|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметриейНИР
- Руководитель НИР: Соколова О.С.
- Участники НИР: Печникова Е.В., Скурат Е.В., Соловьев А.Г., Станишнева-Коновалова Т.Б., Шабурова О.В.
- Подразделение: Кафедра биоинженерии
- Срок исполнения: 1 января 2013 г. - 31 декабря 2015 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 13-04-01326а
- Номер ЦИТИС: 01201355787
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Физико-химические основы биологии и биотехнологии
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.25.17 Морфология и физиология вирусов
- 34.57.23 Методы получения биомедицинской информации
-
Ключевые слова:
вирус штриховатой мозаики ячменя, бактериофаг, квази-атомная структура, крио-электронная микроскопия, молекулярное моделирование
-
Описание:
Проект направлен на разработку комплексного подхода для исследования биологических частиц на основе крио-электронной микроскопии высокого разрешения. Эта фундаментальная проблема является весьма актуальной, так как многие белки до сих пор не закристаллизованы и их атомная структура не известна. Для выявления молекулярных и структурных особенностей строения необходима методология, позволяющая получать квази-атомные структуры макромолекул на основе электронной микроскопии и молекулярного моделирования по гомологии. Эта задача имеет первостепенный приоритет в связи с разработкой современных крио-микроскопов и высокопроизводительных вычислительных кластеров. Конкретная задача исследования состоит в получении квази-атомных структур вирусных частиц с различной симметрией с использованием современных биофизических методов. Структура вирусных частиц будет изучена с помощью крио-электронной микроскопии. Отдельные изображения молекул будут собраны и классифицированы с использованием современных программ для анализа изображений. Качество классов будет оценено с помощью Фурье-преобразования. Лучшие классы, демонстрирующие наиболее четкие структурные характеристики, будут отобраны для построения реконструкции вирусной частицы. В результате будет рассчитана трехмерные структуры вирусных частиц с различной симметрией. Расшифровка структурной организации частиц будет произведена с помощью построения квази-атомных моделей, с использованием методов биоинформатики. Докинг атомных структур, полученных на основе структурной гомологии гомологии с имеющимися кристаллическими структурами, в электронную плотность будет производиться с применением современной методики «гибкого докинга». Определение квази-атомной структуры полноразмерных вирионов существенно расширит наши знания о структуре вирусных капсидов, обладающих спиральной и икосаэдрической симметрией и их взаимодействии с геномом. Эта новая информация будет иметь большое значение для понимания принципов организации вирусных частиц, что представляется весьма актуальным в связи с возможностью использования их в качестве структурных платформ для презентации эпитопов при разработке вакцин нового поколения.
- Добавил в систему: Соколова Ольга Сергеевна
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2013 г.-31 декабря 2013 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
| Результаты этапа: | ||
| 2 | 1 января 2014 г.-31 декабря 2014 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
| Результаты этапа: | ||
| 3 | 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. | Комплексный подход к изучению структуры вирусных частиц с различной симметрией |
| Результаты этапа: | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".