|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Влияние соединений, обладающих геропротекторными свойствами, на единичные биомакромолекулы, модельные объекты и организм человекаНИР
The influence of compounds with geroprotective properties on single biomacromolecules, model objects and the human body
- Руководитель НИР: Зверева М.Э.
- Ответственные исполнители: Бачева А.В., Сергеев А.В., Тишков В.И., Хренова М.Г.
- Участники НИР: Алексеева А.А., Атрошенко Д.Л., Белов В.В., Ворожцова Е.И., Гасанов Т.Н., Готманова Н.Н., Евдакова А., Ерёмин А.А., Кривицкая А.В., Кулакова А.М., Леонова М.С., Малышев Д.П., Мирошниченко К.Д., Мулашкина Т.И., Петров А.С., Писарев Э.К., Поляков И.В., Савин С.С., Свеженцева Г.А., Сергеев А.В., Субач М.Ф., Тишков В.И., Хренова М.Г., Широкова А.А., кисиль о.В.
- Подразделение: Химический факультет
- Срок исполнения: 16 августа 2024 г. - 28 декабря 2024 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 13 К
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Живые системы, медицинские технологии, медицинская химия и новые лекарственные средства
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
- Критическая технология России: Геномные, протеомные и постгеномные технологии
-
Рубрики ГРНТИ:
- 31.23.27 Пептиды, белки
- 31.23.29 Нуклеиновые кислоты и их компоненты
- 31.27.17 Энзимология
-
Ключевые слова:
молекулярное моделирование, ферменты, секвенирование, эффекторы, одномолекулярный анализ, геропротекторы, внеклеточная днк, эпигенетика, «часы старения», модификации нуклеотидов
single molecule analysis, geroprotectants, sequencing, ‘aging clock’, effectors, nucleotide modifications, epigenetics, molecular modelling, enzymes, extracellular dna -
Описание:
Создание методами генетической инженерии модельных белков для разработки методологии оценки функциональной активности единичных объектов; оценка ландшафта внутриклеточных мишеней белковой природы и нацеленных на них антивозрастных и потенциальных геропротективных соединений, для выявления наиболее перспективных мишеней и агентов; определение возможности разработки системы оценки биологического возраста на основе анализа состава внеклеточной ДНК плазмы крови
-
Планируемые результаты:
Генно-инженерная конструкция стабильного модельного цитохрома Р450, устойчивого к действию компонентов крови Набор полноатомных трехмерных структур белковой мишени в присутствии и отсутствии низкомолекулярных эффекторов. Протокол анализа на присутствие 5-метил-цитозина, 6-метиладенина, 5-гидроксиметилцитозина.
-
Научный задел:
Ранее в коллективе-заявителе были разработаны протоколы безамплификационного секвенирования ДНК на уровне единичных молекул. Отработаны и активно используются современные методы суперкомпьютерного молекулярного моделирования для исследования белковых систем, в том числе методы квантовой механики/молекулярной механики для расчетов профилей потенциальной энергии и методы молекулярной динамики для расчетов профилей энергии Гиббса. Имеется большой опыт по клонированию генов ФДГ из разных источников и их экспреcсии в клетках E.coli в активной и растворимой форме, а также создание гибридных белковых молекул методами генной инженерии.
-
Основные результаты:
Генно-инженерная конструкция стабильного модельного цитохрома Р450, устойчивого к действию компонентов крови будет создана в виде плазмиды, кодирующей ген цитохрома Р450 ВМ3, слитый с термостабильной формиатдегидрогеназой, устойчивой к протеолизу. Экспрессируемый белок должен обладать стабильностью при хранении и сохранять активность в присутствии компонентов крови. Отбор мишеней будет проводиться на основании анализа литературы и имеющихся экспериментальных данных по трехмерным структурам белков/белковых комплексов. Для молекулярного моделирования будут созданы и подготовлены полноатомных трехмерных моделей отобранных белков-мишеней в присутствии и отсутствии низкомолекулярных эффекторов Для создания протокола анализа будет проведено тестовое нанопоровое секвенирование модельной и/или внеклеточной (вк)ДНК, будут подобраны условия пробоподготовки (вк)ДНК, проверено распределение модельной ДНК и/или вкДНК по длинам фрагментов и выбран алгоритм анализа данных.
- Добавил в систему: Зверева Мария Эмильевна
Источник финансирования НИР
| Хоздоговор, хоздоговор |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 16 августа 2024 г.-30 сентября 2024 г. | Влияние соединений, обладающих геропротекторными свойствами, на единичные биомакромолекулы, модельные объекты и организм человека |
| Результаты этапа: | ||
| 2 | 1 октября 2024 г.-10 декабря 2024 г. | Влияние соединений, обладающих геропротекторными свойствами, на единичные биомакромолекулы, модельные объекты и организм человека |
| Результаты этапа: | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".