Аннотация:Настоящая статья является вводной к тематическому выпуску журнала. В ней кратко, в историческом плане характеризуется проблема изучения пограничных зон между смежными экосистемами – экотонов. Отмечается высокое биоразнообразие в экотонах, и, вместе с тем – их уязвимость к природным и антропогенным воздействиям и к инвазиям чужеродных видов. Высказывается предположение об отсутствии противоречий между концепциями экотонов и речного континуума. Подчёркивается важная экологическая роль амфибионтных животных и растений во взаимодействии и функционировании смежных экосистем. Затрагивается проблема изучения не только количественных, но и качественных (элементный и биохимический состав) характеристик потоков вещества между экосистемами.