbloom KR,
Lacerda de_Sousa B.,
Beal K.,
Pignatelli M.,
Flicek P.,
Lian J.,
Kahveci T.,
Lee D.,
Kent WJ,
Ramalho Santos M.,
Herrero J.,
Notredame C.,
Johnson A.,
Vong S.,
Lee K.,
Bates D.,
Neri F.,
Diegel M.,
Canfield T.,
Sabo PJ,
Wilken MS,
Reh TA,
Giste E.,
Shafer A.,
Kutyavin T.,
Haugen E.,
Dunn D.Reynolds AP,
Neph S.,
Humbert R.,
Hansen RS,
De Bruijn M.,
Selleri L.,
Rudensky A.,
Josefowicz S.,
Samstein R.,
Eichler EE,
Orkin SH,
Levasseur D.,
Papayannopoulou T.,
Chang KH,
Skoultchi A.,
Gosh S.,
Disteche C.,
Treuting P.,
Wang Y.,
Weiss MJ,
Blobel GA,
Cao X.,
Zhong S.,
Wang T.,
Good PJ,
Lowdon RF,
Adams LB,
Zhou XQ,
Pazin MJ,
Feingold EA,
Wold B.,
Taylor J.,
Mortazavi A.,
Weissman SM,
Stamatoyannopoulos JA,
Snyder MP,
Guigo R.,
Gingeras TR,
Gilbert DM,
Hardison RC,
Beer MA,
Ren B.
-
в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 515, № 7527, с. 355-64
DOI
-
-
2014
Comparative analysis of the transcriptome across distant species" Nature
-
Gerstein MB,
Rozowsky J.,
Yan KK,
Wang D.,
Cheng C.,
Brown JB,
Davis CA,
Hillier L.,
Sisu C.,
Li JJ,
Pei B.,
Harmanci AO,
Duff MO,
Djebali S.,
Alexander RP,
Alver BH,
Auerbach R.,
Bell K.,
Bickel PJ,
Boeck ME,
Boley NP,
Booth BW,
Cherbas L.,
Cherbas P.,
Di_C Dobin A.,
Drenkow J.,
Ewing B.,
Fang G.,
Fastuca M.,
Feingold EA,
Frankish A.,
Gao G.,
Good PJ,
Guigó R.,
Hammonds A.,
Harrow J.,
Hoskins RA,
Howald C.,
Hu L.,
Huang H.,
Hubbard TJ,
Huynh C.,
Jha S.,
Kasper D.,
Kato M.,
Kaufman TC,
Kitchen RR,
Ladewig E.,
Lagarde J.,
Lai E.,
Leng J.,
Lu Z.,
MacCoss M.,
May G.,
McWhirter R.,
Merrihew G.,
Miller DM,
Mortazavi A.,
Murad R.,
Oliver B.,
Olson S.,
Park PJ,
Pazin MJ,
Perrimon N.,
Pervouchine D.,
Reinke V.,
Reymond A.,
Robinson G.,
Samsonova A.,
Saunders GI,
Schlesinger F.,
Sethi A.,
Slack FJ,
Spencer WC,
Stoiber MH,
Strasbourger P.,
Tanzer A.,
Thompson OA,
Wan KH,
Wang G.,
Wang H.,
Watkins KL,
Wen J.,
Wen K.,
Xue C.,
Yang L.,
Yip K.,
Zaleski C.,
Zhang Y.,
Zheng H.,
Brenner SE,
Graveley BR,
Celniker SE,
Gingeras TR,
Waterston R.
-
в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 512, № 7515, с. 445-8
DOI
-
-
-
-
-
-
2006
Low-dimensional maps encoding dynamics in entorhinal cortex and hippocampus
-
Pervouchine D.D.,
Netoff T.I.,
Rotstein H.G.,
White J.A.,
Cunningham M.O.,
Whittington M.A.,
Kopell N.J.
-
в журнале Neural Computation, издательство MIT Press (United States), том 18, № 11, с. 2617-2650
-
-
2006
Neuronal metabolism governs cortical network response state
-
Cunningham M.O.,
Pervouchine D.D.,
Racca C.,
Kopell N.J.,
Davies C.H.,
Jones R.S.,
Traub R.D.,
Whittington M.A.
-
в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 103, № 14, с. 5597-5601
-
-
-
2005
Slow and fast inhibition and an H-current interact to create a theta rhythm in a model of CA1 interneuron network
-
Rotstein H.G.,
Pervouchine D.D.,
Acker C.D.,
Gillies M.J.,
White J.A.,
Buhl E.H.,
Whittington M.A.,
Kopell N.
-
в журнале Journal of Clinical Neurophysiology, издательство Lippincott Williams & Wilkins Ltd. (United States), том 94, № 2, с. 1509-1518
-
-
-
-
-
-
-
-
Статьи в сборниках
-
-
2010
Gamma and Theta Rhythms in Biophysical Models of Hippocampal Circuits
-
Kopell N.,
Börgers C.,
Pervouchine D.,
Malerba P.,
Tort A.
-
в сборнике Hippocampal Microcircuits: A Computational Modeller's Resource Book, серия Eds. V. Cutsuridis, B.P. Graham, S. Cobb, I. Vida, место издания Springer, с. 15
-
-
Доклады на конференциях
-
-
2019
КОРОТКИЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК – ПРОДУКТЫ ТРАНСКРИПЦИИ 6S РНК В БАКТЕРИИ RHODOBACTER SPHAEROIDES
(Стендовый)
-
Авторы:
Елкина Д.А.,
Буренина О.Ю.,
Банникова В.А.,
Транкова Н.А.,
Лисицкая Л.А.,
Кульбачинский А.В.,
Первушин Д.Д.,
Кубарева Е.А.
-
II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Россия, 1-6 октября 2019
-
-
-
2015
Reconstructing the transcriptional profile of a tissue from the transcriptional profiles of primary cells
(Стендовый)
-
Авторы:
Pervouchine DD,
Breschi A.,
Djebali S.,
Gingeras TR,
Dobin A.,
Lagarde J.,
Guigó R.,
Davis CA
-
Cold Spring Harbor annual ENCODE meeting, Cold Spring HArbor, США, 7-11 марта 2015
-
-
2014
Common organizational and regulatory features of the human and mouse transcriptomes
-
Авторы:
Gingeras Thomas R.,
Roderic Guigo,
Julien Lagarde,
Alex Dobin,
Pablo Prieto Barja,
Davis Carrie A.,
Alessandra Breschi,
Sarah Djebali,
Pervouchine Dmitri D.
-
Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Boston, USA, 2014
-
-
-
-
Тезисы докладов
-
-
2019
КОРОТКИЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК – ПРОДУКТЫ ТРАНСКРИПЦИИ 6S РНК В БАКТЕРИИ RHODOBACTER SPHAEROIDES
-
Елкина Д.А.,
Буренина О.Ю.,
Банникова В.А.,
Транкова Н.А.,
Лисицкая Л.А.,
Кульбачинский А.В.,
Первушин Д.Д.,
Кубарева Е.А.
-
в сборнике Acta Naturae (русскоязычная версия), место издания Перо М М, том 1, тезисы, с. 22-22
-
-
2019
Короткие некодирующие РНК - продукты транскрипции 6S РНК в бактерии Rhodobacter sphaeroides
-
Елкина Д.А.,
Буренина О.Ю.,
Банникова В.А.,
Транкова Н.А.,
Лисицкая Л.А.,
Кульбачинский А.В.,
Первушин Д.Д.,
Кубарева Е.А.
-
в сборнике Acta Naturae спецвыпуск, том 2, тезисы, с. 22-22
-
НИРы
-
Участие в программных комитетах конференций
-
Руководство дипломными работами
-
Авторство учебных курсов
-
Преподавание учебных курсов