| 1 |
1 ноября 2010 г.-15 декабря 2010 г. |
Анализ литературных данных, аналитический обзор, выбор и обоснование направления исследования. Подбор условий для экспрессии и очистки молекул модельных ионных каналов. |
| Результаты этапа: 1.1. Анализ литературных данных;
1.2. Написание аналитического обзора по существующим аналогичным методам изучения структуры и функций молекул ионных каналов.
1.3. Моделирование по гомологии атомной структуры ионных каналов;
1.4. Оценка аппаратных возможностей.
1.5. Подбор условий для экспрессии и очистки модельных ионных каналов
|
| 2 |
1 января 2011 г.-15 июля 2011 г. |
Получение электронных изображений белков ионных каналов. Определение структуры ионных каналов. Разработка задач практикума по моделированию структуры ионных каналов |
| Результаты этапа: 2.1. Экспрессия и очистка белка модельного ионного канала.
2.2. Получение электронно-микроскопических изображений модельного белка ионного канала.
2.3. Разработка научно-методических материалов для практикума по моделированию структуры ионных каналов
2.4. Создание первичной трёхмерной реконструкции модельной молекулы. 2.5. Проведение патентных исследований.
|
| 3 |
16 июля 2011 г.-15 декабря 2011 г. |
Выявление молекулярных механизмов связывания белков ионных каналов с блокаторами |
| Результаты этапа: 3.1. Оценка экспрессии белков ионных каналов в культуре клеток с использованием флуоресцирующих комплексов нейротоксина на конфокальном микроскопе. Оценка активности каналов.
3.2. Определение константы связывания модельного ингибитора ионного канала с применением флуоресцирующих комплексов нейротоксина.
3.3. Разработка методов оценки свободной энергии связывания блокаторов с белками ионных каналов.
3.4. Оценка стабильности очищенного белка и измерения связывания ионного канала с меченым нейротоксином на планшетном многофункциональном детекторе.
|
| 4 |
1 января 2012 г.-15 июля 2012 г. |
Тестирование разработанных методов исследования структуры и функций потенциал-зависимых ионных каналов. Разработка методического материала. |
| Результаты этапа: 4.1. Тестирование разработанных методов с использованием синтетических блокаторов на модельном белке ионного канала.
4.2. Тестирование методов с использованием нескольких различных типов ионных каналов.
4.3. Тестирование метода моделирования молекулярной динамики, с использованием возможностей массивно-параллельных вычислений на графических процессорах.
4.4. Оценка возможностей использования результатов НИР в образовательном процессе.
4.5. Разработка пользовательских инструкций, методического материала для обеспечения проведения практических занятий по трехмерной микроскопии биологических молекул.
4.6 Создание технической базы для проведения практических занятий по анализу электронных микрофотографий и созданию трёхмерных реконструкций частиц.
4.7. Разработка плана практикума и методического пособия по анализу электронных микрофотографий и созданию трёхмерных реконструкций частиц.
4.8. Разработка рекомендаций по использованию разрабатываемых методов для определения структуры и функций потенциал-зависимых ионных каналов, кодируемых 18 хромосомой человека.
|
| 5 |
16 июля 2012 г.-15 ноября 2012 г. |
Обобщение и оценка результатов исследований с учетом задач, сформулированных в проекте «Протеом человека». |
| Результаты этапа: 5.1. Разработка рекомендаций по использованию результатов проведенных НИР.
5.2. Оценка использования полученных результатов в учебном процессе, в том числе при проведении практикумов, выполнении курсовых и дипломных работ.
5.3. Подготовка научно-методических материалов
5.4 Разработка программы внедрения результатов НИР в образовательный процесс.
|
