![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
В работе впервые был проведён скрининг библиотеки соединений относительно структуры септина 9 (SEPT9) с целью поиска вещества, предотвращающего процесс полимеризации септиновых филаментов. В результате было отобрано соединение Процианидин В3, которое в in vitro экспериментах снижало формирование септиновых филаментов, а также подавляло процессы пролиферации клеток рака груди (MDA-MB-231), но не крысиных фибробластов (REF_52). Также было впервые показано, что короткая форма виментина (ULF — unit-length filament) участвует в поддержании локальной жёсткости на переднем крае клетки и направленной миграции клеток. В работе предложен возможный механизм, объясняющий данное явление через сохранение взаимодействий укороченной формы виментина с плектином. Была впервые построена гомологичная структура 5 домена плектина с линкером, а также смоделирован комплекс виментина с плектином. Скрининг библиотеки соединений, направленный на поиск молекулы, блокирующей виментин-плектиновое взаимодействие, позволил идентифицировать два соединения — Амикацин и Паромомицин. В in vitro экспериментах данные соединения оказали значительное влияние на уменьшение жёсткости на лидирующем крае клеток, а также на снижение их миграционных свойств.
In this work, for the first time, a library of compounds was screened regarding the structure of septin 9 (SEPT9) in order to find a substance that prevents the polymerization of septin filaments. As a result, the compound Procyanidin B3 was selected, which in in vitro experiments reduced the formation of septin filaments and also inhibited the proliferation of breast cancer cells (MDA-MB-231), but not rat fibroblasts (REF_52). It was also shown for the first time that the short form of vimentin (ULF - unit-length filament) is involved in the maintenance of local stiffness at the cell leading edge and directed cell migration. A possible mechanism explaining this phenomenon through the preservation of interactions between the shortened form of vimentin and plektin was proposed in the work. A homologous structure of the 5 domain of plektin with a linker was constructed for the first time, as well as the complex of vimentin with plektin was modeled. Screening of the library of compounds aimed at finding a molecule blocking vimentin-plektin interaction allowed the identification of two compounds - Amikacin and Paromomycin. In in vitro experiments, these compounds had a significant effect on the reduction of stiffness at the leading edge of the cells as well as on the reduction of their migration properties.
1) Методом виртуального скрининга библиотеки соединений выбрано вещество Процианидин В3, связывающееся предположительно с высокой аффинностью с SEPT9 и препятствующее олигомеризации септиновых субъединиц; 2) Процианидин В3 in vitro снижал количество септиновых филаментов и приводил к образованию преимущественно гексамерных форм септинов; 3) Процианидин В3 дозозависимо снижал пролиферацию раковых клеток MDA-MB-231, но не крысиных фибробластов REF_52; 4) Укороченная форма виментина в виде ULF (unit-length filament) сохраняла локальную жёсткость на лидирующем крае клеток и направленность их миграции; 5) Построена модель комплекса виментина с 5 PRD доменом плектина и идентифицированы аминокислотные остатки, участвующие во взаимодействии виментина с плектином; 6) Методом виртуального скрининга библиотеки соединений выбраны вещества Амикацин и Паромомицин, связывающиеся предположительно с высокой аффинностью в области виментина, взаимодействующей с плектином; 7) Амикацин и Паромомицин не влияли на структурную организацию виментина, но уменьшали локальную жёсткость на лидирующем крае клеток, а также снижали их миграционные свойства.
грант РФФИ |
# | Сроки | Название |
1 | 1 октября 2019 г.-2 сентября 2020 г. | Изучение структуры и динамики белков цитоскелета виментина и септина - потенциальных мишеней для контроля пролиферации и миграции опухолевых клеток |
Результаты этапа: | ||
2 | 3 сентября 2020 г.-30 сентября 2021 г. | Изучение структуры и динамики белков цитоскелета виментина и септина - потенциальных мишеней для контроля пролиферации и миграции опухолевых клеток |
Результаты этапа: В работе впервые был проведён скрининг библиотеки соединений относительно структуры септина 9 (SEPT9) с целью поиска вещества, предотвращающего процесс полимеризации септиновых филаментов. В результате было отобрано соединение Процианидин В3, которое в in vitro экспериментах снижало формирование септиновых филаментов, а также подавляло процессы пролиферации клеток рака груди (MDA-MB-231), но не крысиных фибробластов (REF_52). Также было впервые показано, что короткая форма виментина (ULF — unit-length filament) участвует в поддержании локальной жёсткости на переднем крае клетки и направленной миграции клеток. В работе предложен возможный механизм, объясняющий данное явление через сохранение взаимодействий укороченной формы виментина с плектином. Была впервые построена гомологичная структура 5 домена плектина с линкером, а также смоделирован комплекс виментина с плектином. Скрининг библиотеки соединений, направленный на поиск молекулы, блокирующей виментин-плектиновое взаимодействие, позволил идентифицировать два соединения — Амикацин и Паромомицин. В in vitro экспериментах данные соединения оказали значительное влияние на уменьшение жёсткости на лидирующем крае клеток, а также на снижение их миграционных свойств. |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".