Компьютеризация биологических исследованийНИР

Источник финансирования НИР

госбюджет, раздел 0110 (для тем по госзаданию)

Этапы НИР

# Сроки Название
14 1 января 2014 г.-31 декабря 2014 г. Компьютеризация биологических исследований
Результаты этапа: Продолжалась работа с архивом профессора В.В. Налимова, которая непрерывно ведется в течение ряда лет. Она включает разбор и систематизацию материалов, создание электронных версий рукописей, их редактирование и подготовку для последующих публикаций. Значительный объем в архиве В.В. Налимова занимают материалы, систематизированные под названием «Докладные записки», часть которых связана с математизацией биологического знания. В рамках долгосрочного проекта публикации собрания сочинений В.В. Налимова подготовлена и сдана в издательство «Центр гуманитарных инициатив» книга В.В. Налимова «Разбрасываю мысли», издание 2-е, исправленное и дополненное. Книга содержит главу (140 с.) Мир как геометрия и мера. Биологический аспект глобального эволюционизма (которая в 1995 г. вышла в США отдельной книгой «Space, Time, and Life», 110 p.). Все материалы были подготовлены в электронной форме в формате нового макета, отредактированы, проверены ссылки (по источникам), сделаны необходимые исправления в переводах цитат. В настоящее время ведется вычитка верстки и составление авторского и предметного (подробного) указателей (Ж.А. Дрогалина). По материалам доклада «В.В. Налимов и российская наукометрия: история и современность» (прочитанного на пленарном заседании Международной конференции «Проблемы наукометрии: состояние и перспективы развития», проведенной в Москве 10–12 октября 2013 г.) подготовлена и сдана в печать одноименная статья. (Ж.А. Дрогалина с соавторами). В рамках работы с архивом В.В. Налимова подготовлены и сданы в печать статья – О неопубликованной статье В.В. Налимова «Вглядываясь в далекое прошлое» и ее авторе – В.В. Налимове, а также приложение к ней, содержащее вышеназванную работу В.В. Налимова. Продолжались работы по исследованию эволюции жизненного цикла человека. По материалам работы подготовлена докторская диссертация «Эволюция жизненного цикла человека: анализ глобальных данных и моделирование» (Е.В.Будилова). Были продолжены исследования по влиянию географических, климатических, экологических, демографических и социально-экономических факторов на средовую смертность и рождаемость на территории России (по данным Федеральной службы государственной статистики России за 2000-2010 гг. для 82 регионов России) с применением различных статистических методов (корреляционного, факторного, регрессионного анализа, непараметрических тестов). В частности, анализ, проведенный по разным признакам, показал, что средовая смертность положительно связана со средней температурой января, сбросом загрязненных сточных вод, числом больных алкоголизмом, числом отравлений, уровнем бедности, долей населения старше трудоспособного возраста. Отрицательно связаны со средовой смертностью средняя температура июля, среднедушевой денежный доход (скорректированный на стоимость жизни) и плотность населения (как косвенная характеристика освоенности района проживания). Используя множественный регрессионный анализ, были установлены статистические связи средовой смертности (как общей, так отдельно для мужчин и женщин) с независимыми факторами. По результатам работы опубликованы 2 статьи (Е.В.Будилова с соавторами). Продолжалась работа по исследованию эволюционно-экологических аспектов сохранения здоровья населения (совместно с Институтом социально-экономических проблем народонаселения РАН, с Мурманским государственным техническим университетом, с ЦНИИП градостроительства РААСН). В частности, сдана в печать методика оценки экологического состояния городской среды на основе характеристик резистентности организма человека (Е.В. Будилова с соавторами). Подготовлена и сдана в печать статья, в которой предложен новый методологический подход к территориальному планированию на базе показателей здоровья окружающей среды, который предполагает переход от существующей законодательно закрепленной практики территориального планирования, которая фактически сведена к отражению в градостроительной документации плановых мероприятий, на новую конструктивную основу – формирование конкурентоспособных территорий, т.е. инвестиционно и миграционно привлекательных территорий с высоким качеством среды проживания (Е.В. Будилова с соавторами). Проводились работы (совместно с кафедрой гидробиологии) по изучению пространственного распределения и состояния планктона озера Байкал в районе выпуска сточных вод Байкальского целлюлозно-бумажного комбината, а также оценки экологической значимости локального загрязнения для всего озера в целом. По результатам работы опубликованы 2 статьи (В.Д.Мятлев с соавторами). Пополнено и опубликовано учебное пособие, предназначенное для использования в той части курса «Математические методы в биологии», которая относится к вероятностно-статистическим методам обработки биологических наблюдений, предполагающим существование хотя бы мыслимого ансамбля многих серий наблюдений, как правило не существующих в практике обычных научных исследований. Использование компьютера позволяет имитировать и предъявить студенту этот ансамбль, что дает возможность понять некоторую ограниченность и условность вероятностного подхода. Учебное пособие предназначается для студентов биологических и медицинских специальностей. Начата работа по подбору, редактированию и дальнейшему наполнению примерами и упражнениями изданного учебного пособия (Ю.М.Барабашева, Г.Н.Девяткова, Е.Г.Угер). Дорабатывались материалы и вопросы, относящиеся к современной истории и методологии прикладной математики, а именно к развитию представлений о корректности применения статистических методов. Предлагаемая методология приводит к новой интерпретации базовых понятий прикладной математики, в данном случае, понятий случайности, вероятности, надежности рандомизации выборки, а также к такому взгляду на современную науку, который выходит за пределы рационализма. Такой подход осуществляется на конкретном примере, взятом из области применения статистических методов в медицине при изучении нефротоксичности ренгеноконтрастных веществ (РКВ), применяемых при ангиографии. По результатам исследований опубликована статья (Ю.М.Барабашева, Г.Н.Девяткова, Е.Г.Угер). Продолжена работа по созданию и корректировке мануала к редактору MAEditor, позволяющему специалистам по молекулярной биологии проводить индивидуальное доредактирование множественного выравнивания последовательностей (сейчас объем 264 стр. текста и иллюстраций). В настоящее время с update мануала, выложенным в Интернет, знакомятся студенты факультета биоинформатики МГУ, проходящие сейчас практику в Leiden University Medical Center, Netherlands, и пользующиеся редактором MAEditor в своей теме (Е.П.Никитина). Продолжение работы с данными (определение флуктуационной асимметрии липы мелколистной) в направлении выбора комбинированной меры информации многомерных наблюдений в соответствии с методами, представленными в обзоре Palmer A. R. Strobeck S. Продолжалась учебно-методическая работа по совершенствованию общефакультетского курса "Математические методы в биологии" для студентов 2-ого курса Биологического факультета МГУ: лекционный курс (В.Д.Мятлев); проведение семинарских и практических занятий (В.Д.Мятлев, В.С.Дуженко, Н.Г.Микешина, Е.Г.Угер). Осуществлялось техническое и информационное оснащение учебных классов (В.С.Дуженко, Н.Г.Микешина, В.Д.Мятлев, Е.Г.Угер). Продолжалась учебно-методическая работа по совершенствованию трех спецкурсов (совершенствование программы, плана лекций и семинаров) для студентов биологического ф-та: «Информатика. Математические методы в экологии», «Биометрика. Анализ многомерных данных», «Анализ данных в экологии» (В.Д.Мятлев с соавторами). Продолжалась работа (сбор и обработка методического материала) по подготовке нового спецкурса кафедры «Экология человека» (Е.В. Будилова). Продолжалась работа (совместно с Институтом проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН) по поддержанию и развитию информационного научно-образовательного портала «Фундаментальная экология» (www.sevin.ru/fundecology) (Е.В.Будилова, Н.Н.Жигарева). Продолжалась работа по поддержанию и развитию сайта регулярного научного семинара «Популяционная и системная экология» (Е.В.Будилова). Продолжалась работа по поддержанию и развитию сайта кафедры (Е.В.Будилова). Осуществляется курирование работы сервера GeneBee на сайте НИИ ФХБ МГУ www.genebee.msu.su (Е.П.Никитина).
15 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. Компьютеризация биологических исследований
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".