ИСТИНА

Сулимов Алексей Владимирович пользователь ответственный

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования, ведущий специалист (инженер, геолог, геофизик, программист, технолог и т.п.), с 1 августа 2011

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования, ответственный по системе

Соавторы: Сулимов В.Б., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Офёркин И.В., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Романов А.Н., Тыртышников Е.Е., Ильин И.С., Желтков Д.А., Савкин И.А., Тихонравов А.В., Кочиков И.В. показать полностью..., Shikhaliev K.S., Жабин С.Н., Садовничий В.А., Ткачук В.А., Генс Г.П., Соболев С.И., Тащилова А.С., Атауллаханов Ф.И., Белоглазова И.Б., Головачева А.Ю., Горох А.А., Масленников Е.Д., Оселедец И.В., Шарапова С.А., Krysin M.Y., Nosikov V.V., Podoplelova N.A., Zateyshchikov D.A., Бочаров Г.А., Брызгалов П.А., Вельшер Л.З., Гребенников Д.С., Желткова В.В., Зубков Ф.И., Кислицын А.А., Козьмин М.Ю., Курочкин И.Н., Лукьяненко Д.В., Лущекина С.В., Михалев А.Ю., Моисеева Н.И., Мухин Н.А., Розина Т.П., Самоходская Л.М., Стамбольский Д.В., Старостина Е.Е., Топтыгина А.П., Упоров И.В., Шаров А.Н., Alioshkin V., Bogolyubov A.A., Gribkova I.V., Hasanova Z.B., KRYSIN M., Kochugaeva M.P., Kukharchuk, Lipets E.N., Medvedeva S.M., Meshkov A.N., Potapov A.Y., Smolov M., Vtyurina D.N., Авдеев В.Г., Алешкин А.В., Алфимов М.В., Багатурьянц А.А., Базилевский М.В., Бутылин А.А., Варфоломеев С.Д., Воеводин В.В., Ганцева А.Р., Готтих М.Б., Грибкова А.К., Дутов М.Д., Евдокимова М.А., Затейщиков Д.А., Коновалова В.В., Коробкова Л.И., Краснова Т.Н., Кузнецов Ю.В., Лайков Д.Н., Леденева Е.В., Липец Е.Н., Мартынов Я.Б., Мохнюк К.С., Носиков В.В., Овсий О.Г., Пантелеев М.А., Плеханова О.С., Потапов А.А., Рощин Б.С., Рыбалкина Е.Ю., Савкин А.Г., Сафронова Л.В., Сафронова Л.М., Селезнева И.И., Семикина Е.Л., Синауридзе Е.И., Федулов К.М., Чернобровкин А.Л., Шиндяпин В.В.

68 статей, 1 книга, 44 доклада на конференциях, 20 тезисов докладов, 8 НИР, 1 патент, 2 свидетельства о регистрации прав на ПО, 1 курсовая работа, 1 учебный курс

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 179, Scopus: 316
РИНЦ:

IstinaResearcherID (IRID): 530453

Scopus Author ID: 23482977800

ORCID: 0000-0002-8767-642X

Деятельность стиль:  обычный | ГОСТ | plain | abbrv | acm | alpha | amsalpha | amsplain | apalike | ieeetr | siam

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2020 Development of docking programs for Lomonosov supercomputer
    • Sulimov V.B., Ilin I.S., Kutov D.C., Sulimov A.V.
    • в журнале Journal of the Turkish Chemical Society Section A: Chemistry, том 7, № 1, с. 259-276 DOI
  • • 2020 Generation of Amorphous Silicon Dioxide Structures via Melting-quenching Density Functional Modeling
    • Sulimov A.V., Kutov D.C., Grigoriev F.V., Tikhonravov A.V., Sulimov V.B.
    • в журнале Lobachevskii Journal of Mathematics, издательство Kazanskii Gosudarstvennyi Universitet/Kazan State University (Russian Federation), том 4, № 8
  • 
    • 2020 Synthesis, Docking, and In Vitro Anticoagulant Activity Assay of Hybrid Derivatives of Pyrrolo[3,2,1-ij]Quinolin-2(1H)-one as New Inhibitors of Factor Xa and Factor XIa
    • Novichikhina N., Ilin I., Tashchilova A., Sulimov A., Kutov D., Ledenyova I., Krysin M., Shikhaliev K., Gantseva A., Gantseva E., Podoplelova N., Sulimov V.
    • в журнале Molecules, издательство Molecular Diversity Preservation International (Switzerland), том 25, № 8, с. 1889-1889 DOI
  • • 2019 Advances in Docking
    • Sulimov V.B., Kutov D.C., Sulimov A.V.
    • в журнале Current Medicinal Chemistry, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 26, № 42, с. 7555-7580 DOI
  • 
    • 2019 Docking with combined use of a force field and a quantum-chemical method
    • Sulimov A.V., Kutov D.K., Ilin I.S., Sulimov V.B.
    • в журнале Biomeditsinskaya Khimiya, том 65, № 2, с. 80-85
  • 
    • 2019 New factor Xa inhibitors based on 1,2,3,4-tetrahydroquinoline developed by molecular modelling
    • Ivan Ilin, Elena Lipets, Alexey Sulimov, Danil Kutov, Khidmet Shikhaliev, Andrey Potapov, Michael Krysin, Fedor Zubkov, Lyudmila Sapronova, Fazoyl Ataullakhanov, Vladimir Sulimov
    • в журнале Journal of Molecular Graphics and Modelling, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 89, № June 2019, с. 215-224 DOI
  • 
    • 2019 Prediction of features of the course of chronic hepatitis C using Bayesian networks
    • Самоходская Л.М., Старостина Е.Е., Сулимов А.В., Краснова Т.Н., Розина Т.П., Авдеев В.Г., Савкин И.А., Сулимов В.Б., Мухин Н.А., Ткачук В.А., Садовничий В.А.
    • в журнале Terapevticheskii Arkhiv, издательство Izdatel'stvo Meditsina Publishers (Russian Federation), том 91, № 2, с. 8-39 DOI
  • • 2019 Supercomputer Docking
    • Sulimov Alexey V., Kutov Danil C., Sulimov Vladimir B.
    • в журнале Supercomputing Frontiers and Innovations, том 6, № 3, с. 27-51 DOI
  • 
    • 2019 Supercomputer docking with a large number of degrees of freedom
    • Sulimov A.V., Kutov D., Ilin I., Zheltkov D., Tyrtyshnikov E., Sulimov V.B.
    • в журнале SAR and QSAR in Environmental Research, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 30, № 10, с. 733-749 DOI
  • 
    • 2019 Докинг олигопептидов
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Ильин И.С., Шихалиев Х.С., Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в журнале Известия Академии наук. Серия химическая, издательство Наука (М.), том 68, № 9, с. 1780-1786 DOI
  • 
    • 2019 Прогнозирование особенностей течения хронического гепатита С с использованием байесовских сетей
    • Самоходская Л.М., Старостина Е.Е., Сулимов А.В., Краснова Т.Н., Розина Т.П., Авдеев В.Г., Савкина И.А., Сулимов В.Б., Мухин Н.А., Ткачук В.А., Садовничий В.А.
    • в журнале Терапевтический архив, издательство Медиа Сфера (М.), том 91, № 2, с. 32-40
  • 
    • 2019 Современные методы разработки новых лекарственных средств, влияющих на систему гемостаза
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Тащилова А.С., Ильин И.С., Подоплелова Н.А., Пантелеев М.А., Леденева И.В., Шихалиев Х.С., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии, издательство Фонд поддержки и развития в области детской гематологии, онкологии и иммунологии Врачи, инновации, наука - детям (Москва), том 18, № 4, с. 136-152 DOI
  • • 2018 Application of Bayesian networks for prognosis of breast cancer patient’s outcomes
    • Gelena Guens, Alexey Sulimov, Igor Savkin, Natalya Moiseeva, Vladimir Sulimov
    • в журнале Journal of Cancer Science and Therapy, издательство OMICS Publishing Group (United States), том 10, с. 50-50 DOI
  • 
    • 2018 Supercomputer Docking: Investigation of Low Energy Minima of Protein-Ligand Complexes
    • Kutov D.C., Sulimov A.V., Sulimov V.B.
    • в журнале Supercomputing Frontiers and Innovations, том 5, № 3, с. 134-137 DOI
  • • 2018 Прогнозирование исходов рака толстой кишки с помощью Байесовских сетей
    • Генс Г.П., Мохнюк К.С., Шиндяпин В.В., Савкин И.А., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Исследования и практика в медицине, том 5, № 2S, с. 60-60 DOI
  • 
    • 2017 Combined Docking with Classical Force Field and Quantum Chemical Semiempirical Method PM7
    • Sulimov A.V., Kutov D.C., Katkova E.V., Sulimov V.B.
    • в журнале Advances in bioinformatics, издательство Hindawi Pub. Corp. (New York, United States), том 2017, с. 1-6 DOI
  • 
    • 2017 Computational experiments on atomistic modeling of thin-film deposition
    • Grigoriev F., Sulimov A., Kochikov I., Kondakova O., Sulimov V., Tikhonravov A.
    • в журнале Applied optics, издательство Optical Society of America (United States), том 56, № 4, с. c87-c90 DOI
  • 
    • 2017 Evaluation of the novel algorithm of flexible ligand docking with moveable target protein atoms
    • Sulimov A.V., Zheltkov D.A., Oferkina I.V., Kutov D.C., Katkova E.V., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov V.B.
    • в журнале Computational and Structural Biotechnology Journal, том 15, с. 275-285 DOI
  • 
    • 2017 Influence of the Method of Hydrogen Atoms Incorporation into the Target Protein on the Protein-Ligand Binding Energy
    • Kutov D.C., Katkova E.V., Sulimov A.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в журнале Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия Математическое моделирование и программирование, том 10, № 3, с. 94-107 DOI
  • 
    • 2017 New generation of docking programs: Supercomputer validation offorce fields and quantum-chemical methods for docking
    • Sulimov Alexey V., Kutov Danil C., Katkova Ekaterina V., Ilin Ivan S., Sulimov Vladimir B.
    • в журнале Journal of Molecular Graphics and Modelling, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 78, № November 2017, с. 139-147 DOI
  • 
    • 2017 ПОИСК ПОДХОДОВ К УЛУЧШЕНИЮ ТОЧНОСТИ РАСЧЕТОВ ЭНЕРГИИ СВЯЗЫВАНИЯ БЕЛОК-ЛИГАНД С ПОМОЩЬЮ ДОКИНГА
    • СУЛИМОВ А.В., КУТОВ Д.К., КАТКОВА Е.В., КОНДАКОВА О.А., СУЛИМОВ В.Б.
    • в журнале Известия Академии наук. Серия химическая, издательство Наука (М.), № 10, с. 1913-1924 DOI
  • 
    • 2016 Annealing of deposited SiO2 thin films: full-atomistic simulation results
    • Grigoriev F.V., Katkova E.V., Sulimov A.V., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в журнале Optical Materials Express, том 6, № 12, с. 3960-3966 DOI
  • 
    • 2016 Full-atomistic nanoscale modeling of the ion beam sputtering deposition of SiO2 thin films
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Katkova E.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в журнале Journal of Non-Crystalline Solids, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 448, с. 1-5 DOI
  • 
    • 2016 Суперкомпьютерное моделирование процесса напыления тонких пленок диоксида кремния с использованием программы LAMMPS
    • Горох А.А., Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Сулимов А.В., Шарапова С.А.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 3: Физика, астрономия, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), № 1, с. 91-95 DOI
  • 
    • 2015 Application of Molecular Modeling to Development of New Factor Xa Inhibitors
    • Sulimov Vladimir B., Gribkova Irina V., Kochugaeva Maria P., Katkova Ekaterina V., Sulimov Alexey V., Kutov Danil C., Shikhaliev Khidmet S., Medvedeva Svetlana M., Krysin Michael Yu, Sinauridze Elena I., Ataullakhanov Fazoil I.
    • в журнале BioMed Research International, том 2015, с. 1-15 DOI
  • 
    • 2015 Evaluation of docking target functions by the comprehensive investigation of protein-ligand energy minima
    • Oferkin Igor V., Katkova Ekaterina V., Sulimov Alexey V., Kutov Danil C., Sobolev Sergey I., Voevodin Vladimir V., Sulimov Vladimir B.
    • в журнале Advances in bioinformatics, издательство Hindawi Pub. Corp. (New York, United States), том 2015, № 126858, с. 1-32 DOI
  • 
    • 2015 Evaluation of the docking algorithm based on Tensor Train global optimization
    • Oferkin I.V., Zheltkov D.A., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov A.V., Kutov D.C., Sulimov V.B.
    • в журнале Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия Математическое моделирование и программирование, том 8, № 4, с. 83-99 DOI
  • 
    • 2015 Genome-wide analysis of genetic associations for prediction of polygenic hypercholesterolemia with bayesian networks
    • Sulimov A.V., Meshkov A.N., Savkin I.A., Katkova E.V., Kutov D.C., Hasanova Z.B., Konovalova N.V., Kukharchuk V.V., Sulimov V.B.
    • в журнале Journal of Computational and Engineering Mathematics, том 2, № 4, с. 11-26 DOI
  • 
    • 2015 High-performance atomistic modeling of optical thin films deposited by energetic processes
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в журнале International Journal of High Performance Computing Applications, издательство SAGE Publications (United States), том 29, № 2, с. 184-192 DOI
  • • 2015 Polarized continuum solvent model: considerable acceleration with the multicharge matrix approximation
    • Sulimov V.B., Mikhalev A.Yu, Oferkin I.V., Oseledets I.V., Sulimov A.V., Kutov D.C., Katkova E.V., Tyrtyshnikov E.E.
    • в журнале International Journal of Applied Engineering Research, том 10, № 24, с. 44815-44830
  • 
    • 2015 The prediction of specific humoral immune responses using the baseline immune status parametres in children, vaccinated with measles-mumps-rubella vaccine
    • Toptygina A.P., Aziattceva V.V., Savkin I.A., Kislitsyn A.A., Semikina E.L., Grebennikov D.S., Alioshkin V.A., Sulimov A.V., Sulimov V.B., Bocharov G.A.
    • в журнале Immunologiya, том 36, № 1, с. 22-30
  • 
    • 2015 Применение генных сигнатур и медицинских экспертных систем для прогнозирования клинических исходов рака молочной железы
    • Генс Г.П., Сулимов А.В., Моисеева Н.И., Каткова Е.В., Вельшер Л.З., Коробкова Л.И., Савкин И.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вестник РОНЦ им. Н. Н. Блохина РАМН, том 26, № 4, с. 16-33
  • 
    • 2015 Прогнозирование специфического гуморального иммунного ответа на основании исходных параметров иммунного статуса детей, привитых против кори, краснухи и эпидемического паротита
    • Топтыгина А.П., Азиатцева В.В., Савкин И.А., Кислицин А.А., Семикина Е.Л., Гребенников Д.С., Алешкин А.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Бочаров Г.А.
    • в журнале Иммунология, том 36, № 1, с. 22-30
  • 
    • 2015 Суперкомпьютерное исследование низкоэнергетических минимумов энергии системы белок-лиганд
    • Оферкин И.В., Сулимов А.В., Каткова Е.В., Кутов Д.К., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Биомедицинская химия, том 61, № 6, с. 712-716 DOI
  • 
    • 2014 An intuitive risk factors search algorithm: usage of the Bayesian network technique in personalized medicine
    • Maslennikov Evgeny D., Sulimov Alexey V., Savkin Igor A., Evdokimova Marina A., Zateyshchikov Dmitry A., Nosikov Valery V., Sulimov Vladimir B.
    • в журнале Journal of Applied Statistics, издательство Routledge (United States), том 42, № 1, с. 71-87 DOI
  • 
    • 2014 Application of molecular modeling to urokinase inhibitors development
    • Sulimov V.B., Katkova E.V., Oferkin I.V., Sulimov A.V., Romanov A.N., Roschin A.I., Beloglazova I.B., Plekhanova O.S., Tkachuk V.A., Sadovnichiy V.A.
    • в журнале BioMed Research International, том 2014, с. 625176 DOI
  • • 2014 Поиск подходов к прогнозированию исходов рака молочной железы с помощью байесовских сетей
    • Генс Г.П., Сулимов А.В., Моисеева Н.И., Овсий О.Г., Вельшер Л.З., Рыбалкина Е.Ю., Селезнева И.И., Савкин И.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Онкология. Журнал им. П.А. Герцена, издательство Медиа Сфера (М.), № 5, с. 37-46
  • • 2014 Применение мультизарядового приближения больших плотных матриц в рамках модели поляризуемого континуума для растворителя
    • Михалев А.Ю., Офёркин И.В., Оселедец И.В., Сулимов А.В., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 15, с. 9-21
  • 
    • 2013 Application of the Docking Program SOL for CSAR Benchmark
    • Sulimov Alexey V., Kutov Danil C., Oferkin Igor V., Katkova Ekaterina V., Sulimov Vladimir B.
    • в журнале Journal of Chemical Information and Modeling, издательство American Chemical Society (United States), том 53, с. 1946-1956 DOI
  • • 2013 TTDock: метод докинга на основе тензорных поездов
    • Желтков Д.А., Офёркин И.В., Каткова Е.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Тыртышников Е.Е.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 14, с. 279-291
  • 
    • 2012 Stability of HIV-1 integrase–ligand complexes: the role of coordinating bonds
    • Grigoriev F.V., Golovacheva A.Yu, Romanov A.N., Kondakova O.A., Sulimov A.V., Smolov M.A., Gottikh M.B., Sulimov V.B., Bogolyubov A.A., Kuznetsov Yu V., Dutov M.D.
    • в журнале Structural Chemistry, издательство Springer-Verlag (Heidelberg, Germany), том 23, № 1, с. 185-195 DOI
  • • 2012 Безградиентная параллельная оптимизация геометрии кластера Bi5(3+) и его люминесцентные свойства
    • Масленников Е.Д., Романов А.Н., Офёркин И.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 13, с. 341-346
  • • 2012 ПРОГРАММА MEL АТОМИСТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ СЛОЕВ СОЛНЕЧНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ
    • Григорьев Ф.В., Романов А.Н., Офёркин И.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 13, с. 413-423
  • 
    • 2011 DEVELOPMENT OF GENDER PRESPECIFIED PREDICTION MODEL BASED ON BAYESIAN BELIEVE NETWORKS METHOD FOR RISK ESTIMATION AFTER ACUTE CORONARY SYNDROME
    • Evdokimova M.A., Uporov I.V., Kurochkin I.N., Sulimov A.V., Vtyurina D.N., Nosikov V.V., Zateyshchikov D.A.
    • в журнале Atherosclerosis Supplements, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 12, № 1, с. 129-129
  • • 2011 Квантово-химическое моделирование возбужденных состояний монокатиона висмута
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Головачева А.Ю., Сулимов А.В., Оферкин И.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 417-422
  • • 2011 Континуальная модель растворителя: программа DISOLV – алгоритмы, реализация и валидация
    • Купервассер О.Ю., Жабин С.Н., Мартынов Я.Б., Федулов К.М., Офёркин И.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 246-261
  • • 2011 Расчет параметров возбужденных состояний поликатиона Bi53+ методом спин-орбитального конфигурационного взаимодействия
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Втюрина Д.Н., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 443-449
  • • 2011 Реализация поддержки параллельных вычислений в программах докинга SOLGRID и SOL
    • Оферкин И.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 9-23
  • • 2010 Методы молекулярного моделирования супрамолекулярных комплексов: иерархический подход
    • Григорьев Ф.В., Романов А.Н., Лайков Д.Н., Жабин С.Н., Головачева А.Ю., Оферкин И.В., Сулимов А.В., Базилевский М.В., Багатурьянц А.А., Сулимов В.Б., Алфимов М.В.
    • в журнале Российские нанотехнологии, издательство Парк-медиа (М.), № 5-6, с. 11-17
  • 
    • 2009 On hypervelocity penetration of the mesh-bumper strings into a projectile
    • Myagkov N.N., Shumikhin T.A., Sulimov A.V., Goloveshkin V.A.
    • в журнале International Journal of Impact Engineering, издательство Pergamon Press Ltd. (United Kingdom), том 36, № 3, с. 468-475 DOI
  • • 2008 Компьютерный дизайн лекарственных средств: программа докинга SOL
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Лущекина С.В., Мартынов Я.Б., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование: Новые вычислительные технологии, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 9, с. 213-233
  • • 2008 Численное моделирование высокоскоростного взаимодействия ударника с дискретными экранами
    • Мягков Н.Н., Сулимов А.В., Шумихин Т.А.
    • в журнале Механика композиционных материалов и конструкций, том 14, № 4, с. 532-546
  • • 2006 О высокоскоростном внедрении сеточной преграды в ударник
    • Мягков Н.Н., Головешкин В.А., Сулимов А.В., Шумихин Т.А.
    • в журнале Механика композиционных материалов и конструкций, том 12, № 3, с. 407-419
  • 
    • 2004 Surface generalized born method: A simple, fast, and precise implicit solvent model beyond the coulomb approximation
    • Romanov A.N., Jabin S.N., Martynov Y.B., Sulimov A.V., Grigoriev F.V., Sulimov V.B.
    • в журнале The journal of physical chemistry. A, Molecules, spectroscopy, kinetics, environment & general theory, издательство American Chemical Society (United States), том 108, № 43, с. 9323-9327 DOI

• Статьи в сборниках

  • • 2019 Parallel Supercomputer Docking Program of the New Generation: Finding Low Energy Minima Spectrum
    • Sulimov A.V., Kutov D.C., Sulimov V.B.
    • в сборнике 4th Russian Supercomputing Days, RuSCDays, Moscow, Russia, September 24–25, 2018, Revised Selected Papers, Ed. V. Voevodin, S. Sobolev, серия Communications in Computer and Information Science, место издания Springer International Publishing Cham, том 965, с. 314-330 DOI
  • 
    • 2019 Search for approaches to supercomputer quantum-chemical docking
    • Sulimov A.V., Kutov D.C., Gribkova A.K., Ilin I.S., Tashchilova A.S., Sulimov V.B.
    • в сборнике 5th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2019 / ed. Voevodin V., Sobolev S, серия Communications in Computer and Information Science, место издания Springer International Publishing Cham, том 1129, с. 363-378 DOI
  • • 2018 Параллельная суперкомпьютерная программа докинга нового поколения: нахождение спектра низкоэнергетических минимумов
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Труды международной конференции "Суперкомпьютерные дни в России", место издания Изд-во МГУ Москва, с. 435-451
  • 
    • 2017 Tensor Train Global Optimization: Application to Docking in the Configuration Space with a Large Number of Dimensions
    • Sulimov A.V., Zheltkov D.A., Oferkin I.V., Kutov D.C., Katkova E.V., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov V.B.
    • в сборнике Supercomputing. Third Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2017, Moscow, Russia, September 25–26, 2017, Revised Selected Papers, серия Communications in Computer and Information Science (CCIS), место издания Springer Cham, том 793, с. 1-532 DOI
    • редакторы Воеводин Владимир Валентинович, Соболев Сергей Игоревич
  • • 2017 Глобальная оптимизация с помощью тензорных поездов: применение к докингу в конфигурационном пространстве с большим числом измерений
    • Сулимов А.В., Желтков Д.А., Оферкин И.В., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России, место издания Изд-во МГУ Москва, с. 382-393
  • • 2016 Prospects of High-Performance Computational Experiments on Thin Film Growth
    • Grigoriev F., Sulimov A., Kochikov I., Kondakova O., Sulimov V., Tikhonravov A.
    • в сборнике Optical Interference Coatings 2016, OSA Technical Digest (online) (Optical Society of America, 2016), место издания OSA Publishing USA, с. WB.5-WB.5 DOI
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование механических напряжений в тонких пленках
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва), место издания Изд-во МГУ М, с. 683-688
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование напыления тонких пленок
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Суперкомпьютерные технологии (СКТ-2016) (19-24 сентября 2016 г.) Материалы 4-й Всероссийской научно-технической конференции: в 2-х томах, место издания Издательство ЮФУ Ростов-на-Дону, том 2, с. 223-227
  • • 2016 Суперкомпьютерный квантовохимический квази-докинг
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва), место издания Изд-во МГУ Москва, с. 725-731
  • 
    • 2015 Supercomputer modeling of the ion beam sputtering process: full-atomistic level
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в сборнике Optical Systems Design: Advances in Optical Thin Films V, серия PROCEEDINGS OF SPIE - THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR OPTICAL ENGINEERING, издательство SPIE, the International Society for Optical Engineering (Bellingham, WA, United States), том 9627, с. 962708-1-962708-9 DOI
  • • 2015 Использование программных пакетов LAMMPS и GROMACS для высокопроизводительного моделирования напыления наноструктурированных тонких пленок
    • Шаров А.Н., Горох А.А., Сулимов А.В., Лукьяненко Д.В., Шарапова С.А., Козьмин М.Ю.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (28-29 сентября 2015 г., г. Москва), место издания Изд-во МГУ Москва, с. 185-189
  • • 2011 Молекулярное моделирование для разработки новых лекартсв на основе ингибиторов урокиназы
    • Садовничий В.А., Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Романов А.Н., Сулимов А.В., Оферкин И.В., Стамбольский Д.В., Белоглазова И.Б., Ткачук В.А.
    • в сборнике «Постгеномные исследования и технологии» под ред. члена-корреспондента РАН С.Д.Варфоломеева, место издания Изд. МГУ Москва, с. 103-140
  • • 2011 Экспертные системы персонифицированной медицины: применение байесовских сетей для предсказания состояния пациентов
    • Сулимов А.В., Втюрина Д.Н., Романов А.Н., Масленников Е.Д., Сулимов В.Б., Курочкин И.Н., Упоров И.В., Затейщиков Д.А., Носиков В.В., Варфоломеев С.Д.
    • в сборнике «Постгеномные исследования и технологии» под ред. члена-корреспондента РАН С.Д.Варфоломеева, место издания Изд. МГУ Москва, с. 641-702
  • • 2006 Веб-ориентированная система молекулярного моделирования Keenbase для разработки новых лекарств
    • Сулимов В.Б., Романов А.Н., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов А.В., Жабин С.Н., Соболев С.И.
    • в сборнике Труды Всероссийской научной конференции "Научный сервис в сети Интернет: Технологии параллельного программирования" (г. Новороссийск, 18-23 сентября 2006 г.), место издания МГУ Москва, с. 18-23

• Книги

  • • 2017 Докинг: молекулярное моделирование для разработки лекарств
    • Сулимов В.Б., Сулимов А.В.
    • место издания ИИнтелл Москва, ISBN 978-5-98956-025-7, 348 с.

• Доклады на конференциях

  • • 2019 Поиск подходов для суперкомпьютерного квантово-химического докинга (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Кутов Д.К., Ильин И.С., Грибкова А.К., Тащилова А.С., Сулимов В.Б.
    • Суперкомпьютерные дни в России 2019, Москва, Россия, 23-24 сентября 2019
  • • 2019 Development of docking programs for lomonosov supercomputer (Устный)
    • Авторы: Vladimir Sulimov, Alexey Sulimov, Danil Kutov, Ivan Ilin
    • Asian Federation of Medicinal Chemistry 12th International Medicinal Chemistry Symposium 2019, AFMC-AIMECS 2019, Istanbul, Турция, 8-11 сентября 2019
  • • 2019 Supercomputer docking with a large number of degrees of freedom (Устный)
    • Авторы: Sulimov A.V., Kutov D.K., Ilin I.S., Zheltkov D., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov V.B.
    • 10th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources CMTPI-2019, Ioannina, Greece, 23-27 June 2019, Ioannina, Греция, 23-27 июня 2019
  • • 2019 Докинг лигандов с большим числом внутренних вращательных степеней свободы (Устный)
    • Авторы: Кутов Д.К., Сулимов А.В., Ильин И.С., Сулимов В.Б.
    • «Ломоносовские чтения - 2019». Секция «НИВЦ», Москва, МГУ, Россия, 15-25 апреля 2019
  • • 2019 Суперкомпьютерный докинг: численные эксперименты (Устный)
    • Авторы: Ильин И.С., Кутов Д.К., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • XXVI Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство", Россия, 8-11 апреля 2019
  • • 2018 Параллельная суперкомпьютерная программа докинга нового поколения: нахождение спектра низкоэнергетических минимумов (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Кутов Д.К.
    • Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2018", Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
  • • 2018 Прогнозирование исходов рака толстой кишки с помощью Байесовских сетей (Стендовый)
    • Авторы: Генс Г.П., Мохнюк К.С., Сулимов В.Б., Савкин И.А., Сулимов А.В., Шиндяпин В.В.
    • Первый Международный Форум онкологии и радиологии. Москва, 23-28 сентября 2018 г., Москва, Россия, 23-28 сентября 2018
  • • 2018 Quasi-docking: comparison of different energy functions in docking (Устный)
    • Авторы: Sulimov A.V., Sulimov V.B., Kutov D.C.
    • 22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships EuroQSAR2018, Thessaloniki, Greece, September 16-20, 2018, Thessaloniki, Греция, 16-20 сентября 2018
  • • 2018 Новые синтетические антикоагулянты: молекулярное моделирование и экспериментальная проверка (Устный)
    • Авторы: Ильин И.С., Липец Е.Н., Тащилова А.С., Сулимов В.Б., Кутов Д.К., Шихалиев Х.С., Атауллаханов Ф.И., Сулимов А.В.
    • Ломоносовские чтения-2018, секция "Вычислительная математика и кибернетика", МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 16-27 апреля 2018
  • • 2018 Исследование свойств кварцевого стекла, легированного гафнием, с помощью методов квантовой химии (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Сулимова В.Б., Лагутина А.А., Лагутин Ю.С.
    • Ломоносовские чтения - 2018, секция вычислительной математики и кибернетики, Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Россия, 11-17 апреля 2018
  • • 2018 Программа SOL-P: новое поколение программ докинга (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Кутов Д.К., Оферкин И.В., Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • XXV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Москва, Россия, 9-12 апреля 2018
  • • 2018 Разработка новых антикоагулянтов с использованием методов молекулярного моделирования ингибиторов белков системы свертывания крови (Устный)
    • Авторы: Сулимов В.Б., Атауллаханов Ф.И., Бутылин А.А., Сапронова Л.В., Зубков Ф.И., Крысин М.Ю., Потапов А.Ю., Шихалиев Х.С., Тащилова А.С., Кутов Д.К., Сулимов А.В., Липец Е.Н., Ильин И.С.
    • XXV Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Москва, Россия, 9-12 апреля 2018
  • • 2018 Application of Bayesian networks for prognosis of breast cancer patient′s outcomes (Устный)
    • Авторы: Gelena Guens, Alexey Sulimov, Vladimir Sulimov, Natalya Moiseeva, Igor Savkin
    • 2nd Global Summit on Oncology & Cancer, Сингапур, 12-14 марта 2018
  • • 2017 Глобальная оптимизация с помощью тензорных поездов: применение к докингу в конфигурационном пространстве с большим числом измерений (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Желтков Д.А., Оферкин И.В., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • Суперкомпьютерные дни в России 2017, Москва, Россия, 25-26 сентября 2017
  • • 2017 Молекулярно-динамическое моделирование напыления тонких оптических покрытий (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МНОГОМАСШТАБНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ, Новый Афон, Абхазия, Республика Абхазия, 16-27 августа 2017
  • • 2017 Docking problems: protein-ligand low energy minima analysis (Устный)
    • Авторы: Sulimov V., Sulimov A., Kutov D.
    • Third Kazan Summer School on Chemoinformatics , Казань, Казанский Федеральный Университет, Россия, 5-7 июля 2017
  • • 2017 Оценка особенностей течения онкологических заболеваний на основе вероятностных моделей с использованием Байесовских сетей (Устный)
    • Авторы: Генс Г.П., Сулимов А.В., Савкин И.А., Сулимов В.Б.
    • Форум университетской науки 2017, МГМСУ имени Евдокимова, Россия, 16 мая 2017
  • • 2017 Обобщенный докинг: программы и результаты тестирования (Устный)
    • Авторы: Желтков Д.А., Сулимов А.В., Кутов Д.К., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • Ломоносовские чтения - 2017, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 17-26 апреля 2017
  • • 2017 Квази-докинг с различными силовыми полями и методами квантовой химии (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Кутов Д.К.
    • Симпозиум «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» в рамках проведения Российского Национального Конгресса «Человек и Лекарство» 10 – 13 апреля 2017, Москва, Москва, Центр Международной Торговли, Краснопресненская набережная, д. 12. Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича, Погодинская ул., 10/8, Россия, 10-13 апреля 2017
  • • 2016 Quantum-chemical approach and the role of solvent (Устный)
    • Авторы: Katkova E.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Kutov D.C., Sulimov A.V.
    • XX Менделеевский съезд по общей и прикладной химии, Екатеринбург, Россия, 26-30 сентября 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование механических напряжений в тонких пленках (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2016", Москва, Россия, 26-27 сентября 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерный квантовохимический квази-докинг (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Кутов Д.К.
    • Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2016", Москва, Россия, 26-27 сентября 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование напыления тонких пленок (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • 4-я Всероссийская научно-техническая конференция "Суперкомпьютерные технологии", Геленджик, Россия, 19-24 сентября 2016
  • • 2016 Novel Gridless Program SOL-P for Flexible Ligand Docking with Moveable Protein Atoms (Устный)
    • Авторы: Sulimov A., Zheltkov D., Oferkin I., Kutov D., Tyrtyshnikov E., Sulimov V.B.
    • 21st European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Where Molecular Simulations Meet Drug Discovery, Verona, Italy, September 4-8, 2016 , Verona, Италия, 4 сентября - 8 октября 2016
  • • 2016 Prospects of High-Performance Computational Experiments on Thin Film Growth (Устный)
    • Авторы: Grigoriev F., Sulimov A., Kochikov I., Kondakova O., Sulimov V., Tikhonravov A.
    • Optical Interference Coatings 2016, Loews Ventana Canyon, Tucson, Arizona, США, 19-24 июня 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерный докинг на основе глобальной оптимизации с помощью тензорных поездов (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Кутов Д.К., Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • XXIII Российский национальный Конгресс «Человек и лекарство», Москва, Россия, 11-14 апреля 2016
  • • 2015 Выявление генетических факторов, влияющих на развитие атеросклероза (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Савкин И.А., Кутов Д.К., Каткова Е.В.
    • Конференция молодых ученых, приуроченная к 60-летию НИВЦ МГУ, конференц-зал НОЦ "Суперкомпьютерные технологии" МГУ , Россия, 8 октября 2015
  • • 2015 Рибосома – важнейшая мишень для создания новых антибактериальных средств (Устный)
    • Авторы: Каткова Е.В., Манцызов А.Б., Сафронова Р.Г., Сулимов А.В.
    • Конференция молодых ученых, приуроченная к 60-летию НИВЦ МГУ, конференц-зал НОЦ "Суперкомпьютерные технологии" МГУ , Россия, 8 октября 2015
  • • 2015 Использование программных пакетов LAMMPS и GROMACS для высокопроизводительного моделирования напыления наноструктурированных тонких пленок (Устный)
    • Авторы: Козьмин М.Ю., Шаров А.Н., Горох А.А., Сулимов А.В., Лукьяненко Д.В., Шарапова С.А.
    • Суперкомпьютерные дни в России (научная секция Опыт решения прикладных задач), Москва, Россия, 28-29 сентября 2015
  • • 2015 Supercomputer modeling of the ion beam sputtering process: full-atomistic level (Устный)
    • Авторы: Grigoriev Fedor V., Sulimov Alexei V., Tikhonravov Alexander V., Kondakova Olga A., Sulimov Vladimir B., Kochikov Igor V.
    • SPIE Optical System Design, Йена (Jena), Германия, 7-10 сентября 2015
  • • 2015 Protein-ligand low energy minima pose analysis: docking target functions evaluation with the FLM program (Устный)
    • Авторы: Vladimir Sulimov, Ekaterina Katkova, Alexey Sulimov
    • 332nd OMICS International Conference, International Conference and Expo on Drug Discovery & Designing, Frankfurt, Германия, 11-13 августа 2015
  • • 2015 Применение технологии байесовских сетей для целей персонифицированной медицины (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Савкин И.А., Сулимов В.Б.
    • XXII Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", Москва, Россия, 6-10 апреля 2015
  • • 2014 Применение байесовских сетей для выявления генетические маркеров ассоциированных с факторами риска развития атеросклероза (Устный)
    • Авторы: Савкин И.А., Бойцов С.А., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Мешков А.Н.
    • IV международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» г. Казань, 29 октября – 1 ноября 2014, г. Казань, 2014
  • • 2014 Ускорение расчетов полярной составляющей энергии сольватации молекул при помощи мультизарядового метода (Устный)
    • Авторы: Михалев А.Ю., Офёркин И.В., Оселедец И.В., Сулимов А.В., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • XXI Российский национальный конгресс "Человек и лекарство", ФГБУ "ИБМХ" РАМН, Погодинская ул., 10, корп.8, 2-й этаж, конференц-зал, 2014
  • • 2012 Application of the docking program SOL for CSAR benchmark (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Сулимов В.Б.
    • 244th ACS National Meeting, Philadelphia, Pennsylvania, USA, 2012
  • • 2012 Генетический полиморфизм фактора некроза опухоли альфа наряду с клиническими параметрами определяет течение ИБС. Построение прогностической модели на основе Байесовской сети (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Масленников Е.М., Сулимов В.Б., Носиков В.В., Евдокимова М.А., Затейщиков Д.А.
    • Московский Международный Форум Кардиологов, Москва, 14-15 июня 2012 г., Москва, Россия, 2012
  • • 2012 Генетический полиморфизм фактора некроза опухоли альфа наряду с клиническими параметрами определяет течение ИБС. Построение прогностической модели на основе байесовской сети. (Устный)
    • Авторы: Сулимов А.В., Евдокимова М.А., Носиков В.В., Сулимов В.Б., Масленников Е.Д., Затейщиков Д.А.
    • Московский Международный Форум Кардиологов, Москва, 14-15 июня 2012 г., Москва, Россия, 2012
  • • 2012 Применение поуэмпирических квантово-химических методов для разработки ингибиторов урокиназы
    • Авторы: Каткова Е.В., Офёркин И.В., Сулимов В.Б., Сулимов А.В.
    • IV съезд фармакологов России "Инновации в современной фармакологии", 18-21 сентября, г. Казань, 2012
  • • 2012 Прогностическая модель на основе байесовской сети: факторы, определяющие риск развития неблагоприятного исхода у больных, перенесших инфаркт миокарда или нестабильную стенокардию (Устный)
    • Авторы: Масленников Е.М., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Затейщиков Д.А., Носиков В.В., Евдокимова М.А.
    • Российский Национальный Конгресс Кардиологов "Интеграция Знаний в Кардиологии", Москва, 3-5 октября , Россия, 2012
  • • 2011 A comparative study of different optimization algoruthms for molecular docking
    • Авторы: Afanasiev A., Офёркин И.В., Посыпкин М.А., Rubtsov A., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • IWSG-Life 2011 (3rd International Workshop on Science Gateways for Life Sciences), London, UK, 2011
  • • 2011 Применение молекулярного моделирования для разработки ингибиторов урокиназы (Устный)
    • Авторы: Садовничий В.А., Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Романов А.Н., Ткачук В.А., Офёркин И.В., Белоглазова И.Б., Стамбольский Д.В., Сулимов А.В.
    • Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, Россия, 2011
  • • 2011 Разработка новых лекарств на основе ингибиторов урокиназы (Устный)
    • Авторы: Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Романов А.Н., Садовничий В.А., Сулимов А.В., Оферкин И.В., Ткачук В.А., Рощин А.И., Никитин С.М., Тайдаков И.В., Белоглазова И.Б., Стамбольский Д.В., Федулов К.М.
    • Ломоносовские чтения - 2011, МГУ им. М.В. Ломоносова, 2011
  • • 2011 Разработка программного обеспечения для применения байесовских сетей в экспертных системах персонифицированной медицины (Устный)
    • Авторы: Масленников Е.Д., Сулимов В.Б., Сулимов А.В., Втюрина Д.Н.
    • VI Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития", Москва, Россия, 21-25 марта 2011
  • • 2010 Персонифицированная медицина - предсказания событий на основе байесовской сети доверия: алгоритм и программная реализация (Устный)
    • Авторы: Масленников Е.Д., Романов А.Н., Втюрина Д.Н., Сулимов В.Б., Курочкин И.Н., Упоров И.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А.
    • Ломоносовские чтения - 2010, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 20-21 апреля 2010

• Тезисы докладов

  • 
    • 2019 Development of docking programs for lomonosov supercomputer
    • Vladimir Sulimov, Alexey Sulimov, Danil Kutov, Ivan Ilin
    • в сборнике Asian Federation of Medicinal Chemistry 12th International Medicinal Chemistry Symposium 2019, AFMC-AIMECS 2019, 08-11 September 2019, Istanbul, Turkey, Abstract Book, тезисы, с. 77-77 DOI
  • • 2019 Supercomputer docking with a large number of degrees of freedom
    • Sulimov A.V., Kutov D.K., Ilin I.S., Zheltkov D., Tyrtyshnikov E.E., Sulimov V.B.
    • в сборнике 10th International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources CMTPI-2019, Ioannina, Greece, 23-27 June 2019, тезисы, с. 24-24
  • • 2019 Суперкомпьютерный докинг: численные эксперименты
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Ильин И.С., Сулимов В.Б.
    • в сборнике в Сборнике материалов XXVI Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство". Тезисы докладов. Главный редактор Чучалин А.Г, место издания ООО "Видокс" Москва, тезисы, с. 88-88
  • • 2018 Quasi-docking: comparison of different energy functions in docking
    • Sulimov A.V., Kutov D.C., Sulimov V.B.
    • в сборнике 22nd European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships EuroQSAR2018, Thessaloniki, Greece, September 16-20, тезисы, с. 124-124
  • • 2018 Программа SOL-P: новое поколение программ докинга
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Оферкин И.В., Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в сборнике XXV Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство" 9 – 12 апреля 2018, Москва, Сборник материалов Конгресса, Тезисы докладов, место издания ООО "Видокс" Москва, тезисы, с. 87-87
  • • 2018 Разработка новых антикоагулянтов с использованием методов молекулярного моделирования ингибиторов белков системы свертывания крови
    • Ильин И.С., Липец Е.Н., Сулимов А.В., Кутов Д.К., Тащилова А.С., Шихалиев Х.С., Потапов А.Ю., Крысин М.Ю., Зубков Ф.И., Сапронова Л.В., Бутылин А.А., Атауллаханов Ф.И., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Сборник материалов XXV Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Тезисы докладов/ Главный редактор Чучалин А.Г, серия Секция "Разработка и создание новых лекарственных препаратов", место издания Видокс Москва, тезисы, с. 69-70
  • • 2017 Docking problems: protein-ligand low energy minima analysis
    • Sulimov V., Kutov D., Sulimov A.
    • в сборнике 3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5-7 July 2017), место издания Kazan Federal University Kazan, тезисы, с. 17-17
  • • 2017 Квази-докинг с различными силовыми полями и методами квантовой химии
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Каткова Е.В., Сулимов В.Б.
    • в сборнике XXIV Российский национальный конгресс "Человек и Лекарство", Сборник материалов Конгресса, Тезисы докладов, место издания ООО "Видокс" Москва, тезисы, с. 108-108
  • • 2017 МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ НАПЫЛЕНИЯ ТОНКИХ ОПТИЧЕСКИХ ПОКРЫТИЙ
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Тезисы докладов 14-ой Российской Школы-Симпозиума ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МНОГОМАСШТАБНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ (ФОАММ-2017), место издания г. Долгопрудный, тезисы, с. 1-21
  • • 2016 Docking accuracy: quantum-chemical approach and the role of solvent
    • Kutov D.C., Sulimov A.V., Katkova E.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в сборнике ХХ Менделеевский съезд по общей и прикладной химии. Екатеринбург, 26-30 сентября 2016 г. Тезисы докладов в пяти томах, место издания УрО РАН Екатеринбург, том 5, тезисы, с. 108-108
  • • 2016 Novel gridless program SOL-P for flexible ligand docking with moveable protein atoms
    • Alexey Sulimov, Dmitry Zheltkov, Igor Oferkin, Danil Kutov, Eugene Tyrtyshnikov, Vladimir Sulimov
    • в сборнике 21st EuroQSAR, Verona, Italy, September 4-8, 2016, место издания Verona, Italy, тезисы, с. 62-62
  • • 2016 Суперкомпьютерный докинг на основе глобальной оптимизации с помощью тензорных поездов
    • Сулимов А.В., Кутов Д.К., Желтков Д.А., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Сборник материалов XXIII Российского национального конгресса «Человек и лекарство». Тезисы докладов, место издания Видокс Москва, тезисы, с. 204-204
  • • 2015 Protein-ligand low energy minima pose analysis: Docking target functions evaluation with the FLM program
    • Vladimir Sulimov, Alexey Sulimov, Ekaterina Katkova
    • в сборнике Drug Designing: Open Access 2015. Volume 4, Issue 2 ISSN: 2169-0138 DDO, an open access journal, серия http://www.conferenceseries.com/, место издания OMICS International http://dx.doi.org/10.4172/2169-0138.S1.007, том 4, тезисы, с. 36-36 DOI
  • • 2015 Использование программных пакетов LAMMPS и GROMACS для высокопроизводительного моделирования напыления наноструктурированных тонких пленок
    • Шаров А.Н., Горох А.А., Сулимов А.В., Лукьяненко Д.В., Шарапова С.А., Козьмин М.Ю.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (28-29 сентября 2015 г., г. Москва), место издания Изд-во МГУ Москва, тезисы
  • • 2015 Применение технологии байесовских сетей для целей персонифицированной медицины
    • Сулимов А.В., Савкин И.А., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Сборник материалов XXII Российского национального конгресса «Человек и Лекарство». Москва 6-10 апреля 2015 г. Главный редактор Чучалин А.Г, место издания ЗАО РИЦ «Человек и лекарство» Москва, тезисы, с. 264-264
  • • 2014 Ускорение расчётов полярной составляющей энергии сольватации молекул при помощи мультизарядового метода
    • Михалев А.Ю., Офёркин И.В., Оселедец И.В., Сулимов А.В., Тыртышников Е.Е., Сулимов В.Б.
    • в сборнике Сборник материалов XXI Российского национального конгресса ”Человек и лекарство”, Москва, 7-11 апр. 2014 г, место издания Москва, тезисы
  • • 2012 Применение полуэмпирических квантово-химических методов для разработки ингибиторов урокиназы
    • Каткова Е.В., Оферкин И.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в сборнике IV съезд фармакологов России «Инновации в современной фармакологии». Материалы съезда, место издания Казань, тезисы, с. 83-83
  • • 2009 Применение молекулярного моделирования для разработки ингибиторов урокиназы
    • Садовничий В.А., Сулимов В.Б., Каткова Е.В., Романов А.Н., Сулимов А.В., Оферкин И.В., Белоглазова И.Б., Стамбольский Д.В., Ткачук В.А.
    • в сборнике 5-й Московский международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития". Материалы конгресса, часть 2, место издания Москва, тезисы, с. 252-253
  • • 2006 Web-oriented system Keenbase for virtual screening and design of new ligands for biological macromolecules. Application for new drugs searches
    • Sulimov V., Romanov A., Grigoriev F., Kondakova O., Sulimov A., Bryzgalov P., Zhabin S., Chernobrovkin A., Sobolev S.
    • в сборнике Book of abstract Saint-Petersburg international workshop on nanobiotechnologies, тезисы, с. 27-29
  • • 2006 Веб-ориентированная система Keenbase для виртуального поиска ингибиторов для заданных макромолекул-мишеней и конструирования новых лекарственных средств
    • Сулимов В.Б., Романов А.Н., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов А.В., Брызгалов П.А., Жабин С.Н., Чернобровкин А.Л., Лущекина С.В., Соболев С.И.
    • в сборнике 3-я Международная научно-практическая конференция «Новые технологии создания инновационных лекарств. От достижений «постгеномной эры» к национальным фармацевтическимя брендам. Центр высоких технологий «Химрар», 1 декабря 2006 г, тезисы

• НИРы

  • • 23 апреля 2019 - 31 декабря 2021 Суперкомпьютерное моделирование свойств материалов тонких пленок для оптических и лазерных технологий
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Ответственные исполнители: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б. Участники НИР: Ильин И.С., Исаев Т.Ф., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Савкин И.А., Смирнова Е.Н., Шарапова С.А., кутов д.к.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2023 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физических, физико-химических, биофизических и медицинских проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Ильин И.С., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Савкин И.А., Сулимов А.В., Тащилова А.С.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2018 Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
    • Ректорат
    • Руководитель: Садовничий В.А. Ответственный исполнитель: Каменский П.А. Участники НИР: Cоина В.С., Rimskaya-Korsakova N.N., Абрамов С.М., Аверина О.А., Агеева Л.В., Адельянов А.М., Азовский А.И., Акопян Ж.А., Аксенова А.А., Аксенова В.А., Аксянов Е.А., Аласания К.Ю., Алдобаева И.И., Александров В.В., Александрова А.В., Александрушкина Н.И., Александрушкина Н.А., Алексеевский А.В., Алешин В.В., Аляутдинов А.Р., Алёшин В.В., Андреева Т.В., Антал Т.К., Антоновская А.А., Антохина О.Г., Арифулин Е.А., Армеев Г.А., Артюшин И.В., Арушанян И.О., Ахметжанова А.А., Ашапкин В.В., Бабенко В.А., Бакеева Л.Е., Балацкий А.В., Банникова А.А., Баринова Н.Н., Баулина О.И., Бацевич В.А., Бедарева И.В., Белевич Т.А., Беме И.Р., Бенедиктов А.А., Березина Н.Я., Биланенко Е.Н., Бисерова Н.М., Благовещенская Е.Ю., Боброва В.К., Бондарева Э.А., Бондаренко Г.Н., Борисанова А.О., Брагина Е.Е., Брызгалина Е.В., Бубнова Е.Н., Бугров Д.И., Бушуев А.В., Бызов Б.А., Бычков А.Ю., Бычкова Е.Ю., Вайпан Д.В., Вайс В.Б., Вальехо-Роман К.М., Вангели И.М., Ванюшин Б.Ф., Варлыгина Т.И., Вархотов Т.А., Васильев А.Н., Васильева Е.Д., Васильева С.Г., Вилкул Е.А., Виноградова Е.Н., Виноградская М.И., Владыченская И.П., Водопьянов С.С., Волкова О.А., Волкова О.С., Волцит О.В., Воробьева Е.А., Воронина Е.Ю., Воронко О.В., Ворцепнева Е.В., Высоких М.Ю., Гавриленко С.М., Галинская Т.В., Галкин И.И., Галоян Э.А., Ганчарова О.С., Гаранина А.С., Георгиев А.А., Герасимов Е.С., Глаголева Е.С., Глушакова А.М., Гмошинский В.И., Гоголева С.С., Година Е.З., Головин А.В., Гололобова М.А., Гомыранов И.А., Горелова О.А., Горшкова Е.А., Горюнов Д.В., Гофман Д.К., Григорьев Ф.В., Григорьева А.А., Григорьева О.А., Грицышин В.А., Груздева М.А., Грум-Гржимайло О.А., Гусев Ф.Е., Данилович И.Л., Дегтярева Г.В., Диброва Д.В., Добров Б.В., Добровольская Т.Г., Дроздова О.Ю., Дуброва М.С., Дудов С.В., Дудова К.В., Дыйканов Д.Т., Дьяков М.Ю., Евтеев А.А., Ежова О.В., Екимова И.А., Еланский С.Н., Елумеева Т.Г., Емельянова Л.Г., Еремичев Р.Ю., Ерохина М.В., Ефименко А.Ю., Ефимов С.В., Жадан А.Э., Жирков И.А., Захаров К.В., Землемерова Е.Д., Зернов А.С., Зубкова Е.Н., Иваненко В.Н., Иваницкая О.Н., Иваницкий В.В., Иванов А.О., Иванова А.Е., Игнатов М.С., Игнатова Е.А., Ильина И.Ю., Ильинская О.П., Калякин М.В., Камалов А.А., Карапетян М.К., Касумян А.О., Каткова Е.В., Качалкин А.В., Квятковский А.Л., Квятковский А.Я., Керимов А.Б., Климович П.С., Климчук О.И., Клёнова А.В., Кнорре Д.А., Князева А.А., Кобельков Г.М., Кобельков С.Г., Кокаева Л.Ю., Колбасов Г.А., Колбасова Г.Д., Колесниченко К.А., Кондакова О.А., Коновалова О.П., Конюхов И.В., Копылов-Гуськов Ю.О., Королев Д.Е., Королева А.Т., Корсуновская О.С., Коршунова Г.А., Коршунова Т.А., Кочкин Д.В., Кошелева Н.В., Крайнов В.Н., Крамина Т.Е., Кремнёв С.В., Криницына А.А., Крупицкий А.В., Крускоп С.В., Кручинин П.А., Кручинина А.П., Кублановская (Шанина) А.А., Кузищин К.В., Кузнецов А.Г., Кулебякин К.Ю., Кулебякина М.А., Куприянова Е.В., Кураков А.В., Кутов Д.К., Кутуева Л.И., Кутузова И.А., Кушунина М.А., Лазарев Е.Н., Лапашина А.С., Лапыгина Е.В., Лебедев В.С., Левик Л.Ю., Лемак С.С., Леонтьева О.А., Лисенкова А.А., Лисовский А.А., Лобакова Е.С., Логачева М.Д., Лопатина Ю.В., Лубнина Н.В., Лукашевич Н.В., Лукьянов А.А., Лысак Л.В., Лысков Д.Ф., Мазей Ю.А., Макарова Н.Е., Максимова И.А., Малахов В.В., Малютина А.М., Манахов А.Д., Манских В.Н., Манучарова Н.А., Маркина М.М., Маркова О.В., Марова-Кляйнбуб И.М., Мартынов А.В., Марфенина О.Е., Маслакова А.А., Мелихова Е.В., Мельникова М.Н., Милютина И.А., Михайлов К.В., Михайлов К.Г., Морковин А.А., Москаленко В.Н., Мохова Е.Н., Мулкиджанян А.Я., Мунтян М.С., Мурашев В.В., Мурашев И.А., Нагаев Б.Э., Назаров П.А., Назаров Р.А., Нанова О.Г., Недоспасов С.А., Неретин Н.Ю., Неретина Т.В., Нестеренко А.М., Нетрусов А.И., Никитин М.А., Нилова М.В., Нимирицкий П.П., Новаковский Г.Э., Новаковский Г.Э., Новоселецкая Е.С., Новоселецкий В.Н., Носов А.М., Оболенская Е.В., Овченков Е.А., Огурцов С.В., Озеров А.Л., Озрина Р.Д., Олейникова О.В., Олейникова О.В., Онипченко В.Г., Онищенко Г.Е., Орлов Д.С., Орловский И.В., Павлинов И.Я., Павлов Д.С., Павлов С.Д., Павлова Н.С., Панина О.Б., Панютина А.А., Парфёнова Е.В., Пенин А.А., Перехватов В.В., Петракова О.С., Петров Н.Б., Петров П.Н., Петрунина А.С., Петушкова Ю.А., Пивоваров Е.А., Плетюшкина О.Ю., Плеханова О.С., Погосян С.И., Поздняков Л.А., Полевова С.В., Полилов А.А., Поляков М.П., Полянская Л.М., Попеленский Ф.Ю., Попкова Е.Г., Попов В.С., Попова Е.Н., Попова О.В., Попова С.С., Поярков Н.А., Просвиров А.С., Птушенко В.В., Пугачева Т.Т., Рамонова А.А., Распопова А.А., Ревина Д.Б., Редькин Я.А., Решетников Р.В., Рогаев Е.И., Романов А.А., Романова Е.С., Романова Е.С., Рубина К.А., Румянцев В.Ю., Русин Л.Ю., Русинов И.С., Рыжов А.Л., Рысенкова К.Д., Савилова З.Д., Савицкая М.А., Савицкий В.Ю., Савкин И.А., Самигуллин Т.Х., Самойлов К.Ю., Самоходская Л.М., Самсонов Т.Е., Северова Е.Э., Селях И.О., Семенова А.В., Семенова Л.Р., Семенова М.Л., Семин В.Н., Семина Е.В., Сенченков Е.П., Сенчукова А.Л., Серегин А.П., Сидоренко Г.Ю., Симоненко Е.Ю., Симонян Р.А., Синев А.Ю., Скулачев В.П., Скулачев К.В., Слободкина Е.А., Смирнова Е.А., Соловченко А.Е., Соловьева Е.Н., Сорокин М.И., Сото Э., Спасская Н.Н., Сперанская А.С., Спирин С.А., Стамбольский Д.В., Старостина Е.Е., Степанов А.Л., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Сумбатян Н.В., Суханова Е.С., Сухоруков А.П., Сысоева В.Ю., Тарнопольская М.Е., Тащилова А.С., Твердислов В.А., Темерева Е.Н., Терентьева Е.И., Терехова В.А., Тимошенко В.Ю., Титова М.В., Тихонов В.В., Тишечкин Д.Ю., Токарчук А.В., Томкович П.С., Троицкий А.В., Тужилин А.А., Тузов К.А., Федоров А.В., Федоров В.В., Федорова А.В., Федосеева (Бандолина) Е.В., Федосов В.Э., Фенюк Б.А., Фетисова Е.К., Флегонтов П.Н., Фырнин Д.М., Хайлова Л.С., Храмова Ю.В., Цетлин А.Б., Чеканов К.А., Челомбитько М.А., Черепанов Д.А., Чернов И.Ю., Черняк Б.В., Чертополохов В.А., Чертопруд Е.С., Чесунов А.В., Чивкунова О.Б., Чотчаева Ф.Р., Чубатова Н.В., Чудаев Д.А., Чурикова О.А., Шагиева Г.С., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шалаева Д.Н., Шаранова Н.Э., Шаталкин А.И., Шаталова Н.Н., Шафеи Р.А., Шахпаронов В.В., Шведчикова Н.К., Шестаков А.И., Шилов Е.С., Шиловский Г.А., Шнырева А.В., Штратникова В.Ю., Шубина Е.А., Шуленина Н.Э., Щелкунов М.И., Щербаков П.Н., Эльдаров Ч.М., Юрцева О.В., Яворская М.И., Яковенко С.А., Якушев А.В., Якушев А.Г., Яровая Е.Б.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2015 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физических, физико-химических, биофизических и медицинских проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Савкин И.А., Сулимов А.В.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2016 Высокопроизводительные технологии моделирования релаксационных процессов в наноструктурированных тонких пленках
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Участники НИР: Горох А.А., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Кочиков И.В., Лукьяненко Д.В., Смирнова Е.Н., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Шарапова С.А., Шаров А.Н.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2014 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физико-химических и био-физических проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Оферкин И.В., Романов А.Н., Сулимов А.В.
  • • 19 августа 2011 - 10 ноября 2012 Создание сверхмасштабируемой программы для молекулярного моделирования солнечных батарей
    • Научно-исследовательский вычислительный центр
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Втюрина Д.Н., Григорьев Ф.В., Жабин С.Н., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Масленников Е.Д., Оферкин И.В., Романов А.Н., Сулимов А.В., Федулов К.М.
  • • 1 мая 2010 - 31 декабря 2012 Разработка и реализация эффективных алгоритмов глобальной оптимизации на высокопроизводительных вычислительных системах
    • Научно-исследовательский вычислительный центр
    • Руководитель: Кондакова О.А. Участники НИР: Головачева А.Ю., Каткова Е.В., Оферкин И.В., Сулимов А.В.

• Патенты

  • • 2015 Способ прогнозирования исходов рака молочной железы
    • Авторы: Генс Г.П., Сулимов В.Б., Моисеева Н.И., Сулимов А.В., Овсий О.Г.
    • #2014125822/14, 20 сентября

• Свидетельства о регистрации прав на программное обеспечение

  • • 2012 MEL (тип не указан)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Романов А.Н., Оферкин И.В., Сулимов А.В.
    • #2012618963, 4 октября
  • • 2012 POLYA (тип не указан)
    • Авторы: Романов А.Н., Оферкин И.В., Сулимов А.В.
    • #2012618962, 4 октября

• Руководство курсовыми работами

  • • 2017 Вероятностные модели предсказания на основе байесовских сетей
    • Научные руководители: Шешенин Сергей Владимирович, Сулимов Алексей Владимирович
    • Автор: Юрчик Артем Евгеньевич (Специалист)

• Преподавание учебных курсов

  • • с 11 февраля 2016 Компьютерные методы в фармакологии
    • МГУ имени М.В. Ломоносова, Физический факультет, Отделение экспериментальной и теоретической физики, Кафедра биофизики
    • обязательная, по выбору (спецкурс), лабораторные занятия, 12 часов

---