Таксономические и филогенетические взаимоотношения рукокрылых (Chiroptera, Mammalia) востока АзииНИР

Taxonomic and phylogenetic relationships of bats (Chiroptera, Mammalia) on the east of Asia

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2022 г.-31 декабря 2022 г. Таксономические и филогенетические взаимоотношения рукокрылых (Chiroptera, Mammalia) востока Азии
Результаты этапа: Для видов группы Myotis muricola проанализированы 2 митохондриальных и семь ядерных генов. Митохондриальные маркеры разделяют M. muricola и M. ater, а также M. ater с материка и с островов достаточно надежно. Дистанции между M. muricola и M. ater составляют около 5%. По данным конкатената семи ядерных маркеров M. ater и M. muricola образуют отдельные группы, хотя для M. muricola значения по ML немного не достигают уровня значимости. Отдельно взятые ядерные маркеры при таком уровне дивергенции ожидаемо не разграничивают рассматриваемые виды. Данные морфометрии черепа и зубов (20 промеров) показывают разделение M. muricola и M. ater на уровне, ожидаемом для близких видов. Несколько экземпляров неопределенной таксономической принадлежности с Борнео, Сулавеси и Молукских островов, по-видимому, не принадлежат ни к одному из двух обсуждаемых видов. Дискиминантный анализ разделяет выборки M. muricola и M. ater ожидаемо лучше, чем метод Главных компонент: эти виды оказываются разделены значениями первой Канонической переменной, при этом вторая Каноническая переменная почти без перекрывания отделяет материковых и островных M. ater. В целом результаты морфометрического анализа согласуются с мнением о видовой самостоятельности M. muricola, M. cf. ater из материковой Азии и M. ater с островов Австралазии. Разделение этих выборок достоверно, тогда как разные географические выборки M. muricola широко перекрываются и не имеют достоверных различий. Различия между материковыми и островными M. ater должны быть изучены более детально: по-видимому, материковую Азию населяет еще не описанный таксон. Филогеография Myotis longicaudatus рассмотрена на основании 52 последовательностей гена cytb и позволяет выделить три незначительно различающихся кластера, распространённые в Сибири и Прибайкалье; на Дальнем Востоке; и на Сахалине, Кунашире и Японских островах, соответственно. Они приблизительно соответствуют трём традиционно выделяемым подвидам. Филогеографический паттерн M. sibiricus также обнаруживает 3 гаплогруппы, в целом сходные по распространению с гаплогруппами M. longicaudatus: сибирская, дальневосточно-амурская и островная. Зона контакта первых двух гаплогрупп расположена в западном Забайкалье. По данным гена CR, у M. petax выявлено пять гаплогрупп, четыре из которых материковые. В целом, у трех видов ночниц есть определенная общность филогеографической структуры: для все характерно существование особой островной и «Сибирской» гаплогрупп. Дистанции между гаплогруппами и число выявленных гаплотипов у M. sibirica и M. petax больше, чем у M. longicaudatus (41 гаплотип cytb у M. sibiricus против 20 у M. longicaudatus), что, вероятно, связано с более поздним расселением последней. Внутривидовая изменчивость с пропорциях черепа у M. longicaudatus выражена сравнительно слабо. Тем не менее, несмотря на широкое перекрывание, заметна тенденция к разделению общей выборки в пространстве двух первых Главных компонент на «восточную» (longicaudatus и kaguyae) и «западную» (eniseensis). Животные с Сахалина и Кунашира определенно принадлежат к «восточной» расе. Для расчета квадратов дистанций Махаланобиса и апостериорных вероятностей было выделено пять географических выборок. Между этими выборками перекрывание также присутствует, однако недостоверными (p>0.1) оказываются только различия между двумя выборками из разных частей Хонсю; наибольшие отличия демонстрирует выборка «Сибирь». Для установления филогенетических отношений в роде Pipistrellus и между ним и близкими родами получены последовательности двух митохондриальных и трех ядерных генов. Топологии деревьев, полученные по митохондриальным генам демонстрируют разделение нетопырей в современном понимании на «восточную» и «западную» клады и парафилию этих двух клад относительно родов Nyctalus и Glischropus. Топологии деревьев, построенных по конкатенату трех ядерных генов, показали высокие поддержки для клады Pipistrellina в узком смысле (Pipistrellus+Nyctalus+ Glischropus). Та, в свою очередь, разделяется на две клады следующего порядка, одна из которых включает «западные» виды нетопырей (группы видов «pipistrellus», «kuhlii» и «nathusii») и род Nyctalus, а вторая – «восточные» виды нетопырей (группы видов «javanicus» и «stenopterus») и род Glischropus. Положение Nyctalus неоднозначно: на разных реконструкциях они могут объединяться с группой видов «nathusii» или формировать неразрешимую трихотомию Nyctalus – группа «nathusii» – группы «pipistrellus»+«kuhlii». В «восточной» кладе на всех реконструкциях род Glischropus занимает базальное положение. Все включенные в анализ «восточные» нетопыри формируют хорошо поддержанную монофилетическую группу. При этом базальное положение в ней занимает P. abramus, а не морфологически обособленный P. stenopterus. Значение генетических p-дистанций между «восточными» и «западными» нетопырями выше, чем между этим кладами и родами Glishropus и Nyctalus. Таким образом, род Pipistrellus в современном понимании безусловно парафилетичен относительно родов Nyctalus и Glischropus, более того, генетическая линия морфологически обособленных Nyctalus с высокой вероятностью располагается внутри «западной» клады Pipistrellus. Результаты нашего анализа показывают, что, вероятно, в подтрибе Pipistrellina имели место два параллельных процесса дивергенции в двух центрах происхождения: Европе (где известны среднемиоценовые Pipistrellus и Nyctalus) и в тропической Азии. Вероятно, из Европы нетопыри группы «kuhlii» в дальнейшем проникли в Африку к югу от Сахары, а вечерницы – вдоль горных систем в Восточную Азию. Внутри «восточной» клады нетопырей наш анализ показывает полифилетическую природу Pipistrellus javanicus. На территории Вьетнама существует по крайней мере две генетические линии, традиционно относимые к P. javanicus: одна – в равнинной части юга страны, вторая, генетически близкая к P. paterculus – на Центральном нагорье и в на севере Вьетнама. Для азиатских длиннокрылов комплекса M. fuliginosus /magnater был осуществлен морфометрический анализ 21 черепного признака. Результаты анализа методом Главных компонент разделяют эти трудноразличимые виды почти без перекрывания. Разделение M. magnater от M. fuliginosus идет главным образом по значениям первого фактора, а выборки M. fuliginosus из разных частей ареала хотя и широко перекрываются, однако имеют заметную тенденцию к разделению по значениям других факторов, что может свидетельствовать о реальности выделяемых подвидов. Экземпляры из вьетнамской провинция Каобанг по данным анализа оказались более близки к M. magnater. Проведенный филогенетический анализ, основанный на митохондриальном гене COI и на ядерном гене RAG2, в целом хорошо разделил M. fuliginosus и M. magnater на две родственные, но монофилетические клады. При этом экземпляры из Каобанга попадают в кладу fuliginosus. Такое несоответствие между молекулярными и морфологическими данными может быть следствием гибридного происхождения популяции из Каобанга.
2 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. Таксономические и филогенетические взаимоотношения рукокрылых (Chiroptera, Mammalia) востока Азии
Результаты этапа: Был получен полный митогеном Glischropus bucephalus, имеющий общую длину 17023 п.н. и состоящий из 13 белок-кодирующих генов (PCG), 22 генов тРНК и 2 ренов рРНК. В целом по своей длине и структуре он сходен с опубликованными митогеномами Pipistrellus spp. и Nyctalus spp. При реконструкции филогенетических отношений на основании полных последовательностей всех mtPCG, триба Pipistrellini (с родами Pipistrellus, Nyctalus и Glischropus), ее ассоциация с Vespertilionini и наличие в ней двух основных клад имеют максимальную поддержку. G. bucephalus принадлежит к «восточной» кладе, делая, как и в других анализах, род Pipistrellus парафилетическим. Исходный сет ядерных маркеров был дополнен геном THY. Как и прочие вовлеченные в анализ ядерные гены, THY не дает удовлетворительного разделения видов внутри группы «javanicus», но при этом выделяет все ранее отмеченные нами надвидовые таксоны. Кокатенат четырех ядерных генов позволяет получить достаточно высокие поддержки как для надвидовых таксонов, так и для большинства видов, в том числе и для предполагаемого нового вида из центрального и северного Вьетнама. По митохондриальным генам были генотипированы экземпляры P. ceylonicus, положение которых на филогенетическом дереве однозначно подтверждает их принадлежность к группе видов «javanicus». Для придания группам нетопырей, выделяемым при помощи молекулярных маркеров, таксономического статуса, были исследованы качественные признаки зубной системы и морфометрия черепа. Качественные признаки зубной системы включают степень выраженности дополнительных вершин на резцах, соотношение высоты первого и второго резцов, форму клыка, размеры и положение малого предкоренного зуба, степень развития выступа на передне-внутреннем крае большого предкоренного, развитие на коренных зубах гипокона и постпротокристы. На уровне отдельных видов либо комплекксов близких видов эти признаки в совокупности работают достаточно хорошо, формируя специфические синдромы, в том числе позволяющие отличить предполагаемый неописанный вид из Юго-Восточной Азии. В то же время провести по какому-либо из этих признаков или по их совокупности четкую границу между всеми «западными» и всеми «восточными» нетопырями не представляется возможным. В факторном анализе со включением максимального числа видов (кроме P. stenopterus), «западные» P. kuhlii и P. pipistrellus несколько обособлены от основного «облака», но не образуют единого кластера ни друг с другом, ни с P. nathusii. Отдельные кластеры формируют P. ceylonicus (включая P. raptor) и P. mimus; все остальные виды (включая неродственного P. nathusii) широко перекрываются. Анализ редуцированной выборки (только «восточные» нетопыри, без P. ceylonicus) демонстрирует наличие определенных видоспецифических различий внутри клады. Хотя перекрывания отдельных облаков присутствуют, для части видов они минимальны. В дискриминантном анализе все виды, взятые в качестве обучающих выборок демонстрируют достоверные различия. В обоих анализах выборка нового вида из Индокитая достаточно хорошо обособлена от родственных таксонов. Добавление новых данных и повторный их анализ в ходе подготовки статьи не выявили значимых отличий от ранее установленной филогеографической структуры длиннохвостой ночницы, Myotis longicaudatus. Две основные гаплогруппы в целом согласуются с данными морфометрии (данные прошлого года), а модели ареалов, реконструированные на основании оптимальных факторов среды, у этих гаплогрупп отличаются, немного перекрываясь лишь с среднем течении Амура и на Хингане. Филогеографический паттерн восточной ночницы, M. petax позволяет выделить пять гаплогрупп, из которых четыре (корейская, охотская, амурская и сибирская) – материковые, и одна гаплогруппа распространена на Кунашире и, вероятно, на Хоккайдо. Южный Сихоте-Алинь и предгорья Чёрных гор населены преимущественно сибирской гаплогруппой, а охотские гаплотипы распространены здесь мозаично. «Анклава» сибирской гаплогруппы в Приморье удалён от её основного ареала более чем на 1800 км, что говорит о существовавшей связи между ними в прошлом. При этом на территории Даурских степей сибирская гаплогруппа не обитает. Вероятно, в южном Приморье ранее преобладала охотская гаплогруппа, но затем была оттеснена до центрального Сихотэ-Алиня в процессе расселения сибирской гаплогруппы. Данные о зонах контакта разных гаплогрупп выявляют ключевые регионы для потока генов между популяциями M. petax. Для сравнения с бореальными видами был рассмотрен филогеографический паттерн тропического вида Myotis muricola. Показано, что, отличие от бореальных видов, распределение гаплотипов не имеет выраженной географической приуроченности. Можно предположить, что, в условиях тропической Азии географические барьеры внутри материка не особо влияли на динамику распространения вида, а основное разделение обеспечивала высотная составляющая, разделявшая равнинные популяции (приуроченные к субэкваториальному и тропическому климату) от горных (субтропических). В рамках изучения границ видов у ночниц комплекса Myotis muricola/ater завершен начатый в прошлом году анализ генетических данных, показавший, что эти таксоны представляют собой разные, хоть и близкородственные виды (р-дистанция по 6 ядерным маркерам составила около 0.0065), а также что материковые и островные M. ater также, по-видимому, представляют собой самостоятельные таксоны. Был фиксирован лектотип M. ater и его типовая территория (о. Тернате, Индонезия). Митохондриальные гены хорошо разделяют M. fuliginosus и M. magnater: средние дистанции между кладами составили 6.0% для cytb и 6.85% для COI. При этом экземпляры из провинции Каобанг однозначно определяются как M. fuliginosus. Данные по ядерным генам этому по крайней мере не противоречат. PC-анализ на увеличенной выборке показывает неплохое разделение M. fuliginosus и M. magnater, и экземпляры из провинции Каобанг определенно тяготеют к ко второму. По данным дискриминантного анализа из трех измеренных экземпляров из провинции Каобанг два ассоциируются с M. magnater, хоть и лежат на графике за пределами распределения особей этого вида, тогда как третий по значениям квадратов дистанций Махаланобиса занимает промежуточное положение. Примечательно, что эти экземпляры по результатам морфометрического анализа хоть и тяготеют к M. magnater, все же не идентичны ему, а занимают в некотором смысле промежуточное положение.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".