|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
TrEsp –заряды: чувствительность к изменению ядерной геометрии и формальная применимость метода уравнивания электроотрицательноститезисы доклада
- Автор: Хохлов Даниил Витальевич
- Сборник: Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2015»
- Редакторы: Андреев А.И., Андриянов Андрей Владимирович, Антипов Евгений Александрович, Аязбекова Сабина Шариповна, Аязбекова Сабина Шариповна, Аязбекова Сабина Шариповна, Воронова Евгения Сергеевна
- Серия: Социология
- Том: 13
- Тезисы
- Год издания: 2015
- Издательство: ООО "МАКС Пресс"
- Местоположение издательства: Москва
- Аннотация: Точное описание электронно-возбужденных состояний крупных систем, таких как фотосинтетические антенны или иные белковые комплексы, невозможно в силу их размеров и требует использования приближенных методов. Одной из задач, требующих решения при моделировании электронных состояний таких комплексов, является описание взаимодействия между компонентами комплекса. Так, кулоновское взаимодействие между отдельными молекулами в комплексе можно представить как взаимодействие точечных зарядов, аппроксимирующих электростатический потенциал, между собой. Однако, основанная на этой идее и приобретающая все большую популярность схема расчета TrESP (transition charge from electrostatic potential [1]) не учитывает зависимость эффективных зарядов от координат атомов, что ограничивает их применение для моделирования динамических процессов.. Одна из задач данной работы — исследование чувствительности TrESP-зарядов к изменениям ядерной геометрии. С помощью численного дифференцирования были рассчитаны производные TrEsp-зарядов для пиррола и бутадиена – молекул, являющихся структурными фрагментами двух классов хромофоров, присутствующих в фотосинтетических комплексах, — порфиринов и каротиноидов, соответственно. Абсолютные значения соответствующих производных во внутренних координатах достигают нескольких ат. ед., что позволяет говорить о необходимости учета изменения зарядов при моделировании динамики. На примере вышеуказанных двух молекул была проверена применимость метода уравнивания электроотрицательности (electronegativity equilibration, далее УЭО) для расчета атомных зарядов [2,3]. Для 300 ядерных геометрий, полученных случайным малым смещением ядер относительно равновесной, были рассчитаны TrEsp-заряды, соответствующие различным матричным элементам молекулярного потенциала. Показано, что TrEsp-заряды, соответствующие одному и тому же матричному элементу молекулярного потенциала, в рамках использованной совокупности геометрий молекулы могут быть удовлетворительно описаны уравнениями метода УЭО при подходящем выборе атомных параметров JAA0 (мера отталкивания электронов) и χA0 (электроотрицательность изолированного атома). Эти параметры, однако, не имеют физического смысла для всех элементов матрицы потенциала кроме соответствующего основному состоянию, и оказываются неодинаковыми для структурно неэквивалентных атомов одного и того же элемента. Таким образом, данный метод оказывается формально применимым не только для основных состояний молекул, но нуждается в более глубоком обосновании. Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (гранты № 14-03-31548 и № 13-03-00621 ).
- Добавил в систему: Хохлов Даниил Витальевич
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | uid68019_1b8daeea4d1b411dae514c486f18f0cec5b33473.doc | 18,0 КБ | 14 октября 2015 [daniilkh] |