ИСТИНА

Работа посвящена изучению взаимодействия лигандов с биомишенями с использованием методов ЯМР, основанных на детектировании свойств лигандов. При этом планируется проводить исследования по двум комплементарным направлениям. Первое направление посвящено поиску с помощью современных методик ЯМР-скрининга новых лигандов, связывающихся с мишенью с высокой аффинностью и специфичностью. В качестве мишени предполагается использовать метионин-гамма-лиазу – фермент, присутствующий у серии патогенных микроорганизмов и отсутствующий в клетках человека, что определяет его перспективность в антибактериальной терапии. Кроме того, отработку методик ЯМР-скрининга и их совершенствование планируется проводить с использованием в качестве мишени альбумина (человеческого и бычьего). Второе направление исследований предполагает определение с помощью методов ЯМР структуры конформационно жестких лигандов, связывающихся с высокой аффинностью с биомишенью. В этом случае конформация лиганда и его электронные свойства предоставят важную информацию о строении центра связывания биомишени. В качестве объектов исследования в этом случае выбраны аптамеры ДНК, прочно связывающиеся с тромбином. Известно, что эти аптамеры имеют жесткую структуру, скрепленную G-квартетами, однако структура высокого разрешения для них не определена. Полученные результаты позволят внести вклад в развитие теории молекулярного узнавания и создание методов рационального дизайна соединений, связывающихся с высокой специфичностью с биомишенями.