|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Распределенные вычислительные системы для решения задач молекулярной биоинженерииНИР
- Руководитель НИР: Шайтан К.В.
- Участники НИР: Антонов М.Ю., Балабаев Н.К., Боздаганян М.Е., Волох О.И., Касимова М.А., Левцова О.В., Новоселецкий В.Н., Орехов Ф.С., Оршанский И.А., Попинако А.В., Соколова О.С., Станишнева-Коновалова Т.Б., Турлей Е.В., Шайтан А.К.
- Сторонняя организация: Биологический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова
- Срок исполнения: 18 ноября 2009 г. - 15 сентября 2011 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 02.740.11.0487
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: другое
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.57.23 Методы получения биомедицинской информации
-
Ключевые слова:
графические процессоры, молекулярное моделирование
-
Описание:
Быстрое развитие компьютерных технологий и методов молекулярного модели-рования делает актуальным их широкое внедрение для решения фундаменталь-ных и прикладных задач современной биологии и биоинженерии. При этом необходимо совершенствовать и адаптировать программно-аппаратные решения и методы, направленные на конкретные задачи молекулярной биоинженерии для систем, содержащих сотни тысяч атомов. Необходимо также выстроить эффек-тивную методику моделирования таких систем, начиная от сборки мегаатомных структур до обработки траекторных файлов объемом десятки и сотни гигига-байт.
-
Основные результаты:
Программа ЭВМ для сборки сложных молекулярных систем, включающая средства подготовки данных для вычислительного эксперимента, контроля и визуализации.
- Добавил в систему: Шайтан Константин Вольдемарович
Источник финансирования НИР
| НТП: Научно-техническая программа, Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 18 ноября 2009 г.-15 декабря 2009 г. | Выбор и обоснование направления исследований |
| Результаты этапа: Полученные результаты применимы при выборе аппаратных решений для создания массивно-параллельных гибридных суперкомпьютерных систем, ориентированных на молекулярное моделирование сложных объектов | ||
| 2 | 1 января 2010 г.-15 июля 2010 г. | Разработка методик, программ подготовки данных и конфигураций аппаратных средств |
| Результаты этапа: Разработка методики проведения компьютерного моделирования молекулярной динамики и обработки данных электронной микроскопии с использованием распределенных вычислительных систем и графических процессоров. | ||
| 3 | 16 июля 2010 г.-10 декабря 2010 г. | Разработка программно- аппаратного обеспечения для моделирования объектов молекулярной биоинженерии |
| Результаты этапа: Разработка и тестирование ПО для численного моделирования молекулярной динамики объектов биоинженерии с использованием интеграции различных уровней параллелизма. | ||
| 4 | 1 января 2011 г.-15 апреля 2011 г. | Верификация программно-аппаратного обеспечения и формирование базы данных |
| Результаты этапа: Сборка серии структур объектов молекулярной биоинженерии для пробных вычислительных экспериментов | ||
| 5 | 16 апреля 2011 г.-15 сентября 2011 г. | Апробация применения программно- аппаратного комплекса к объектам молекулярной биоинженерии |
| Результаты этапа: Оценка эффективности использования полученных результатов в учебном процессе, в том числе при проведении практикумов, выполнении курсовых и дипломных работ. | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".