|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Рецептор эпидермального фактора роста EGFR как онкомаркер глиобластомы, получение к нему аптамеровНИР
Receptor of epidermal growth factor EGFR as oncomarker for glioblastoma, development of aptamers for EGFR
- Руководитель НИР: Копылов А.М.
- Ответственные исполнители: Антипова О.М., Бизяева А.А., Завьялова Е.Г.
- Участники НИР: Бизяева А.А., Завьялова Е.Г., Савченко Е.А., Яковлева К.А., решетников р.в.
- Подразделение: Кафедра химии природных соединений
- Срок исполнения: 30 октября 2017 г. - 30 октября 2020 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 17-00-00160\17
- Номер ЦИТИС: АААА-А17-117112220078-0
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Живые системы, медицинские технологии, медицинская химия и новые лекарственные средства
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
-
Рубрики ГРНТИ:
- 31.23.29 Нуклеиновые кислоты и их компоненты
- 34.15.17 Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
-
Ключевые слова:
дифференцировка, глиома, аптамер, онкомаркер
aptamer, glioma, differentiation, oncomarker -
Описание:
Согласно рекомендациям ВОЗ 2016 года классификация опухолей ЦНС опирается на данные молекулярной генетики. Онкомаркером глиобластом III и IV стадий является рецептор эпидермального фактора роста (РЭФР, EGFR). Нарушения функционирования EGFR критичны и при других онкологиях - 30% всех случаев эпителиального рака. В 2016 году одобрен первый тест на EGFR в плазме. Идентификация EGFR как онкогена стимулировала разработку ингибиторов активности EGFR для противораковой терапии. Моноклональные антитела блокируют внеклеточный домен для связывания лиганда; низкомолекулярные ингибиторы EGFR-зависимых тирозинкиназ блокируют передачу сигнала на пролиферацию. Несмотря на положительные результаты оба типа препаратов имеют недостатки, что диктует необходимость создания ингибиторов принципиально новой природы. В проекте совместно с ИБГ РАН будут типированы клинические образцы глиобластом из ФГАУ «ННПЦН им. ак. Н. Н. Бурденко» Минздрава России по EGFR. В проекте разрабатываются блокаторы EGFR нового типа на основе аптамеров. Аптамеры - это молекулярные узнающие элементы на основе нуклеиновых кислот (НК), иногда называемые “химическими антителами”. Благодаря уникальной пространственной структуре небольшие фрагменты НК способны специфически и высокоаффинно связываться с мишенями, в данном случае - с EGFR, и вмешиваться в их функционирование.
-
Планируемые результаты:
Создание теоретической базы данных по онкомаркеру EGFR в глиобластомах для ФГАУ «ННПЦН им. ак. Н. Н. Бурденко» Минздрава России. Методика для ПЦР-анализа в реальном времени для анализа мРНК EGFR и его вариантов в клинических и экспериментальных образцах. Методика и данные иммуноцитохимического анализа EGFR. База экспериментальных данных по онкомаркеру EGFR в глиобластомах для ФГАУ «ННПЦН им. ак. Н. Н. Бурденко» Минздрава России. Анализ корреляции уровня экспрессии мРНК EGFR и других онкомаркеров с природой, стадийностью глиобластом и прогнозами выживаемости. Оценка возможности проведения неоперационного генотипирования в плазме. Дизайн и синтез нескольких прототипов-аптамеров к EGFR. Модели пространственной структуры аптамеров с помощью моделирования на суперкомпьютерах и экспериментально. Физико-химические свойства аптамеров, включая стабильность и взаимодействие с EGFR. Результаты функциональных тестов аптамеров на первичных культурах клеток и клеточных линиях, включая МТТ, экспрессию маркеров пролиферации и генов сигнального каскада.
- Добавил в систему: Завьялова Елена Геннадиевна
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 30 октября 2017 г.-31 декабря 2018 г. | Рецептор эпидермального фактора роста EGFR как онкомаркер глиобластомы, получение к нему аптамеров |
| Результаты этапа: EGFR представляет собой значимый онкомаркер для диагностики и перспективную мишень для терапии глиобластомы. Один из наиболее удобных способов количественной оценки содержания EGFR представляет собой оценку экспрессии EGFR-гена. Нами разработана методика количественной оценки представленности EGFR в послеоперационных образцах тканей пациентов; причем анализ дает положительный результат также в случае наличия мутации EGFRvIII. Показано, что увеличение экспрессии EGFR достоверно коррелирует с ухудшением диагностического прогноза. Проанализированы аптамеры к EGFR, описанные в литературе. Методами биоинформатического моделирования найдены структурные доминанты аптамеров к EGFR, предположительно обуславливающие их аффинность и специфичность. Полученные результаты представляют собой основу для применения разработанного в нашей лаборатории уникального подхода оптимизации структурно-функциональной активности для создания терапевтических аптамеров к EGFR. | ||
| 2 | 1 января 2019 г.-31 декабря 2019 г. | Рецептор эпидермального фактора роста EGFR как онкомаркер глиобластомы, получение к нему аптамеров |
| Результаты этапа: Создана база данных по онкомаркеру EGFR в глиобластомах для ФГАУ «ННПЦН им. ак. Н. Н. Бурденко» Минздрава России. Разработаны методики иммуноцитохимического анализа EGFR на поверхности клеток и проведены эксперименты на разных клеточных линиях Предложены и синтезированы несколько аптамеров к EGFR. Изучены физико-химические свойства аптамеров, включая стабильность и взаимодействие с EGFR. | ||
| 3 | 1 января 2020 г.-31 декабря 2020 г. | Рецептор эпидермального фактора роста EGFR как онкомаркер глиобластомы, получение к нему аптамеров |
| Результаты этапа: 1) Исследована возможность проведения неоперационного генотипирования глиобластом в биологических жидкостях. 2) Проведены функциональные тесты аптамеров на первичных культурах клеток и клеточных линиях. Выполнена оценка выживаемости клеток МТТ. Проведена оценка экспрессии маркеров пролиферации и генов сигнального каскада. 3) Исследовано взаимное влияние аптамера к EGFR и его природного лиганда - EGF. 4) Экспериментальная база по экспрессии EGFR в различных глиобластомах с учетом природы и гетерогенности опухоли актуализирвана. 5) Проведен системный анализ данных литературы по экспрессии EGFR в различных глиобластомах с учетом природы и гетерогенности опухоли. Результаты дополнены собственными экспериментальными данными. 6) Проведена оценка потенциала аптамеров к EGFR в качестве средства доставки фотосенсибилизаторов в клетки первичной перевиваемой культуры глиомы | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".