Поиск новых ненуклеозидных антиретровирусных препаратов и изучение подходов к созданию их инъекционных депо-форм на основе микросфер PLGA с применением математического анализа кинетики высвобожденияНИР

Search for new non-nucleoside antiretroviral drugs and study approaches to creating their depot injections based on PLGA microspheres using mathematical analysis of release kinetics

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 3 марта 2020 г.-31 декабря 2020 г. Поиск новых ненуклеозидных антиретровирусных препаратов и изучение подходов к созданию их инъекционных депо-форм на основе микросфер PLGA с применением математического анализа кинетики высвобождения
Результаты этапа: План работ на 2020 г. по выполнению проекта включал в себя синтез производных ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы из группы диарилпиримидинов – рилпивирина, доказательство строения полученных соединений на основании современных физико-химических методов анализа, оптимизация основных стадий синтеза, изучение возможности использования производных диарилпиримидинов в реакции аза-Коупа-Манниха и определение влияния условий проведения реакции аза-Коупа-Манниха (температура, растворитель, природа и количество кислоты Льюиса или Брёнстеда) на стереохимический результат. Дополнительно, планировали изучить противовирусную активность полученных производных диарилпиримидинов в отношении вирусных ферментов и установить влияние природы заместителей в пиримидиновом ядре на противовирусную активность. В ходе выполнения первого этапа работы были также запланированы: разработка и оптимизация методов получения микросфер на основе PLGA, содержащих рилпивирин как модельное соединение, установление влияния параметров процесса получения на основные характеристики депо-форм, нагруженных рилпивирином, выбор оптимального метода получения полилактидных микросфер, нагруженных рилпивирином; анализ физико-химических свойств микросфер PLGA, нагруженных рилпивирином (размер, распределение по размерам, морфология поверхности, содержание рилпивирина, эффективность включения); изучение кинетики высвобождения рилпивирина из полученных микросфер in vitro в различных средах, установление влияния различных факторов (в том числе размер микросфер, распределение по размерам, степень включения) на профили высвобождения in vitro. Идея синтеза производных диарилпиримидинов с пирролидиновым фрагментом была основана на возможности использования в качестве основных строительных блоков производных 6-карбальдегиддиарилпиримидинов и 1-аминобут-3-ен-2-олов, которые можно задействовать в тандеме реакций аза-перегруппировки Коупа и реакции Манниха, что позволяет получить сфокусированную библиотеку новых диарилпиримидинов из коммерчески доступных веществ в минимальное количество стадий с использованием минимального количества хроматографических очисток. Ключевыми стадиями данного подхода явились: синтез производных 6-карбальдегиддиарилпиримидина (9 стадий с суммарным выходом 3%-4%), синтез производных 1-аминобут-3-ен-2-ола и итоговый синтез производных 6-(пирролидин-2-ил) диарилпиримидина с использованием стереоселективного тандема реакций аза-перегруппировки Коупа и Манниха. Простота всех стадий синтеза позволила получать производные диарилпиримидина в граммовых количествах (виде рацемата) и открывает широкие возможности для синтеза производных диарилпиримидина (в том числе, и в энантиомерно чистой форме). На первом этапе нашей работы был осуществлен пяти стадийный синтез рилпивирина (РПВ), который был получен в виде смести E- и Z-изомеров (в соотношении 5:1) в граммовых количествах. Далее нами были разработаны две методики получения микросфер PLGA, нагруженных рилпивирином: путем эмульгирования с помощью диспергатора и с применением микрофлюидной технологии. Было показано, что увеличение массового отношения РПВ:PLGA приводит к увеличению содержания РПВ в микросферах. Было установлено, что добавление ДМСО в органическую фазу снижает эффективность включения рилпивирина в полилактидную матрицу (ЕЕ 78% против ЕЕ 95% без добавления ДМСО) и приводит к изменению формы частиц. Наилучшим, с точки зрения размеров частиц, степени полидисперсности и эффективности включения РПВ, для получения полилактидных микросфер, нагруженных рилпивирином, является микрофлюидный метод, а микросферы, полученные микрофлюидным методом, демонстрируют существенно более медленное высвобождение РПВ по сравнению с микросферами, полученными методом простых эмульсий. Мы показали, что увеличение кислотности среды приводит к ускоренному высвобождению РПВ из микросфер, полученных методом простых эмульсий, и не влияет на профиль высвобождения РПВ из микросфер, полученных микрофлюидным методом. Важно отметить, что в ходе выполнения первого этапа работы нами была показана возможность использования метода КЭ для качественного и количественного определения РПВ в исследуемых образцах. Также нами была показана принципиальная возможность синтеза 4-((2-((4-цианофенил)амино)-6-формилпиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметилбензонитрила – ключевого соединения, необходимого для осуществления синтеза производных диарилпиримидинов с пирролидиновым фрагментом с использованием тандема реакций аза-перегруппировки Коупа и реакции Манниха. На следующем этапе работы мы изучили взаимодействие 4-((2-((4-цианофенил)амино)-6-формилпиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметилбензонитрила с 1-амино-2,3-диметилбут-3-ен-2-ола (был получен в три стадии из ацетона с общим выходом 53%). В результате сигматропной перегруппировки был получен целевой продукт - 4-((6-(4-ацетил-4-метилпирролидин-2-ил)-2-((4-цианофенил)амино)пиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметил-бензонитирил. Важным моментом данного этапа работы стало изучение влияния различных факторов (природа растворителя, температурный режим, природа катализатора) на выход продукта реакции, также были установлены основные закономерности, влияющие на стереоселективность реакции. Относительная конфигурация 4-((6-(4-ацетил-4-метилпирролидин-2-ил)-2-((4-цианофенил)амино)пиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметил-бензонитирила была доказана с помощью суммирования данных полученных из экспериментов ЯМР 1H, 13C, APT (Attached Proton Test), HMQC (Heteronuclear Multiple-Quantum Correlation), COSY (Correlation Spectroscopy) и NOESY (Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy). Список литературы: 1. Belov D.S., Lukyanenko E.R., Kurkin A. V., Yurovskaya M. A., Highly stereoselective and scalable synthesis of trans-fused octahydrocyclohepta[b]pyrrol-4(1H)-ones via the aza-Cope−Mannich rearrangement in racemic and enantiopure forms. // J. Org. Chem., 2012, 77 (22), 10125–10134. 2. Usach I., Melis V., Peris J.-E. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors: a review on pharmacokinetics, pharmacodynamics, safety and tolerability. // Journal of the International AIDS Society. – 2013. – Vol. 16, № 1. ‒ P. 1–14. 3. Natarajan S. et al. Atropisomerism in Rilpivirine hydrochloride: Spectroscopic characterization of Rilpivirine and related impurities // Chirality. – 2018. – Vol. 30, № 8. ‒ P. 966–973. 4. Else L.J. et al. Quantification of rilpivirine in human plasma, cervicovaginal fluid, rectal fluid and genital/rectal mucosal tissues using liquid chromatography-tandem mass spectrometry // Bioanalysis. – 2014. – Vol. 6, № 14. ‒ P. 1907–1921. 5. Kumar K.R., Suneetha A., Srilakshmi N. A validated LC Method for the Estimation of Rilpivirine in API and Pharmaceutical Dosage form // Journal of Pharmacy Research. – 2012. – Vol. 5, № 8. ‒ P. 4434–4436. 6. Date A.A. et al. Development and validation of a simple and isocratic reversed-phase HPLC method for the determination of rilpivirine from tablets, nanoparticles and HeLa cell lysates // Biomedical Chromatography. – 2015. – Vol. 29, № 5. ‒ P. 709–715. 7. Shibata M. et al. Development and application of a simple LC-MS method for the determination of plasma rilpivirine (TMC-278) concentrations // Journal of Medical Investigation. – 2013. – Vol. 60, № 1–2. ‒ P. 35–40. 8. ОФС.1.1.0008.15. Остаточные органические растворители [Electronic resource] // Государственная фармакопея Российской Федерации. XIII изд. Т. I. URL: https://pharmacopoeia.ru/ofs-1-1-0008-15-ostatochnye-organicheskie-rastvoriteli/ (accessed: 20.12.2020). 9. Гребёнкин Д.Ю., Станишевский Я.М., Шохин И.Е. Современные подходы к проведению сравнительного теста кинетики растворения (обзор) // Разработка и регистрация лекарственных средств. – 2016. – Vol. 1. ‒ P. 166–171. 10. Stokbroekx S.C.M. CRYSTALLINE FORM OF 4-4-4-(2-CYANOETHENYL)-2,6-DIMETHYLPHENYL-AMINO-2-PYRIMIDINYLAMINOBENZONITRILE: pat. 2010/0189796 A1 USA. US, – 2010. 11. Watanabe T., Ono T., Kimura Y. Continuous fabrication of monodisperse polylactide microspheres by droplet-to-particle technology using microfluidic emulsification and emulsion-solvent diffusion // Soft Matter. – 2011. – Vol. 7, № 21. ‒ P. 9894–9897. 12. Ульянова Ю.В. et al. ВЛИЯНИЕ ПАРАМЕТРОВ МИКРОФЛЮИДНОГО ПРОЦЕССА НА ХАРАКТЕРИСТИКИ МИКРОСФЕР НА ОСНОВЕ ВЫСОКОМОЛЕКУЛЯРНОГО СОПОЛИМЕРА МОЛОЧНОЙ И ГЛИКОЛЕВОЙ КИСЛОТ // Успехи в химии и химической технологии. – 2019. – Vol. 33, № 3(213). ‒ P. 44–46.
2 1 января 2021 г.-31 декабря 2021 г. Поиск новых ненуклеозидных антиретровирусных препаратов и изучение подходов к созданию их инъекционных депо-форм на основе микросфер PLGA с применением математического анализа кинетики высвобождения
Результаты этапа: План работ на 2021 г. по выполнению проекта включал в себя продолжение работ по синтезу производных рилпивирина, было проведено доказательство строения полученных соединений, входящих в состав сфокусированной библиотеки малых молекул, на основании современных физико-химических методов анализа, была проведена оптимизация основных стадий синтеза, изучение возможности использования производных диарилпиримидинов в тандемных реакциях и изучено пространственное строение синтезированных молекул. Дополнительно, был проведен молекулярный докинг базы синтезированных соединений, изучены основные критерии связывания молекул в сайте обратной транскриптазы. Все полученные соединения были направлены в ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора для изучения противовирусной активности в отношении вирусных ферментов. В ходе выполнения второго этапа работы были разработаны и оптимизированы методы получения микросфер на основе PLGA, содержащих рилпивирин как модельное соединение, установлены параметры процесса получения микросфер, влияющие на на основные характеристики депо-форм, нагруженных рилпивирином, был проведен выбор оптимального метода получения полилактидных микросфер, нагруженных рилпивирином; проанализированы физико-химические свойства микросфер PLGA, нагруженных рилпивирином (размер, распределение по размерам, морфология поверхности, содержание рилпивирина, эффективность включения); изучена кинетика высвобождения рилпивирина из полученных микросфер in vitro в различных средах, установлено влияние различных факторов (в том числе размер микросфер, распределение по размерам, степень включения) на профили высвобождения in vitro. Идея синтеза производных диарилпиримидинов с пирролидиновым фрагментом была основана на возможности использования в качестве основных строительных блоков производных 6-карбальдегиддиарилпиримидинов и 1-аминобут-3-ен-2-олов, которые можно задействовать в тандеме реакций аза-перегруппировки Коупа и реакции Манниха, что позволяет получить сфокусированную библиотеку новых диарилпиримидинов из коммерчески доступных веществ в минимальное количество стадий с использованием минимального количества хроматографических очисток. Ключевыми стадиями данного подхода явились: синтез производных 6-карбальдегиддиарилпиримидина (9 стадий с суммарным выходом 3%-4%), синтез производных 1-аминобут-3-ен-2-ола и итоговый синтез производных 6-(пирролидин-2-ил) диарилпиримидина с использованием стереоселективного тандема реакций аза-перегруппировки Коупа и Манниха. Простота всех стадий синтеза позволила получать производные диарилпиримидина в граммовых количествах (виде рацемата) и открывает широкие возможности для синтеза производных диарилпиримидина (в том числе, и в энантиомерно чистой форме). Относительная конфигурация 4-((6-(4-ацетил-4-метилпирролидин-2-ил)-2-((4-цианофенил)амино)пиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметил-бензонитирила была доказана с помощью суммирования данных полученных из экспериментов ЯМР 1H, 13C, APT (Attached Proton Test), HMQC (Heteronuclear Multiple-Quantum Correlation), COSY (Correlation Spectroscopy) и NOESY (Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy). Список литературы: 1. Belov D.S., Lukyanenko E.R., Kurkin A. V., Yurovskaya M. A., Highly stereoselective and scalable synthesis of trans-fused octahydrocyclohepta[b]pyrrol-4(1H)-ones via the aza-Cope−Mannich rearrangement in racemic and enantiopure forms. // J. Org. Chem., 2012, 77 (22), 10125–10134. 2. Usach I., Melis V., Peris J.-E. Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors: a review on pharmacokinetics, pharmacodynamics, safety and tolerability. // Journal of the International AIDS Society. – 2013. – Vol. 16, № 1. ‒ P. 1–14. 3. Natarajan S. et al. Atropisomerism in Rilpivirine hydrochloride: Spectroscopic characterization of Rilpivirine and related impurities // Chirality. – 2018. – Vol. 30, № 8. ‒ P. 966–973. 4. Else L.J. et al. Quantification of rilpivirine in human plasma, cervicovaginal fluid, rectal fluid and genital/rectal mucosal tissues using liquid chromatography-tandem mass spectrometry // Bioanalysis. – 2014. – Vol. 6, № 14. ‒ P. 1907–1921. 5. Kumar K.R., Suneetha A., Srilakshmi N. A validated LC Method for the Estimation of Rilpivirine in API and Pharmaceutical Dosage form // Journal of Pharmacy Research. – 2012. – Vol. 5, № 8. ‒ P. 4434–4436. 6. Date A.A. et al. Development and validation of a simple and isocratic reversed-phase HPLC method for the determination of rilpivirine from tablets, nanoparticles and HeLa cell lysates // Biomedical Chromatography. – 2015. – Vol. 29, № 5. ‒ P. 709–715. 7. Shibata M. et al. Development and application of a simple LC-MS method for the determination of plasma rilpivirine (TMC-278) concentrations // Journal of Medical Investigation. – 2013. – Vol. 60, № 1–2. ‒ P. 35–40. 8. ОФС.1.1.0008.15. Остаточные органические растворители [Electronic resource] // Государственная фармакопея Российской Федерации. XIII изд. Т. I. URL: https://pharmacopoeia.ru/ofs-1-1-0008-15-ostatochnye-organicheskie-rastvoriteli/ (accessed: 20.12.2020). 9. Гребёнкин Д.Ю., Станишевский Я.М., Шохин И.Е. Современные подходы к проведению сравнительного теста кинетики растворения (обзор) // Разработка и регистрация лекарственных средств. – 2016. – Vol. 1. ‒ P. 166–171. 10. Stokbroekx S.C.M. CRYSTALLINE FORM OF 4-4-4-(2-CYANOETHENYL)-2,6-DIMETHYLPHENYL-AMINO-2-PYRIMIDINYLAMINOBENZONITRILE: pat. 2010/0189796 A1 USA. US, – 2010. 11. Watanabe T., Ono T., Kimura Y. Continuous fabrication of monodisperse polylactide microspheres by droplet-to-particle technology using microfluidic emulsification and emulsion-solvent diffusion // Soft Matter. – 2011. – Vol. 7, № 21. ‒ P. 9894–9897. 12. Ульянова Ю.В. et al. ВЛИЯНИЕ ПАРАМЕТРОВ МИКРОФЛЮИДНОГО ПРОЦЕССА НА ХАРАКТЕРИСТИКИ МИКРОСФЕР НА ОСНОВЕ ВЫСОКОМОЛЕКУЛЯРНОГО СОПОЛИМЕРА МОЛОЧНОЙ И ГЛИКОЛЕВОЙ КИСЛОТ // Успехи в химии и химической технологии. – 2019. – Vol. 33, № 3(213). ‒ P. 44–46.
3 1 января 2022 г.-31 декабря 2022 г. Поиск новых ненуклеозидных антиретровирусных препаратов и изучение подходов к созданию их инъекционных депо-форм на основе микросфер PLGA с применением математического анализа кинетики высвобождения
Результаты этапа: План работ на 2022 г. по выполнению проекта включал в себя продолжение работ по синтезу производных рилпивирина, модифицированных по 5-му (или 6-му) положению диарилпиримидинового ядра, установление строения полученных соединений, создание сфокусированной библиотеки малых молекул, разработка и оптимизация методов получения микросфер на основе PLGA, содержащих рилпивирин, установление параметров процесса получения микросфер, влияющих на основные характеристики депо-форм, нагруженных рилпивирином, выбор оптимального метода получения полилактидных микросфер, нагруженных рилпивирином; анализ физико-химических свойств микросфер PLGA, нагруженных рилпивирином (размер, распределение по размерам, морфология поверхности, содержание рилпивирина, эффективность включения); изучение кинетики высвобождения рилпивирина из полученных микросфер in vitro в различных средах, установление влияния различных факторов (в том числе размер микросфер, распределение по размерам, степень включения) на профиль высвобождения in vitro. В результате выполнения работ в 2022 г была проведена оптимизация основных стадий синтеза, изучение возможности использования производных диарилпиримидинов в тандемных реакциях и изучено пространственное строение синтезированных молекул. Дополнительно, был проведен молекулярный докинг базы синтезированных соединений, изучены основные критерии связывания молекул в сайте обратной транскриптазы. Ряд перспективных соединений был протестирован на противовирусную активность в ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора в отношении вирусных ферментов. Идея синтеза производных диарилпиримидинов с пирролидиновым фрагментом была основана на возможности использования в качестве основных строительных блоков производных 6-карбальдегиддиарилпиримидинов и 1-аминобут-3-ен-2-олов, которые можно задействовать в тандеме реакций аза-перегруппировки Коупа и реакции Манниха, что позволяет получить сфокусированную библиотеку новых диарилпиримидинов из коммерчески доступных веществ в минимальное количество стадий с использованием минимального количества хроматографических очисток. Ключевыми стадиями данного подхода явились: синтез производных 6-карбальдегиддиарилпиримидина (9 стадий с суммарным выходом 3%-4%), синтез производных 1-аминобут-3-ен-2-ола и итоговый синтез производных 6-(пирролидин-2-ил) диарилпиримидина с использованием стереоселективного тандема реакций аза-перегруппировки Коупа и Манниха. Простота всех стадий синтеза позволила получать производные диарилпиримидина в граммовых количествах (виде рацемата) и открывает широкие возможности для синтеза производных диарилпиримидина (в том числе, и в энантиомерно чистой форме). Относительная конфигурация 4-((6-(4-ацетил-4-метилпирролидин-2-ил)-2-((4-цианофенил)амино)пиримидин-4-ил)окси)-3,5-диметил-бензонитирила была доказана с помощью суммирования данных полученных из экспериментов ЯМР 1H, 13C, APT (Attached Proton Test), HMQC (Heteronuclear Multiple-Quantum Correlation), COSY (Correlation Spectroscopy) и NOESY (Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy).

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".