ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Цели планируемой научной работы: филогенетический анализ генов рибосомных РНК 2-х видов грегарин, 1-го вида бластогрегарин и 1 вида протококцидий и построение общего филогенетического дерева споровиков с привлечением новых данных. Задачи: 1) выполнение работ по получению нуклеотидных последовательностей генов рибосомных РНК вышеназванных организмов; 2) построение нуклеотидных выравниваний; 3) выполнение филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей и построение филогенетических деревьев с помощью современных методов методами (Bayesian inference, Maximum likelihood).
Для проведения научной работы по данному проекту была использована 21 проба ДНК одноклеточных организмов, принадлежащих к базальным ветвям споровиков (Apicomplexa) и являющихся критическими для поcтроения филогении Apicomplexa (Blastogregarinea, Agamococidia, Protococcidia, Gregarinea (Lecudinoidea)). Принимая во внимание сложности с работой с ДНК паразитов (контаминация ДНК хозяев, что требует трудоёмкой и времязатратной процедуры клонирования, невозможной в столь ограниченное время) и короткий период (2 месяца), я считаю результаты данного проекта очень успешными. Получены и прочитаны нуклеотидные последовательности гена 18S рРНК 2-х видов бластогрегарин (Siedleckia spp.), 2-х видов агамококцидий (Rhytidocystis spp. ) и 2-х видов асептатных грегарин - паразитов морских беспозвоночных) (Polyrhabdina sp. из полихеты Pygospio elegans и Difficilina cf. linei из немертины Poseidon (Lineus) ruber). Из некоторых проб ДНК этих организмов были также амплифицированы фрагменты, предположительно относящиеся к их генам 28S рРНК. К сожалению, в связи с ограниченным сроком проекта, эти фрагменты пока не удалось прочитать и идентифицировать. Кроме того получены гетерогенные фрагменты генов 18S рРНК из проб ДНК ещё одной агамококцидии и 2-х видов протококцидий, которые требуют клонирования. Таким образом, хотя по уже полученным ценным данным запланированы доклады на международных конференциях и написание статей в ведущие протозоологические журналы, требуется дальнейшая обширная работа по изучению нуклеотидных последовательностей всех вышеуказанных организмов.
грант РФФИ |
# | Сроки | Название |
1 | 15 октября 2015 г.-15 декабря 2015 г. | Молекулярно-филогенетические исследования низших споровиков (Apicomplexa): грегарин, бластогрегарин и протококцидий |
Результаты этапа: |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".