ИСТИНА

Занегина Ольга Николаевна пользователь

кандидат биологических наук с 2016 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

Соавторы: Алексеевский А.В., Карягина-Жулина А.С., Спирин С.А., Аксянов Е.А., Kirsanov D.D., Гришин А.В., Alexeyevsky D., Fonfara I., Wende W., Алёшин В.В., Баулин Е.Ф., Высоких М.Ю., Ефейкин Б.Д. показать полностью..., Кнорре Д.А., Коршунова Г.А., Логачёва М.Д., Михайлов К.В., Мунтян М.С., Никитин М.А., Николаева О.В., Панчин А.Ю., Панчин Ю.В., Пенин А.А., Спиридонов С.Э., Сумбатян Н.В., Сыромятникова И.Ф.

6 статей, 6 докладов на конференциях, 4 тезисов докладов, 6 НИР, 1 награда, 1 диссертация

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 61, Scopus: 73

IstinaResearcherID (IRID): 2624127

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2019 Coding palindromes in mitochondrial genes of Nematomorpha
    • Mikhailov Kirill V., Efeykin Boris D., Panchin Alexander Y., Knorre Dmitry A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Muntyan Maria S., Nikitin Mikhail A., Popova Olga V., Zanegina Olga N., Vyssokikh Mikhail Y., Spiridonov Sergei E., Aleoshin Vladimir V., Panchin Yuri V.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 47, № 13, с. 6858-6870 DOI
  • 
    • 2016 An updated version of NPIDB includes new classifications of DNA–protein complexes and their families
    • Zanegina O.N., Kirsanov D.D., Baulin E.F., Spirin S.A., Karyagina A.S., Alexeevski A.V.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 44, № D1, с. D144-D153 DOI
  • 
    • 2016 Conserved features of complexes of TATA-box binding proteins with DNA
    • Zanegina O.N., Aksianov E.A., Alexeevski A.V., Karyagina A.S., Spirin S.A.
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 14, № 02, с. 1641007 DOI
  • 
    • 2013 NPIDB: nucleic acid—protein interaction database
    • Kirsanov Dmitry D., Zanegina Olga N., Aksianov Evgeniy A., Spirin Sergei A., Karyagina Anna S., Alexeevski Andrei V.
    • в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 41, № D1, с. D517-D523 DOI
  • 
    • 2010 Identification of conserved features of LAGLIDADG homing endonucleases
    • Grishin Alexander, Fonfara Ines, Alexeevski Andrei, Spirin Sergei, Zanegina Olga, Karyagina Anna, Alexeyevsky Daniil, Wende Wolfgang
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 8, № 3, с. 453-469 DOI
  • 
    • 2008 Conserved water molecules in X-ray structures highlight the role of water in intramolecular and intermolecular interactions
    • Aksianov Evgeniy, Zanegina Olga, Grishin Alexander, Spirin Sergey, Karyagina Anna, Alexeevski Andrei
    • в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 6, № 4, с. 775-788 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2018 New automated classification of DNA-protein complexes in Nucleic acids – Protein Interaction Database (Стендовый)
    • Авторы: Eugene Baulin, Olga Zanegina, Sergei Spirin, Andrei Alexeevski, Anna Karyagina
    • 17th European Conference on Computational Biology (ECCB'18), Athens, Stavros Niarchos Foundation Cultural Center, Греция, 2-12 сентября 2018
  • • 2016 Conserved DNA-protein contacts formed by TATA-box binding proteins (Стендовый)
    • Авторы: Andrei Alexeevski, Olga Zanegina, Evgeniy Aksianov, Anna Karyagina, Sergei Spirin
    • 15th European Conference on Computational Biology (ECCB'16), г. Гаага, Нидерланды, 3-7 сентября 2016
  • • 2016 Search of conserved features in protein-DNA complexesvia Nucleic acid—Protein Interaction DataBase (NPIDB) (Устный)
    • Автор: Zanegina O.
    • International Conference SocBiN Bioinformatics 2016, Москва, Россия, 14-16 июня 2016
  • • 2015 In search of conserved features in protein-NA complexes: examples of usage of Nucleic acid – Protein Interaction DataBase (NPIDB). (Устный)
    • Авторы: Zanegina O., Spirin S., Karyagina A., Alexeevski A.
    • Symposium “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group Gießen/Marburg‐Moscow (DFG/RFBR‐funded). 14-15 сентября 2015 года, Гисен, Германия., Гисен, Германия, 14-15 сентября 2015
  • • 2014 Structural classification of protein-DNA complexes and their families based on interacting elements (Стендовый)
    • Авторы: Zanegina O.N., Spirin S.A., Alexeevski A.V., Karyagina A.S.
    • 13th European Conference on Computational Biology (ECCB'14), Страсбург, Франция, 7-10 сентября 2014
  • • 2014 Contact-based approach to structural classification of protein-DNA complexes (Стендовый)
    • Авторы: Zanegina O.N., Spirin S.A., Alexeevski A.V., Karyagina A.S.
    • The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS-2014), Новосибирск, Россия, 23-28 июня 2014

• Тезисы докладов

  • • 2016 Conserved DNA-protein contacts formed by TATA-box binding proteins
    • Olga Zanegina, Evgeniy Aksianov, Alexeevski Andrei V., Anna Karyagina, Sergei Spirin
    • в сборнике F1000 Research 2016, серия 5:2305 (poster), тезисы
  • • 2014 Contact-based approach to structural classification of protein-DNA complexes
    • Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
    • в сборнике The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014, Novosibirsk, June 23-28, место издания Publishing House of the Siberian Branch Russian Academy of Sciences Novosibirsk, тезисы, с. 170-170
  • • 2014 Structural classification of protein-DNA complexes and their families based on interacting elements
    • Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
    • в сборнике Материалы конференции "European Conference on Computational Biology, ECCB 2014", место издания Страсбург, Франция, тезисы
  • • 2003 Гистидин-содержащие дипептиды, обладающие антиоксидантной активностью
    • Коршунова Г.А., Сумбатян Н.В., Сыромятникова И.Ф., Занегина О.Н.
    • в сборнике Российский симпозиум по химии и биологии пептидов. Тезисы стендовых сообщений, место издания ИБХ РАН Москва, тезисы, с. 30-30

• НИРы

  • • 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Изучение внутри- и межклеточных взаимодействий методами молекулярной и клеточной биологии, физиологии, математики и биоинформатики
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Ответственные исполнители: Дугина В.Б., Плетюшкина О.Ю., Попова Л.Б., Потапова Т.В., Спирин С.А. Участники НИР: Баринова О.А., Бойцова Л.Ю., Вирясова Г.М., Воейкова А.В., Волобуева Т.А., Воронов Д.А., Галкин И.И., Головин А.В., Диброва Д.В., Домнина Л.В., Дугина В.Б., Дунина-Барковская А.Я., Ершова А.С., Занегина О.Н., Зиновкин Р.А., Иванова О.Ю., Игнатова Т.Ю., Карягина-Жулина А.С., Кирпиченко А.О., Кондратенко Н.Д., Леонтович А.М., Макарикова О.Л., Макиевская К.И., Мейзеров Е.С., Мошенский Д.М., Павлова Г.А., Павлюченкова А.Н., Панчин Ю.В., Пирожков Е.В., Пирусская А.М., Плетюшкина О.Ю., Попов Д.А., Попова Е.Н., Попова Л.Б., Потапова Т.В., Приходько А.С., Романов А.В., Русинов И.С., Савченко И.М., Самохина М.Е., Самохина (Волобуева) М.Е., Синещекова Д.А., Смиренина Л.К., Смолина Г.Б., Сорочкина А.И., Спирин С.А., Титова Е.В., Фетисова Е.К., Челомбитько М.А., Черкашина А.А., Чернявский Д.А., Чуркина (Таран) А.С., Шагиева Г.С., Штратникова В.Ю., Яшанова Л.А.
  • • 4 августа 2014 - 31 декабря 2015 Изучение эволюции систем рестрикции-модификации методами сравнительной геномики
    • Отдел математических методов в биологии
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Ершова А.С., Занегина О.Н., Русинов И.С.
  • • 1 августа 2014 - 31 декабря 2014 Проект организации научно-практической школы «Высокопроизводительное секвенирование: получение, анализ данных и их использование в филогенетике»
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Богданов А.А. Участники НИР: Алёшин В.В., Горюнов Д.В., Занегина О.Н., Игнатов М.С., Карпов С.А., Логачёва М.Д., Михайлов К.В., Русин Л.Ю.
  • • 28 марта 2013 - 31 декабря 2015 Развитие биоинформатических сервисов и баз данных на портале НИИ ФХБ имени А.Н.Белозерского на основе разработок новых программ
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Спирин С.А. Участники НИР: Аксянов Е.А., Занегина О.Н., Леонтович А.М., Николаев В.К., Пеков Ю.А.
  • • 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Математика и её применение в биологии и медицине. Биоинформатика
    • Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Аксянов Е.А., Андреева Н.В., Баринова О.А., Головин А.В., Диброва Д.В., Ершова А.С., Занегина О.Н., Карягина-Жулина А.С., Королев Д.Е., Леонтович А.М., Мейзеров Е.С., Мошенский Д.М., Попов Д.А., Русинов И.С., Сафонов Н.А., Спирин С.А., Хачатурян М.А., Чернявский Д.А., Штратникова В.Ю.
  • • 1 апреля 2011 - 31 декабря 2013 Хоминг эндонуклеазы семейства LAGLIDADG и прокариотические системы рестрикции-модификации: распространение, эволюция и рациональный дизайн
    • Отдел математических методов в биологии
    • Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Гришин А.В., Ершова А.С., Занегина О.Н., Кирсанов Д.Д.

• Награды и премии

  • • 2020 Академическая премия
    • Лауреаты: Mikhailov Kirill V., Efeykin Boris D., Panchin Alexander Y., Knorre Dmitry A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Muntyan Maria S., Nikitin Mikhail A., Popova Olga V., Zanegina Olga N., Vyssokikh Mikhail Y., Spiridonov Sergei E., Aleoshin Vladimir V., Panchin Yuri V.
    • НИИ физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Россия

• Диссертация

  • • 2016 Сравнительная характеристика структур ДНК-белковых комплексов
    • Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
    • Автор: Занегина О.Н., к.б.н.
    • Научный руководитель: Спирин С.А., к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
    • Защищена в совете Д 002.077.04 при Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук (ИППИ РАН)
    • Организация, в которой выполнялась работа: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова"

---