Вторичная структура N-концевой области SsoII-подобных C5-цитозиновых ДНК-метилтрансфераз, определенная методом спектроскопии кругового дихроизмастатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 29 мая 2015 г.
Аннотация:С5-цитозиновая ДНК-метилтрансфераза SsoII (M.SsoII) имеет протяженную N-концевую область (171 а.о.), предшествующую последовательности, включающей консервативные мотивы, характерные для всех ДНК-метилтрансфераз такого типа. Наличие этой области обеспечивает способность M.SsoII выполнять функцию регулятора транскрипции в системе рестрикциимодификации SsoII. Чтобы осуществить регуляторную функцию, M.SsoII специфически связывается с 15-звенным инвертированным повтором в промоторной области генов этой системы. В данной работе изучены свойства белка дельта(72-379)M.Ecl18kI - делеционного мутанта SsoII-подобной метилтрансферазы Ecl18kI, гомологичного N-концевой области M.SsoII. Показана способность дельта(72-379)M.Ecl18kI специфически связываться с ДНК-дуплексом, содержащим регуляторный участок. Однако такое связывание происходит только в присутствии больших избытков дельта(72-379)M.Ecl18kI относительно ДНК, что может свидетельствовать об изменении структуры делеционного мутанта по сравнению с полноразмерной M.SsoII. Методом спектроскопии кругового дихроизма показано, что дельта(72-379)M.Ecl18kI имеет выраженную вторичную структуру и содержит 32% альфа-спиралей и 20% бета-тяжей. Проведено сравнение аминокислотных последовательностей N-концевой области M.SsoII и факторов транскрипции с известной пространственной структурой. Выдвинуто предположение о расположении альфа-спиралей и бета-тяжей в структуре N-концевой области M.SsoII.